Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5F110

Protein Details
Accession V5F110    Localization Confidence Low Confidence Score 9.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
45-68QASSSDRPAKRRRAAREAKPKVTPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
51-65RPAKRRRAAREAKPK
Subcellular Location(s) cyto 9, cyto_mito 8.833, cyto_nucl 8.333, mito 7.5, nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002815  Spo11/TopoVI_A  
IPR013049  Spo11/TopoVI_A_N  
IPR036078  Spo11/TopoVI_A_sf  
IPR034136  TOPRIM_Topo6A/Spo11  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005694  C:chromosome  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003918  F:DNA topoisomerase type II (double strand cut, ATP-hydrolyzing) activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006259  P:DNA metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF04406  TP6A_N  
CDD cd00223  TOPRIM_TopoIIB_SPO  
Amino Acid Sequences MTSTQPAVLARIDELITHFVRQLVLQDAALQQPTPPLSLSSADSQASSSDRPAKRRRAAREAKPKVTPMRLLSFAQDGERKESNVSYPPSSVARLRRFAQILKVLSLIQTNLLRGTLVTKRLKEINTGSRDIFYQCLQLFRTQAASDRIINQIVTLLGCAARAELNIVASPRGMIAGPLTLVPPRQEAIKCRAGQARFIPPEVGVGWRVDLQCTPECASARCAHLVLVVEKEAVFKTLLQHQALASNASSIDWGRVVIVTAKGYPDHATRTLLRLLSSSQCQFGREIRVLGLFDGDPYGVHIHHQFGVQWLGVDVEDFLPPNEGGALVQLRNDERTMAVRLLRTLPRDEVEKRTRLTTMLLTGYKVEIEAAYDVSSGLVGYVEHKLSELS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.18
3 0.18
4 0.18
5 0.18
6 0.17
7 0.17
8 0.17
9 0.18
10 0.17
11 0.18
12 0.16
13 0.18
14 0.19
15 0.2
16 0.21
17 0.18
18 0.14
19 0.16
20 0.18
21 0.16
22 0.15
23 0.14
24 0.16
25 0.18
26 0.2
27 0.2
28 0.22
29 0.21
30 0.2
31 0.19
32 0.19
33 0.19
34 0.18
35 0.19
36 0.26
37 0.3
38 0.39
39 0.48
40 0.56
41 0.63
42 0.71
43 0.75
44 0.77
45 0.82
46 0.84
47 0.86
48 0.85
49 0.83
50 0.79
51 0.77
52 0.73
53 0.68
54 0.63
55 0.57
56 0.53
57 0.5
58 0.45
59 0.41
60 0.36
61 0.32
62 0.3
63 0.28
64 0.24
65 0.26
66 0.27
67 0.26
68 0.25
69 0.25
70 0.25
71 0.27
72 0.3
73 0.26
74 0.25
75 0.26
76 0.27
77 0.28
78 0.3
79 0.32
80 0.35
81 0.37
82 0.39
83 0.43
84 0.44
85 0.43
86 0.45
87 0.43
88 0.38
89 0.34
90 0.33
91 0.27
92 0.25
93 0.24
94 0.17
95 0.14
96 0.13
97 0.12
98 0.11
99 0.11
100 0.1
101 0.1
102 0.14
103 0.14
104 0.21
105 0.25
106 0.26
107 0.29
108 0.33
109 0.34
110 0.35
111 0.38
112 0.39
113 0.39
114 0.41
115 0.39
116 0.34
117 0.35
118 0.31
119 0.26
120 0.17
121 0.17
122 0.15
123 0.17
124 0.17
125 0.18
126 0.18
127 0.17
128 0.19
129 0.14
130 0.17
131 0.19
132 0.2
133 0.19
134 0.2
135 0.21
136 0.19
137 0.19
138 0.15
139 0.12
140 0.1
141 0.09
142 0.06
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.05
151 0.05
152 0.06
153 0.06
154 0.07
155 0.07
156 0.06
157 0.06
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.04
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.06
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.1
173 0.12
174 0.15
175 0.21
176 0.27
177 0.27
178 0.29
179 0.34
180 0.31
181 0.33
182 0.34
183 0.36
184 0.3
185 0.3
186 0.27
187 0.22
188 0.22
189 0.19
190 0.17
191 0.09
192 0.08
193 0.08
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.1
198 0.12
199 0.13
200 0.14
201 0.16
202 0.16
203 0.16
204 0.17
205 0.2
206 0.19
207 0.19
208 0.18
209 0.16
210 0.14
211 0.15
212 0.15
213 0.13
214 0.11
215 0.1
216 0.09
217 0.09
218 0.1
219 0.08
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.09
224 0.15
225 0.19
226 0.18
227 0.19
228 0.18
229 0.2
230 0.2
231 0.19
232 0.13
233 0.09
234 0.09
235 0.08
236 0.09
237 0.06
238 0.07
239 0.06
240 0.06
241 0.05
242 0.05
243 0.06
244 0.07
245 0.09
246 0.09
247 0.09
248 0.1
249 0.1
250 0.11
251 0.13
252 0.12
253 0.15
254 0.16
255 0.18
256 0.19
257 0.22
258 0.24
259 0.23
260 0.22
261 0.19
262 0.2
263 0.2
264 0.23
265 0.21
266 0.22
267 0.22
268 0.22
269 0.23
270 0.24
271 0.27
272 0.24
273 0.24
274 0.21
275 0.23
276 0.22
277 0.2
278 0.18
279 0.12
280 0.1
281 0.1
282 0.09
283 0.07
284 0.08
285 0.09
286 0.07
287 0.09
288 0.1
289 0.12
290 0.13
291 0.14
292 0.13
293 0.14
294 0.16
295 0.14
296 0.13
297 0.11
298 0.1
299 0.09
300 0.09
301 0.08
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.09
307 0.09
308 0.09
309 0.08
310 0.08
311 0.07
312 0.1
313 0.12
314 0.1
315 0.12
316 0.14
317 0.15
318 0.17
319 0.17
320 0.15
321 0.14
322 0.17
323 0.19
324 0.2
325 0.22
326 0.21
327 0.24
328 0.29
329 0.32
330 0.32
331 0.32
332 0.33
333 0.32
334 0.37
335 0.38
336 0.42
337 0.46
338 0.48
339 0.47
340 0.46
341 0.45
342 0.4
343 0.4
344 0.34
345 0.31
346 0.31
347 0.3
348 0.28
349 0.28
350 0.28
351 0.24
352 0.2
353 0.16
354 0.09
355 0.1
356 0.1
357 0.1
358 0.1
359 0.1
360 0.1
361 0.09
362 0.09
363 0.07
364 0.06
365 0.05
366 0.04
367 0.07
368 0.11
369 0.12
370 0.12