FuNGI

V5GTC4

Protein Details

Accession

V5GTC4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
238-258	LSKLSKTQRKKINKQLKAQEL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
193-205	KKAKPSGSSNGKG
372-379	KGKKKGVA

Subcellular Location(s)

cyto 12, cyto_mito 11.833, mito 10.5, cyto_nucl 7.833

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007823 RRP8 IPR042036 RRP8_N IPR029063 SAM-dependent_MTases_sf
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0008168 F:methyltransferase activity GO:0032259 P:methylation GO:0006364 P:rRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF11578 DUF3237 PF05148 Methyltransf_8
CDD	cd02440 AdoMet_MTases

Amino Acid Sequences

MSTPSITLTHAFTLKLPVAAALSIPGTPVGDRSYIPVVEGGTLEGEGISAKVTPGGDWAIVKDGYGKLDVRVHAITPDNEVLYIQYSGHLELQAQLELKRSALADSILSKLPGLEAASSSQAPPEPTSRPRHSNLGLGATPKQQSGSNGKSHSAADVRLKGALTAKRKRQEEPLAQVEDEEEEETSRAGAIGKKAKPSGSSNGKGAKKDPFAATGVEAQRAAQNQPRIVVVDGESVDLSKLSKTQRKKINKQLKAQELSTSNEIPTVTAKIAPAASSSSPTKALSTTSTSSTAPALTPLQAQMLSKLSGSRFRTINEKLYTTASTEAVRMIDAAPAMFDEYHAGFREQVRSWPKNPLDRIVELFDASSSSAKGKKKGVAEVAKGGKARFSPGALVVDLGAGEGGLAKKLVPKGIKVLCYDLVTTSDGWVRKQDTAALHGLPLPGFFDSNDPLGLHPPPEGAAPGVADVAVFCLSLMGTNWIHMLLEAKRVLRTGGELIIAEVSSRFADGFEAFVKVVKMLGFKLDGKDASNTHFVLFEFTKLGREEHVRSLEGVEGSEIDPNNTSLDELAEHGKSLLKPCIYKRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.23
3	0.2
4	0.17
5	0.16
6	0.16
7	0.15
8	0.11
9	0.1
10	0.09
11	0.09
12	0.09
13	0.08
14	0.08
15	0.1
16	0.11
17	0.12
18	0.12
19	0.16
20	0.2
21	0.19
22	0.2
23	0.2
24	0.18
25	0.17
26	0.17
27	0.14
28	0.1
29	0.09
30	0.09
31	0.07
32	0.06
33	0.05
34	0.05
35	0.05
36	0.05
37	0.05
38	0.07
39	0.08
40	0.08
41	0.1
42	0.11
43	0.12
44	0.12
45	0.14
46	0.15
47	0.15
48	0.15
49	0.17
50	0.16
51	0.17
52	0.19
53	0.19
54	0.18
55	0.23
56	0.24
57	0.24
58	0.24
59	0.23
60	0.24
61	0.27
62	0.25
63	0.24
64	0.25
65	0.21
66	0.2
67	0.2
68	0.17
69	0.15
70	0.15
71	0.1
72	0.1
73	0.11
74	0.12
75	0.13
76	0.13
77	0.11
78	0.13
79	0.15
80	0.15
81	0.16
82	0.15
83	0.17
84	0.17
85	0.17
86	0.16
87	0.15
88	0.13
89	0.13
90	0.14
91	0.12
92	0.13
93	0.16
94	0.15
95	0.15
96	0.14
97	0.13
98	0.12
99	0.11
100	0.1
101	0.09
102	0.09
103	0.1
104	0.12
105	0.13
106	0.13
107	0.13
108	0.13
109	0.14
110	0.16
111	0.18
112	0.21
113	0.28
114	0.37
115	0.43
116	0.47
117	0.49
118	0.54
119	0.53
120	0.52
121	0.48
122	0.45
123	0.39
124	0.36
125	0.34
126	0.31
127	0.3
128	0.24
129	0.23
130	0.19
131	0.22
132	0.28
133	0.31
134	0.33
135	0.34
136	0.35
137	0.36
138	0.34
139	0.33
140	0.26
141	0.24
142	0.23
143	0.25
144	0.24
145	0.24
146	0.24
147	0.21
148	0.25
149	0.28
150	0.32
151	0.37
152	0.45
153	0.51
154	0.54
155	0.55
156	0.59
157	0.63
158	0.62
159	0.61
160	0.6
161	0.55
162	0.52
163	0.49
164	0.4
165	0.31
166	0.23
167	0.16
168	0.09
169	0.06
170	0.07
171	0.07
172	0.06
173	0.05
174	0.05
175	0.06
176	0.08
177	0.13
178	0.21
179	0.24
180	0.27
181	0.29
182	0.3
183	0.32
184	0.35
185	0.38
186	0.39
187	0.4
188	0.4
189	0.47
190	0.49
191	0.47
192	0.45
193	0.43
194	0.36
195	0.37
196	0.34
197	0.28
198	0.26
199	0.25
200	0.24
201	0.23
202	0.22
203	0.19
204	0.18
205	0.15
206	0.16
207	0.17
208	0.17
209	0.16
210	0.18
211	0.18
212	0.19
213	0.19
214	0.18
215	0.17
216	0.16
217	0.13
218	0.12
219	0.12
220	0.11
221	0.1
222	0.09
223	0.09
224	0.08
225	0.07
226	0.05
227	0.08
228	0.13
229	0.2
230	0.25
231	0.34
232	0.44
233	0.54
234	0.63
235	0.7
236	0.76
237	0.77
238	0.81
239	0.81
240	0.8
241	0.73
242	0.64
243	0.58
244	0.49
245	0.44
246	0.38
247	0.29
248	0.21
249	0.18
250	0.18
251	0.13
252	0.12
253	0.11
254	0.08
255	0.09
256	0.09
257	0.08
258	0.09
259	0.08
260	0.08
261	0.08
262	0.08
263	0.1
264	0.11
265	0.11
266	0.12
267	0.12
268	0.12
269	0.11
270	0.12
271	0.11
272	0.14
273	0.15
274	0.15
275	0.17
276	0.16
277	0.16
278	0.15
279	0.14
280	0.1
281	0.1
282	0.09
283	0.07
284	0.08
285	0.07
286	0.08
287	0.08
288	0.08
289	0.08
290	0.09
291	0.09
292	0.09
293	0.1
294	0.1
295	0.16
296	0.19
297	0.21
298	0.21
299	0.21
300	0.27
301	0.29
302	0.35
303	0.31
304	0.29
305	0.27
306	0.28
307	0.27
308	0.22
309	0.21
310	0.15
311	0.13
312	0.12
313	0.11
314	0.09
315	0.09
316	0.08
317	0.07
318	0.06
319	0.06
320	0.05
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.05
325	0.04
326	0.05
327	0.06
328	0.08
329	0.09
330	0.09
331	0.1
332	0.11
333	0.16
334	0.15
335	0.21
336	0.28
337	0.31
338	0.32
339	0.4
340	0.43
341	0.46
342	0.47
343	0.47
344	0.43
345	0.4
346	0.41
347	0.34
348	0.3
349	0.23
350	0.21
351	0.15
352	0.11
353	0.1
354	0.08
355	0.06
356	0.08
357	0.13
358	0.16
359	0.2
360	0.24
361	0.28
362	0.31
363	0.35
364	0.42
365	0.43
366	0.43
367	0.46
368	0.45
369	0.43
370	0.4
371	0.35
372	0.29
373	0.23
374	0.24
375	0.18
376	0.16
377	0.14
378	0.15
379	0.17
380	0.15
381	0.14
382	0.11
383	0.1
384	0.09
385	0.07
386	0.05
387	0.03
388	0.03
389	0.04
390	0.04
391	0.04
392	0.04
393	0.04
394	0.08
395	0.1
396	0.15
397	0.15
398	0.16
399	0.24
400	0.28
401	0.32
402	0.3
403	0.33
404	0.3
405	0.3
406	0.29
407	0.22
408	0.19
409	0.17
410	0.15
411	0.13
412	0.15
413	0.15
414	0.15
415	0.18
416	0.19
417	0.19
418	0.2
419	0.23
420	0.21
421	0.24
422	0.26
423	0.22
424	0.2
425	0.2
426	0.2
427	0.15
428	0.14
429	0.11
430	0.08
431	0.09
432	0.08
433	0.1
434	0.1
435	0.12
436	0.12
437	0.12
438	0.12
439	0.14
440	0.15
441	0.13
442	0.12
443	0.11
444	0.11
445	0.11
446	0.11
447	0.09
448	0.08
449	0.08
450	0.08
451	0.07
452	0.06
453	0.06
454	0.05
455	0.06
456	0.05
457	0.05
458	0.04
459	0.05
460	0.05
461	0.05
462	0.06
463	0.09
464	0.09
465	0.1
466	0.1
467	0.1
468	0.1
469	0.1
470	0.13
471	0.1
472	0.16
473	0.18
474	0.19
475	0.2
476	0.2
477	0.21
478	0.18
479	0.19
480	0.16
481	0.15
482	0.15
483	0.14
484	0.14
485	0.14
486	0.13
487	0.1
488	0.08
489	0.08
490	0.07
491	0.07
492	0.06
493	0.06
494	0.08
495	0.08
496	0.1
497	0.1
498	0.12
499	0.11
500	0.13
501	0.13
502	0.11
503	0.12
504	0.12
505	0.12
506	0.12
507	0.14
508	0.17
509	0.19
510	0.21
511	0.24
512	0.24
513	0.24
514	0.28
515	0.26
516	0.27
517	0.29
518	0.27
519	0.23
520	0.24
521	0.22
522	0.24
523	0.23
524	0.2
525	0.19
526	0.18
527	0.22
528	0.22
529	0.22
530	0.21
531	0.26
532	0.29
533	0.34
534	0.38
535	0.35
536	0.35
537	0.35
538	0.35
539	0.29
540	0.25
541	0.17
542	0.15
543	0.14
544	0.18
545	0.16
546	0.14
547	0.14
548	0.15
549	0.15
550	0.14
551	0.14
552	0.1
553	0.11
554	0.11
555	0.11
556	0.15
557	0.14
558	0.14
559	0.14
560	0.19
561	0.2
562	0.24
563	0.29
564	0.3
565	0.35

V5GTC4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer