Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5F1H8

Protein Details
Accession V5F1H8    Localization Confidence Low Confidence Score 9.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
659-685TDPLPFQRVKRLRNPWRDNRQVKVSRDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12, cyto 5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007275  YTH_domain  
IPR045168  YTH_prot  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04146  YTH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50882  YTH  
CDD cd21134  YTH  
Amino Acid Sequences MSTHPHYHQHPPPPLQGAAPYTSYATPPSADTYGYAGSAYHPARQGNESHPYSRPRATHSQSHSSGSGSSGAAHESVGGSHYAPHYTSSFPAQYGPYSTTYFPSQTGSAPHSASTTSHQSYQYAEHPVQVEGQEHASETSAIDDDVDDHGVLSIFIISRSNCAFVNYATSTHLDRAVKYFQGKQVRPRDTRCPKLVCRVRKKDDEAQAGVAGQRGRGIHVAWLKQQRELERAQNASTADRNPSETSSQPSSDVLTSPLKDTQAVAAGLTSAASYSSSGSASYASTNSSLFRHPAFRHRFFILKSLRADDLDRSVETGYWATQPHNENVLDQAYRNSETVFLIFGVNQTGQFHGYAKMAGPIHTSTNDSKEKEEQVRRASQASTLSVVTGNLSATAVPDSVDEKVGESHIVASPLDAEARSHPTLDKRDIEAARGLFGALVVDGVLDARGQPMTSPLPITPNPEEGAFEKSLSMSPQRDDTITPQNADAYVQSSTWPYTSTKSTISGNNTSESDKTERPKLGSALSADRSSARVAAESDEHGVRRMDMEPDSSQTSSSLNDQPSLAPSDSASWSSADPRVAEQIALRAVIHNLRLDEMESRGQAERLESKLRSTPGHTDDDTTGKGEEAPPSQGDEPRSPPRQSSSDSWGKPFRVEWVRTDPLPFQRVKRLRNPWRDNRQVKVSRDGTELEPGVGRQLLEEWNRLHAPALVDSTKASSKVADTSPSSAGRNASDEDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.52
3 0.49
4 0.42
5 0.36
6 0.32
7 0.27
8 0.24
9 0.24
10 0.23
11 0.21
12 0.19
13 0.17
14 0.17
15 0.2
16 0.19
17 0.18
18 0.18
19 0.19
20 0.19
21 0.18
22 0.16
23 0.12
24 0.12
25 0.2
26 0.2
27 0.21
28 0.23
29 0.25
30 0.28
31 0.3
32 0.33
33 0.31
34 0.4
35 0.4
36 0.4
37 0.45
38 0.48
39 0.5
40 0.53
41 0.49
42 0.47
43 0.54
44 0.56
45 0.59
46 0.61
47 0.65
48 0.61
49 0.62
50 0.56
51 0.46
52 0.41
53 0.33
54 0.28
55 0.19
56 0.17
57 0.13
58 0.13
59 0.12
60 0.11
61 0.1
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.07
67 0.1
68 0.11
69 0.12
70 0.13
71 0.15
72 0.16
73 0.17
74 0.19
75 0.21
76 0.22
77 0.21
78 0.23
79 0.22
80 0.22
81 0.23
82 0.24
83 0.22
84 0.23
85 0.23
86 0.23
87 0.25
88 0.25
89 0.23
90 0.23
91 0.21
92 0.2
93 0.23
94 0.23
95 0.23
96 0.23
97 0.22
98 0.2
99 0.2
100 0.19
101 0.21
102 0.25
103 0.23
104 0.27
105 0.28
106 0.28
107 0.29
108 0.31
109 0.31
110 0.3
111 0.28
112 0.27
113 0.27
114 0.27
115 0.27
116 0.24
117 0.21
118 0.16
119 0.17
120 0.14
121 0.13
122 0.13
123 0.12
124 0.11
125 0.09
126 0.1
127 0.08
128 0.08
129 0.07
130 0.07
131 0.08
132 0.09
133 0.09
134 0.08
135 0.07
136 0.08
137 0.08
138 0.07
139 0.06
140 0.06
141 0.05
142 0.06
143 0.08
144 0.08
145 0.11
146 0.12
147 0.13
148 0.12
149 0.14
150 0.15
151 0.13
152 0.19
153 0.18
154 0.18
155 0.18
156 0.19
157 0.19
158 0.19
159 0.24
160 0.19
161 0.18
162 0.22
163 0.24
164 0.25
165 0.27
166 0.3
167 0.32
168 0.41
169 0.44
170 0.49
171 0.56
172 0.62
173 0.65
174 0.66
175 0.7
176 0.7
177 0.75
178 0.73
179 0.71
180 0.66
181 0.71
182 0.74
183 0.74
184 0.75
185 0.77
186 0.77
187 0.77
188 0.8
189 0.78
190 0.78
191 0.74
192 0.65
193 0.56
194 0.49
195 0.41
196 0.34
197 0.28
198 0.19
199 0.12
200 0.12
201 0.11
202 0.12
203 0.12
204 0.12
205 0.15
206 0.19
207 0.22
208 0.26
209 0.34
210 0.33
211 0.36
212 0.39
213 0.37
214 0.36
215 0.37
216 0.37
217 0.35
218 0.36
219 0.33
220 0.32
221 0.3
222 0.28
223 0.27
224 0.22
225 0.19
226 0.19
227 0.21
228 0.19
229 0.21
230 0.21
231 0.2
232 0.24
233 0.24
234 0.24
235 0.22
236 0.21
237 0.21
238 0.19
239 0.18
240 0.16
241 0.15
242 0.15
243 0.16
244 0.18
245 0.16
246 0.16
247 0.16
248 0.14
249 0.14
250 0.13
251 0.11
252 0.09
253 0.09
254 0.08
255 0.08
256 0.06
257 0.03
258 0.03
259 0.03
260 0.04
261 0.04
262 0.05
263 0.05
264 0.06
265 0.06
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.08
272 0.08
273 0.09
274 0.1
275 0.11
276 0.11
277 0.12
278 0.18
279 0.19
280 0.28
281 0.36
282 0.39
283 0.41
284 0.42
285 0.44
286 0.38
287 0.45
288 0.4
289 0.36
290 0.34
291 0.32
292 0.31
293 0.29
294 0.29
295 0.21
296 0.2
297 0.17
298 0.15
299 0.14
300 0.13
301 0.12
302 0.12
303 0.11
304 0.08
305 0.09
306 0.1
307 0.09
308 0.14
309 0.16
310 0.17
311 0.2
312 0.19
313 0.17
314 0.18
315 0.19
316 0.15
317 0.13
318 0.13
319 0.11
320 0.12
321 0.12
322 0.11
323 0.1
324 0.1
325 0.1
326 0.09
327 0.07
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.07
337 0.07
338 0.08
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.11
344 0.11
345 0.11
346 0.12
347 0.11
348 0.12
349 0.13
350 0.15
351 0.12
352 0.18
353 0.22
354 0.21
355 0.22
356 0.23
357 0.27
358 0.33
359 0.37
360 0.36
361 0.37
362 0.4
363 0.39
364 0.38
365 0.34
366 0.28
367 0.25
368 0.21
369 0.18
370 0.13
371 0.13
372 0.11
373 0.1
374 0.08
375 0.07
376 0.06
377 0.05
378 0.05
379 0.04
380 0.04
381 0.05
382 0.04
383 0.04
384 0.05
385 0.06
386 0.06
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.06
394 0.07
395 0.07
396 0.08
397 0.07
398 0.07
399 0.07
400 0.07
401 0.07
402 0.06
403 0.05
404 0.07
405 0.12
406 0.12
407 0.13
408 0.14
409 0.18
410 0.23
411 0.26
412 0.27
413 0.24
414 0.31
415 0.3
416 0.31
417 0.29
418 0.25
419 0.21
420 0.19
421 0.17
422 0.09
423 0.09
424 0.07
425 0.04
426 0.03
427 0.02
428 0.02
429 0.02
430 0.02
431 0.02
432 0.02
433 0.02
434 0.03
435 0.03
436 0.04
437 0.04
438 0.07
439 0.08
440 0.09
441 0.1
442 0.1
443 0.14
444 0.15
445 0.21
446 0.2
447 0.21
448 0.21
449 0.2
450 0.21
451 0.17
452 0.21
453 0.16
454 0.15
455 0.13
456 0.13
457 0.13
458 0.13
459 0.16
460 0.13
461 0.14
462 0.16
463 0.17
464 0.17
465 0.18
466 0.21
467 0.27
468 0.27
469 0.27
470 0.24
471 0.24
472 0.23
473 0.22
474 0.18
475 0.1
476 0.09
477 0.08
478 0.09
479 0.09
480 0.1
481 0.09
482 0.11
483 0.1
484 0.12
485 0.15
486 0.17
487 0.17
488 0.19
489 0.22
490 0.25
491 0.29
492 0.32
493 0.3
494 0.3
495 0.3
496 0.29
497 0.27
498 0.26
499 0.25
500 0.24
501 0.26
502 0.3
503 0.32
504 0.32
505 0.35
506 0.33
507 0.31
508 0.29
509 0.28
510 0.27
511 0.27
512 0.25
513 0.22
514 0.21
515 0.21
516 0.18
517 0.17
518 0.11
519 0.1
520 0.11
521 0.12
522 0.13
523 0.13
524 0.15
525 0.15
526 0.15
527 0.15
528 0.15
529 0.13
530 0.14
531 0.14
532 0.14
533 0.13
534 0.17
535 0.17
536 0.19
537 0.22
538 0.2
539 0.19
540 0.17
541 0.17
542 0.14
543 0.17
544 0.2
545 0.18
546 0.19
547 0.19
548 0.19
549 0.21
550 0.24
551 0.2
552 0.14
553 0.14
554 0.16
555 0.17
556 0.17
557 0.16
558 0.13
559 0.13
560 0.16
561 0.18
562 0.16
563 0.16
564 0.16
565 0.19
566 0.18
567 0.18
568 0.16
569 0.16
570 0.16
571 0.16
572 0.14
573 0.11
574 0.13
575 0.15
576 0.16
577 0.14
578 0.14
579 0.14
580 0.15
581 0.15
582 0.15
583 0.16
584 0.17
585 0.15
586 0.17
587 0.17
588 0.18
589 0.17
590 0.19
591 0.21
592 0.22
593 0.28
594 0.26
595 0.28
596 0.33
597 0.35
598 0.34
599 0.34
600 0.38
601 0.36
602 0.42
603 0.39
604 0.37
605 0.36
606 0.38
607 0.34
608 0.28
609 0.23
610 0.18
611 0.18
612 0.17
613 0.18
614 0.17
615 0.19
616 0.18
617 0.22
618 0.24
619 0.26
620 0.29
621 0.3
622 0.35
623 0.41
624 0.47
625 0.44
626 0.45
627 0.48
628 0.48
629 0.49
630 0.47
631 0.47
632 0.5
633 0.51
634 0.54
635 0.54
636 0.5
637 0.47
638 0.42
639 0.43
640 0.42
641 0.43
642 0.42
643 0.45
644 0.48
645 0.47
646 0.5
647 0.47
648 0.45
649 0.48
650 0.46
651 0.41
652 0.48
653 0.55
654 0.59
655 0.63
656 0.67
657 0.72
658 0.8
659 0.86
660 0.86
661 0.88
662 0.92
663 0.88
664 0.84
665 0.85
666 0.82
667 0.76
668 0.75
669 0.69
670 0.62
671 0.58
672 0.53
673 0.45
674 0.43
675 0.39
676 0.3
677 0.26
678 0.23
679 0.22
680 0.2
681 0.18
682 0.11
683 0.13
684 0.19
685 0.21
686 0.26
687 0.25
688 0.29
689 0.3
690 0.3
691 0.28
692 0.25
693 0.25
694 0.23
695 0.28
696 0.23
697 0.22
698 0.23
699 0.26
700 0.25
701 0.23
702 0.21
703 0.17
704 0.18
705 0.23
706 0.25
707 0.27
708 0.27
709 0.3
710 0.35
711 0.36
712 0.36
713 0.33
714 0.32
715 0.29
716 0.29