Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5EWQ8

Protein Details
Accession V5EWQ8    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
77-100VEAISHKEQRRRKKLAKLDPSTSSHydrophilic
297-326AGLRNPAPKKKMKKDRKKSERKPKASSSSSBasic
490-512DPDAPLPKKHKETKEERMARRAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-35KAAKE
86-90RRRKK
300-321RNPAPKKKMKKDRKKSERKPKA
441-466RGAGKASREALGKKGKNELRVGFMRK
472-473PR
495-525LPKKHKETKEERMARRAEKGERGPARRAKPG
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSDTEPTPTEAGAERVLTNKEKRQLAVAQKKAAKEAAAARKAGGSADIAAGTKRKADDDTPLTTTDAAADGEAEEEVEAISHKEQRRRKKLAKLDPSTSSSDPSPNNLVHPDRAAPLPRSQYSVWVGNLSFFTAPAKLIDWFAQRGVDGISRVNMPKGARRAEMNKGFCYVDLPSKDALVAAVNLSEQPLDGRKLLIKDGGDFAGRPEINGIALGVARSLPSATTNLHANKDDEEGDEEEKGEEKGEGERKGKTGLTKTAQKILRAQKNAPSMTLFLGNLSFNTTEQGVRDLFDRSAGLRNPAPKKKMKKDRKKSERKPKASSSSSSSSDSESDSDSDSDSDSDSSSSSSSSATEDEEESTPTDSSKPATPALGEVTPSPAGIRKVRLGTFEDAPDKCKGFGFIDFHTIEQATASLIDARNTFLDGRKILLQYASADATRRGAGKASREALGKKGKNELRVGFMRKDQMTRPRRERVEEEKVAPVPGSFDPDAPLPKKHKETKEERMARRAEKGERGPARRAKPGAALANAQRASTGIVQSTGTRVTFDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.2
3 0.24
4 0.29
5 0.34
6 0.39
7 0.45
8 0.47
9 0.47
10 0.5
11 0.54
12 0.58
13 0.62
14 0.62
15 0.63
16 0.63
17 0.64
18 0.61
19 0.55
20 0.44
21 0.38
22 0.41
23 0.42
24 0.42
25 0.41
26 0.38
27 0.38
28 0.37
29 0.33
30 0.24
31 0.15
32 0.11
33 0.12
34 0.12
35 0.11
36 0.12
37 0.14
38 0.13
39 0.16
40 0.15
41 0.16
42 0.19
43 0.21
44 0.29
45 0.32
46 0.37
47 0.36
48 0.36
49 0.35
50 0.31
51 0.29
52 0.21
53 0.17
54 0.11
55 0.09
56 0.08
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.06
61 0.05
62 0.05
63 0.04
64 0.04
65 0.05
66 0.06
67 0.08
68 0.15
69 0.2
70 0.29
71 0.37
72 0.48
73 0.58
74 0.68
75 0.74
76 0.78
77 0.84
78 0.86
79 0.89
80 0.86
81 0.81
82 0.76
83 0.71
84 0.66
85 0.57
86 0.48
87 0.39
88 0.37
89 0.32
90 0.31
91 0.31
92 0.26
93 0.28
94 0.3
95 0.31
96 0.28
97 0.29
98 0.27
99 0.24
100 0.27
101 0.29
102 0.26
103 0.29
104 0.34
105 0.33
106 0.35
107 0.33
108 0.36
109 0.35
110 0.37
111 0.32
112 0.28
113 0.27
114 0.24
115 0.24
116 0.2
117 0.15
118 0.11
119 0.12
120 0.1
121 0.1
122 0.09
123 0.1
124 0.09
125 0.11
126 0.14
127 0.16
128 0.16
129 0.17
130 0.16
131 0.15
132 0.15
133 0.15
134 0.13
135 0.11
136 0.11
137 0.11
138 0.13
139 0.14
140 0.14
141 0.16
142 0.15
143 0.21
144 0.26
145 0.28
146 0.28
147 0.32
148 0.36
149 0.42
150 0.49
151 0.47
152 0.42
153 0.41
154 0.39
155 0.34
156 0.31
157 0.24
158 0.22
159 0.19
160 0.2
161 0.18
162 0.18
163 0.18
164 0.16
165 0.14
166 0.09
167 0.08
168 0.06
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.06
173 0.05
174 0.04
175 0.05
176 0.07
177 0.09
178 0.09
179 0.1
180 0.12
181 0.14
182 0.15
183 0.17
184 0.15
185 0.15
186 0.16
187 0.16
188 0.14
189 0.13
190 0.12
191 0.16
192 0.16
193 0.14
194 0.13
195 0.12
196 0.12
197 0.12
198 0.11
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.05
209 0.06
210 0.07
211 0.08
212 0.13
213 0.15
214 0.18
215 0.19
216 0.18
217 0.18
218 0.19
219 0.18
220 0.14
221 0.14
222 0.14
223 0.13
224 0.13
225 0.12
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.08
230 0.06
231 0.06
232 0.11
233 0.15
234 0.19
235 0.2
236 0.21
237 0.22
238 0.24
239 0.24
240 0.23
241 0.22
242 0.24
243 0.27
244 0.33
245 0.34
246 0.4
247 0.4
248 0.38
249 0.42
250 0.45
251 0.48
252 0.44
253 0.44
254 0.42
255 0.47
256 0.46
257 0.38
258 0.3
259 0.24
260 0.21
261 0.21
262 0.15
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.07
267 0.08
268 0.08
269 0.06
270 0.07
271 0.08
272 0.07
273 0.07
274 0.09
275 0.08
276 0.08
277 0.09
278 0.1
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.13
284 0.13
285 0.15
286 0.16
287 0.23
288 0.3
289 0.36
290 0.39
291 0.43
292 0.52
293 0.6
294 0.69
295 0.73
296 0.76
297 0.82
298 0.89
299 0.92
300 0.94
301 0.95
302 0.95
303 0.95
304 0.92
305 0.88
306 0.85
307 0.83
308 0.76
309 0.68
310 0.63
311 0.56
312 0.51
313 0.46
314 0.38
315 0.3
316 0.27
317 0.24
318 0.19
319 0.15
320 0.13
321 0.11
322 0.11
323 0.1
324 0.1
325 0.09
326 0.08
327 0.08
328 0.08
329 0.07
330 0.07
331 0.06
332 0.07
333 0.07
334 0.06
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.07
339 0.08
340 0.08
341 0.09
342 0.09
343 0.11
344 0.11
345 0.12
346 0.11
347 0.12
348 0.11
349 0.11
350 0.11
351 0.09
352 0.11
353 0.13
354 0.15
355 0.15
356 0.15
357 0.15
358 0.15
359 0.18
360 0.16
361 0.14
362 0.12
363 0.14
364 0.13
365 0.13
366 0.12
367 0.12
368 0.15
369 0.17
370 0.19
371 0.21
372 0.25
373 0.26
374 0.29
375 0.3
376 0.3
377 0.3
378 0.3
379 0.32
380 0.28
381 0.3
382 0.3
383 0.27
384 0.24
385 0.22
386 0.21
387 0.17
388 0.22
389 0.22
390 0.21
391 0.26
392 0.26
393 0.25
394 0.24
395 0.22
396 0.17
397 0.14
398 0.12
399 0.06
400 0.06
401 0.06
402 0.09
403 0.09
404 0.11
405 0.11
406 0.12
407 0.12
408 0.13
409 0.14
410 0.14
411 0.18
412 0.16
413 0.19
414 0.21
415 0.22
416 0.21
417 0.21
418 0.19
419 0.16
420 0.18
421 0.17
422 0.14
423 0.14
424 0.14
425 0.15
426 0.16
427 0.16
428 0.14
429 0.17
430 0.2
431 0.24
432 0.31
433 0.31
434 0.33
435 0.35
436 0.36
437 0.39
438 0.46
439 0.43
440 0.39
441 0.47
442 0.47
443 0.5
444 0.55
445 0.5
446 0.47
447 0.5
448 0.53
449 0.47
450 0.48
451 0.49
452 0.45
453 0.46
454 0.46
455 0.49
456 0.53
457 0.6
458 0.64
459 0.66
460 0.69
461 0.72
462 0.73
463 0.72
464 0.73
465 0.69
466 0.64
467 0.61
468 0.57
469 0.51
470 0.43
471 0.33
472 0.26
473 0.21
474 0.24
475 0.18
476 0.18
477 0.19
478 0.22
479 0.29
480 0.28
481 0.34
482 0.34
483 0.41
484 0.5
485 0.58
486 0.64
487 0.67
488 0.74
489 0.78
490 0.83
491 0.85
492 0.82
493 0.82
494 0.8
495 0.74
496 0.73
497 0.69
498 0.65
499 0.64
500 0.64
501 0.65
502 0.67
503 0.68
504 0.69
505 0.7
506 0.69
507 0.69
508 0.66
509 0.59
510 0.56
511 0.59
512 0.56
513 0.5
514 0.5
515 0.45
516 0.51
517 0.48
518 0.41
519 0.33
520 0.27
521 0.27
522 0.25
523 0.24
524 0.16
525 0.16
526 0.18
527 0.19
528 0.21
529 0.2
530 0.17