FuNGI

V5GTC1

Protein Details

Accession

V5GTC1

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
21-47	ASSSSKRVRIDEPSRRQRKREETDFFD	Hydrophilic
52-74	LEEEERRRIRRDQKSGRIDDRGE	Basic
101-120	ADAGSHRRRAEKKRRGDAAG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
107-116	RRRAEKKRRG
143-149	SGKGKQK
253-258	KKSNKS

Subcellular Location(s)

nucl 16, cyto_nucl 11.5, mito 6, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039905 CD2BP2/Lin1 IPR003169 GYF IPR035445 GYF-like_dom_sf
Gene Ontology	GO:0005682 C:U5 snRNP
PROSITE	View protein in PROSITE PS50829 GYF

Amino Acid Sequences

MSLTDKRKASSATAGPSTTPASSSSKRVRIDEPSRRQRKREETDFFDGDPELEEEERRRIRRDQKSGRIDDRGEDLSESDESDANGADLFNENEDESDAEADAGSHRRRAEKKRRGDAAGAGGDDDDEDMFDVADDEPKASKSGKGKQKDAKRGDHLNLGELGEGQDFGSKTRSAVDAADDDAEALRGGDADDDDLDPDLELEDEDERDDDDRDVGDPDRDQYVDLNALAERSPPTSPGGTPLSTSSRTLKAKKSNKSKAPKVTGFNMKEEMRTGKFDAEGNYHENQRDPDAQHDVWLTGNYSKIKILEARKAQQKRDQEARDKEKAALQVDGDEDDVKKRLVEFMHRAETVQRTLQRLGRVLADRKKAAKSKGSDGTDEVKQAASDVDNVTHLSSVLMSRFGRLDIYDQTYERLLHDVHKSGLVRQTFDPAAKYDPAPVAAEANAASSSSELNATAGDWEYRWTPSYLAAAAREAGTPVDPEIQVFGPFGLAELKNWAQQGYFGDGGERILLRRKGSKDAWTTYNDVASADT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.39
3	0.39
4	0.37
5	0.28
6	0.23
7	0.2
8	0.23
9	0.26
10	0.34
11	0.41
12	0.46
13	0.49
14	0.52
15	0.55
16	0.58
17	0.66
18	0.68
19	0.7
20	0.73
21	0.8
22	0.83
23	0.84
24	0.84
25	0.84
26	0.83
27	0.83
28	0.8
29	0.77
30	0.79
31	0.76
32	0.65
33	0.56
34	0.46
35	0.36
36	0.29
37	0.21
38	0.15
39	0.13
40	0.15
41	0.15
42	0.24
43	0.31
44	0.32
45	0.36
46	0.43
47	0.53
48	0.62
49	0.71
50	0.73
51	0.76
52	0.83
53	0.87
54	0.85
55	0.81
56	0.71
57	0.63
58	0.57
59	0.48
60	0.39
61	0.31
62	0.25
63	0.2
64	0.19
65	0.17
66	0.13
67	0.12
68	0.11
69	0.11
70	0.1
71	0.08
72	0.08
73	0.07
74	0.07
75	0.08
76	0.08
77	0.08
78	0.09
79	0.09
80	0.09
81	0.1
82	0.1
83	0.08
84	0.09
85	0.08
86	0.07
87	0.07
88	0.07
89	0.08
90	0.14
91	0.15
92	0.17
93	0.19
94	0.28
95	0.36
96	0.47
97	0.56
98	0.6
99	0.7
100	0.77
101	0.81
102	0.77
103	0.72
104	0.66
105	0.62
106	0.54
107	0.43
108	0.33
109	0.26
110	0.22
111	0.18
112	0.14
113	0.06
114	0.04
115	0.04
116	0.04
117	0.04
118	0.04
119	0.05
120	0.05
121	0.08
122	0.08
123	0.08
124	0.09
125	0.1
126	0.12
127	0.12
128	0.16
129	0.21
130	0.31
131	0.39
132	0.45
133	0.53
134	0.6
135	0.69
136	0.75
137	0.75
138	0.74
139	0.72
140	0.72
141	0.66
142	0.65
143	0.55
144	0.47
145	0.4
146	0.32
147	0.25
148	0.18
149	0.16
150	0.09
151	0.09
152	0.07
153	0.08
154	0.08
155	0.09
156	0.11
157	0.11
158	0.11
159	0.12
160	0.13
161	0.12
162	0.12
163	0.13
164	0.12
165	0.12
166	0.13
167	0.1
168	0.1
169	0.09
170	0.08
171	0.06
172	0.05
173	0.04
174	0.03
175	0.04
176	0.04
177	0.04
178	0.04
179	0.05
180	0.05
181	0.05
182	0.05
183	0.05
184	0.05
185	0.05
186	0.04
187	0.04
188	0.04
189	0.04
190	0.05
191	0.05
192	0.05
193	0.05
194	0.06
195	0.06
196	0.07
197	0.07
198	0.07
199	0.07
200	0.07
201	0.09
202	0.09
203	0.09
204	0.09
205	0.1
206	0.11
207	0.11
208	0.1
209	0.09
210	0.1
211	0.1
212	0.09
213	0.09
214	0.07
215	0.08
216	0.07
217	0.08
218	0.07
219	0.08
220	0.08
221	0.09
222	0.11
223	0.11
224	0.11
225	0.14
226	0.16
227	0.15
228	0.15
229	0.17
230	0.18
231	0.18
232	0.2
233	0.18
234	0.22
235	0.26
236	0.3
237	0.34
238	0.41
239	0.48
240	0.56
241	0.64
242	0.67
243	0.72
244	0.77
245	0.78
246	0.77
247	0.77
248	0.73
249	0.66
250	0.63
251	0.63
252	0.55
253	0.49
254	0.44
255	0.36
256	0.31
257	0.3
258	0.27
259	0.19
260	0.19
261	0.18
262	0.15
263	0.15
264	0.16
265	0.17
266	0.16
267	0.16
268	0.17
269	0.18
270	0.19
271	0.18
272	0.18
273	0.17
274	0.18
275	0.2
276	0.17
277	0.18
278	0.22
279	0.22
280	0.22
281	0.22
282	0.19
283	0.15
284	0.15
285	0.13
286	0.08
287	0.12
288	0.11
289	0.11
290	0.12
291	0.12
292	0.13
293	0.17
294	0.2
295	0.25
296	0.3
297	0.35
298	0.43
299	0.48
300	0.51
301	0.52
302	0.56
303	0.54
304	0.59
305	0.59
306	0.6
307	0.64
308	0.68
309	0.67
310	0.6
311	0.55
312	0.49
313	0.46
314	0.38
315	0.3
316	0.22
317	0.18
318	0.17
319	0.17
320	0.13
321	0.1
322	0.09
323	0.09
324	0.1
325	0.09
326	0.09
327	0.08
328	0.11
329	0.12
330	0.19
331	0.23
332	0.27
333	0.32
334	0.32
335	0.32
336	0.32
337	0.33
338	0.29
339	0.28
340	0.26
341	0.24
342	0.27
343	0.31
344	0.3
345	0.29
346	0.28
347	0.29
348	0.31
349	0.34
350	0.38
351	0.4
352	0.4
353	0.42
354	0.48
355	0.48
356	0.48
357	0.49
358	0.46
359	0.49
360	0.54
361	0.53
362	0.47
363	0.45
364	0.44
365	0.38
366	0.34
367	0.27
368	0.19
369	0.16
370	0.15
371	0.13
372	0.09
373	0.1
374	0.09
375	0.09
376	0.1
377	0.11
378	0.11
379	0.1
380	0.09
381	0.07
382	0.07
383	0.07
384	0.07
385	0.11
386	0.11
387	0.12
388	0.12
389	0.13
390	0.13
391	0.12
392	0.15
393	0.15
394	0.2
395	0.21
396	0.21
397	0.22
398	0.23
399	0.23
400	0.21
401	0.19
402	0.14
403	0.17
404	0.21
405	0.22
406	0.21
407	0.25
408	0.25
409	0.26
410	0.32
411	0.29
412	0.28
413	0.26
414	0.3
415	0.27
416	0.28
417	0.26
418	0.22
419	0.24
420	0.23
421	0.23
422	0.21
423	0.21
424	0.22
425	0.21
426	0.2
427	0.17
428	0.15
429	0.16
430	0.12
431	0.12
432	0.1
433	0.08
434	0.08
435	0.07
436	0.07
437	0.07
438	0.07
439	0.06
440	0.07
441	0.07
442	0.07
443	0.08
444	0.09
445	0.09
446	0.08
447	0.1
448	0.11
449	0.13
450	0.15
451	0.14
452	0.14
453	0.16
454	0.19
455	0.19
456	0.2
457	0.19
458	0.18
459	0.18
460	0.19
461	0.16
462	0.14
463	0.12
464	0.11
465	0.1
466	0.11
467	0.14
468	0.13
469	0.13
470	0.15
471	0.15
472	0.15
473	0.15
474	0.13
475	0.1
476	0.1
477	0.1
478	0.13
479	0.12
480	0.12
481	0.18
482	0.19
483	0.22
484	0.23
485	0.22
486	0.17
487	0.2
488	0.22
489	0.22
490	0.22
491	0.19
492	0.2
493	0.19
494	0.2
495	0.2
496	0.17
497	0.13
498	0.2
499	0.24
500	0.27
501	0.35
502	0.38
503	0.44
504	0.49
505	0.57
506	0.56
507	0.59
508	0.6
509	0.56
510	0.57
511	0.51
512	0.48
513	0.39

V5GTC1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer