FuNGI

V5GKZ0

Protein Details

Accession

V5GKZ0

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-22	MPSKSKTKNKSIWRSDNAQHFQ	Hydrophilic
661-718	VTAKRDRNESKEDRKARKEALKANKKERKDRKMKTKQAFASEKKKQAKAEKGRKETEG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
323-326	KGRP
665-715	RDRNESKEDRKARKEALKANKKERKDRKMKTKQAFASEKKKQAKAEKGRKE

Subcellular Location(s)

nucl 18, mito 5, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPSKSKTKNKSIWRSDNAQHFQLVHRSQRDPLINDPDAGAHVLLSYDPANQARAKGKTRAELEADATVIRDKYGRPIRSNIGEAANYGVYFDDTEYDYMQHLRPINDDENVKRGGENVDETVDTILVSASAGAKGKGKGKESFALKEGEEEKGLSLPASVLPSKQEMPFSFTSHLAVEPSLQGFQPDMDPHLRQALEALDDEAFVDDDLDDDFFGEVVQDGEWDGVVRDDDEWREQAPEGDEGIWADPAARAQKELDQNGEENMSLEARVALFKKQQELARSQKPSSDDEAEDDEDRDQVASLRAGSRAGTMYTAGGSAIGKKGRPGALARRAASTKAPSIGGGSTAWSMSSSAMFRNKGLTDLDDRFAQLGRKYGIREDFDPSLESLEDEEFVDSDGDEAGEEVTREDFEGIMDDFLAKYETKHGKLREALGGVDSTSVEKLTILRQALGKARINGREWAGKDADEGKGEGDLGEYEDYESPDEEIVDPIPRSHMREKWDVETIQSTKTNLENHPRTISAKESVFGGSNASAFRPGSVANGSAVNRNMLGNGMAPSMTSYTSQRPSASAFLNDEERLPKIRINPRTGFPEIVGYSKPRGVNGKTKPDAATNGHLDEEDDGRGPPSGSDPGSDTEEGEGSEYDSDTTEGGELARRLSTIAVTAKRDRNESKEDRKARKEALKANKKERKDRKMKTKQAFASEKKKQAKAEKGRKETEGGPAGMRLL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.83
2	0.8
3	0.81
4	0.76
5	0.67
6	0.59
7	0.5
8	0.47
9	0.48
10	0.47
11	0.45
12	0.45
13	0.45
14	0.46
15	0.53
16	0.56
17	0.5
18	0.52
19	0.53
20	0.48
21	0.46
22	0.43
23	0.36
24	0.3
25	0.27
26	0.19
27	0.1
28	0.09
29	0.08
30	0.08
31	0.09
32	0.08
33	0.08
34	0.12
35	0.13
36	0.16
37	0.17
38	0.23
39	0.28
40	0.35
41	0.39
42	0.43
43	0.47
44	0.52
45	0.55
46	0.55
47	0.52
48	0.48
49	0.45
50	0.39
51	0.35
52	0.26
53	0.23
54	0.2
55	0.16
56	0.14
57	0.13
58	0.12
59	0.21
60	0.31
61	0.37
62	0.39
63	0.45
64	0.51
65	0.55
66	0.58
67	0.51
68	0.46
69	0.39
70	0.35
71	0.32
72	0.26
73	0.2
74	0.17
75	0.14
76	0.1
77	0.1
78	0.1
79	0.08
80	0.09
81	0.1
82	0.11
83	0.12
84	0.12
85	0.15
86	0.15
87	0.18
88	0.2
89	0.2
90	0.22
91	0.27
92	0.29
93	0.31
94	0.35
95	0.32
96	0.33
97	0.34
98	0.31
99	0.25
100	0.24
101	0.22
102	0.2
103	0.2
104	0.17
105	0.17
106	0.17
107	0.18
108	0.16
109	0.14
110	0.11
111	0.08
112	0.07
113	0.05
114	0.05
115	0.05
116	0.05
117	0.07
118	0.07
119	0.08
120	0.12
121	0.15
122	0.22
123	0.26
124	0.3
125	0.33
126	0.37
127	0.43
128	0.44
129	0.45
130	0.41
131	0.38
132	0.34
133	0.35
134	0.32
135	0.27
136	0.23
137	0.2
138	0.18
139	0.16
140	0.16
141	0.11
142	0.09
143	0.08
144	0.09
145	0.11
146	0.11
147	0.11
148	0.13
149	0.16
150	0.18
151	0.19
152	0.22
153	0.2
154	0.26
155	0.28
156	0.29
157	0.28
158	0.26
159	0.26
160	0.22
161	0.22
162	0.16
163	0.14
164	0.12
165	0.11
166	0.11
167	0.11
168	0.1
169	0.09
170	0.09
171	0.09
172	0.11
173	0.1
174	0.12
175	0.15
176	0.16
177	0.16
178	0.21
179	0.2
180	0.17
181	0.18
182	0.16
183	0.14
184	0.14
185	0.14
186	0.09
187	0.09
188	0.1
189	0.08
190	0.07
191	0.05
192	0.05
193	0.04
194	0.04
195	0.05
196	0.05
197	0.04
198	0.05
199	0.05
200	0.04
201	0.04
202	0.04
203	0.04
204	0.04
205	0.04
206	0.04
207	0.04
208	0.04
209	0.04
210	0.04
211	0.04
212	0.04
213	0.04
214	0.05
215	0.05
216	0.07
217	0.09
218	0.11
219	0.12
220	0.12
221	0.13
222	0.13
223	0.14
224	0.14
225	0.14
226	0.12
227	0.12
228	0.11
229	0.1
230	0.11
231	0.09
232	0.07
233	0.06
234	0.05
235	0.07
236	0.1
237	0.1
238	0.1
239	0.11
240	0.17
241	0.22
242	0.23
243	0.24
244	0.22
245	0.23
246	0.23
247	0.22
248	0.17
249	0.12
250	0.11
251	0.08
252	0.07
253	0.06
254	0.06
255	0.05
256	0.07
257	0.07
258	0.09
259	0.13
260	0.15
261	0.18
262	0.22
263	0.25
264	0.27
265	0.33
266	0.38
267	0.42
268	0.45
269	0.42
270	0.41
271	0.41
272	0.4
273	0.38
274	0.34
275	0.26
276	0.24
277	0.27
278	0.25
279	0.23
280	0.2
281	0.16
282	0.12
283	0.12
284	0.1
285	0.07
286	0.06
287	0.07
288	0.07
289	0.07
290	0.08
291	0.08
292	0.09
293	0.09
294	0.09
295	0.08
296	0.08
297	0.08
298	0.07
299	0.07
300	0.07
301	0.06
302	0.05
303	0.05
304	0.05
305	0.05
306	0.08
307	0.09
308	0.09
309	0.09
310	0.13
311	0.13
312	0.15
313	0.18
314	0.24
315	0.31
316	0.36
317	0.37
318	0.36
319	0.36
320	0.35
321	0.34
322	0.28
323	0.2
324	0.17
325	0.16
326	0.13
327	0.14
328	0.13
329	0.11
330	0.09
331	0.08
332	0.07
333	0.07
334	0.06
335	0.05
336	0.06
337	0.05
338	0.06
339	0.06
340	0.08
341	0.12
342	0.12
343	0.12
344	0.14
345	0.14
346	0.15
347	0.15
348	0.14
349	0.15
350	0.16
351	0.17
352	0.15
353	0.15
354	0.14
355	0.14
356	0.15
357	0.11
358	0.12
359	0.12
360	0.14
361	0.14
362	0.17
363	0.2
364	0.21
365	0.22
366	0.22
367	0.22
368	0.21
369	0.21
370	0.18
371	0.14
372	0.12
373	0.11
374	0.08
375	0.07
376	0.07
377	0.06
378	0.06
379	0.05
380	0.06
381	0.05
382	0.04
383	0.04
384	0.04
385	0.03
386	0.03
387	0.03
388	0.03
389	0.03
390	0.04
391	0.04
392	0.04
393	0.04
394	0.04
395	0.05
396	0.04
397	0.04
398	0.05
399	0.05
400	0.05
401	0.05
402	0.05
403	0.05
404	0.05
405	0.06
406	0.05
407	0.05
408	0.13
409	0.18
410	0.21
411	0.27
412	0.28
413	0.32
414	0.35
415	0.37
416	0.32
417	0.29
418	0.26
419	0.21
420	0.19
421	0.14
422	0.12
423	0.09
424	0.07
425	0.06
426	0.06
427	0.05
428	0.05
429	0.06
430	0.07
431	0.11
432	0.11
433	0.12
434	0.13
435	0.16
436	0.2
437	0.25
438	0.26
439	0.25
440	0.29
441	0.32
442	0.33
443	0.33
444	0.31
445	0.31
446	0.3
447	0.3
448	0.26
449	0.22
450	0.22
451	0.21
452	0.2
453	0.15
454	0.15
455	0.11
456	0.1
457	0.1
458	0.09
459	0.07
460	0.05
461	0.06
462	0.06
463	0.06
464	0.07
465	0.08
466	0.08
467	0.08
468	0.09
469	0.08
470	0.08
471	0.08
472	0.07
473	0.07
474	0.08
475	0.09
476	0.09
477	0.09
478	0.13
479	0.14
480	0.19
481	0.24
482	0.27
483	0.3
484	0.37
485	0.4
486	0.4
487	0.44
488	0.39
489	0.35
490	0.37
491	0.33
492	0.3
493	0.28
494	0.25
495	0.21
496	0.25
497	0.27
498	0.25
499	0.34
500	0.35
501	0.36
502	0.38
503	0.38
504	0.37
505	0.34
506	0.33
507	0.28
508	0.24
509	0.22
510	0.2
511	0.2
512	0.19
513	0.16
514	0.15
515	0.1
516	0.11
517	0.11
518	0.1
519	0.11
520	0.1
521	0.1
522	0.09
523	0.09
524	0.1
525	0.11
526	0.11
527	0.1
528	0.14
529	0.14
530	0.17
531	0.17
532	0.16
533	0.15
534	0.15
535	0.14
536	0.11
537	0.11
538	0.09
539	0.09
540	0.09
541	0.08
542	0.08
543	0.08
544	0.09
545	0.09
546	0.09
547	0.11
548	0.16
549	0.2
550	0.23
551	0.22
552	0.23
553	0.25
554	0.28
555	0.27
556	0.24
557	0.23
558	0.23
559	0.26
560	0.25
561	0.23
562	0.21
563	0.2
564	0.21
565	0.2
566	0.21
567	0.27
568	0.36
569	0.42
570	0.48
571	0.51
572	0.52
573	0.58
574	0.57
575	0.49
576	0.41
577	0.4
578	0.33
579	0.3
580	0.28
581	0.24
582	0.23
583	0.27
584	0.27
585	0.23
586	0.29
587	0.31
588	0.4
589	0.45
590	0.54
591	0.52
592	0.55
593	0.53
594	0.5
595	0.51
596	0.45
597	0.43
598	0.36
599	0.35
600	0.32
601	0.3
602	0.27
603	0.23
604	0.2
605	0.15
606	0.12
607	0.11
608	0.11
609	0.12
610	0.12
611	0.1
612	0.12
613	0.15
614	0.15
615	0.16
616	0.17
617	0.19
618	0.23
619	0.23
620	0.2
621	0.18
622	0.18
623	0.16
624	0.15
625	0.13
626	0.09
627	0.1
628	0.1
629	0.09
630	0.09
631	0.09
632	0.08
633	0.08
634	0.08
635	0.07
636	0.07
637	0.11
638	0.1
639	0.11
640	0.12
641	0.12
642	0.12
643	0.12
644	0.12
645	0.13
646	0.2
647	0.24
648	0.29
649	0.37
650	0.43
651	0.45
652	0.52
653	0.52
654	0.52
655	0.57
656	0.61
657	0.64
658	0.68
659	0.75
660	0.78
661	0.81
662	0.81
663	0.8
664	0.79
665	0.78
666	0.77
667	0.78
668	0.79
669	0.8
670	0.84
671	0.84
672	0.83
673	0.86
674	0.87
675	0.87
676	0.87
677	0.89
678	0.89
679	0.92
680	0.94
681	0.93
682	0.92
683	0.88
684	0.87
685	0.87
686	0.84
687	0.83
688	0.82
689	0.82
690	0.8
691	0.79
692	0.77
693	0.77
694	0.8
695	0.8
696	0.82
697	0.83
698	0.83
699	0.83
700	0.77
701	0.72
702	0.64
703	0.62
704	0.57
705	0.48
706	0.4

V5GKZ0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer