Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5F352

Protein Details
Accession V5F352    Localization Confidence Low Confidence Score 6.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
253-279KSRAEWEKYTRERRKKQDEDQEKQRQABasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 11.5, cyto_nucl 10.333, nucl 8, mito_nucl 7.333, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045146  SF3A1  
IPR022030  SF3A1_dom  
IPR000061  Surp  
IPR035967  SWAP/Surp_sf  
IPR000626  Ubiquitin-like_dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF12230  PRP21_like_P  
PF01805  Surp  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50128  SURP  
PS50053  UBIQUITIN_2  
Amino Acid Sequences MAPALNLPAPAHGTDNTLASTSSSSSRFASTGGIIYPPPELRRTIDKAAELIAKKDPAFEVTIKATEQNNPKFAYLKEDDVYHAYYASRRDAVRRGETLAPASADDTASSGTAQGEMQDNAVAGPSTQAPPEPQPFEFSADLPNITAVDLDILKLTALFTARKGRSFATSLLSRESKSYQFEFLRPSHSLFPYFNHLVEQYQKVISPTAALLDTVKLGAYGTTDTTAISSQRTRSTLGTGKGGARPLLLEQAKSRAEWEKYTRERRKKQDEDQEKQRQAFDEIDWQDFVVVGSVELTEADGHLDLPPPRSLREMESMTLAQKKMASMIMVTDDGEEVEELVMPRSSLSGVATAPPPPAVEEVVGKGGTIKVRRDYVPRGLASRTAPTTTKCPVCGEMVGVDEMAEHVRFELLNPAYREQRQQLEAKKANQSALQAGADPTFYLKQLASGRADEDEDARLKREAEEKRLAREKEKIIWDGHAKSRQAARELIAKNKGLEEEMHRVSGRPVVKLAEFGPQFPGMDGDVGQGVDEEEGDDRPIQLPAGSTLPARPVTNSPPPQGVKRPASTELSPPPAPPAPQPSTALAKKTDGSLHPEKAWIEAHSRPAITLTLVLPNDEGGEREEPYEAAIKSTIATMRDYVHQDLLDSQVAASKIKIKVNGKATTLKQTLAHWNLTDGDMVTVDVVK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.2
3 0.19
4 0.17
5 0.16
6 0.15
7 0.15
8 0.13
9 0.16
10 0.16
11 0.18
12 0.19
13 0.21
14 0.2
15 0.19
16 0.2
17 0.17
18 0.18
19 0.17
20 0.17
21 0.15
22 0.15
23 0.19
24 0.19
25 0.21
26 0.21
27 0.22
28 0.25
29 0.34
30 0.39
31 0.42
32 0.44
33 0.43
34 0.41
35 0.43
36 0.45
37 0.38
38 0.34
39 0.32
40 0.31
41 0.29
42 0.31
43 0.27
44 0.23
45 0.26
46 0.24
47 0.24
48 0.24
49 0.25
50 0.24
51 0.27
52 0.26
53 0.29
54 0.38
55 0.4
56 0.41
57 0.41
58 0.42
59 0.42
60 0.4
61 0.41
62 0.35
63 0.34
64 0.31
65 0.3
66 0.31
67 0.3
68 0.32
69 0.23
70 0.21
71 0.17
72 0.18
73 0.2
74 0.22
75 0.23
76 0.22
77 0.27
78 0.33
79 0.4
80 0.43
81 0.43
82 0.43
83 0.43
84 0.44
85 0.41
86 0.36
87 0.29
88 0.23
89 0.21
90 0.17
91 0.14
92 0.12
93 0.1
94 0.08
95 0.08
96 0.08
97 0.08
98 0.07
99 0.08
100 0.07
101 0.08
102 0.1
103 0.1
104 0.11
105 0.11
106 0.1
107 0.09
108 0.1
109 0.08
110 0.06
111 0.07
112 0.08
113 0.09
114 0.09
115 0.1
116 0.13
117 0.18
118 0.25
119 0.27
120 0.25
121 0.29
122 0.3
123 0.33
124 0.32
125 0.27
126 0.24
127 0.22
128 0.22
129 0.17
130 0.16
131 0.12
132 0.11
133 0.1
134 0.06
135 0.07
136 0.06
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.08
145 0.08
146 0.11
147 0.21
148 0.22
149 0.25
150 0.27
151 0.27
152 0.29
153 0.31
154 0.3
155 0.27
156 0.29
157 0.28
158 0.32
159 0.32
160 0.28
161 0.27
162 0.29
163 0.26
164 0.27
165 0.28
166 0.29
167 0.3
168 0.32
169 0.35
170 0.33
171 0.35
172 0.32
173 0.33
174 0.32
175 0.31
176 0.31
177 0.27
178 0.27
179 0.3
180 0.3
181 0.27
182 0.23
183 0.22
184 0.21
185 0.24
186 0.24
187 0.18
188 0.17
189 0.18
190 0.17
191 0.18
192 0.15
193 0.12
194 0.1
195 0.1
196 0.09
197 0.09
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.07
202 0.07
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.06
209 0.06
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.08
214 0.08
215 0.1
216 0.11
217 0.13
218 0.17
219 0.19
220 0.2
221 0.2
222 0.25
223 0.28
224 0.28
225 0.28
226 0.26
227 0.27
228 0.27
229 0.27
230 0.22
231 0.16
232 0.15
233 0.13
234 0.19
235 0.17
236 0.16
237 0.16
238 0.21
239 0.22
240 0.21
241 0.23
242 0.21
243 0.22
244 0.26
245 0.3
246 0.35
247 0.43
248 0.54
249 0.62
250 0.66
251 0.74
252 0.79
253 0.85
254 0.83
255 0.84
256 0.84
257 0.84
258 0.82
259 0.83
260 0.83
261 0.76
262 0.69
263 0.61
264 0.51
265 0.43
266 0.37
267 0.27
268 0.25
269 0.23
270 0.22
271 0.21
272 0.2
273 0.17
274 0.15
275 0.14
276 0.06
277 0.05
278 0.03
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.03
283 0.04
284 0.03
285 0.03
286 0.04
287 0.03
288 0.04
289 0.04
290 0.07
291 0.08
292 0.1
293 0.12
294 0.13
295 0.14
296 0.15
297 0.16
298 0.16
299 0.21
300 0.21
301 0.19
302 0.2
303 0.2
304 0.2
305 0.22
306 0.19
307 0.14
308 0.13
309 0.12
310 0.11
311 0.11
312 0.09
313 0.06
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.07
318 0.06
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.04
323 0.03
324 0.03
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.05
333 0.04
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.07
338 0.07
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.08
343 0.07
344 0.08
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.07
349 0.09
350 0.08
351 0.07
352 0.07
353 0.08
354 0.1
355 0.12
356 0.14
357 0.15
358 0.18
359 0.2
360 0.24
361 0.27
362 0.31
363 0.34
364 0.33
365 0.32
366 0.3
367 0.31
368 0.28
369 0.27
370 0.21
371 0.18
372 0.18
373 0.17
374 0.2
375 0.22
376 0.22
377 0.21
378 0.21
379 0.21
380 0.21
381 0.2
382 0.17
383 0.13
384 0.12
385 0.11
386 0.09
387 0.07
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.05
392 0.04
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.05
397 0.11
398 0.12
399 0.17
400 0.18
401 0.2
402 0.24
403 0.25
404 0.28
405 0.24
406 0.27
407 0.26
408 0.31
409 0.35
410 0.41
411 0.45
412 0.46
413 0.49
414 0.47
415 0.44
416 0.4
417 0.35
418 0.27
419 0.24
420 0.2
421 0.14
422 0.13
423 0.12
424 0.1
425 0.09
426 0.09
427 0.07
428 0.07
429 0.08
430 0.07
431 0.12
432 0.15
433 0.18
434 0.18
435 0.18
436 0.19
437 0.19
438 0.2
439 0.15
440 0.14
441 0.13
442 0.14
443 0.13
444 0.14
445 0.14
446 0.14
447 0.16
448 0.23
449 0.25
450 0.3
451 0.39
452 0.39
453 0.46
454 0.54
455 0.53
456 0.49
457 0.52
458 0.48
459 0.46
460 0.49
461 0.44
462 0.38
463 0.4
464 0.41
465 0.38
466 0.41
467 0.4
468 0.36
469 0.36
470 0.4
471 0.38
472 0.36
473 0.34
474 0.29
475 0.32
476 0.34
477 0.37
478 0.37
479 0.35
480 0.32
481 0.32
482 0.31
483 0.23
484 0.23
485 0.21
486 0.24
487 0.24
488 0.25
489 0.24
490 0.24
491 0.24
492 0.27
493 0.24
494 0.18
495 0.18
496 0.18
497 0.19
498 0.2
499 0.2
500 0.22
501 0.2
502 0.2
503 0.22
504 0.2
505 0.2
506 0.18
507 0.18
508 0.11
509 0.11
510 0.1
511 0.08
512 0.08
513 0.08
514 0.07
515 0.06
516 0.06
517 0.05
518 0.05
519 0.05
520 0.05
521 0.06
522 0.07
523 0.07
524 0.08
525 0.09
526 0.09
527 0.09
528 0.08
529 0.09
530 0.1
531 0.11
532 0.12
533 0.11
534 0.12
535 0.16
536 0.17
537 0.17
538 0.18
539 0.2
540 0.26
541 0.35
542 0.39
543 0.38
544 0.43
545 0.45
546 0.48
547 0.53
548 0.55
549 0.51
550 0.51
551 0.53
552 0.49
553 0.52
554 0.48
555 0.47
556 0.45
557 0.44
558 0.41
559 0.37
560 0.38
561 0.36
562 0.35
563 0.32
564 0.35
565 0.32
566 0.35
567 0.37
568 0.36
569 0.42
570 0.43
571 0.42
572 0.36
573 0.34
574 0.31
575 0.31
576 0.33
577 0.27
578 0.32
579 0.36
580 0.38
581 0.36
582 0.39
583 0.36
584 0.34
585 0.34
586 0.28
587 0.25
588 0.25
589 0.3
590 0.31
591 0.3
592 0.28
593 0.27
594 0.25
595 0.21
596 0.2
597 0.15
598 0.18
599 0.18
600 0.18
601 0.17
602 0.16
603 0.17
604 0.15
605 0.14
606 0.11
607 0.13
608 0.14
609 0.14
610 0.15
611 0.13
612 0.15
613 0.2
614 0.16
615 0.16
616 0.16
617 0.15
618 0.15
619 0.18
620 0.19
621 0.15
622 0.16
623 0.16
624 0.18
625 0.24
626 0.28
627 0.27
628 0.28
629 0.26
630 0.25
631 0.25
632 0.26
633 0.22
634 0.18
635 0.15
636 0.16
637 0.17
638 0.17
639 0.16
640 0.2
641 0.23
642 0.27
643 0.36
644 0.36
645 0.44
646 0.51
647 0.56
648 0.53
649 0.56
650 0.56
651 0.57
652 0.55
653 0.5
654 0.43
655 0.43
656 0.48
657 0.45
658 0.46
659 0.36
660 0.36
661 0.35
662 0.34
663 0.3
664 0.21
665 0.17
666 0.13
667 0.13