FuNGI

V5EQJ7

Protein Details

Accession

V5EQJ7

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-23	MPPKKKSTAPPAKRQKRAVVSDD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
4-16	KKKSTAPPAKRQK

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, mito 11, cyto_nucl 7, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001352 RNase_HII/HIII IPR024567 RNase_HII/HIII_dom IPR023160 RNase_HII_hlx-loop-hlx_cap_dom IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0046872 F:metal ion binding GO:0003723 F:RNA binding GO:0004523 F:RNA-DNA hybrid ribonuclease activity GO:0006401 P:RNA catabolic process
Pfam	View protein in Pfam PF01351 RNase_HII
PROSITE	View protein in PROSITE PS51975 RNASE_H_2
CDD	cd07181 RNase_HII_eukaryota_like

Amino Acid Sequences

MPPKKKSTAPPAKRQKRAVVSDDEDDIQQDDVSQAIVAPPPPIPSEPLGPIAQSYTYASDIPSECSKIDPSNPSIKVPCVLGVDEAGRGPVLGPLVYGIAYCPVSYQDSLKEIGFADSKALTAERRDHLLAALIDDSAHLGWAVRVMSPQDISAGMLRRRPVNLNAQSSQATVGLIAGVLESGVDVTEIYVDTVGDPKSYSRLLSSHFPRHPHIKWTVTSKADAIYPIVGAASIAAKVTRDRCVEGWKYAEQRQQVPSSKAAGDEEVKVLGDATNHTPSHLGSAAETKKRKAEVESVPQSTQNVDTVWSSMGSLGSGYPGDPNTVAYLKRNLDPVFGWPGLVRFSWATAKTMLEEKVKPPSSTAGKVTASAADATPASLGGKRLTRSLSRTSSFNSEVEAPTTSESEPIIASTRPTSIYGTYLPAPSVPGGTAPRGYKVKWIDEPVSISKFFGPTSTKKPATAPTSTASTSVDSTDAFHVSALQATINDWLKREPSSAAKTAAAVPGDIGQIHIAVSKLTKDLSLVSGDATFIL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.88
2	0.86
3	0.85
4	0.83
5	0.78
6	0.76
7	0.7
8	0.64
9	0.6
10	0.51
11	0.41
12	0.33
13	0.28
14	0.19
15	0.14
16	0.11
17	0.09
18	0.08
19	0.08
20	0.07
21	0.06
22	0.07
23	0.09
24	0.09
25	0.11
26	0.11
27	0.13
28	0.16
29	0.17
30	0.19
31	0.2
32	0.23
33	0.24
34	0.28
35	0.26
36	0.24
37	0.23
38	0.21
39	0.19
40	0.16
41	0.15
42	0.13
43	0.14
44	0.14
45	0.14
46	0.17
47	0.18
48	0.21
49	0.22
50	0.22
51	0.2
52	0.22
53	0.25
54	0.24
55	0.29
56	0.3
57	0.33
58	0.4
59	0.42
60	0.44
61	0.43
62	0.41
63	0.37
64	0.32
65	0.3
66	0.23
67	0.22
68	0.18
69	0.17
70	0.16
71	0.15
72	0.14
73	0.11
74	0.09
75	0.08
76	0.08
77	0.08
78	0.07
79	0.06
80	0.06
81	0.07
82	0.07
83	0.07
84	0.07
85	0.06
86	0.08
87	0.08
88	0.08
89	0.08
90	0.09
91	0.12
92	0.13
93	0.15
94	0.15
95	0.17
96	0.19
97	0.18
98	0.18
99	0.16
100	0.17
101	0.17
102	0.14
103	0.14
104	0.12
105	0.12
106	0.12
107	0.12
108	0.11
109	0.13
110	0.19
111	0.19
112	0.22
113	0.23
114	0.23
115	0.22
116	0.25
117	0.22
118	0.17
119	0.15
120	0.12
121	0.11
122	0.1
123	0.11
124	0.06
125	0.06
126	0.04
127	0.04
128	0.04
129	0.06
130	0.07
131	0.06
132	0.07
133	0.09
134	0.1
135	0.1
136	0.11
137	0.09
138	0.09
139	0.1
140	0.12
141	0.17
142	0.18
143	0.2
144	0.22
145	0.23
146	0.26
147	0.28
148	0.29
149	0.34
150	0.39
151	0.43
152	0.42
153	0.42
154	0.4
155	0.37
156	0.33
157	0.23
158	0.16
159	0.09
160	0.08
161	0.05
162	0.05
163	0.04
164	0.03
165	0.02
166	0.02
167	0.02
168	0.02
169	0.02
170	0.02
171	0.02
172	0.02
173	0.02
174	0.03
175	0.03
176	0.03
177	0.04
178	0.04
179	0.04
180	0.07
181	0.07
182	0.07
183	0.07
184	0.07
185	0.1
186	0.11
187	0.11
188	0.1
189	0.11
190	0.14
191	0.22
192	0.28
193	0.34
194	0.37
195	0.4
196	0.41
197	0.47
198	0.46
199	0.44
200	0.44
201	0.39
202	0.39
203	0.42
204	0.45
205	0.39
206	0.37
207	0.32
208	0.27
209	0.23
210	0.21
211	0.15
212	0.1
213	0.08
214	0.07
215	0.06
216	0.05
217	0.04
218	0.04
219	0.03
220	0.03
221	0.03
222	0.03
223	0.04
224	0.06
225	0.08
226	0.13
227	0.14
228	0.15
229	0.17
230	0.24
231	0.25
232	0.26
233	0.27
234	0.26
235	0.29
236	0.32
237	0.34
238	0.3
239	0.31
240	0.32
241	0.36
242	0.36
243	0.34
244	0.31
245	0.3
246	0.28
247	0.25
248	0.22
249	0.17
250	0.14
251	0.13
252	0.11
253	0.09
254	0.09
255	0.08
256	0.07
257	0.06
258	0.05
259	0.06
260	0.08
261	0.13
262	0.13
263	0.13
264	0.13
265	0.13
266	0.15
267	0.14
268	0.12
269	0.08
270	0.15
271	0.19
272	0.24
273	0.26
274	0.25
275	0.27
276	0.28
277	0.29
278	0.26
279	0.3
280	0.3
281	0.39
282	0.44
283	0.43
284	0.42
285	0.41
286	0.38
287	0.31
288	0.25
289	0.16
290	0.1
291	0.08
292	0.08
293	0.09
294	0.09
295	0.08
296	0.07
297	0.07
298	0.06
299	0.05
300	0.05
301	0.04
302	0.05
303	0.04
304	0.05
305	0.05
306	0.06
307	0.06
308	0.06
309	0.07
310	0.08
311	0.1
312	0.1
313	0.11
314	0.16
315	0.17
316	0.19
317	0.23
318	0.21
319	0.21
320	0.21
321	0.22
322	0.23
323	0.21
324	0.2
325	0.15
326	0.16
327	0.16
328	0.15
329	0.13
330	0.08
331	0.1
332	0.14
333	0.15
334	0.15
335	0.15
336	0.16
337	0.16
338	0.19
339	0.2
340	0.2
341	0.21
342	0.21
343	0.3
344	0.32
345	0.31
346	0.29
347	0.32
348	0.33
349	0.34
350	0.35
351	0.3
352	0.28
353	0.29
354	0.28
355	0.23
356	0.19
357	0.16
358	0.13
359	0.09
360	0.09
361	0.08
362	0.07
363	0.06
364	0.06
365	0.07
366	0.08
367	0.1
368	0.14
369	0.15
370	0.18
371	0.21
372	0.24
373	0.28
374	0.34
375	0.38
376	0.36
377	0.38
378	0.38
379	0.41
380	0.39
381	0.34
382	0.29
383	0.25
384	0.24
385	0.23
386	0.21
387	0.16
388	0.15
389	0.16
390	0.14
391	0.12
392	0.11
393	0.11
394	0.09
395	0.09
396	0.11
397	0.09
398	0.11
399	0.11
400	0.12
401	0.13
402	0.14
403	0.15
404	0.14
405	0.16
406	0.16
407	0.18
408	0.19
409	0.18
410	0.17
411	0.16
412	0.16
413	0.14
414	0.13
415	0.1
416	0.11
417	0.13
418	0.14
419	0.19
420	0.18
421	0.24
422	0.26
423	0.26
424	0.31
425	0.34
426	0.38
427	0.39
428	0.44
429	0.41
430	0.41
431	0.46
432	0.44
433	0.42
434	0.36
435	0.31
436	0.27
437	0.26
438	0.23
439	0.22
440	0.22
441	0.24
442	0.32
443	0.4
444	0.4
445	0.41
446	0.45
447	0.48
448	0.49
449	0.47
450	0.43
451	0.37
452	0.39
453	0.38
454	0.35
455	0.29
456	0.25
457	0.21
458	0.19
459	0.17
460	0.12
461	0.14
462	0.15
463	0.15
464	0.13
465	0.12
466	0.12
467	0.11
468	0.13
469	0.11
470	0.09
471	0.08
472	0.09
473	0.15
474	0.2
475	0.21
476	0.2
477	0.23
478	0.24
479	0.26
480	0.27
481	0.26
482	0.29
483	0.34
484	0.37
485	0.38
486	0.36
487	0.36
488	0.37
489	0.36
490	0.28
491	0.21
492	0.18
493	0.17
494	0.17
495	0.15
496	0.13
497	0.1
498	0.09
499	0.09
500	0.1
501	0.08
502	0.08
503	0.1
504	0.11
505	0.12
506	0.13
507	0.13
508	0.12
509	0.15
510	0.16
511	0.17
512	0.15
513	0.15
514	0.15

V5EQJ7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer