Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5ECS7

Protein Details
Accession V5ECS7    Localization Confidence High Confidence Score 17.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
161-183ANGTKPSKSAKRRQKKKAAAAAAHydrophilic
202-221EAKARAPRAKREPKGKPTGEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
111-135KPKARRTRSKKGTESSSSSRAPRRA
164-179TKPSKSAKRRQKKKAA
204-218KARAPRAKREPKGKP
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 10.333, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MTDPNQSIVDPVANNVQPVTKNEDDDKKVFAGNLAFATTEDQLKSLFSEAGKVTHAQIITRGTRSLGYGFVTFSSETEAQTAIQLLNKRDVDGREISVESAKPQTAADAEKPKARRTRSKKGTESSSSSRAPRRARADEGEEGAAEEDAAKAVNGDEAKEANGTKPSKSAKRRQKKKAAAAAAGADGEAAATSGDAAAESSEAKARAPRAKREPKGKPTGEPSKTLVFVANLAFATTDDSLKAAFSDYKVKSAHVVKRRSGNRSKGFGFVDFEDASEQQRAIAAAQGKQIDGRDVTLQVAVQTDKEDQVEAAEATPAAAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.21
3 0.23
4 0.21
5 0.24
6 0.31
7 0.26
8 0.3
9 0.36
10 0.44
11 0.46
12 0.45
13 0.45
14 0.38
15 0.37
16 0.33
17 0.3
18 0.23
19 0.19
20 0.19
21 0.16
22 0.15
23 0.14
24 0.16
25 0.14
26 0.15
27 0.13
28 0.12
29 0.12
30 0.12
31 0.13
32 0.12
33 0.13
34 0.11
35 0.15
36 0.15
37 0.17
38 0.18
39 0.18
40 0.17
41 0.18
42 0.19
43 0.15
44 0.17
45 0.21
46 0.23
47 0.24
48 0.23
49 0.2
50 0.21
51 0.22
52 0.2
53 0.16
54 0.15
55 0.14
56 0.13
57 0.13
58 0.14
59 0.13
60 0.11
61 0.15
62 0.13
63 0.13
64 0.14
65 0.13
66 0.12
67 0.12
68 0.13
69 0.08
70 0.11
71 0.15
72 0.15
73 0.22
74 0.22
75 0.22
76 0.25
77 0.25
78 0.27
79 0.25
80 0.25
81 0.2
82 0.2
83 0.2
84 0.19
85 0.18
86 0.15
87 0.15
88 0.14
89 0.12
90 0.11
91 0.12
92 0.11
93 0.14
94 0.17
95 0.22
96 0.24
97 0.28
98 0.31
99 0.36
100 0.41
101 0.45
102 0.5
103 0.52
104 0.62
105 0.67
106 0.75
107 0.76
108 0.75
109 0.76
110 0.71
111 0.68
112 0.62
113 0.58
114 0.5
115 0.47
116 0.46
117 0.46
118 0.44
119 0.45
120 0.47
121 0.46
122 0.47
123 0.46
124 0.46
125 0.42
126 0.4
127 0.33
128 0.25
129 0.2
130 0.16
131 0.13
132 0.07
133 0.05
134 0.03
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.06
144 0.06
145 0.07
146 0.08
147 0.08
148 0.07
149 0.13
150 0.13
151 0.13
152 0.18
153 0.22
154 0.3
155 0.37
156 0.46
157 0.52
158 0.62
159 0.72
160 0.77
161 0.84
162 0.85
163 0.86
164 0.85
165 0.79
166 0.7
167 0.6
168 0.51
169 0.4
170 0.31
171 0.21
172 0.12
173 0.07
174 0.05
175 0.03
176 0.03
177 0.02
178 0.02
179 0.02
180 0.02
181 0.02
182 0.02
183 0.02
184 0.02
185 0.03
186 0.03
187 0.04
188 0.06
189 0.06
190 0.07
191 0.09
192 0.14
193 0.21
194 0.26
195 0.34
196 0.43
197 0.54
198 0.61
199 0.68
200 0.74
201 0.76
202 0.81
203 0.75
204 0.69
205 0.68
206 0.71
207 0.63
208 0.57
209 0.51
210 0.44
211 0.42
212 0.38
213 0.3
214 0.2
215 0.19
216 0.16
217 0.14
218 0.1
219 0.09
220 0.09
221 0.08
222 0.1
223 0.09
224 0.09
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.07
231 0.08
232 0.09
233 0.18
234 0.19
235 0.24
236 0.25
237 0.25
238 0.29
239 0.36
240 0.43
241 0.43
242 0.49
243 0.48
244 0.57
245 0.63
246 0.67
247 0.68
248 0.7
249 0.69
250 0.7
251 0.67
252 0.63
253 0.59
254 0.52
255 0.46
256 0.37
257 0.34
258 0.27
259 0.25
260 0.21
261 0.2
262 0.2
263 0.17
264 0.16
265 0.11
266 0.12
267 0.12
268 0.1
269 0.15
270 0.15
271 0.16
272 0.21
273 0.22
274 0.21
275 0.22
276 0.23
277 0.22
278 0.19
279 0.19
280 0.18
281 0.18
282 0.18
283 0.17
284 0.17
285 0.14
286 0.16
287 0.14
288 0.12
289 0.14
290 0.15
291 0.16
292 0.16
293 0.16
294 0.14
295 0.14
296 0.16
297 0.14
298 0.13
299 0.12
300 0.11