Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5A879

Protein Details
Accession Q5A879    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-57MPTTRSSRRRSIARLKELQDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) plas 22, pero 2, mito 1, cyto 1, E.R. 1, cyto_mito 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016439  Lag1/Lac1-like  
IPR006634  TLC-dom  
IPR013599  TRAM1  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0050291  F:sphingosine N-acyltransferase activity  
GO:0046513  P:ceramide biosynthetic process  
GO:0044182  P:filamentous growth of a population of unicellular organisms  
GO:0007009  P:plasma membrane organization  
GO:0009826  P:unidimensional cell growth  
KEGG cal:CAALFM_CR01060WA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08390  TRAM1  
PF03798  TRAM_LAG1_CLN8  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50922  TLC  
Amino Acid Sequences MSSSSSSLGVPHENPIRHRSSSVGRIDVGDTSASLSTMPTTRSSRRRSIARLKELQDNSTTDSAIVHKLYVGFRELTYRHTWIIPLIVLLMAFGTYYLSSPSGKVHQVLEDMIIPSYHIPGTDQYGKGGNDFKFVGFYAIFFTFLREFMMCCVLRPISVWFGIKKEAKQKRFLEQTYAMFYYGITGPFGLWIMRRLPLWYFNTTQFYINYPHKTHDIYFKIYYLGQAAFWVQQSVVLILQLEKPRKDFKELVLHHIITIALIWCSYRFHFTWMGLAVYITMDISDFFLALSKTLNYLESPITGPFFVIFIGVWIYLRHYINLQILWSVLTEFRTVGDFELNWITQQYKCWISQPITFFLIFALQLVNFYWLVLIFRILYRYVFTGVSKDERSDDEDEDEDSEDSADEKKKEQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.43
3 0.46
4 0.43
5 0.43
6 0.42
7 0.43
8 0.48
9 0.5
10 0.46
11 0.41
12 0.41
13 0.41
14 0.36
15 0.29
16 0.2
17 0.14
18 0.13
19 0.12
20 0.11
21 0.09
22 0.09
23 0.1
24 0.12
25 0.13
26 0.16
27 0.22
28 0.31
29 0.41
30 0.48
31 0.54
32 0.6
33 0.66
34 0.71
35 0.76
36 0.78
37 0.79
38 0.8
39 0.75
40 0.77
41 0.71
42 0.64
43 0.57
44 0.48
45 0.43
46 0.35
47 0.32
48 0.22
49 0.21
50 0.2
51 0.19
52 0.17
53 0.13
54 0.13
55 0.16
56 0.17
57 0.17
58 0.18
59 0.16
60 0.16
61 0.22
62 0.21
63 0.23
64 0.26
65 0.27
66 0.26
67 0.25
68 0.25
69 0.2
70 0.22
71 0.17
72 0.13
73 0.11
74 0.09
75 0.08
76 0.08
77 0.06
78 0.04
79 0.04
80 0.03
81 0.04
82 0.04
83 0.04
84 0.06
85 0.07
86 0.08
87 0.09
88 0.11
89 0.15
90 0.16
91 0.17
92 0.18
93 0.18
94 0.19
95 0.19
96 0.17
97 0.15
98 0.14
99 0.13
100 0.11
101 0.1
102 0.09
103 0.1
104 0.08
105 0.07
106 0.07
107 0.08
108 0.14
109 0.19
110 0.19
111 0.19
112 0.23
113 0.23
114 0.24
115 0.29
116 0.24
117 0.21
118 0.21
119 0.2
120 0.17
121 0.17
122 0.17
123 0.11
124 0.11
125 0.11
126 0.11
127 0.12
128 0.11
129 0.13
130 0.12
131 0.12
132 0.13
133 0.1
134 0.1
135 0.1
136 0.16
137 0.14
138 0.13
139 0.16
140 0.15
141 0.14
142 0.15
143 0.16
144 0.12
145 0.14
146 0.15
147 0.14
148 0.15
149 0.21
150 0.22
151 0.24
152 0.32
153 0.39
154 0.41
155 0.49
156 0.51
157 0.54
158 0.59
159 0.57
160 0.53
161 0.49
162 0.47
163 0.42
164 0.39
165 0.31
166 0.23
167 0.21
168 0.17
169 0.14
170 0.12
171 0.07
172 0.07
173 0.06
174 0.07
175 0.07
176 0.05
177 0.05
178 0.06
179 0.07
180 0.09
181 0.09
182 0.1
183 0.11
184 0.16
185 0.19
186 0.2
187 0.21
188 0.23
189 0.26
190 0.26
191 0.26
192 0.21
193 0.2
194 0.21
195 0.23
196 0.25
197 0.23
198 0.23
199 0.24
200 0.25
201 0.24
202 0.28
203 0.27
204 0.27
205 0.27
206 0.25
207 0.25
208 0.23
209 0.22
210 0.16
211 0.13
212 0.08
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.06
219 0.06
220 0.07
221 0.07
222 0.06
223 0.05
224 0.05
225 0.06
226 0.1
227 0.14
228 0.17
229 0.17
230 0.2
231 0.26
232 0.28
233 0.33
234 0.31
235 0.32
236 0.4
237 0.41
238 0.45
239 0.44
240 0.42
241 0.36
242 0.34
243 0.28
244 0.17
245 0.16
246 0.1
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.06
252 0.07
253 0.11
254 0.1
255 0.14
256 0.16
257 0.17
258 0.19
259 0.19
260 0.18
261 0.15
262 0.14
263 0.11
264 0.08
265 0.08
266 0.05
267 0.04
268 0.03
269 0.03
270 0.05
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.07
278 0.06
279 0.08
280 0.08
281 0.09
282 0.08
283 0.1
284 0.11
285 0.11
286 0.12
287 0.12
288 0.12
289 0.12
290 0.11
291 0.09
292 0.09
293 0.07
294 0.06
295 0.05
296 0.05
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.08
302 0.13
303 0.13
304 0.13
305 0.13
306 0.17
307 0.19
308 0.2
309 0.18
310 0.14
311 0.13
312 0.13
313 0.12
314 0.1
315 0.08
316 0.09
317 0.09
318 0.09
319 0.09
320 0.1
321 0.11
322 0.11
323 0.12
324 0.11
325 0.12
326 0.16
327 0.16
328 0.15
329 0.15
330 0.16
331 0.15
332 0.18
333 0.2
334 0.2
335 0.22
336 0.25
337 0.3
338 0.32
339 0.36
340 0.37
341 0.37
342 0.36
343 0.34
344 0.31
345 0.25
346 0.23
347 0.17
348 0.13
349 0.1
350 0.07
351 0.08
352 0.09
353 0.11
354 0.09
355 0.09
356 0.09
357 0.08
358 0.1
359 0.09
360 0.1
361 0.09
362 0.1
363 0.12
364 0.13
365 0.13
366 0.14
367 0.15
368 0.16
369 0.17
370 0.17
371 0.18
372 0.22
373 0.27
374 0.27
375 0.27
376 0.27
377 0.28
378 0.32
379 0.33
380 0.31
381 0.28
382 0.28
383 0.27
384 0.26
385 0.25
386 0.2
387 0.16
388 0.15
389 0.11
390 0.11
391 0.15
392 0.19