Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5ESW5

Protein Details
Accession V5ESW5    Localization Confidence High Confidence Score 18.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-31MSKELKTKSKDKSKRRESKSGSESPKKSRKSBasic
313-336AEESEGKKKGSKSKRKSTSAVEVAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-30KTKSKDKSKRRESKSGSESPKKSRK
318-328GKKKGSKSKRK
348-353EKKRRK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, mito 5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041901  RNAP_I_Rpa43_N  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
CDD cd04328  RNAP_I_Rpa43_N  
Amino Acid Sequences MSKELKTKSKDKSKRRESKSGSESPKKSRKSSSSSLPITVTDDDSSATTAVTSSVPSSSRTVSTAFETLYPILNLPIPPVWTSDPYSAFSDLMDTLVMRYVPQLSGVLITHSPTRFLQDTAVFSADSAFATAQVGFECTVWRPKIGQMLEGTICLSSPSHVSLLLYGLFNASIPASHLPEEEWEFVLNDPDAVHTDHGLGHWRNRATGDRLGGEKGKLEFTVISLTIANHMLSLHGSLLDDPFKGPPPTLDRSYLKKSLLPTQALGLGSAAAARESPAATPPRRVRWQDEDDSEAVESDDPSKYETPAEVVKAEESEGKKKGSKSKRKSTSAVEVAADTDGLNTPSREKKRRKET
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.9
2 0.9
3 0.91
4 0.88
5 0.88
6 0.87
7 0.86
8 0.84
9 0.84
10 0.82
11 0.81
12 0.82
13 0.78
14 0.75
15 0.75
16 0.73
17 0.71
18 0.72
19 0.72
20 0.73
21 0.7
22 0.66
23 0.58
24 0.5
25 0.45
26 0.39
27 0.31
28 0.22
29 0.18
30 0.16
31 0.15
32 0.15
33 0.12
34 0.1
35 0.07
36 0.07
37 0.08
38 0.07
39 0.07
40 0.07
41 0.1
42 0.11
43 0.13
44 0.15
45 0.16
46 0.17
47 0.18
48 0.19
49 0.18
50 0.21
51 0.2
52 0.19
53 0.17
54 0.18
55 0.17
56 0.17
57 0.16
58 0.13
59 0.12
60 0.13
61 0.12
62 0.12
63 0.13
64 0.13
65 0.13
66 0.16
67 0.17
68 0.18
69 0.21
70 0.23
71 0.24
72 0.25
73 0.27
74 0.25
75 0.23
76 0.2
77 0.18
78 0.14
79 0.12
80 0.1
81 0.07
82 0.06
83 0.08
84 0.08
85 0.06
86 0.07
87 0.08
88 0.08
89 0.09
90 0.09
91 0.08
92 0.09
93 0.09
94 0.1
95 0.09
96 0.1
97 0.13
98 0.13
99 0.15
100 0.13
101 0.18
102 0.17
103 0.17
104 0.19
105 0.18
106 0.2
107 0.2
108 0.2
109 0.16
110 0.15
111 0.15
112 0.12
113 0.09
114 0.08
115 0.06
116 0.05
117 0.06
118 0.06
119 0.05
120 0.05
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.07
125 0.07
126 0.13
127 0.13
128 0.14
129 0.14
130 0.16
131 0.23
132 0.22
133 0.24
134 0.19
135 0.22
136 0.21
137 0.2
138 0.18
139 0.11
140 0.11
141 0.08
142 0.07
143 0.05
144 0.05
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.07
149 0.06
150 0.07
151 0.08
152 0.07
153 0.06
154 0.06
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.04
159 0.03
160 0.04
161 0.05
162 0.06
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.09
167 0.11
168 0.11
169 0.1
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.1
174 0.08
175 0.06
176 0.05
177 0.06
178 0.07
179 0.07
180 0.07
181 0.06
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.12
186 0.12
187 0.15
188 0.19
189 0.19
190 0.19
191 0.21
192 0.24
193 0.23
194 0.25
195 0.24
196 0.22
197 0.22
198 0.24
199 0.23
200 0.2
201 0.18
202 0.15
203 0.14
204 0.12
205 0.12
206 0.1
207 0.1
208 0.12
209 0.1
210 0.09
211 0.09
212 0.09
213 0.1
214 0.1
215 0.09
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.06
220 0.07
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.07
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.09
230 0.12
231 0.13
232 0.13
233 0.15
234 0.21
235 0.26
236 0.28
237 0.33
238 0.33
239 0.39
240 0.46
241 0.46
242 0.42
243 0.39
244 0.39
245 0.42
246 0.44
247 0.39
248 0.34
249 0.31
250 0.33
251 0.3
252 0.27
253 0.18
254 0.12
255 0.1
256 0.09
257 0.08
258 0.04
259 0.04
260 0.05
261 0.06
262 0.06
263 0.07
264 0.12
265 0.19
266 0.2
267 0.29
268 0.35
269 0.43
270 0.51
271 0.55
272 0.57
273 0.6
274 0.66
275 0.65
276 0.62
277 0.58
278 0.5
279 0.47
280 0.39
281 0.3
282 0.23
283 0.16
284 0.13
285 0.1
286 0.11
287 0.1
288 0.14
289 0.14
290 0.15
291 0.16
292 0.16
293 0.17
294 0.19
295 0.21
296 0.18
297 0.18
298 0.18
299 0.17
300 0.18
301 0.2
302 0.21
303 0.25
304 0.28
305 0.31
306 0.35
307 0.4
308 0.5
309 0.55
310 0.62
311 0.66
312 0.74
313 0.81
314 0.83
315 0.84
316 0.82
317 0.81
318 0.76
319 0.69
320 0.59
321 0.49
322 0.42
323 0.36
324 0.28
325 0.17
326 0.12
327 0.1
328 0.11
329 0.12
330 0.12
331 0.17
332 0.27
333 0.37
334 0.46
335 0.55