FuNGI

V5F0C8

Protein Details

Accession

V5F0C8

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
179-203	IDSTAKRLSSQRKPKSKRKAPEGYA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
188-198	SQRKPKSKRKA

Subcellular Location(s)

cyto 19, cyto_nucl 13.833, nucl 6.5, mito_nucl 4.166

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013915 Pre-mRNA_splic_Prp19 IPR038959 Prp19 IPR003613 Ubox_domain IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf IPR013083 Znf_RING/FYVE/PHD
Gene Ontology	GO:0000974 C:Prp19 complex GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0061630 F:ubiquitin protein ligase activity GO:0006281 P:DNA repair GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome GO:0070534 P:protein K63-linked ubiquitination
Pfam	View protein in Pfam PF08606 Prp19 PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS51698 U_BOX PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION
CDD	cd16656 RING-Ubox_PRP19 cd00200 WD40

Amino Acid Sequences

MFCAISGEPPKVPVISKKSGLVYEQRLIQKYINDNGKDPVTGDTLELDDLIEIKSSPKAAAPRPPQHSSIPSLLTSLQNEYDAIILETFTLKKHYDNLRQELAHALYANDASARVIARLLNERDQAREALASIQGTIGAGPSTSRAAQDVEMSDSTQAENGAASAAGASGLPADVLDVIDSTAKRLSSQRKPKSKRKAPEGYATQATVADFAELQKLPSMHHAKPAGVSCLALSVDGNVLVTGGNDKNVQVFDRKEERVLATLKGHTKRITQVAVSGKSDNPLGSEAASDDAALPAYIVSASEDGKVKVWEPSGATGAKSQAYALSNTADAHASEVTGVDIHPSETFYGSVGRDGKLSFRSLADGSELHTLTSGEDDSFESFSFHPDGQLAAAGTPTGAIRIWEIKSGNAPSLIQTELPGRVSSLHFSENGYYLAAASDAGKAVEVWDLRKLTVIGKLAIEEEGATGVSAVKFDPSLQFLAVATDSVNVYANKSWNRLIKVEGAEKLTGLEWDARDGSVVVSSLDRTVRTFGVAA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.34
2	0.38
3	0.4
4	0.43
5	0.45
6	0.46
7	0.47
8	0.46
9	0.44
10	0.42
11	0.46
12	0.48
13	0.47
14	0.47
15	0.45
16	0.44
17	0.43
18	0.47
19	0.49
20	0.45
21	0.44
22	0.46
23	0.45
24	0.38
25	0.33
26	0.28
27	0.22
28	0.2
29	0.19
30	0.16
31	0.15
32	0.15
33	0.14
34	0.11
35	0.08
36	0.08
37	0.08
38	0.07
39	0.06
40	0.08
41	0.1
42	0.11
43	0.11
44	0.15
45	0.21
46	0.26
47	0.36
48	0.45
49	0.52
50	0.59
51	0.62
52	0.61
53	0.6
54	0.59
55	0.55
56	0.49
57	0.43
58	0.36
59	0.33
60	0.32
61	0.29
62	0.27
63	0.24
64	0.2
65	0.17
66	0.17
67	0.16
68	0.14
69	0.12
70	0.11
71	0.08
72	0.07
73	0.07
74	0.09
75	0.09
76	0.09
77	0.12
78	0.12
79	0.14
80	0.22
81	0.31
82	0.39
83	0.47
84	0.53
85	0.56
86	0.55
87	0.54
88	0.51
89	0.43
90	0.35
91	0.27
92	0.2
93	0.15
94	0.15
95	0.14
96	0.09
97	0.08
98	0.07
99	0.08
100	0.08
101	0.07
102	0.08
103	0.09
104	0.11
105	0.19
106	0.22
107	0.25
108	0.29
109	0.3
110	0.31
111	0.33
112	0.3
113	0.24
114	0.21
115	0.17
116	0.14
117	0.15
118	0.12
119	0.1
120	0.1
121	0.09
122	0.08
123	0.07
124	0.06
125	0.04
126	0.04
127	0.04
128	0.05
129	0.07
130	0.08
131	0.08
132	0.09
133	0.1
134	0.11
135	0.13
136	0.13
137	0.15
138	0.14
139	0.15
140	0.14
141	0.13
142	0.12
143	0.1
144	0.09
145	0.06
146	0.06
147	0.05
148	0.05
149	0.04
150	0.04
151	0.03
152	0.03
153	0.03
154	0.03
155	0.03
156	0.03
157	0.03
158	0.03
159	0.03
160	0.03
161	0.03
162	0.03
163	0.03
164	0.03
165	0.04
166	0.06
167	0.06
168	0.07
169	0.09
170	0.09
171	0.1
172	0.17
173	0.26
174	0.34
175	0.45
176	0.54
177	0.63
178	0.72
179	0.81
180	0.86
181	0.87
182	0.86
183	0.85
184	0.85
185	0.79
186	0.8
187	0.75
188	0.68
189	0.6
190	0.5
191	0.4
192	0.31
193	0.26
194	0.17
195	0.12
196	0.07
197	0.06
198	0.06
199	0.09
200	0.08
201	0.08
202	0.09
203	0.1
204	0.1
205	0.18
206	0.24
207	0.21
208	0.27
209	0.28
210	0.27
211	0.29
212	0.3
213	0.24
214	0.19
215	0.18
216	0.12
217	0.12
218	0.12
219	0.09
220	0.07
221	0.05
222	0.05
223	0.05
224	0.05
225	0.03
226	0.04
227	0.03
228	0.03
229	0.05
230	0.05
231	0.06
232	0.07
233	0.07
234	0.08
235	0.08
236	0.09
237	0.1
238	0.11
239	0.15
240	0.21
241	0.22
242	0.21
243	0.22
244	0.22
245	0.23
246	0.23
247	0.2
248	0.16
249	0.19
250	0.24
251	0.25
252	0.26
253	0.24
254	0.24
255	0.26
256	0.27
257	0.25
258	0.19
259	0.23
260	0.26
261	0.27
262	0.26
263	0.25
264	0.21
265	0.2
266	0.21
267	0.15
268	0.11
269	0.1
270	0.09
271	0.07
272	0.07
273	0.07
274	0.07
275	0.07
276	0.06
277	0.05
278	0.05
279	0.05
280	0.04
281	0.04
282	0.03
283	0.03
284	0.03
285	0.03
286	0.03
287	0.04
288	0.05
289	0.06
290	0.08
291	0.08
292	0.09
293	0.1
294	0.1
295	0.11
296	0.11
297	0.12
298	0.11
299	0.13
300	0.14
301	0.14
302	0.14
303	0.13
304	0.14
305	0.13
306	0.12
307	0.11
308	0.11
309	0.11
310	0.12
311	0.11
312	0.11
313	0.11
314	0.11
315	0.12
316	0.09
317	0.08
318	0.08
319	0.07
320	0.06
321	0.06
322	0.06
323	0.05
324	0.05
325	0.05
326	0.04
327	0.05
328	0.05
329	0.06
330	0.06
331	0.07
332	0.07
333	0.07
334	0.07
335	0.09
336	0.09
337	0.12
338	0.13
339	0.13
340	0.14
341	0.14
342	0.16
343	0.16
344	0.18
345	0.15
346	0.14
347	0.16
348	0.15
349	0.16
350	0.14
351	0.12
352	0.12
353	0.16
354	0.16
355	0.13
356	0.13
357	0.13
358	0.11
359	0.12
360	0.11
361	0.06
362	0.07
363	0.08
364	0.09
365	0.09
366	0.09
367	0.1
368	0.1
369	0.12
370	0.13
371	0.12
372	0.11
373	0.11
374	0.11
375	0.1
376	0.11
377	0.09
378	0.07
379	0.07
380	0.06
381	0.05
382	0.05
383	0.05
384	0.05
385	0.04
386	0.05
387	0.06
388	0.11
389	0.12
390	0.16
391	0.16
392	0.17
393	0.21
394	0.23
395	0.22
396	0.19
397	0.19
398	0.16
399	0.18
400	0.18
401	0.13
402	0.13
403	0.14
404	0.15
405	0.16
406	0.14
407	0.12
408	0.14
409	0.15
410	0.17
411	0.17
412	0.17
413	0.16
414	0.17
415	0.19
416	0.18
417	0.17
418	0.15
419	0.12
420	0.1
421	0.1
422	0.08
423	0.07
424	0.06
425	0.06
426	0.06
427	0.06
428	0.06
429	0.06
430	0.07
431	0.1
432	0.11
433	0.11
434	0.16
435	0.17
436	0.17
437	0.2
438	0.2
439	0.18
440	0.23
441	0.24
442	0.2
443	0.2
444	0.2
445	0.19
446	0.18
447	0.16
448	0.11
449	0.09
450	0.07
451	0.07
452	0.06
453	0.05
454	0.06
455	0.06
456	0.07
457	0.06
458	0.07
459	0.07
460	0.09
461	0.11
462	0.13
463	0.14
464	0.14
465	0.15
466	0.14
467	0.16
468	0.15
469	0.12
470	0.1
471	0.1
472	0.1
473	0.09
474	0.12
475	0.1
476	0.13
477	0.16
478	0.22
479	0.25
480	0.28
481	0.33
482	0.37
483	0.41
484	0.41
485	0.4
486	0.41
487	0.44
488	0.46
489	0.44
490	0.41
491	0.37
492	0.35
493	0.33
494	0.26
495	0.2
496	0.16
497	0.17
498	0.14
499	0.17
500	0.18
501	0.17
502	0.17
503	0.17
504	0.16
505	0.13
506	0.12
507	0.1
508	0.1
509	0.11
510	0.13
511	0.15
512	0.15
513	0.15
514	0.18
515	0.18

V5F0C8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer