FuNGI

V5GVC9

Protein Details

Accession

V5GVC9

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
85-112	GPQGAAKQPKKQPKKEAPKSQPSRQGNA	Hydrophilic
378-404	AAGSEGKGKKKSKKDKGKEKAKAGSAD	Basic
410-437	DNAKDGSVKKEKPKPKKGKKAPADVSAQ	Hydrophilic
476-501	TDGAAKAKPKPPRRKGGGAKYKDKSA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
90-104	AKQPKKQPKKEAPKS
311-373	KGKEKEREARNAAGKATPLLQHLRAIKLAKKESAAAIKKAKKQEKAAAKAGAAKGGSASGPAA
378-430	AAGSEGKGKKKSKKDKGKEKAKAGSADGAKAEDNAKDGSVKKEKPKPKKGKKA
471-499	PAGAATDGAAKAKPKPPRRKGGGAKYKDK

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 10.999, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MSQPDAGPSAPAAAASEGQASKVKAQQTNKAAQQHKATDNRSKAQQNKDRAAQNRARKAQNVTFVEDKDVDSASVAEASKASALGPQGAAKQPKKQPKKEAPKSQPSRQGNAGPTQFKSKVVIRRLPPNLPEEVFWKAVSPWVRDVADCKAPAAPAPAQTNPEASQSEAQAANTVATASTSSALTPTVDFKQYVAGKLKTDANKTNKHARAYVRFLDPQSLVQFHKAFDGHIFRDSKGKESVAIVEFAPYQKVVLPPSASGQRGRRARPDPKQGTIEKDADYLSFVERLNEASDDVKRSEGDLLASLHDPKGKEKEREARNAAGKATPLLQHLRAIKLAKKESAAAIKKAKKQEKAAAKAGAAKGGSASGPAAVISTAAGSEGKGKKKSKKDKGKEKAKAGSADGAKAEDNAKDGSVKKEKPKPKKGKKAPADVSAQASAEHSAQAQTVKPPPKGSTNKKTEAKADAVNKPAGAATDGAAKAKPKPPRRKGGGAKYKDKSAAASANSSSAQPANVQILKRD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.11
2	0.11
3	0.16
4	0.13
5	0.16
6	0.19
7	0.19
8	0.22
9	0.26
10	0.32
11	0.35
12	0.4
13	0.47
14	0.51
15	0.58
16	0.61
17	0.66
18	0.63
19	0.62
20	0.65
21	0.64
22	0.65
23	0.65
24	0.64
25	0.65
26	0.68
27	0.67
28	0.67
29	0.69
30	0.69
31	0.71
32	0.73
33	0.73
34	0.74
35	0.76
36	0.76
37	0.72
38	0.74
39	0.72
40	0.73
41	0.74
42	0.74
43	0.71
44	0.68
45	0.7
46	0.67
47	0.68
48	0.62
49	0.56
50	0.53
51	0.49
52	0.48
53	0.41
54	0.35
55	0.26
56	0.23
57	0.18
58	0.14
59	0.13
60	0.1
61	0.12
62	0.11
63	0.1
64	0.09
65	0.1
66	0.1
67	0.09
68	0.09
69	0.08
70	0.09
71	0.1
72	0.11
73	0.12
74	0.16
75	0.21
76	0.29
77	0.3
78	0.38
79	0.45
80	0.55
81	0.64
82	0.69
83	0.75
84	0.78
85	0.86
86	0.88
87	0.91
88	0.9
89	0.91
90	0.91
91	0.88
92	0.87
93	0.81
94	0.76
95	0.69
96	0.66
97	0.59
98	0.58
99	0.55
100	0.48
101	0.44
102	0.46
103	0.42
104	0.36
105	0.37
106	0.36
107	0.38
108	0.43
109	0.49
110	0.46
111	0.55
112	0.59
113	0.6
114	0.56
115	0.51
116	0.48
117	0.41
118	0.38
119	0.3
120	0.29
121	0.25
122	0.22
123	0.19
124	0.15
125	0.19
126	0.22
127	0.22
128	0.2
129	0.24
130	0.24
131	0.23
132	0.26
133	0.26
134	0.28
135	0.25
136	0.23
137	0.2
138	0.19
139	0.2
140	0.22
141	0.18
142	0.18
143	0.21
144	0.22
145	0.23
146	0.24
147	0.25
148	0.22
149	0.24
150	0.2
151	0.17
152	0.17
153	0.16
154	0.18
155	0.16
156	0.15
157	0.13
158	0.13
159	0.11
160	0.1
161	0.09
162	0.06
163	0.05
164	0.06
165	0.05
166	0.05
167	0.05
168	0.05
169	0.06
170	0.06
171	0.06
172	0.07
173	0.09
174	0.11
175	0.12
176	0.12
177	0.12
178	0.19
179	0.19
180	0.23
181	0.26
182	0.25
183	0.24
184	0.27
185	0.33
186	0.3
187	0.33
188	0.37
189	0.39
190	0.45
191	0.48
192	0.56
193	0.55
194	0.53
195	0.54
196	0.51
197	0.51
198	0.5
199	0.49
200	0.43
201	0.41
202	0.39
203	0.37
204	0.32
205	0.27
206	0.23
207	0.21
208	0.18
209	0.19
210	0.19
211	0.16
212	0.18
213	0.16
214	0.15
215	0.16
216	0.19
217	0.16
218	0.2
219	0.21
220	0.19
221	0.25
222	0.25
223	0.25
224	0.23
225	0.22
226	0.18
227	0.18
228	0.21
229	0.16
230	0.16
231	0.13
232	0.12
233	0.12
234	0.11
235	0.11
236	0.07
237	0.06
238	0.07
239	0.08
240	0.08
241	0.1
242	0.1
243	0.1
244	0.13
245	0.16
246	0.15
247	0.18
248	0.2
249	0.26
250	0.3
251	0.32
252	0.38
253	0.42
254	0.5
255	0.54
256	0.62
257	0.59
258	0.58
259	0.62
260	0.56
261	0.54
262	0.49
263	0.43
264	0.33
265	0.29
266	0.25
267	0.19
268	0.18
269	0.13
270	0.09
271	0.1
272	0.09
273	0.09
274	0.09
275	0.1
276	0.1
277	0.09
278	0.09
279	0.09
280	0.1
281	0.12
282	0.12
283	0.12
284	0.11
285	0.12
286	0.12
287	0.11
288	0.1
289	0.1
290	0.1
291	0.1
292	0.11
293	0.11
294	0.1
295	0.12
296	0.12
297	0.13
298	0.22
299	0.26
300	0.29
301	0.35
302	0.44
303	0.48
304	0.56
305	0.57
306	0.55
307	0.54
308	0.52
309	0.46
310	0.38
311	0.32
312	0.25
313	0.23
314	0.18
315	0.15
316	0.16
317	0.16
318	0.19
319	0.2
320	0.21
321	0.22
322	0.24
323	0.25
324	0.3
325	0.32
326	0.29
327	0.28
328	0.28
329	0.28
330	0.35
331	0.34
332	0.32
333	0.39
334	0.44
335	0.49
336	0.57
337	0.61
338	0.58
339	0.61
340	0.64
341	0.65
342	0.65
343	0.65
344	0.58
345	0.52
346	0.52
347	0.46
348	0.4
349	0.3
350	0.23
351	0.17
352	0.15
353	0.14
354	0.08
355	0.08
356	0.05
357	0.05
358	0.05
359	0.05
360	0.04
361	0.04
362	0.04
363	0.04
364	0.03
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.12
369	0.18
370	0.24
371	0.31
372	0.38
373	0.47
374	0.57
375	0.69
376	0.72
377	0.78
378	0.83
379	0.87
380	0.91
381	0.94
382	0.92
383	0.9
384	0.86
385	0.8
386	0.73
387	0.63
388	0.6
389	0.5
390	0.43
391	0.34
392	0.28
393	0.22
394	0.2
395	0.19
396	0.13
397	0.13
398	0.12
399	0.12
400	0.14
401	0.16
402	0.23
403	0.31
404	0.36
405	0.43
406	0.52
407	0.62
408	0.69
409	0.79
410	0.82
411	0.85
412	0.9
413	0.92
414	0.94
415	0.93
416	0.93
417	0.89
418	0.84
419	0.79
420	0.7
421	0.63
422	0.54
423	0.44
424	0.34
425	0.28
426	0.22
427	0.16
428	0.14
429	0.1
430	0.09
431	0.1
432	0.12
433	0.13
434	0.16
435	0.24
436	0.31
437	0.33
438	0.37
439	0.39
440	0.47
441	0.56
442	0.61
443	0.64
444	0.66
445	0.73
446	0.75
447	0.76
448	0.71
449	0.66
450	0.61
451	0.58
452	0.56
453	0.53
454	0.51
455	0.49
456	0.43
457	0.38
458	0.33
459	0.27
460	0.2
461	0.15
462	0.11
463	0.16
464	0.17
465	0.18
466	0.19
467	0.2
468	0.25
469	0.31
470	0.4
471	0.44
472	0.55
473	0.63
474	0.73
475	0.79
476	0.84
477	0.88
478	0.9
479	0.9
480	0.88
481	0.88
482	0.81
483	0.79
484	0.73
485	0.63
486	0.54
487	0.5
488	0.48
489	0.4
490	0.4
491	0.34
492	0.33
493	0.33
494	0.3
495	0.26
496	0.2
497	0.18
498	0.15
499	0.17
500	0.22
501	0.25

V5GVC9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer