Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5EPQ1

Protein Details
Accession V5EPQ1    Localization Confidence High Confidence Score 16.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MAKDESKKDKKSKRKSDVAAMDVHydrophilic
27-53TDVEASPSKKEKKEKKEKKAKLESAAIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-15KKDKKSKRK
34-47SKKEKKEKKEKKAK
83-115SKKLFKLTKKASKSRGHVKRGVKEVVKALRKGE
176-180KAAAK
Subcellular Location(s) cyto 12.5, nucl 9.5, cyto_mito 8.833, mito_nucl 7.333, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002415  H/ACA_rnp_Nhp2-like  
IPR029064  L30e-like  
IPR004038  Ribosomal_L7Ae/L30e/S12e/Gad45  
IPR018492  Ribosomal_L7Ae/L8/Nhp2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01248  Ribosomal_L7Ae  
Amino Acid Sequences MAKDESKKDKKSKRKSDVAAMDVDAVTDVEASPSKKEKKEKKEKKAKLESAAIDDDGSDDEEATPSTLEISPIAQPLAQAKMSKKLFKLTKKASKSRGHVKRGVKEVVKALRKGEKGLVVLAGDISPIDILSHIPVLCEDTSNPYIFVESKEALGAASATKRPTSVVMIVPGGGKKAAAKGKDASKAKEEYAEDYASLHKQVQTLSDQVAMAV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.9
2 0.87
3 0.87
4 0.85
5 0.77
6 0.68
7 0.58
8 0.49
9 0.39
10 0.32
11 0.22
12 0.13
13 0.09
14 0.07
15 0.06
16 0.06
17 0.08
18 0.1
19 0.13
20 0.21
21 0.28
22 0.34
23 0.44
24 0.53
25 0.62
26 0.73
27 0.8
28 0.84
29 0.89
30 0.91
31 0.92
32 0.93
33 0.88
34 0.83
35 0.79
36 0.7
37 0.63
38 0.56
39 0.45
40 0.33
41 0.26
42 0.2
43 0.13
44 0.12
45 0.07
46 0.06
47 0.06
48 0.06
49 0.07
50 0.07
51 0.06
52 0.05
53 0.07
54 0.07
55 0.07
56 0.07
57 0.08
58 0.09
59 0.09
60 0.1
61 0.08
62 0.08
63 0.09
64 0.11
65 0.12
66 0.13
67 0.14
68 0.22
69 0.25
70 0.28
71 0.28
72 0.33
73 0.39
74 0.44
75 0.52
76 0.53
77 0.6
78 0.64
79 0.7
80 0.71
81 0.71
82 0.7
83 0.71
84 0.71
85 0.68
86 0.67
87 0.67
88 0.64
89 0.62
90 0.61
91 0.51
92 0.43
93 0.42
94 0.42
95 0.39
96 0.34
97 0.31
98 0.32
99 0.32
100 0.31
101 0.28
102 0.23
103 0.2
104 0.2
105 0.18
106 0.12
107 0.11
108 0.1
109 0.08
110 0.05
111 0.04
112 0.03
113 0.03
114 0.03
115 0.03
116 0.03
117 0.03
118 0.04
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.09
124 0.08
125 0.09
126 0.09
127 0.13
128 0.15
129 0.15
130 0.16
131 0.13
132 0.14
133 0.14
134 0.15
135 0.13
136 0.12
137 0.12
138 0.12
139 0.11
140 0.1
141 0.1
142 0.09
143 0.06
144 0.08
145 0.1
146 0.11
147 0.11
148 0.12
149 0.13
150 0.14
151 0.17
152 0.17
153 0.18
154 0.19
155 0.19
156 0.2
157 0.2
158 0.19
159 0.16
160 0.12
161 0.1
162 0.09
163 0.15
164 0.2
165 0.2
166 0.23
167 0.28
168 0.35
169 0.44
170 0.47
171 0.45
172 0.45
173 0.47
174 0.45
175 0.46
176 0.4
177 0.36
178 0.35
179 0.32
180 0.26
181 0.24
182 0.26
183 0.21
184 0.21
185 0.19
186 0.17
187 0.18
188 0.19
189 0.21
190 0.22
191 0.23
192 0.23
193 0.23