Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5EFH2

Protein Details
Accession V5EFH2    Localization Confidence High Confidence Score 23.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
294-319VETASEREQRHRRERREQLRYKEAKEBasic
1028-1047DKMIKESKGSKKKSVKDHSVBasic
1160-1182EPASSTPAKRPRRTPTTPSKTVQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
303-323RHRRERREQLRYKEAKERQAK
334-335GK
449-465KKPNKLRAGAKKSASRR
552-557GKGKPA
1017-1024RIAKRVKE
1028-1040DKMIKESKGSKKK
1144-1151PAKRPRKS
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018327  BHD_2  
IPR004583  DNA_repair_Rad4  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR018325  Rad4/PNGase_transGLS-fold  
IPR018326  Rad4_beta-hairpin_dom1  
IPR018328  Rad4_beta-hairpin_dom3  
IPR042488  Rad4_BHD3_sf  
IPR002931  Transglutaminase-like  
IPR036985  Transglutaminase-like_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF10403  BHD_1  
PF10404  BHD_2  
PF10405  BHD_3  
PF03835  Rad4  
PF01841  Transglut_core  
Amino Acid Sequences MPSRNKAAAAPRAKPSASSKSSNQQPSSQDIVEISADESLGHGQNGHDDMDMSDFEDVDVEGQATAEGSQAGSDDLDMEDVDVEADQSAQDLQDMYAAAYRDIQAKYGDGTGDYDGEGGIEEDADQAADDGSSGSKQIPIFKDGKGQHRGVEISMGSKTSKQTDSPKQKSNNFLTPRDRQNRITAHKLLVLSMLAHTRVRNQWCNDGQLRDTLAETVPDYLITKLRSIHPKKVTEQRERIRMFESFLSDLVHWWSSRFRLDPTMVAKSALRQPDQDIATGVIPSSGRRVDGWIVETASEREQRHRRERREQLRYKEAKERQAKTDAEANGQGKGKGKARDTSSNGTSAAVSLKPPTKAMEITIFAPGSAIRPIYLRLLPAAEDIASPAGLKKRAEERSGSRETSAQLFCALCRSIGIPARLVVSPQPLSWSVGASKLANTAQPGSQADKKPNKLRAGAKKSASRRFASKPVNEFTSDDEDGTYSASGASSTARSKGSVRAISVDSLSSADEARASDTSKSKRKAAVGGKTAKDNEDLTKKAVLSAAAKTPNGKGKPARRGDQSSPITLDDTASDASSTRYVSSSKKTKAHAIVTATVKGKGKARQIETIEIEPLPGNREKSSDEDYRPDKWKNLKAPLKVEHKIKLRAFRPKQLKDSEVAGDDTTADPVDLQAPPTMWVEVFSKPYQKWITVDPVRSMIRPSGNRHMEPPGFDRQNKLIYVVAFEEDGYARDVTARYTKTLNSRVSRLRPPTRAKGEEDWWTKVVRSIHRPQKLDRDAMEDAELQDNSSREPMPSSMNGFKDHPIYFLEKFLKRDEVIFPRRQIATFQGTPVFAKSDVQTLRSSRQWFNEGRVVKDGEAALKWVKSRGYTLANKRAEEQAKLEGREVAQEGLYAEFQTQLYVPPPVGEDGVIPTNGFGNIDLFVPSMLPAGAVHLAYSGVAKVAKKLGVPYAEAITGFEFRKQRGMPKITGVVVAQQNAELVEEAFWQQEQQDALKQQTKKMERAMKNWRKLINAVRIAKRVKEQYGDKMIKESKGSKKKSVKDHSVGDEQDGGEKSRFFAPKSDAAEPAADVSLDTTAEDLDIDTPMDDIPEPTSAPSTAASTPSKRKKIISLAQLASTSSHPDDGNTSSDASPSPPPAEAPPAKRPRKSATRSDEAAEPASSTPAKRPRRTPTTPSKTVQAEPTSARRSARSRTSKAYAEPDTDVDDDAEADDGIVVQLDAPTADEEPSSRRTSRRITVKLTPKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.52
3 0.53
4 0.51
5 0.51
6 0.51
7 0.55
8 0.64
9 0.69
10 0.65
11 0.61
12 0.59
13 0.6
14 0.6
15 0.51
16 0.42
17 0.34
18 0.32
19 0.26
20 0.23
21 0.17
22 0.11
23 0.11
24 0.09
25 0.1
26 0.1
27 0.11
28 0.1
29 0.11
30 0.1
31 0.15
32 0.17
33 0.17
34 0.14
35 0.13
36 0.14
37 0.16
38 0.16
39 0.12
40 0.11
41 0.1
42 0.09
43 0.09
44 0.09
45 0.07
46 0.07
47 0.07
48 0.06
49 0.06
50 0.06
51 0.06
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.05
56 0.05
57 0.06
58 0.06
59 0.06
60 0.06
61 0.06
62 0.06
63 0.07
64 0.07
65 0.07
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.05
70 0.05
71 0.05
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.06
76 0.05
77 0.06
78 0.06
79 0.06
80 0.08
81 0.09
82 0.09
83 0.11
84 0.12
85 0.12
86 0.13
87 0.14
88 0.18
89 0.18
90 0.19
91 0.17
92 0.18
93 0.19
94 0.19
95 0.19
96 0.13
97 0.15
98 0.15
99 0.14
100 0.13
101 0.11
102 0.09
103 0.09
104 0.08
105 0.06
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.04
114 0.05
115 0.04
116 0.04
117 0.04
118 0.05
119 0.06
120 0.07
121 0.07
122 0.11
123 0.12
124 0.2
125 0.22
126 0.27
127 0.29
128 0.3
129 0.38
130 0.41
131 0.48
132 0.48
133 0.47
134 0.44
135 0.46
136 0.46
137 0.38
138 0.36
139 0.27
140 0.23
141 0.22
142 0.2
143 0.17
144 0.19
145 0.21
146 0.22
147 0.24
148 0.27
149 0.36
150 0.45
151 0.56
152 0.61
153 0.67
154 0.7
155 0.74
156 0.78
157 0.76
158 0.75
159 0.7
160 0.7
161 0.69
162 0.69
163 0.73
164 0.72
165 0.7
166 0.63
167 0.65
168 0.67
169 0.66
170 0.66
171 0.6
172 0.54
173 0.53
174 0.5
175 0.41
176 0.33
177 0.26
178 0.19
179 0.16
180 0.16
181 0.13
182 0.14
183 0.15
184 0.19
185 0.26
186 0.33
187 0.39
188 0.4
189 0.48
190 0.49
191 0.57
192 0.55
193 0.52
194 0.45
195 0.41
196 0.39
197 0.3
198 0.28
199 0.22
200 0.18
201 0.15
202 0.14
203 0.13
204 0.11
205 0.11
206 0.11
207 0.11
208 0.15
209 0.15
210 0.16
211 0.17
212 0.24
213 0.34
214 0.39
215 0.47
216 0.52
217 0.57
218 0.62
219 0.69
220 0.72
221 0.72
222 0.76
223 0.75
224 0.76
225 0.72
226 0.67
227 0.61
228 0.52
229 0.45
230 0.38
231 0.33
232 0.25
233 0.23
234 0.23
235 0.2
236 0.19
237 0.19
238 0.18
239 0.14
240 0.14
241 0.16
242 0.17
243 0.2
244 0.21
245 0.21
246 0.25
247 0.27
248 0.31
249 0.33
250 0.36
251 0.33
252 0.33
253 0.3
254 0.28
255 0.33
256 0.33
257 0.29
258 0.24
259 0.27
260 0.33
261 0.33
262 0.3
263 0.25
264 0.21
265 0.2
266 0.19
267 0.16
268 0.1
269 0.1
270 0.09
271 0.12
272 0.11
273 0.11
274 0.12
275 0.15
276 0.16
277 0.18
278 0.2
279 0.18
280 0.18
281 0.17
282 0.18
283 0.17
284 0.18
285 0.22
286 0.21
287 0.28
288 0.35
289 0.44
290 0.54
291 0.62
292 0.67
293 0.72
294 0.82
295 0.84
296 0.87
297 0.87
298 0.85
299 0.86
300 0.83
301 0.77
302 0.77
303 0.72
304 0.71
305 0.71
306 0.67
307 0.61
308 0.63
309 0.59
310 0.51
311 0.53
312 0.44
313 0.37
314 0.38
315 0.34
316 0.3
317 0.3
318 0.29
319 0.25
320 0.29
321 0.31
322 0.31
323 0.34
324 0.36
325 0.4
326 0.48
327 0.5
328 0.52
329 0.48
330 0.44
331 0.41
332 0.36
333 0.3
334 0.21
335 0.18
336 0.12
337 0.11
338 0.13
339 0.16
340 0.16
341 0.17
342 0.19
343 0.19
344 0.19
345 0.21
346 0.22
347 0.2
348 0.2
349 0.22
350 0.2
351 0.17
352 0.17
353 0.14
354 0.11
355 0.1
356 0.09
357 0.07
358 0.08
359 0.09
360 0.12
361 0.13
362 0.12
363 0.12
364 0.12
365 0.12
366 0.12
367 0.12
368 0.08
369 0.08
370 0.08
371 0.07
372 0.06
373 0.06
374 0.08
375 0.11
376 0.13
377 0.14
378 0.17
379 0.25
380 0.3
381 0.33
382 0.36
383 0.39
384 0.44
385 0.49
386 0.47
387 0.39
388 0.36
389 0.35
390 0.35
391 0.29
392 0.21
393 0.18
394 0.17
395 0.16
396 0.18
397 0.16
398 0.1
399 0.11
400 0.11
401 0.13
402 0.17
403 0.18
404 0.16
405 0.16
406 0.19
407 0.18
408 0.18
409 0.15
410 0.15
411 0.15
412 0.14
413 0.16
414 0.15
415 0.17
416 0.16
417 0.16
418 0.12
419 0.13
420 0.15
421 0.13
422 0.12
423 0.13
424 0.13
425 0.12
426 0.13
427 0.13
428 0.12
429 0.14
430 0.15
431 0.17
432 0.23
433 0.25
434 0.33
435 0.39
436 0.45
437 0.5
438 0.56
439 0.57
440 0.57
441 0.63
442 0.65
443 0.66
444 0.66
445 0.63
446 0.64
447 0.67
448 0.68
449 0.64
450 0.56
451 0.52
452 0.51
453 0.55
454 0.55
455 0.53
456 0.5
457 0.49
458 0.49
459 0.44
460 0.4
461 0.34
462 0.33
463 0.27
464 0.22
465 0.19
466 0.17
467 0.15
468 0.15
469 0.11
470 0.05
471 0.04
472 0.04
473 0.04
474 0.04
475 0.05
476 0.06
477 0.07
478 0.1
479 0.1
480 0.11
481 0.13
482 0.18
483 0.23
484 0.23
485 0.23
486 0.24
487 0.25
488 0.24
489 0.23
490 0.18
491 0.12
492 0.1
493 0.1
494 0.07
495 0.06
496 0.05
497 0.06
498 0.06
499 0.07
500 0.07
501 0.08
502 0.11
503 0.16
504 0.23
505 0.3
506 0.33
507 0.35
508 0.38
509 0.39
510 0.45
511 0.47
512 0.49
513 0.49
514 0.53
515 0.5
516 0.5
517 0.48
518 0.4
519 0.34
520 0.27
521 0.24
522 0.22
523 0.22
524 0.2
525 0.22
526 0.21
527 0.2
528 0.19
529 0.17
530 0.14
531 0.14
532 0.17
533 0.17
534 0.17
535 0.17
536 0.19
537 0.25
538 0.24
539 0.26
540 0.28
541 0.34
542 0.44
543 0.48
544 0.51
545 0.49
546 0.55
547 0.54
548 0.58
549 0.52
550 0.44
551 0.4
552 0.35
553 0.3
554 0.24
555 0.2
556 0.1
557 0.09
558 0.08
559 0.07
560 0.06
561 0.06
562 0.06
563 0.07
564 0.07
565 0.06
566 0.07
567 0.09
568 0.12
569 0.18
570 0.25
571 0.3
572 0.35
573 0.36
574 0.41
575 0.45
576 0.45
577 0.42
578 0.37
579 0.36
580 0.33
581 0.35
582 0.29
583 0.27
584 0.25
585 0.23
586 0.24
587 0.24
588 0.28
589 0.31
590 0.33
591 0.36
592 0.38
593 0.4
594 0.38
595 0.34
596 0.29
597 0.23
598 0.2
599 0.14
600 0.12
601 0.11
602 0.11
603 0.11
604 0.11
605 0.12
606 0.13
607 0.17
608 0.22
609 0.24
610 0.24
611 0.28
612 0.3
613 0.34
614 0.37
615 0.35
616 0.34
617 0.37
618 0.42
619 0.43
620 0.5
621 0.52
622 0.51
623 0.56
624 0.58
625 0.59
626 0.56
627 0.53
628 0.5
629 0.49
630 0.53
631 0.5
632 0.5
633 0.47
634 0.54
635 0.54
636 0.56
637 0.61
638 0.58
639 0.62
640 0.58
641 0.54
642 0.45
643 0.44
644 0.37
645 0.29
646 0.24
647 0.17
648 0.13
649 0.12
650 0.11
651 0.08
652 0.06
653 0.05
654 0.04
655 0.04
656 0.06
657 0.05
658 0.06
659 0.06
660 0.07
661 0.08
662 0.09
663 0.09
664 0.07
665 0.09
666 0.1
667 0.11
668 0.14
669 0.14
670 0.18
671 0.17
672 0.24
673 0.23
674 0.23
675 0.22
676 0.22
677 0.3
678 0.3
679 0.32
680 0.27
681 0.3
682 0.3
683 0.29
684 0.27
685 0.21
686 0.22
687 0.25
688 0.28
689 0.34
690 0.37
691 0.37
692 0.38
693 0.41
694 0.36
695 0.34
696 0.33
697 0.32
698 0.31
699 0.31
700 0.32
701 0.29
702 0.32
703 0.3
704 0.27
705 0.21
706 0.17
707 0.18
708 0.16
709 0.13
710 0.1
711 0.09
712 0.09
713 0.07
714 0.07
715 0.08
716 0.07
717 0.06
718 0.07
719 0.08
720 0.09
721 0.14
722 0.14
723 0.14
724 0.15
725 0.18
726 0.24
727 0.31
728 0.36
729 0.33
730 0.38
731 0.43
732 0.47
733 0.52
734 0.54
735 0.54
736 0.56
737 0.6
738 0.64
739 0.65
740 0.63
741 0.6
742 0.56
743 0.52
744 0.53
745 0.5
746 0.44
747 0.37
748 0.34
749 0.29
750 0.29
751 0.3
752 0.27
753 0.31
754 0.38
755 0.46
756 0.52
757 0.55
758 0.54
759 0.6
760 0.59
761 0.55
762 0.46
763 0.43
764 0.37
765 0.35
766 0.33
767 0.23
768 0.2
769 0.18
770 0.17
771 0.11
772 0.12
773 0.11
774 0.1
775 0.12
776 0.11
777 0.09
778 0.1
779 0.11
780 0.13
781 0.14
782 0.18
783 0.21
784 0.23
785 0.25
786 0.25
787 0.25
788 0.26
789 0.25
790 0.21
791 0.19
792 0.21
793 0.2
794 0.24
795 0.29
796 0.27
797 0.29
798 0.3
799 0.31
800 0.28
801 0.29
802 0.3
803 0.33
804 0.38
805 0.4
806 0.4
807 0.41
808 0.41
809 0.39
810 0.35
811 0.3
812 0.3
813 0.26
814 0.26
815 0.23
816 0.23
817 0.23
818 0.22
819 0.19
820 0.12
821 0.12
822 0.11
823 0.16
824 0.17
825 0.19
826 0.21
827 0.22
828 0.26
829 0.3
830 0.34
831 0.3
832 0.33
833 0.36
834 0.35
835 0.37
836 0.4
837 0.37
838 0.35
839 0.35
840 0.33
841 0.27
842 0.28
843 0.23
844 0.18
845 0.16
846 0.15
847 0.13
848 0.13
849 0.14
850 0.14
851 0.15
852 0.14
853 0.16
854 0.19
855 0.25
856 0.32
857 0.4
858 0.48
859 0.5
860 0.5
861 0.5
862 0.53
863 0.47
864 0.41
865 0.35
866 0.34
867 0.35
868 0.35
869 0.34
870 0.28
871 0.26
872 0.26
873 0.25
874 0.17
875 0.12
876 0.11
877 0.11
878 0.1
879 0.1
880 0.08
881 0.07
882 0.08
883 0.08
884 0.08
885 0.07
886 0.08
887 0.09
888 0.1
889 0.09
890 0.09
891 0.1
892 0.1
893 0.1
894 0.09
895 0.08
896 0.1
897 0.11
898 0.11
899 0.09
900 0.09
901 0.09
902 0.09
903 0.09
904 0.07
905 0.06
906 0.06
907 0.07
908 0.07
909 0.07
910 0.07
911 0.06
912 0.06
913 0.06
914 0.05
915 0.05
916 0.04
917 0.06
918 0.07
919 0.07
920 0.07
921 0.06
922 0.07
923 0.06
924 0.07
925 0.05
926 0.05
927 0.07
928 0.08
929 0.1
930 0.13
931 0.14
932 0.15
933 0.16
934 0.2
935 0.2
936 0.21
937 0.21
938 0.19
939 0.19
940 0.18
941 0.16
942 0.13
943 0.15
944 0.14
945 0.17
946 0.18
947 0.18
948 0.25
949 0.26
950 0.32
951 0.39
952 0.44
953 0.41
954 0.44
955 0.48
956 0.42
957 0.41
958 0.34
959 0.3
960 0.27
961 0.25
962 0.2
963 0.16
964 0.15
965 0.14
966 0.14
967 0.08
968 0.06
969 0.06
970 0.07
971 0.07
972 0.07
973 0.07
974 0.07
975 0.07
976 0.09
977 0.1
978 0.11
979 0.16
980 0.18
981 0.23
982 0.3
983 0.31
984 0.33
985 0.42
986 0.45
987 0.45
988 0.51
989 0.57
990 0.56
991 0.63
992 0.7
993 0.71
994 0.74
995 0.76
996 0.7
997 0.63
998 0.63
999 0.63
1000 0.61
1001 0.6
1002 0.6
1003 0.58
1004 0.61
1005 0.61
1006 0.58
1007 0.56
1008 0.52
1009 0.47
1010 0.47
1011 0.46
1012 0.48
1013 0.56
1014 0.56
1015 0.5
1016 0.52
1017 0.51
1018 0.46
1019 0.47
1020 0.46
1021 0.46
1022 0.53
1023 0.58
1024 0.61
1025 0.67
1026 0.72
1027 0.78
1028 0.8
1029 0.79
1030 0.76
1031 0.78
1032 0.74
1033 0.71
1034 0.64
1035 0.55
1036 0.48
1037 0.38
1038 0.35
1039 0.29
1040 0.26
1041 0.2
1042 0.19
1043 0.19
1044 0.24
1045 0.26
1046 0.23
1047 0.27
1048 0.3
1049 0.36
1050 0.42
1051 0.42
1052 0.37
1053 0.36
1054 0.36
1055 0.3
1056 0.26
1057 0.19
1058 0.13
1059 0.1
1060 0.09
1061 0.08
1062 0.07
1063 0.07
1064 0.06
1065 0.05
1066 0.05
1067 0.06
1068 0.05
1069 0.05
1070 0.06
1071 0.06
1072 0.06
1073 0.06
1074 0.06
1075 0.07
1076 0.07
1077 0.07
1078 0.08
1079 0.1
1080 0.1
1081 0.1
1082 0.12
1083 0.12
1084 0.13
1085 0.13
1086 0.14
1087 0.14
1088 0.19
1089 0.23
1090 0.27
1091 0.37
1092 0.46
1093 0.53
1094 0.53
1095 0.55
1096 0.59
1097 0.65
1098 0.67
1099 0.66
1100 0.65
1101 0.6
1102 0.59
1103 0.56
1104 0.48
1105 0.4
1106 0.32
1107 0.27
1108 0.18
1109 0.19
1110 0.16
1111 0.16
1112 0.19
1113 0.2
1114 0.22
1115 0.19
1116 0.21
1117 0.18
1118 0.19
1119 0.19
1120 0.18
1121 0.19
1122 0.2
1123 0.2
1124 0.18
1125 0.2
1126 0.22
1127 0.31
1128 0.34
1129 0.38
1130 0.46
1131 0.54
1132 0.62
1133 0.65
1134 0.69
1135 0.69
1136 0.73
1137 0.74
1138 0.74
1139 0.72
1140 0.73
1141 0.71
1142 0.67
1143 0.62
1144 0.54
1145 0.49
1146 0.38
1147 0.31
1148 0.23
1149 0.24
1150 0.23
1151 0.19
1152 0.25
1153 0.33
1154 0.42
1155 0.48
1156 0.57
1157 0.63
1158 0.72
1159 0.79
1160 0.8
1161 0.82
1162 0.82
1163 0.82
1164 0.76
1165 0.73
1166 0.68
1167 0.64
1168 0.62
1169 0.54
1170 0.49
1171 0.46
1172 0.51
1173 0.49
1174 0.47
1175 0.45
1176 0.44
1177 0.46
1178 0.49
1179 0.55
1180 0.57
1181 0.59
1182 0.64
1183 0.68
1184 0.67
1185 0.68
1186 0.67
1187 0.61
1188 0.55
1189 0.51
1190 0.44
1191 0.41
1192 0.36
1193 0.31
1194 0.23
1195 0.19
1196 0.15
1197 0.13
1198 0.12
1199 0.08
1200 0.07
1201 0.06
1202 0.06
1203 0.05
1204 0.05
1205 0.05
1206 0.04
1207 0.05
1208 0.05
1209 0.05
1210 0.06
1211 0.08
1212 0.08
1213 0.09
1214 0.09
1215 0.11
1216 0.15
1217 0.2
1218 0.24
1219 0.27
1220 0.3
1221 0.36
1222 0.44
1223 0.52
1224 0.59
1225 0.61
1226 0.64
1227 0.7