Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5F0L8

Protein Details
Accession V5F0L8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
168-189NQEKQMIKNRSRRRQDDPDAEVHydrophilic
194-213DGNKHFNKKLKRFYDKQTQEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MAASTRANRKDILSEQSRSRAIAADLKNPSASRKIQKAEKVLEERDLRESGEDVERHRNMHYSLEDSERWDAKLEEKERRKDQGGVADFGDAAERAYQRQVRMLRPNVAGYKKQQTEAEAIKASSPASTVLIKGKGRATAQEVVLDDFHYGAHKPSDDAIDRVVSHLNQEKQMIKNRSRRRQDDPDAEVNYINDGNKHFNKKLKRFYDKQTQEIRENLERGTAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.46
3 0.51
4 0.5
5 0.43
6 0.39
7 0.33
8 0.29
9 0.32
10 0.31
11 0.32
12 0.34
13 0.35
14 0.36
15 0.34
16 0.35
17 0.32
18 0.36
19 0.36
20 0.41
21 0.47
22 0.52
23 0.58
24 0.63
25 0.63
26 0.64
27 0.63
28 0.56
29 0.57
30 0.52
31 0.47
32 0.44
33 0.38
34 0.3
35 0.25
36 0.24
37 0.19
38 0.22
39 0.21
40 0.2
41 0.28
42 0.29
43 0.29
44 0.29
45 0.29
46 0.25
47 0.28
48 0.27
49 0.21
50 0.22
51 0.25
52 0.25
53 0.25
54 0.27
55 0.23
56 0.22
57 0.2
58 0.18
59 0.19
60 0.27
61 0.29
62 0.35
63 0.41
64 0.48
65 0.51
66 0.56
67 0.54
68 0.49
69 0.48
70 0.47
71 0.42
72 0.36
73 0.32
74 0.27
75 0.24
76 0.2
77 0.18
78 0.08
79 0.06
80 0.06
81 0.06
82 0.06
83 0.1
84 0.12
85 0.12
86 0.19
87 0.22
88 0.26
89 0.34
90 0.36
91 0.37
92 0.37
93 0.39
94 0.38
95 0.37
96 0.33
97 0.29
98 0.34
99 0.3
100 0.31
101 0.28
102 0.25
103 0.27
104 0.27
105 0.26
106 0.19
107 0.18
108 0.17
109 0.16
110 0.15
111 0.1
112 0.09
113 0.06
114 0.07
115 0.07
116 0.08
117 0.11
118 0.15
119 0.16
120 0.17
121 0.18
122 0.2
123 0.2
124 0.21
125 0.22
126 0.21
127 0.21
128 0.22
129 0.21
130 0.19
131 0.19
132 0.17
133 0.13
134 0.09
135 0.09
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.08
140 0.08
141 0.09
142 0.1
143 0.15
144 0.15
145 0.16
146 0.16
147 0.17
148 0.16
149 0.17
150 0.17
151 0.13
152 0.15
153 0.21
154 0.22
155 0.22
156 0.25
157 0.29
158 0.32
159 0.42
160 0.46
161 0.48
162 0.56
163 0.64
164 0.71
165 0.77
166 0.78
167 0.78
168 0.81
169 0.82
170 0.81
171 0.78
172 0.75
173 0.68
174 0.62
175 0.54
176 0.43
177 0.36
178 0.28
179 0.21
180 0.15
181 0.15
182 0.22
183 0.28
184 0.35
185 0.38
186 0.44
187 0.55
188 0.62
189 0.71
190 0.74
191 0.77
192 0.76
193 0.8
194 0.83
195 0.8
196 0.79
197 0.79
198 0.74
199 0.7
200 0.67
201 0.66
202 0.61
203 0.56
204 0.47