Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5EKX6

Protein Details
Accession V5EKX6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
135-159AAEQKGGKKKKGKQQERKSRVPRVTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
139-156KGGKKKKGKQQERKSRVP
330-361ERKRDELKELRIKFERDRAKVAKLKEGRRFKP
Subcellular Location(s) mito 14, cyto 6, nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR040447  RRM_Rrp7  
IPR040446  RRP7  
IPR024326  RRP7_C  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF17799  RRM_Rrp7  
PF12923  RRP7  
Amino Acid Sequences MGKTKKGSTSANGEASKPKSGDAAIQLTNGFLAVPLAIPHTSAKHWLYVRQHAASQTASSSKLDKLPADRTLFMANLPVDADEEWVRGVFGKVGGVSSVKFRRQAVADEEDEREMVGEGESGSEAEEEEEHQLAAAEQKGGKKKKGKQQERKSRVPRVTPLPSLDPREAAGGTSFLATASSAHVVFLDGLTLTRAMEALRKGLRWPTRKEDAPPTGLTFLLQQHTLSRPALPAIAAWANSTIALHTYRVAHPAPRRLGVRGVTLGPSGELLDEDGFIIVQRSSSSKYGRVGASAESGGSVGIAKGGYVEGKNGKRKSEGLQDFYRFQLRERKRDELKELRIKFERDRAKVAKLKEGRRFKPY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.49
3 0.49
4 0.41
5 0.35
6 0.29
7 0.28
8 0.31
9 0.29
10 0.31
11 0.26
12 0.27
13 0.27
14 0.24
15 0.23
16 0.18
17 0.12
18 0.06
19 0.06
20 0.04
21 0.05
22 0.05
23 0.08
24 0.08
25 0.09
26 0.11
27 0.13
28 0.14
29 0.2
30 0.21
31 0.25
32 0.27
33 0.33
34 0.38
35 0.45
36 0.5
37 0.46
38 0.48
39 0.42
40 0.44
41 0.38
42 0.32
43 0.25
44 0.21
45 0.2
46 0.19
47 0.2
48 0.19
49 0.22
50 0.24
51 0.24
52 0.28
53 0.32
54 0.37
55 0.39
56 0.37
57 0.35
58 0.35
59 0.32
60 0.26
61 0.25
62 0.18
63 0.14
64 0.14
65 0.12
66 0.11
67 0.1
68 0.13
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.08
74 0.08
75 0.09
76 0.07
77 0.07
78 0.08
79 0.07
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.14
85 0.19
86 0.21
87 0.24
88 0.24
89 0.28
90 0.29
91 0.33
92 0.31
93 0.32
94 0.31
95 0.31
96 0.32
97 0.28
98 0.26
99 0.21
100 0.16
101 0.1
102 0.09
103 0.06
104 0.05
105 0.04
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.05
115 0.07
116 0.07
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.08
122 0.07
123 0.07
124 0.09
125 0.13
126 0.21
127 0.25
128 0.31
129 0.38
130 0.45
131 0.53
132 0.62
133 0.7
134 0.73
135 0.81
136 0.86
137 0.86
138 0.88
139 0.88
140 0.86
141 0.8
142 0.74
143 0.68
144 0.64
145 0.61
146 0.53
147 0.48
148 0.44
149 0.41
150 0.4
151 0.35
152 0.28
153 0.23
154 0.22
155 0.19
156 0.14
157 0.11
158 0.07
159 0.07
160 0.06
161 0.06
162 0.04
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.04
175 0.03
176 0.03
177 0.04
178 0.04
179 0.03
180 0.03
181 0.04
182 0.04
183 0.07
184 0.07
185 0.11
186 0.12
187 0.12
188 0.14
189 0.2
190 0.28
191 0.31
192 0.36
193 0.39
194 0.45
195 0.47
196 0.5
197 0.52
198 0.48
199 0.46
200 0.42
201 0.37
202 0.31
203 0.28
204 0.25
205 0.17
206 0.15
207 0.13
208 0.12
209 0.1
210 0.11
211 0.13
212 0.16
213 0.14
214 0.13
215 0.12
216 0.13
217 0.13
218 0.11
219 0.09
220 0.09
221 0.1
222 0.09
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.06
229 0.06
230 0.07
231 0.07
232 0.08
233 0.11
234 0.12
235 0.16
236 0.17
237 0.21
238 0.25
239 0.33
240 0.35
241 0.37
242 0.38
243 0.36
244 0.4
245 0.36
246 0.34
247 0.28
248 0.26
249 0.23
250 0.21
251 0.19
252 0.14
253 0.13
254 0.09
255 0.07
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.06
265 0.05
266 0.05
267 0.06
268 0.08
269 0.12
270 0.16
271 0.19
272 0.22
273 0.25
274 0.3
275 0.3
276 0.29
277 0.27
278 0.24
279 0.24
280 0.2
281 0.17
282 0.12
283 0.11
284 0.09
285 0.08
286 0.07
287 0.04
288 0.05
289 0.05
290 0.04
291 0.05
292 0.06
293 0.08
294 0.08
295 0.12
296 0.19
297 0.27
298 0.36
299 0.38
300 0.41
301 0.43
302 0.46
303 0.48
304 0.51
305 0.51
306 0.49
307 0.55
308 0.56
309 0.54
310 0.54
311 0.55
312 0.44
313 0.4
314 0.44
315 0.44
316 0.5
317 0.55
318 0.61
319 0.63
320 0.71
321 0.77
322 0.76
323 0.79
324 0.79
325 0.75
326 0.74
327 0.72
328 0.69
329 0.65
330 0.65
331 0.64
332 0.58
333 0.65
334 0.61
335 0.65
336 0.66
337 0.63
338 0.64
339 0.63
340 0.68
341 0.68
342 0.74