Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5EXH0

Protein Details
Accession V5EXH0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
230-254QDDAEKAERKRRKAERKAEQSARIAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
211-217AKKKTKA
235-247KAERKRRKAERKA
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 12.833, mito_nucl 12.333, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006735  Rtf2  
IPR027799  Rtf2_RING-finger  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:1902979  P:mitotic DNA replication termination  
Pfam View protein in Pfam  
PF04641  Rtf2  
CDD cd16653  RING-like_Rtf2  
Amino Acid Sequences MGNDGGSIAKRDELVRTKASLEKVDPELLRQSLWTICSLSRQPLSPPVASDPLGRLYNKDAIVQHLLLRHSEASSSKLDPIAHIRGLRDITDLTLTPNTLYRPASPTTAASDEHSVYPFMCPLSSKQMDGKQRFVYIVGCGCVMSATGLKSTISASEEETPCPVCSKPFNAAGLLKGKQEATGSVVTINPAREEEEDMREAMEKARAEQAAKKKTKARTADQAAEKGTAQDDAEKAERKRRKAERKAEQSARIAALTAELAAEQA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.34
3 0.35
4 0.37
5 0.4
6 0.43
7 0.4
8 0.35
9 0.35
10 0.35
11 0.39
12 0.36
13 0.34
14 0.35
15 0.31
16 0.29
17 0.24
18 0.23
19 0.19
20 0.2
21 0.18
22 0.15
23 0.15
24 0.21
25 0.23
26 0.26
27 0.26
28 0.26
29 0.27
30 0.33
31 0.37
32 0.32
33 0.32
34 0.31
35 0.32
36 0.31
37 0.3
38 0.24
39 0.25
40 0.26
41 0.24
42 0.22
43 0.23
44 0.27
45 0.27
46 0.28
47 0.24
48 0.25
49 0.28
50 0.27
51 0.25
52 0.23
53 0.23
54 0.2
55 0.21
56 0.17
57 0.14
58 0.15
59 0.14
60 0.14
61 0.16
62 0.17
63 0.16
64 0.18
65 0.18
66 0.18
67 0.22
68 0.23
69 0.22
70 0.22
71 0.22
72 0.22
73 0.23
74 0.22
75 0.18
76 0.14
77 0.12
78 0.13
79 0.12
80 0.11
81 0.11
82 0.1
83 0.09
84 0.11
85 0.11
86 0.12
87 0.13
88 0.12
89 0.15
90 0.16
91 0.18
92 0.17
93 0.17
94 0.17
95 0.18
96 0.17
97 0.15
98 0.16
99 0.15
100 0.15
101 0.15
102 0.12
103 0.1
104 0.1
105 0.09
106 0.07
107 0.06
108 0.06
109 0.08
110 0.16
111 0.16
112 0.17
113 0.2
114 0.26
115 0.34
116 0.36
117 0.39
118 0.32
119 0.32
120 0.31
121 0.28
122 0.23
123 0.15
124 0.14
125 0.1
126 0.09
127 0.08
128 0.07
129 0.06
130 0.06
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.09
143 0.15
144 0.15
145 0.15
146 0.16
147 0.17
148 0.16
149 0.17
150 0.15
151 0.11
152 0.14
153 0.17
154 0.2
155 0.22
156 0.23
157 0.23
158 0.24
159 0.24
160 0.26
161 0.24
162 0.21
163 0.18
164 0.17
165 0.16
166 0.16
167 0.14
168 0.12
169 0.12
170 0.11
171 0.11
172 0.11
173 0.11
174 0.13
175 0.13
176 0.1
177 0.1
178 0.11
179 0.11
180 0.16
181 0.18
182 0.2
183 0.2
184 0.2
185 0.2
186 0.19
187 0.19
188 0.15
189 0.17
190 0.14
191 0.14
192 0.19
193 0.2
194 0.21
195 0.28
196 0.36
197 0.42
198 0.46
199 0.5
200 0.52
201 0.58
202 0.65
203 0.65
204 0.63
205 0.63
206 0.68
207 0.71
208 0.69
209 0.65
210 0.58
211 0.52
212 0.44
213 0.35
214 0.27
215 0.2
216 0.15
217 0.15
218 0.14
219 0.16
220 0.21
221 0.27
222 0.29
223 0.38
224 0.44
225 0.47
226 0.57
227 0.64
228 0.7
229 0.74
230 0.82
231 0.84
232 0.87
233 0.92
234 0.9
235 0.86
236 0.8
237 0.73
238 0.64
239 0.53
240 0.43
241 0.32
242 0.25
243 0.18
244 0.13
245 0.08