Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

V5F2V6

Protein Details
Accession V5F2V6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-58GNKMKRTELYRKYKAEKRKDKFARRSAQAKEERBasic
399-420EGTGSSSSKKKRQRGEEETVGMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
27-69NKMKRTELYRKYKAEKRKDKFARRSAQAKEERGEDGAAKKAAR
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12.5, cyto 7, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR044281  IMP4/RPF1  
Gene Ontology GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MPGNAEASSSGTGGKPAASGSFKHVGNKMKRTELYRKYKAEKRKDKFARRSAQAKEERGEDGAAKKAARLAANKTRTIENTRDFNPTIINAPNTHEGPGPSSLDKKVGEKSDGEDSDEDDAEEMMEEEEQEAAEEIDDDEDPSAPPAILITTSMPSSSTSPHLDSLNARSHPSEKTREFVDELLSVFPGAEYRPRSKAQGVGLGKICGWARERRFGAVLVVGESRKEPFALTVIQLPHGPTAFFRLTSISTGAEIYGKARPTPHTPELILNNFTTVLGHRVGKVLQSLFPKIPQLEGRQAVTCHNQRDYIFFRRHRYMFKSDTKTALQEIGPRFTLKLHSLKEGLPKGAGVWDGKYSEEYAELEPEEVEVLSRQEEGEEGEKVVDAEGSTLSGKTVSAEGTGSSSSKKKRQRGEEETVGMDFQWKPKMSVSRRNFYL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.1
3 0.1
4 0.14
5 0.15
6 0.17
7 0.22
8 0.29
9 0.29
10 0.34
11 0.39
12 0.44
13 0.51
14 0.58
15 0.58
16 0.59
17 0.63
18 0.65
19 0.7
20 0.71
21 0.73
22 0.73
23 0.76
24 0.76
25 0.8
26 0.82
27 0.83
28 0.84
29 0.8
30 0.82
31 0.84
32 0.87
33 0.89
34 0.89
35 0.88
36 0.85
37 0.86
38 0.81
39 0.81
40 0.78
41 0.73
42 0.66
43 0.58
44 0.52
45 0.45
46 0.39
47 0.32
48 0.26
49 0.26
50 0.26
51 0.23
52 0.22
53 0.24
54 0.26
55 0.27
56 0.28
57 0.32
58 0.39
59 0.45
60 0.47
61 0.46
62 0.47
63 0.47
64 0.49
65 0.48
66 0.44
67 0.44
68 0.43
69 0.47
70 0.43
71 0.4
72 0.36
73 0.3
74 0.27
75 0.24
76 0.24
77 0.19
78 0.22
79 0.26
80 0.25
81 0.25
82 0.23
83 0.2
84 0.21
85 0.23
86 0.22
87 0.19
88 0.21
89 0.21
90 0.24
91 0.24
92 0.24
93 0.27
94 0.28
95 0.28
96 0.26
97 0.28
98 0.33
99 0.32
100 0.31
101 0.26
102 0.24
103 0.24
104 0.23
105 0.2
106 0.12
107 0.11
108 0.08
109 0.08
110 0.07
111 0.04
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.07
131 0.06
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.06
137 0.06
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.08
142 0.08
143 0.1
144 0.11
145 0.13
146 0.14
147 0.16
148 0.17
149 0.17
150 0.18
151 0.18
152 0.22
153 0.25
154 0.24
155 0.23
156 0.22
157 0.24
158 0.27
159 0.3
160 0.33
161 0.27
162 0.29
163 0.29
164 0.3
165 0.29
166 0.26
167 0.23
168 0.16
169 0.16
170 0.14
171 0.12
172 0.1
173 0.08
174 0.07
175 0.06
176 0.05
177 0.08
178 0.11
179 0.15
180 0.19
181 0.2
182 0.23
183 0.24
184 0.28
185 0.26
186 0.31
187 0.29
188 0.28
189 0.28
190 0.26
191 0.25
192 0.22
193 0.2
194 0.14
195 0.15
196 0.18
197 0.19
198 0.26
199 0.26
200 0.25
201 0.26
202 0.25
203 0.23
204 0.18
205 0.16
206 0.1
207 0.11
208 0.1
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.07
213 0.07
214 0.06
215 0.05
216 0.07
217 0.08
218 0.08
219 0.12
220 0.12
221 0.12
222 0.13
223 0.13
224 0.12
225 0.11
226 0.11
227 0.07
228 0.12
229 0.12
230 0.11
231 0.11
232 0.12
233 0.12
234 0.13
235 0.14
236 0.09
237 0.09
238 0.09
239 0.09
240 0.08
241 0.07
242 0.08
243 0.1
244 0.1
245 0.1
246 0.12
247 0.15
248 0.19
249 0.27
250 0.28
251 0.29
252 0.29
253 0.33
254 0.36
255 0.36
256 0.32
257 0.25
258 0.22
259 0.19
260 0.18
261 0.14
262 0.1
263 0.09
264 0.09
265 0.1
266 0.1
267 0.11
268 0.12
269 0.12
270 0.14
271 0.13
272 0.15
273 0.18
274 0.2
275 0.2
276 0.21
277 0.23
278 0.2
279 0.22
280 0.22
281 0.24
282 0.27
283 0.29
284 0.29
285 0.29
286 0.29
287 0.29
288 0.33
289 0.33
290 0.3
291 0.29
292 0.31
293 0.29
294 0.34
295 0.37
296 0.38
297 0.42
298 0.44
299 0.48
300 0.52
301 0.55
302 0.56
303 0.57
304 0.56
305 0.56
306 0.61
307 0.62
308 0.57
309 0.59
310 0.54
311 0.49
312 0.43
313 0.38
314 0.29
315 0.28
316 0.28
317 0.27
318 0.26
319 0.25
320 0.24
321 0.22
322 0.25
323 0.23
324 0.28
325 0.26
326 0.29
327 0.31
328 0.33
329 0.4
330 0.4
331 0.36
332 0.29
333 0.27
334 0.23
335 0.23
336 0.23
337 0.15
338 0.13
339 0.15
340 0.15
341 0.16
342 0.16
343 0.15
344 0.13
345 0.14
346 0.14
347 0.13
348 0.14
349 0.14
350 0.13
351 0.12
352 0.12
353 0.11
354 0.09
355 0.08
356 0.07
357 0.07
358 0.08
359 0.08
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.11
364 0.13
365 0.13
366 0.12
367 0.12
368 0.13
369 0.13
370 0.12
371 0.1
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.08
376 0.08
377 0.08
378 0.08
379 0.08
380 0.08
381 0.08
382 0.09
383 0.09
384 0.09
385 0.09
386 0.1
387 0.11
388 0.13
389 0.12
390 0.15
391 0.21
392 0.28
393 0.37
394 0.46
395 0.53
396 0.61
397 0.71
398 0.79
399 0.81
400 0.83
401 0.83
402 0.78
403 0.71
404 0.62
405 0.51
406 0.4
407 0.35
408 0.27
409 0.22
410 0.26
411 0.25
412 0.27
413 0.33
414 0.44
415 0.48
416 0.57
417 0.62