Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

V5E496

Protein Details
Accession V5E496    Localization Confidence High Confidence Score 23.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-32TSSPPPVEVSKNKKHRKDKPWDDETIDHydrophilic
231-278ENWERFLPKFRKQNQKKSKPTTTEEGEEKKPKQKIKPKTYTPFPPPQQHydrophilic
329-354VEGDAGKKEKRKRNDESGEKKSKKVKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
241-251RKQNQKKSKPT
255-267EGEEKKPKQKIKP
298-310KKQAEEAKKLQKQ
331-354GDAGKKEKRKRNDESGEKKSKKVK
Subcellular Location(s) nucl 19, mito 4, cyto 4, cyto_mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041174  KH_8  
IPR004087  KH_dom  
IPR036612  KH_dom_type_1_sf  
IPR024166  rRNA_assembly_KRR1  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17903  KH_8  
CDD cd22393  KH-I_KRR1_rpt1  
cd22394  KH-I_KRR1_rpt2  
Amino Acid Sequences MADATTSSPPPVEVSKNKKHRKDKPWDDETIDHWSVPKFTADEIKGPFLEESSFATLFPKYRERYLKEVWGHVTSALDKHGIACTLDLVEGSMTVKTTRKTYDPYVILKARDMIRLLSRSVPFPQAVKILEDGVECDVIKIGNLLRNKERFVKRRQRIIGPNGSTLKAIELLTGCYVLVQGNTVSAMGQFKNLKEVRRIVIDCLKNVHPIYHIKELMIKRELAKDPKLAEENWERFLPKFRKQNQKKSKPTTTEEGEEKKPKQKIKPKTYTPFPPPQQPSKIDLQLESGEYFLKPRQKKQAEEAKKLQKQAEHRETREAERQKAFIAPVEGDAGKKEKRKRNDESGEKKSKKVK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.51
3 0.62
4 0.71
5 0.79
6 0.85
7 0.88
8 0.89
9 0.91
10 0.92
11 0.92
12 0.89
13 0.85
14 0.8
15 0.72
16 0.65
17 0.62
18 0.51
19 0.41
20 0.35
21 0.31
22 0.26
23 0.24
24 0.23
25 0.15
26 0.16
27 0.24
28 0.24
29 0.29
30 0.3
31 0.33
32 0.3
33 0.31
34 0.29
35 0.21
36 0.2
37 0.15
38 0.16
39 0.17
40 0.17
41 0.16
42 0.17
43 0.18
44 0.19
45 0.23
46 0.27
47 0.25
48 0.33
49 0.42
50 0.46
51 0.52
52 0.55
53 0.6
54 0.55
55 0.57
56 0.53
57 0.46
58 0.41
59 0.34
60 0.3
61 0.23
62 0.2
63 0.17
64 0.13
65 0.11
66 0.12
67 0.13
68 0.12
69 0.11
70 0.1
71 0.09
72 0.09
73 0.09
74 0.08
75 0.07
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.06
80 0.06
81 0.07
82 0.1
83 0.11
84 0.14
85 0.17
86 0.2
87 0.25
88 0.29
89 0.36
90 0.37
91 0.4
92 0.44
93 0.44
94 0.41
95 0.37
96 0.37
97 0.3
98 0.29
99 0.26
100 0.21
101 0.22
102 0.23
103 0.24
104 0.25
105 0.24
106 0.23
107 0.25
108 0.25
109 0.21
110 0.2
111 0.21
112 0.19
113 0.18
114 0.17
115 0.16
116 0.14
117 0.14
118 0.13
119 0.12
120 0.09
121 0.09
122 0.08
123 0.07
124 0.07
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.1
130 0.12
131 0.15
132 0.21
133 0.23
134 0.26
135 0.34
136 0.41
137 0.43
138 0.52
139 0.6
140 0.61
141 0.68
142 0.71
143 0.7
144 0.69
145 0.7
146 0.68
147 0.6
148 0.58
149 0.5
150 0.46
151 0.38
152 0.3
153 0.23
154 0.16
155 0.13
156 0.09
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.07
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.06
174 0.05
175 0.09
176 0.1
177 0.1
178 0.18
179 0.2
180 0.22
181 0.24
182 0.27
183 0.26
184 0.31
185 0.31
186 0.27
187 0.32
188 0.32
189 0.29
190 0.29
191 0.29
192 0.26
193 0.26
194 0.23
195 0.18
196 0.21
197 0.26
198 0.28
199 0.27
200 0.24
201 0.3
202 0.31
203 0.33
204 0.3
205 0.27
206 0.22
207 0.28
208 0.33
209 0.31
210 0.32
211 0.31
212 0.3
213 0.34
214 0.34
215 0.28
216 0.29
217 0.33
218 0.33
219 0.32
220 0.31
221 0.28
222 0.27
223 0.36
224 0.37
225 0.36
226 0.43
227 0.49
228 0.6
229 0.69
230 0.79
231 0.81
232 0.86
233 0.89
234 0.88
235 0.89
236 0.85
237 0.8
238 0.76
239 0.69
240 0.64
241 0.6
242 0.55
243 0.53
244 0.53
245 0.51
246 0.51
247 0.53
248 0.55
249 0.59
250 0.63
251 0.67
252 0.71
253 0.78
254 0.81
255 0.84
256 0.85
257 0.84
258 0.82
259 0.81
260 0.74
261 0.74
262 0.7
263 0.69
264 0.67
265 0.62
266 0.58
267 0.56
268 0.57
269 0.48
270 0.42
271 0.38
272 0.33
273 0.31
274 0.26
275 0.19
276 0.15
277 0.14
278 0.15
279 0.16
280 0.23
281 0.26
282 0.34
283 0.45
284 0.51
285 0.56
286 0.64
287 0.71
288 0.71
289 0.76
290 0.78
291 0.78
292 0.76
293 0.76
294 0.7
295 0.65
296 0.64
297 0.66
298 0.67
299 0.65
300 0.63
301 0.67
302 0.67
303 0.68
304 0.68
305 0.64
306 0.61
307 0.56
308 0.54
309 0.47
310 0.47
311 0.41
312 0.35
313 0.32
314 0.25
315 0.21
316 0.24
317 0.23
318 0.2
319 0.21
320 0.23
321 0.25
322 0.32
323 0.41
324 0.47
325 0.57
326 0.66
327 0.72
328 0.78
329 0.84
330 0.87
331 0.88
332 0.89
333 0.9
334 0.83