Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V5EYW2

Protein Details
Accession V5EYW2    Localization Confidence High Confidence Score 18.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
396-420STEDPERSGRRNRDRRPRRSDMEAMBasic
424-443LEDHRRSRHRDHQRELSPGRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
404-414GRRNRDRRPRR
432-433HR
437-459RELSPGRREDSDRVRVKGRGRMK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MADVALDYGSAEIDSSAVPMHDDAMEDVSGPTQPTSRFYALPTDQAVEAGAQRGPAPSSGAEPSLDDAALVGDETPSSIPDPPPVESGSDIRLETLLIEGSPITQLSTSRLFAYLTHFGAQPLGLEWIDDQSCKVVFPDERSARLGLEYLVPSTPADAMQDDMPLPNIETLLEYDPDSWHSEYITSLVTPRRAHRVPAKLYTHVERQAALTERSHKEEASTLPDDVPEIYREMEEADRSAKQPREVRDLLKLRGSLWLRHAVTDIDRKENRASTKSQWYKRHGYEAGREIVPKLLQVGEAKEAVELFPDYKPTEGDGRRRELNELDAELDRHVASRDEEPERRAGEMMADAVQARSRGRRNDGDLMDRFSSRDGGRRRGRRDDGERWGHDAYDALSTEDPERSGRRNRDRRPRRSDMEAMDAELEDHRRSRHRDHQRELSPGRREDSDRVRVKGRGRMKAPGFDDRWGGDEGKGSLAKRMGGGNDLLGRLGGGGRLADRFS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.05
2 0.06
3 0.06
4 0.06
5 0.07
6 0.07
7 0.08
8 0.08
9 0.09
10 0.1
11 0.12
12 0.11
13 0.11
14 0.11
15 0.11
16 0.11
17 0.11
18 0.11
19 0.13
20 0.14
21 0.17
22 0.23
23 0.26
24 0.26
25 0.26
26 0.35
27 0.33
28 0.36
29 0.35
30 0.3
31 0.27
32 0.26
33 0.25
34 0.17
35 0.16
36 0.13
37 0.12
38 0.1
39 0.11
40 0.12
41 0.12
42 0.12
43 0.13
44 0.12
45 0.15
46 0.16
47 0.17
48 0.16
49 0.16
50 0.17
51 0.16
52 0.15
53 0.11
54 0.09
55 0.08
56 0.08
57 0.07
58 0.05
59 0.04
60 0.04
61 0.05
62 0.05
63 0.06
64 0.08
65 0.1
66 0.11
67 0.16
68 0.19
69 0.2
70 0.22
71 0.22
72 0.22
73 0.22
74 0.23
75 0.2
76 0.2
77 0.18
78 0.16
79 0.15
80 0.14
81 0.12
82 0.11
83 0.08
84 0.06
85 0.06
86 0.05
87 0.06
88 0.07
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.07
93 0.1
94 0.14
95 0.14
96 0.15
97 0.16
98 0.15
99 0.16
100 0.21
101 0.22
102 0.2
103 0.21
104 0.2
105 0.19
106 0.2
107 0.19
108 0.13
109 0.09
110 0.1
111 0.08
112 0.08
113 0.08
114 0.1
115 0.11
116 0.11
117 0.1
118 0.1
119 0.1
120 0.1
121 0.1
122 0.12
123 0.13
124 0.18
125 0.28
126 0.29
127 0.32
128 0.34
129 0.34
130 0.3
131 0.28
132 0.24
133 0.14
134 0.15
135 0.13
136 0.11
137 0.11
138 0.11
139 0.1
140 0.1
141 0.1
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.08
146 0.08
147 0.09
148 0.08
149 0.08
150 0.09
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.07
155 0.06
156 0.07
157 0.08
158 0.09
159 0.09
160 0.09
161 0.1
162 0.1
163 0.12
164 0.14
165 0.13
166 0.11
167 0.11
168 0.11
169 0.1
170 0.11
171 0.1
172 0.07
173 0.09
174 0.12
175 0.16
176 0.17
177 0.19
178 0.26
179 0.27
180 0.31
181 0.37
182 0.43
183 0.44
184 0.5
185 0.52
186 0.47
187 0.49
188 0.48
189 0.45
190 0.4
191 0.35
192 0.27
193 0.24
194 0.24
195 0.24
196 0.22
197 0.19
198 0.23
199 0.24
200 0.28
201 0.28
202 0.24
203 0.22
204 0.24
205 0.24
206 0.22
207 0.22
208 0.18
209 0.17
210 0.17
211 0.17
212 0.14
213 0.14
214 0.08
215 0.07
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.09
224 0.09
225 0.1
226 0.16
227 0.16
228 0.21
229 0.25
230 0.28
231 0.34
232 0.35
233 0.36
234 0.39
235 0.42
236 0.38
237 0.36
238 0.33
239 0.26
240 0.3
241 0.3
242 0.23
243 0.21
244 0.27
245 0.25
246 0.25
247 0.25
248 0.19
249 0.21
250 0.26
251 0.24
252 0.24
253 0.24
254 0.26
255 0.28
256 0.31
257 0.31
258 0.28
259 0.3
260 0.27
261 0.38
262 0.45
263 0.51
264 0.55
265 0.58
266 0.62
267 0.61
268 0.63
269 0.56
270 0.51
271 0.49
272 0.46
273 0.43
274 0.35
275 0.34
276 0.27
277 0.25
278 0.21
279 0.15
280 0.11
281 0.08
282 0.09
283 0.1
284 0.11
285 0.11
286 0.11
287 0.11
288 0.1
289 0.1
290 0.08
291 0.08
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.09
296 0.09
297 0.1
298 0.1
299 0.11
300 0.18
301 0.21
302 0.29
303 0.32
304 0.36
305 0.4
306 0.4
307 0.41
308 0.34
309 0.33
310 0.27
311 0.23
312 0.21
313 0.18
314 0.17
315 0.15
316 0.15
317 0.11
318 0.1
319 0.09
320 0.08
321 0.09
322 0.12
323 0.17
324 0.22
325 0.24
326 0.26
327 0.29
328 0.29
329 0.28
330 0.25
331 0.2
332 0.15
333 0.14
334 0.13
335 0.09
336 0.09
337 0.08
338 0.08
339 0.09
340 0.09
341 0.1
342 0.15
343 0.2
344 0.24
345 0.31
346 0.36
347 0.41
348 0.48
349 0.5
350 0.51
351 0.48
352 0.48
353 0.43
354 0.38
355 0.32
356 0.25
357 0.26
358 0.19
359 0.26
360 0.26
361 0.34
362 0.44
363 0.52
364 0.58
365 0.64
366 0.7
367 0.71
368 0.74
369 0.73
370 0.74
371 0.74
372 0.69
373 0.64
374 0.57
375 0.48
376 0.39
377 0.31
378 0.22
379 0.17
380 0.16
381 0.12
382 0.12
383 0.13
384 0.15
385 0.15
386 0.15
387 0.14
388 0.17
389 0.22
390 0.31
391 0.4
392 0.49
393 0.59
394 0.68
395 0.77
396 0.85
397 0.89
398 0.9
399 0.89
400 0.84
401 0.82
402 0.8
403 0.73
404 0.7
405 0.6
406 0.51
407 0.42
408 0.36
409 0.28
410 0.23
411 0.2
412 0.14
413 0.15
414 0.18
415 0.24
416 0.3
417 0.38
418 0.47
419 0.56
420 0.65
421 0.71
422 0.78
423 0.78
424 0.82
425 0.79
426 0.78
427 0.74
428 0.67
429 0.62
430 0.55
431 0.53
432 0.52
433 0.55
434 0.56
435 0.54
436 0.55
437 0.57
438 0.58
439 0.59
440 0.6
441 0.6
442 0.59
443 0.57
444 0.62
445 0.62
446 0.65
447 0.64
448 0.65
449 0.59
450 0.51
451 0.51
452 0.42
453 0.4
454 0.34
455 0.3
456 0.22
457 0.23
458 0.21
459 0.23
460 0.25
461 0.23
462 0.25
463 0.26
464 0.26
465 0.24
466 0.26
467 0.23
468 0.23
469 0.23
470 0.22
471 0.24
472 0.23
473 0.21
474 0.17
475 0.16
476 0.13
477 0.13
478 0.09
479 0.07
480 0.07
481 0.09