Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

B2AVW8

Protein Details
Accession B2AVW8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
239-260AEEASLKKRRERQARNGEDNGDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG pan:PODANSg4904  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MPPTTKRKSPASDREEETSPEPSSKRQATPTTTEPSNPTPSAEPPSQTSTQQSRLARFKALQARAKSSSTQNLKEATKESQRLASDPSQLTAITRKHAVASHKLLKAEIEDSGGDFERKRAWDWTIEESERWDKRVKKKDAHRDDTAFRDYQRQSEKSYKRQLKSMGAPDVEKYTRDKMAAIEKAAAEGTLEIVETEDGEMIAVDKDGTFFSTADSTDFARHKPDKAAVDRLVEDLRKAEEASLKKRRERQARNGEDNGDVTYINEKNKQFNQKLARFYNKYTAEIRDSFERGTMV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.64
3 0.58
4 0.51
5 0.45
6 0.38
7 0.35
8 0.32
9 0.31
10 0.37
11 0.39
12 0.41
13 0.44
14 0.5
15 0.51
16 0.56
17 0.58
18 0.55
19 0.51
20 0.49
21 0.46
22 0.44
23 0.45
24 0.38
25 0.35
26 0.31
27 0.34
28 0.37
29 0.35
30 0.31
31 0.29
32 0.35
33 0.34
34 0.33
35 0.36
36 0.36
37 0.39
38 0.45
39 0.44
40 0.45
41 0.5
42 0.51
43 0.48
44 0.43
45 0.45
46 0.48
47 0.52
48 0.52
49 0.49
50 0.53
51 0.53
52 0.54
53 0.49
54 0.44
55 0.45
56 0.44
57 0.44
58 0.4
59 0.42
60 0.41
61 0.4
62 0.39
63 0.35
64 0.36
65 0.36
66 0.34
67 0.35
68 0.34
69 0.33
70 0.35
71 0.33
72 0.32
73 0.29
74 0.28
75 0.23
76 0.22
77 0.22
78 0.23
79 0.21
80 0.17
81 0.18
82 0.17
83 0.18
84 0.22
85 0.25
86 0.26
87 0.32
88 0.37
89 0.38
90 0.38
91 0.37
92 0.34
93 0.31
94 0.25
95 0.18
96 0.12
97 0.09
98 0.09
99 0.1
100 0.1
101 0.09
102 0.09
103 0.09
104 0.11
105 0.12
106 0.14
107 0.15
108 0.16
109 0.2
110 0.23
111 0.28
112 0.28
113 0.28
114 0.26
115 0.27
116 0.33
117 0.28
118 0.27
119 0.28
120 0.3
121 0.4
122 0.5
123 0.54
124 0.56
125 0.65
126 0.74
127 0.78
128 0.78
129 0.73
130 0.66
131 0.62
132 0.58
133 0.51
134 0.41
135 0.31
136 0.32
137 0.27
138 0.29
139 0.32
140 0.29
141 0.31
142 0.4
143 0.46
144 0.47
145 0.57
146 0.6
147 0.55
148 0.58
149 0.58
150 0.54
151 0.54
152 0.52
153 0.46
154 0.39
155 0.38
156 0.34
157 0.33
158 0.28
159 0.22
160 0.19
161 0.18
162 0.18
163 0.18
164 0.18
165 0.16
166 0.24
167 0.25
168 0.23
169 0.22
170 0.2
171 0.2
172 0.19
173 0.17
174 0.09
175 0.07
176 0.06
177 0.04
178 0.04
179 0.03
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.05
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.1
203 0.11
204 0.14
205 0.16
206 0.15
207 0.22
208 0.24
209 0.26
210 0.29
211 0.34
212 0.37
213 0.41
214 0.48
215 0.43
216 0.44
217 0.42
218 0.4
219 0.38
220 0.3
221 0.26
222 0.2
223 0.18
224 0.16
225 0.16
226 0.15
227 0.19
228 0.24
229 0.33
230 0.41
231 0.46
232 0.52
233 0.6
234 0.68
235 0.73
236 0.77
237 0.78
238 0.8
239 0.84
240 0.85
241 0.81
242 0.73
243 0.64
244 0.55
245 0.45
246 0.34
247 0.24
248 0.17
249 0.19
250 0.19
251 0.2
252 0.26
253 0.27
254 0.34
255 0.42
256 0.51
257 0.49
258 0.55
259 0.63
260 0.63
261 0.7
262 0.71
263 0.73
264 0.67
265 0.68
266 0.69
267 0.62
268 0.59
269 0.54
270 0.51
271 0.47
272 0.45
273 0.45
274 0.41
275 0.4
276 0.37