FuNGI

T5AG56

Protein Details

Accession

T5AG56

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
106-128	QTKFSRPAPTRTQQRARGKRSET	Hydrophilic
190-211	GTRTYGSKAKNKLKRRKDMEGA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
197-206	KAKNKLKRRK

Subcellular Location(s)

nucl 10, mito 9, cyto 5, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039024 RTC4 IPR028094 RTC4_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0005634 C:nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF14474 RTC4

Amino Acid Sequences

MTAHQPRRVGMAKYQNIPPLLSKIGNKSRDTTKPSPKVDEPPLSSEDEEDVEDVEAVGISQCGGSNASQDSTHGQRPGSRLIMRGALLNSPSNSNDEKTARGSIAQTKFSRPAPTRTQQRARGKRSETIESLDSGAKRSDDDQGPSNKRIRCSNSPPSTFERGTGATAGRSGPGAHLMNEHGFARKTTAGTRTYGSKAKNKLKRRKDMEGAAAKQRADETWRQTGGVEAQAASKPQIQVPKPLDEPEKPSTGKLVVPKAVPWSSPTKTPGVLLTSRYPADDYLDKNSDSPQADTAASPTHFADFGRGAKGSDGKPEVVLSDVASDTEKSNGPLSDLEVIGSDTEVAAVCPWCGQPVDKSLLDDFSRGKRMNVRLQTRFCRQHKKQTAVETWQAKGYPEVDWEGLDRRFAAHRRPLLDIVNGKASHFRGILAQKIESGQARSMKKEGNMNPGYYGPRGFDLMCDYIVDEFGALLKERAVDDRVIAGRGSAAFIQTVLVAELAVRLIGDDMGVSAEEARGIMEESKALGEMVHDGA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.59
2	0.57
3	0.52
4	0.5
5	0.44
6	0.38
7	0.36
8	0.34
9	0.33
10	0.38
11	0.46
12	0.51
13	0.51
14	0.51
15	0.55
16	0.6
17	0.65
18	0.65
19	0.67
20	0.7
21	0.73
22	0.75
23	0.72
24	0.72
25	0.72
26	0.71
27	0.64
28	0.6
29	0.57
30	0.53
31	0.47
32	0.4
33	0.32
34	0.25
35	0.21
36	0.16
37	0.14
38	0.11
39	0.11
40	0.09
41	0.08
42	0.06
43	0.05
44	0.05
45	0.04
46	0.04
47	0.05
48	0.05
49	0.05
50	0.07
51	0.07
52	0.1
53	0.12
54	0.13
55	0.13
56	0.14
57	0.18
58	0.21
59	0.26
60	0.25
61	0.25
62	0.28
63	0.31
64	0.36
65	0.38
66	0.35
67	0.33
68	0.33
69	0.36
70	0.32
71	0.32
72	0.27
73	0.22
74	0.23
75	0.23
76	0.22
77	0.2
78	0.21
79	0.21
80	0.22
81	0.21
82	0.25
83	0.24
84	0.26
85	0.26
86	0.28
87	0.25
88	0.24
89	0.26
90	0.29
91	0.33
92	0.37
93	0.36
94	0.38
95	0.42
96	0.43
97	0.49
98	0.43
99	0.46
100	0.47
101	0.55
102	0.61
103	0.66
104	0.72
105	0.73
106	0.81
107	0.84
108	0.82
109	0.83
110	0.77
111	0.74
112	0.7
113	0.66
114	0.57
115	0.51
116	0.45
117	0.36
118	0.34
119	0.3
120	0.25
121	0.2
122	0.19
123	0.15
124	0.15
125	0.15
126	0.2
127	0.2
128	0.23
129	0.28
130	0.36
131	0.41
132	0.45
133	0.5
134	0.46
135	0.46
136	0.5
137	0.52
138	0.51
139	0.55
140	0.61
141	0.64
142	0.64
143	0.66
144	0.64
145	0.64
146	0.55
147	0.47
148	0.39
149	0.31
150	0.28
151	0.26
152	0.2
153	0.13
154	0.14
155	0.13
156	0.1
157	0.1
158	0.09
159	0.07
160	0.12
161	0.12
162	0.12
163	0.13
164	0.14
165	0.14
166	0.15
167	0.15
168	0.13
169	0.12
170	0.12
171	0.14
172	0.14
173	0.15
174	0.16
175	0.21
176	0.21
177	0.22
178	0.23
179	0.24
180	0.26
181	0.29
182	0.3
183	0.33
184	0.4
185	0.48
186	0.56
187	0.62
188	0.69
189	0.74
190	0.81
191	0.81
192	0.8
193	0.78
194	0.74
195	0.73
196	0.7
197	0.64
198	0.59
199	0.54
200	0.45
201	0.39
202	0.34
203	0.25
204	0.21
205	0.23
206	0.22
207	0.25
208	0.26
209	0.26
210	0.25
211	0.26
212	0.23
213	0.19
214	0.14
215	0.09
216	0.1
217	0.1
218	0.11
219	0.11
220	0.11
221	0.1
222	0.12
223	0.19
224	0.18
225	0.26
226	0.28
227	0.31
228	0.3
229	0.33
230	0.34
231	0.29
232	0.35
233	0.3
234	0.31
235	0.27
236	0.26
237	0.25
238	0.23
239	0.23
240	0.21
241	0.22
242	0.2
243	0.2
244	0.2
245	0.23
246	0.22
247	0.2
248	0.18
249	0.21
250	0.19
251	0.22
252	0.24
253	0.21
254	0.21
255	0.21
256	0.2
257	0.17
258	0.18
259	0.17
260	0.17
261	0.18
262	0.18
263	0.17
264	0.16
265	0.13
266	0.14
267	0.15
268	0.14
269	0.17
270	0.19
271	0.19
272	0.19
273	0.2
274	0.21
275	0.19
276	0.19
277	0.15
278	0.15
279	0.15
280	0.14
281	0.14
282	0.12
283	0.11
284	0.11
285	0.11
286	0.1
287	0.09
288	0.09
289	0.11
290	0.1
291	0.11
292	0.12
293	0.12
294	0.11
295	0.12
296	0.16
297	0.14
298	0.17
299	0.18
300	0.16
301	0.16
302	0.16
303	0.15
304	0.13
305	0.12
306	0.08
307	0.07
308	0.07
309	0.07
310	0.07
311	0.08
312	0.07
313	0.09
314	0.09
315	0.09
316	0.11
317	0.11
318	0.12
319	0.11
320	0.12
321	0.13
322	0.12
323	0.11
324	0.09
325	0.09
326	0.08
327	0.08
328	0.06
329	0.04
330	0.04
331	0.04
332	0.03
333	0.04
334	0.04
335	0.04
336	0.05
337	0.06
338	0.06
339	0.07
340	0.08
341	0.1
342	0.14
343	0.19
344	0.18
345	0.2
346	0.2
347	0.23
348	0.22
349	0.22
350	0.2
351	0.19
352	0.26
353	0.25
354	0.26
355	0.3
356	0.36
357	0.43
358	0.49
359	0.53
360	0.55
361	0.62
362	0.66
363	0.68
364	0.72
365	0.7
366	0.72
367	0.69
368	0.73
369	0.75
370	0.76
371	0.72
372	0.72
373	0.71
374	0.66
375	0.68
376	0.6
377	0.52
378	0.47
379	0.42
380	0.33
381	0.28
382	0.23
383	0.16
384	0.15
385	0.16
386	0.14
387	0.14
388	0.15
389	0.18
390	0.17
391	0.16
392	0.15
393	0.14
394	0.19
395	0.22
396	0.29
397	0.32
398	0.37
399	0.39
400	0.43
401	0.44
402	0.41
403	0.44
404	0.39
405	0.33
406	0.35
407	0.33
408	0.29
409	0.3
410	0.29
411	0.26
412	0.23
413	0.21
414	0.21
415	0.24
416	0.29
417	0.27
418	0.26
419	0.24
420	0.25
421	0.27
422	0.23
423	0.22
424	0.21
425	0.26
426	0.28
427	0.3
428	0.33
429	0.34
430	0.36
431	0.42
432	0.43
433	0.46
434	0.47
435	0.45
436	0.43
437	0.42
438	0.42
439	0.34
440	0.3
441	0.21
442	0.19
443	0.2
444	0.18
445	0.16
446	0.18
447	0.18
448	0.17
449	0.16
450	0.15
451	0.14
452	0.14
453	0.13
454	0.07
455	0.06
456	0.07
457	0.08
458	0.08
459	0.08
460	0.08
461	0.1
462	0.11
463	0.14
464	0.15
465	0.14
466	0.14
467	0.2
468	0.21
469	0.21
470	0.2
471	0.17
472	0.17
473	0.16
474	0.17
475	0.12
476	0.11
477	0.1
478	0.1
479	0.1
480	0.09
481	0.09
482	0.07
483	0.06
484	0.06
485	0.05
486	0.06
487	0.06
488	0.05
489	0.04
490	0.04
491	0.05
492	0.05
493	0.05
494	0.04
495	0.04
496	0.05
497	0.06
498	0.06
499	0.06
500	0.06
501	0.06
502	0.06
503	0.06
504	0.06
505	0.08
506	0.09
507	0.09
508	0.1
509	0.1
510	0.11
511	0.11
512	0.11
513	0.09
514	0.08

T5AG56

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer