Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

T5AFB0

Protein Details
Accession T5AFB0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
83-117APRSRKSSQGARPKKPTSRKPTSKKPRTNGTQPVAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
84-110PRSRKSSQGARPKKPTSRKPTSKKPRT
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 9, cyto 4.5, mito 4, pero 2, plas 1, golg 1, cysk 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039662  Cohesin_Scc3/SA  
IPR020839  SCD  
IPR013721  STAG  
Pfam View protein in Pfam  
PF08514  STAG  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51425  SCD  
Amino Acid Sequences MDGIASSSPSASPDPDSTARRSRSGRVVKAPTKFAPDATAPSASKRKRDDLDQDGDEVDDADLTSDDDVSDEPDAVSDDDHPAPRSRKSSQGARPKKPTSRKPTSKKPRTNGTQPVASGHVARIPSRPKKTVRIDAGERGTGLFADIFGSGDTPEAVSQQWLERYRQDDAAAMGDLVNCILQCAGCDLQVTTDDIRDPENIPNRLVDLQNVYQEQNITEYPLISRAKNTRSFRDMLLAFFPSLLSLLHETDVMYKDPDLMDNLHAWLASMSSSTLRPFRHTATTVSLAVQAGLIYIAGVLDRRIATIEQQSLAAKKGKNKSKAAEIQRGLTEANGYRKTCSEAIQSFFDTVFVHRYRDVDPKIRTECVEALGSWIWNLPTVFMEPGYLRYLGWMPGCFQTPTHRRARRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.3
3 0.34
4 0.38
5 0.46
6 0.48
7 0.51
8 0.53
9 0.53
10 0.57
11 0.63
12 0.65
13 0.65
14 0.72
15 0.72
16 0.74
17 0.74
18 0.66
19 0.64
20 0.57
21 0.48
22 0.43
23 0.38
24 0.37
25 0.34
26 0.37
27 0.29
28 0.35
29 0.43
30 0.42
31 0.47
32 0.49
33 0.54
34 0.52
35 0.6
36 0.62
37 0.62
38 0.66
39 0.6
40 0.55
41 0.47
42 0.42
43 0.34
44 0.26
45 0.17
46 0.09
47 0.07
48 0.06
49 0.06
50 0.06
51 0.06
52 0.05
53 0.05
54 0.06
55 0.06
56 0.07
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.09
62 0.08
63 0.09
64 0.08
65 0.12
66 0.14
67 0.16
68 0.18
69 0.23
70 0.26
71 0.31
72 0.35
73 0.35
74 0.41
75 0.46
76 0.54
77 0.57
78 0.65
79 0.7
80 0.74
81 0.8
82 0.79
83 0.83
84 0.83
85 0.84
86 0.83
87 0.84
88 0.86
89 0.86
90 0.89
91 0.9
92 0.91
93 0.91
94 0.88
95 0.87
96 0.85
97 0.85
98 0.83
99 0.77
100 0.7
101 0.6
102 0.55
103 0.47
104 0.39
105 0.3
106 0.21
107 0.19
108 0.15
109 0.16
110 0.19
111 0.26
112 0.34
113 0.39
114 0.45
115 0.47
116 0.56
117 0.63
118 0.66
119 0.64
120 0.63
121 0.61
122 0.61
123 0.59
124 0.5
125 0.42
126 0.33
127 0.26
128 0.18
129 0.15
130 0.07
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.04
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.06
146 0.08
147 0.13
148 0.15
149 0.17
150 0.19
151 0.22
152 0.24
153 0.25
154 0.23
155 0.19
156 0.17
157 0.17
158 0.14
159 0.11
160 0.09
161 0.08
162 0.07
163 0.06
164 0.05
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.03
169 0.03
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.08
177 0.09
178 0.07
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.09
183 0.1
184 0.11
185 0.14
186 0.21
187 0.21
188 0.21
189 0.21
190 0.21
191 0.22
192 0.2
193 0.16
194 0.13
195 0.13
196 0.15
197 0.16
198 0.15
199 0.14
200 0.14
201 0.13
202 0.11
203 0.1
204 0.09
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.13
209 0.14
210 0.13
211 0.16
212 0.2
213 0.25
214 0.34
215 0.37
216 0.36
217 0.39
218 0.41
219 0.38
220 0.39
221 0.34
222 0.27
223 0.25
224 0.21
225 0.17
226 0.15
227 0.14
228 0.08
229 0.08
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.07
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.1
238 0.11
239 0.11
240 0.1
241 0.09
242 0.1
243 0.1
244 0.11
245 0.1
246 0.1
247 0.1
248 0.1
249 0.11
250 0.1
251 0.1
252 0.09
253 0.08
254 0.06
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.06
259 0.07
260 0.08
261 0.13
262 0.14
263 0.18
264 0.2
265 0.23
266 0.28
267 0.29
268 0.3
269 0.31
270 0.33
271 0.3
272 0.28
273 0.26
274 0.2
275 0.18
276 0.16
277 0.1
278 0.06
279 0.06
280 0.05
281 0.03
282 0.03
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.06
288 0.06
289 0.06
290 0.08
291 0.08
292 0.11
293 0.16
294 0.18
295 0.17
296 0.18
297 0.19
298 0.19
299 0.22
300 0.25
301 0.22
302 0.28
303 0.37
304 0.45
305 0.52
306 0.57
307 0.58
308 0.63
309 0.69
310 0.7
311 0.7
312 0.63
313 0.59
314 0.54
315 0.5
316 0.4
317 0.31
318 0.26
319 0.2
320 0.27
321 0.28
322 0.28
323 0.29
324 0.3
325 0.34
326 0.32
327 0.32
328 0.32
329 0.31
330 0.34
331 0.36
332 0.35
333 0.32
334 0.3
335 0.27
336 0.2
337 0.17
338 0.2
339 0.18
340 0.2
341 0.2
342 0.22
343 0.25
344 0.34
345 0.39
346 0.41
347 0.43
348 0.49
349 0.53
350 0.53
351 0.51
352 0.46
353 0.42
354 0.36
355 0.34
356 0.25
357 0.24
358 0.23
359 0.22
360 0.17
361 0.17
362 0.14
363 0.15
364 0.15
365 0.12
366 0.12
367 0.14
368 0.15
369 0.14
370 0.16
371 0.14
372 0.17
373 0.19
374 0.17
375 0.15
376 0.17
377 0.18
378 0.2
379 0.22
380 0.2
381 0.2
382 0.23
383 0.26
384 0.24
385 0.24
386 0.31
387 0.36
388 0.42
389 0.5