Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

T5ABC2

Protein Details
Accession T5ABC2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
399-420GHVGRGRRSRPRHTLSKPCSRLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
443-450RPRRRGTK
Subcellular Location(s) mito 17, nucl 6, extr 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MPVPFPTTLAPRPRRSASTLPRSVVCPLHSAHSLLTPCSLPAHSLLTPCSLSAHSLLTLLSSQGNCKFGPKCANVHVLPDGRRINYGKNGVTIGTSLLNLASRSSPGSASPTSASATAYSHGASASALTSSLYQYPSAYSPDDRQLAQHHALDSAIPAIDMPYSHSTYNSPRDDDAARLGFGRSPVNGKGLSVLDAPLPSSFDSNGISNAARFPSAPWPSSVPSRFNLDSPTLSPSSARESPRTSETLKLLHTSAFGSSEHLATPTASSPPNSQPVNGDEYFGKRTMHSSRYAKPKMLSASLPKTASVDRDWEAGFAFGDEGDNVPENYVPENLQDLLTPAEKARRGSMRADNDAGVDGMTKYGSPLGSSPSRWGPLFQRQKEEEDATRAARNAGSVFGHVGRGRRSRPRHTLSKPCSRLMMRPSTASLSRPPPALYILKATRPRRRGTKGGAARSSDACLMATAGRATARLAVATRRMAVRNMAAGGRESACRLGSDVSWWVAAFGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.64
3 0.67
4 0.67
5 0.69
6 0.69
7 0.65
8 0.62
9 0.59
10 0.56
11 0.5
12 0.41
13 0.33
14 0.28
15 0.29
16 0.29
17 0.28
18 0.25
19 0.26
20 0.26
21 0.23
22 0.24
23 0.2
24 0.19
25 0.2
26 0.2
27 0.15
28 0.15
29 0.2
30 0.19
31 0.21
32 0.22
33 0.23
34 0.22
35 0.21
36 0.21
37 0.17
38 0.17
39 0.16
40 0.17
41 0.13
42 0.13
43 0.13
44 0.12
45 0.12
46 0.11
47 0.13
48 0.12
49 0.15
50 0.18
51 0.21
52 0.19
53 0.25
54 0.26
55 0.28
56 0.37
57 0.37
58 0.39
59 0.42
60 0.49
61 0.44
62 0.46
63 0.47
64 0.44
65 0.42
66 0.44
67 0.42
68 0.36
69 0.4
70 0.38
71 0.37
72 0.39
73 0.43
74 0.37
75 0.35
76 0.35
77 0.31
78 0.29
79 0.24
80 0.18
81 0.12
82 0.11
83 0.09
84 0.08
85 0.09
86 0.09
87 0.1
88 0.09
89 0.09
90 0.11
91 0.12
92 0.12
93 0.11
94 0.16
95 0.16
96 0.17
97 0.17
98 0.17
99 0.17
100 0.17
101 0.16
102 0.12
103 0.13
104 0.11
105 0.11
106 0.1
107 0.09
108 0.08
109 0.08
110 0.07
111 0.07
112 0.06
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.06
117 0.07
118 0.1
119 0.1
120 0.1
121 0.1
122 0.12
123 0.13
124 0.15
125 0.16
126 0.15
127 0.18
128 0.23
129 0.25
130 0.23
131 0.24
132 0.25
133 0.29
134 0.3
135 0.29
136 0.23
137 0.22
138 0.22
139 0.2
140 0.16
141 0.11
142 0.08
143 0.06
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.09
149 0.11
150 0.13
151 0.14
152 0.15
153 0.17
154 0.23
155 0.31
156 0.3
157 0.28
158 0.26
159 0.29
160 0.3
161 0.28
162 0.27
163 0.2
164 0.18
165 0.17
166 0.17
167 0.15
168 0.15
169 0.15
170 0.11
171 0.13
172 0.14
173 0.16
174 0.15
175 0.14
176 0.15
177 0.14
178 0.15
179 0.12
180 0.12
181 0.1
182 0.1
183 0.1
184 0.08
185 0.08
186 0.07
187 0.08
188 0.07
189 0.08
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.1
194 0.09
195 0.09
196 0.1
197 0.09
198 0.08
199 0.08
200 0.09
201 0.16
202 0.19
203 0.19
204 0.19
205 0.22
206 0.23
207 0.29
208 0.3
209 0.24
210 0.23
211 0.28
212 0.27
213 0.25
214 0.26
215 0.22
216 0.2
217 0.19
218 0.21
219 0.16
220 0.15
221 0.15
222 0.13
223 0.17
224 0.21
225 0.22
226 0.21
227 0.23
228 0.26
229 0.28
230 0.3
231 0.25
232 0.23
233 0.23
234 0.23
235 0.21
236 0.2
237 0.18
238 0.15
239 0.15
240 0.12
241 0.1
242 0.09
243 0.08
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.07
251 0.08
252 0.07
253 0.08
254 0.08
255 0.09
256 0.12
257 0.15
258 0.2
259 0.2
260 0.19
261 0.19
262 0.21
263 0.26
264 0.23
265 0.21
266 0.16
267 0.19
268 0.2
269 0.2
270 0.18
271 0.12
272 0.16
273 0.19
274 0.22
275 0.27
276 0.29
277 0.35
278 0.45
279 0.48
280 0.47
281 0.43
282 0.44
283 0.4
284 0.37
285 0.33
286 0.29
287 0.32
288 0.33
289 0.32
290 0.28
291 0.27
292 0.25
293 0.24
294 0.19
295 0.18
296 0.15
297 0.16
298 0.16
299 0.15
300 0.14
301 0.12
302 0.11
303 0.08
304 0.07
305 0.04
306 0.05
307 0.04
308 0.04
309 0.05
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.07
314 0.07
315 0.08
316 0.08
317 0.08
318 0.08
319 0.1
320 0.1
321 0.1
322 0.09
323 0.09
324 0.1
325 0.1
326 0.1
327 0.09
328 0.14
329 0.16
330 0.17
331 0.21
332 0.24
333 0.26
334 0.32
335 0.39
336 0.4
337 0.42
338 0.43
339 0.38
340 0.33
341 0.31
342 0.25
343 0.17
344 0.11
345 0.07
346 0.06
347 0.06
348 0.05
349 0.05
350 0.07
351 0.07
352 0.07
353 0.08
354 0.12
355 0.15
356 0.16
357 0.2
358 0.22
359 0.25
360 0.24
361 0.26
362 0.27
363 0.35
364 0.44
365 0.44
366 0.49
367 0.49
368 0.53
369 0.55
370 0.54
371 0.46
372 0.41
373 0.4
374 0.34
375 0.33
376 0.3
377 0.26
378 0.22
379 0.2
380 0.15
381 0.15
382 0.13
383 0.11
384 0.13
385 0.13
386 0.16
387 0.16
388 0.19
389 0.23
390 0.29
391 0.34
392 0.42
393 0.5
394 0.56
395 0.65
396 0.7
397 0.74
398 0.76
399 0.81
400 0.8
401 0.83
402 0.78
403 0.7
404 0.69
405 0.61
406 0.59
407 0.56
408 0.57
409 0.48
410 0.46
411 0.46
412 0.44
413 0.43
414 0.39
415 0.37
416 0.33
417 0.33
418 0.33
419 0.31
420 0.28
421 0.31
422 0.31
423 0.26
424 0.29
425 0.3
426 0.37
427 0.45
428 0.52
429 0.57
430 0.6
431 0.66
432 0.68
433 0.72
434 0.73
435 0.72
436 0.75
437 0.75
438 0.78
439 0.76
440 0.69
441 0.65
442 0.58
443 0.51
444 0.42
445 0.33
446 0.23
447 0.18
448 0.15
449 0.13
450 0.13
451 0.11
452 0.11
453 0.1
454 0.11
455 0.11
456 0.13
457 0.13
458 0.13
459 0.14
460 0.18
461 0.22
462 0.24
463 0.27
464 0.28
465 0.29
466 0.3
467 0.32
468 0.31
469 0.3
470 0.3
471 0.28
472 0.25
473 0.24
474 0.25
475 0.23
476 0.21
477 0.19
478 0.19
479 0.18
480 0.18
481 0.18
482 0.17
483 0.16
484 0.18
485 0.2
486 0.19
487 0.19
488 0.19