Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

T5AMB0

Protein Details
Accession T5AMB0    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
363-382APSPPRRRMRGRKSTAAPAAHydrophilic
433-455GPTRAARRGKRAPDEPREPRAKSBasic
462-498VSQPGRGRGRPRKSAAPSQTSKPQGVAKRKRGRPRKMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
366-498PPRRRMRGRKSTAAPAAPSPPRTRMRGRRPMAAPAAAAPEPREPPKRRSARIAATRRQPEPAAAAPEGPTRAARRGKRAPDEPREPRAKSAAGPGNVSQPGRGRGRPRKSAAPSQTSKPQGVAKRKRGRPRKM
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 9, pero 6, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
Amino Acid Sequences MPELQDMADNQPLLEQHLDRRFNRDDPPPYRSPSADEDDDDQDIYEHLGFDLLHPLQSLTAQDRAKIDNLIGEPLTETELIKAQRYFESSQPAYNPGRLYDKAAKDATLRAMMPSYDGCPLEVRKSYNGRAGRQRLNVLIRHGIKKRWQSLGVWNPEWGIPGRVDSKPRDESFRWRWTWQGDTQERGATLGFDHHVAQHPNSRAIRLRQGLRRGEASCVPPPPRHRLEPDASQSTAESFITSRPWYIYGLEQAEESVRLRRLSGRARRLYDEDHGVYVQTRWEESGEFDIREKAGRDDAGLAGKAIPPPTPTRPPVILSPGPPPPPEVARMIASIFGRACPDPEAPAPEPESDGDDGVEEEAAPSPPRRRMRGRKSTAAPAAPSPPRTRMRGRRPMAAPAAAAPEPREPPKRRSARIAATRRQPEPAAAAPEGPTRAARRGKRAPDEPREPRAKSAAGPGNVSQPGRGRGRPRKSAAPSQTSKPQGVAKRKRGRPRKM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.2
3 0.25
4 0.34
5 0.41
6 0.41
7 0.48
8 0.49
9 0.5
10 0.55
11 0.56
12 0.57
13 0.56
14 0.63
15 0.61
16 0.62
17 0.62
18 0.56
19 0.51
20 0.48
21 0.48
22 0.43
23 0.4
24 0.38
25 0.37
26 0.37
27 0.32
28 0.25
29 0.18
30 0.16
31 0.15
32 0.11
33 0.08
34 0.07
35 0.09
36 0.08
37 0.09
38 0.15
39 0.14
40 0.14
41 0.14
42 0.14
43 0.13
44 0.15
45 0.16
46 0.13
47 0.2
48 0.2
49 0.22
50 0.25
51 0.27
52 0.28
53 0.26
54 0.23
55 0.21
56 0.22
57 0.22
58 0.19
59 0.17
60 0.16
61 0.15
62 0.16
63 0.12
64 0.11
65 0.09
66 0.14
67 0.15
68 0.18
69 0.18
70 0.19
71 0.21
72 0.26
73 0.28
74 0.26
75 0.34
76 0.32
77 0.34
78 0.34
79 0.37
80 0.35
81 0.35
82 0.32
83 0.26
84 0.31
85 0.28
86 0.34
87 0.36
88 0.37
89 0.39
90 0.39
91 0.38
92 0.34
93 0.36
94 0.32
95 0.27
96 0.24
97 0.19
98 0.19
99 0.18
100 0.18
101 0.16
102 0.14
103 0.14
104 0.14
105 0.14
106 0.16
107 0.18
108 0.21
109 0.23
110 0.24
111 0.27
112 0.33
113 0.36
114 0.4
115 0.44
116 0.45
117 0.52
118 0.57
119 0.57
120 0.56
121 0.55
122 0.53
123 0.53
124 0.49
125 0.43
126 0.43
127 0.4
128 0.43
129 0.44
130 0.43
131 0.46
132 0.51
133 0.53
134 0.51
135 0.49
136 0.45
137 0.52
138 0.56
139 0.56
140 0.48
141 0.43
142 0.37
143 0.36
144 0.34
145 0.25
146 0.17
147 0.1
148 0.12
149 0.16
150 0.17
151 0.22
152 0.23
153 0.29
154 0.34
155 0.35
156 0.4
157 0.38
158 0.45
159 0.49
160 0.56
161 0.52
162 0.47
163 0.49
164 0.45
165 0.47
166 0.42
167 0.44
168 0.38
169 0.37
170 0.37
171 0.35
172 0.32
173 0.27
174 0.23
175 0.13
176 0.1
177 0.09
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.09
182 0.12
183 0.14
184 0.15
185 0.19
186 0.21
187 0.26
188 0.26
189 0.28
190 0.28
191 0.3
192 0.36
193 0.35
194 0.4
195 0.39
196 0.46
197 0.47
198 0.45
199 0.46
200 0.39
201 0.37
202 0.34
203 0.32
204 0.27
205 0.28
206 0.29
207 0.29
208 0.32
209 0.37
210 0.38
211 0.38
212 0.39
213 0.41
214 0.43
215 0.45
216 0.47
217 0.42
218 0.38
219 0.35
220 0.3
221 0.25
222 0.21
223 0.14
224 0.09
225 0.06
226 0.07
227 0.09
228 0.09
229 0.09
230 0.08
231 0.1
232 0.1
233 0.11
234 0.11
235 0.12
236 0.13
237 0.12
238 0.12
239 0.11
240 0.1
241 0.1
242 0.09
243 0.09
244 0.1
245 0.1
246 0.11
247 0.14
248 0.19
249 0.28
250 0.35
251 0.42
252 0.46
253 0.49
254 0.51
255 0.5
256 0.48
257 0.41
258 0.37
259 0.29
260 0.23
261 0.21
262 0.18
263 0.16
264 0.13
265 0.12
266 0.08
267 0.07
268 0.07
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.14
273 0.14
274 0.14
275 0.14
276 0.15
277 0.15
278 0.16
279 0.16
280 0.11
281 0.12
282 0.11
283 0.11
284 0.12
285 0.13
286 0.13
287 0.12
288 0.11
289 0.09
290 0.1
291 0.11
292 0.1
293 0.1
294 0.1
295 0.15
296 0.2
297 0.26
298 0.26
299 0.29
300 0.31
301 0.32
302 0.33
303 0.35
304 0.32
305 0.28
306 0.31
307 0.31
308 0.31
309 0.29
310 0.29
311 0.24
312 0.23
313 0.23
314 0.21
315 0.18
316 0.18
317 0.18
318 0.17
319 0.18
320 0.16
321 0.15
322 0.13
323 0.12
324 0.13
325 0.12
326 0.13
327 0.13
328 0.13
329 0.14
330 0.16
331 0.21
332 0.21
333 0.23
334 0.24
335 0.22
336 0.22
337 0.2
338 0.21
339 0.15
340 0.14
341 0.11
342 0.1
343 0.09
344 0.09
345 0.08
346 0.05
347 0.05
348 0.06
349 0.07
350 0.08
351 0.1
352 0.15
353 0.23
354 0.29
355 0.36
356 0.45
357 0.56
358 0.66
359 0.74
360 0.78
361 0.79
362 0.78
363 0.8
364 0.76
365 0.68
366 0.59
367 0.5
368 0.49
369 0.44
370 0.43
371 0.37
372 0.39
373 0.4
374 0.44
375 0.52
376 0.55
377 0.62
378 0.69
379 0.69
380 0.71
381 0.69
382 0.71
383 0.66
384 0.57
385 0.46
386 0.37
387 0.38
388 0.29
389 0.27
390 0.21
391 0.21
392 0.23
393 0.29
394 0.37
395 0.37
396 0.43
397 0.53
398 0.6
399 0.61
400 0.66
401 0.69
402 0.7
403 0.76
404 0.79
405 0.77
406 0.77
407 0.79
408 0.72
409 0.67
410 0.57
411 0.49
412 0.44
413 0.41
414 0.36
415 0.3
416 0.29
417 0.27
418 0.29
419 0.28
420 0.23
421 0.22
422 0.2
423 0.27
424 0.35
425 0.39
426 0.46
427 0.55
428 0.63
429 0.69
430 0.75
431 0.77
432 0.78
433 0.83
434 0.82
435 0.82
436 0.8
437 0.73
438 0.69
439 0.64
440 0.56
441 0.48
442 0.5
443 0.48
444 0.42
445 0.43
446 0.4
447 0.41
448 0.43
449 0.41
450 0.34
451 0.31
452 0.35
453 0.38
454 0.43
455 0.47
456 0.54
457 0.63
458 0.7
459 0.71
460 0.75
461 0.77
462 0.81
463 0.8
464 0.79
465 0.75
466 0.71
467 0.74
468 0.69
469 0.63
470 0.56
471 0.55
472 0.54
473 0.6
474 0.65
475 0.67
476 0.72
477 0.8
478 0.87