Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

T5AMT8

Protein Details
Accession T5AMT8    Localization Confidence High Confidence Score 19.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
257-285LEKEDGRRGRERERRRRDREHGHGHRSPABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
88-93RRKRKR
159-162RKKK
230-283KRGAAKVREVKQERKRLQDEREEELRRLEKEDGRRGRERERRRRDREHGHGHRS
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 4, mito 2, cyto_pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019339  CIR_N_dom  
IPR039875  LENG1-like  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF10197  Cir_N  
Amino Acid Sequences MPLHLLGKKSWNVYNTDNIARVRRDEAAAEAAEEAEEQRMQEIDAQRRLATLRGEAPPPVDTAQDEGESGDVARHTGASRNDYEGGARRKRKRNGEDDTDFELRLARDRNEAPKKMAGDVRRQSSSAPIVDRTGHINLFGDERSRAHAEKNDEAEKEARKKKREYEDQYTMRFSNAAGREGLARPWYSQQDMVAALGEAPSKDVWGNQDPRRKAREAQRLVAHDPLAMMKRGAAKVREVKQERKRLQDEREEELRRLEKEDGRRGRERERRRRDREHGHGHRSPAGQSESRRGSQQEETQR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.44
3 0.44
4 0.44
5 0.43
6 0.45
7 0.42
8 0.41
9 0.36
10 0.34
11 0.31
12 0.28
13 0.28
14 0.26
15 0.24
16 0.22
17 0.19
18 0.16
19 0.14
20 0.13
21 0.1
22 0.08
23 0.08
24 0.07
25 0.08
26 0.08
27 0.09
28 0.14
29 0.21
30 0.27
31 0.31
32 0.33
33 0.32
34 0.33
35 0.34
36 0.31
37 0.26
38 0.22
39 0.22
40 0.24
41 0.26
42 0.25
43 0.26
44 0.23
45 0.24
46 0.21
47 0.16
48 0.13
49 0.15
50 0.16
51 0.14
52 0.13
53 0.11
54 0.1
55 0.1
56 0.09
57 0.08
58 0.06
59 0.06
60 0.06
61 0.07
62 0.07
63 0.12
64 0.15
65 0.18
66 0.2
67 0.23
68 0.24
69 0.23
70 0.25
71 0.27
72 0.33
73 0.38
74 0.45
75 0.51
76 0.59
77 0.68
78 0.76
79 0.77
80 0.79
81 0.78
82 0.79
83 0.74
84 0.69
85 0.66
86 0.57
87 0.48
88 0.38
89 0.32
90 0.22
91 0.22
92 0.2
93 0.15
94 0.18
95 0.21
96 0.31
97 0.37
98 0.39
99 0.39
100 0.4
101 0.4
102 0.39
103 0.4
104 0.34
105 0.35
106 0.38
107 0.4
108 0.37
109 0.36
110 0.33
111 0.32
112 0.32
113 0.24
114 0.21
115 0.17
116 0.17
117 0.18
118 0.18
119 0.17
120 0.16
121 0.13
122 0.12
123 0.11
124 0.11
125 0.11
126 0.11
127 0.09
128 0.08
129 0.08
130 0.11
131 0.13
132 0.13
133 0.14
134 0.18
135 0.21
136 0.24
137 0.28
138 0.28
139 0.26
140 0.27
141 0.28
142 0.28
143 0.32
144 0.36
145 0.38
146 0.41
147 0.45
148 0.52
149 0.59
150 0.65
151 0.65
152 0.66
153 0.7
154 0.69
155 0.68
156 0.62
157 0.52
158 0.42
159 0.33
160 0.24
161 0.22
162 0.19
163 0.17
164 0.15
165 0.15
166 0.17
167 0.17
168 0.19
169 0.13
170 0.12
171 0.12
172 0.15
173 0.17
174 0.16
175 0.17
176 0.16
177 0.15
178 0.15
179 0.14
180 0.11
181 0.08
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.05
186 0.06
187 0.05
188 0.06
189 0.06
190 0.07
191 0.11
192 0.18
193 0.26
194 0.31
195 0.4
196 0.43
197 0.49
198 0.54
199 0.52
200 0.52
201 0.55
202 0.59
203 0.57
204 0.6
205 0.6
206 0.59
207 0.59
208 0.55
209 0.44
210 0.34
211 0.28
212 0.24
213 0.19
214 0.16
215 0.13
216 0.13
217 0.18
218 0.2
219 0.24
220 0.22
221 0.28
222 0.36
223 0.42
224 0.51
225 0.52
226 0.59
227 0.65
228 0.74
229 0.73
230 0.74
231 0.75
232 0.73
233 0.75
234 0.75
235 0.7
236 0.66
237 0.7
238 0.63
239 0.56
240 0.55
241 0.52
242 0.43
243 0.42
244 0.41
245 0.38
246 0.43
247 0.53
248 0.55
249 0.57
250 0.64
251 0.65
252 0.7
253 0.74
254 0.76
255 0.77
256 0.8
257 0.84
258 0.85
259 0.91
260 0.91
261 0.91
262 0.91
263 0.91
264 0.9
265 0.88
266 0.83
267 0.77
268 0.74
269 0.65
270 0.55
271 0.5
272 0.46
273 0.42
274 0.41
275 0.46
276 0.45
277 0.46
278 0.48
279 0.44
280 0.43
281 0.46