Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

T5ABM2

Protein Details
Accession T5ABM2    Localization Confidence High Confidence Score 17.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
236-257NGEPRGPRPKEVRRRANRLGLGBasic
267-306LGSWDQKGGKKRRPRLDEYRREQSRRKESRRDVDSYKRERBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
239-259PRGPRPKEVRRRANRLGLGAK
272-328QKGGKKRRPRLDEYRREQSRRKESRRDVDSYKRERERERDGSRAGSRDRDRHRDRRR
Subcellular Location(s) nucl 15, mito 8, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045166  Spp2-like  
IPR026822  Spp2/MOS2_G-patch  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF12656  G-patch_2  
Amino Acid Sequences MSNQDKGRIAIKFASPSANRPPPRPSASSSLGKRPRPHAFGGHDSDSDNDEHSGQHEVITGFGVDGAETERERRGREASRKEFFIQRQPNRDWRAEVKAHKRGKNLLPEEARQQQNLVVKTEPADQDEGIQWGLTVKKSKTDDNEDGSPPGEVPAARDDENQRPTPAARTADEEALDALLGRTPTAKKIITQPPLSEDEAYLRDAATAGAASTLDDYEAMPVEEFGAALLRGMGWNGEPRGPRPKEVRRRANRLGLGAKELKESEDLGSWDQKGGKKRRPRLDEYRREQSRRKESRRDVDSYKRERERERDGSRAGSRDRDRHRDRRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.36
3 0.39
4 0.46
5 0.51
6 0.5
7 0.49
8 0.54
9 0.54
10 0.59
11 0.58
12 0.53
13 0.51
14 0.54
15 0.59
16 0.58
17 0.6
18 0.62
19 0.64
20 0.65
21 0.66
22 0.68
23 0.64
24 0.64
25 0.61
26 0.6
27 0.61
28 0.61
29 0.56
30 0.48
31 0.44
32 0.41
33 0.34
34 0.28
35 0.21
36 0.16
37 0.13
38 0.12
39 0.13
40 0.15
41 0.13
42 0.13
43 0.14
44 0.13
45 0.13
46 0.14
47 0.12
48 0.09
49 0.09
50 0.08
51 0.05
52 0.05
53 0.07
54 0.08
55 0.08
56 0.1
57 0.14
58 0.17
59 0.19
60 0.21
61 0.26
62 0.34
63 0.44
64 0.53
65 0.57
66 0.6
67 0.61
68 0.62
69 0.62
70 0.57
71 0.57
72 0.57
73 0.55
74 0.59
75 0.6
76 0.66
77 0.65
78 0.63
79 0.57
80 0.51
81 0.52
82 0.51
83 0.54
84 0.55
85 0.59
86 0.64
87 0.64
88 0.63
89 0.63
90 0.63
91 0.64
92 0.58
93 0.57
94 0.52
95 0.5
96 0.52
97 0.52
98 0.47
99 0.37
100 0.34
101 0.29
102 0.31
103 0.31
104 0.27
105 0.2
106 0.18
107 0.2
108 0.24
109 0.21
110 0.17
111 0.17
112 0.14
113 0.15
114 0.16
115 0.15
116 0.1
117 0.09
118 0.07
119 0.08
120 0.09
121 0.09
122 0.12
123 0.12
124 0.18
125 0.21
126 0.24
127 0.28
128 0.35
129 0.37
130 0.38
131 0.41
132 0.36
133 0.34
134 0.31
135 0.26
136 0.18
137 0.14
138 0.1
139 0.06
140 0.07
141 0.09
142 0.11
143 0.11
144 0.13
145 0.17
146 0.22
147 0.26
148 0.26
149 0.24
150 0.22
151 0.22
152 0.23
153 0.23
154 0.19
155 0.16
156 0.19
157 0.2
158 0.2
159 0.2
160 0.17
161 0.13
162 0.11
163 0.1
164 0.06
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.06
170 0.07
171 0.08
172 0.12
173 0.12
174 0.13
175 0.22
176 0.3
177 0.34
178 0.35
179 0.35
180 0.35
181 0.38
182 0.38
183 0.3
184 0.22
185 0.18
186 0.18
187 0.18
188 0.14
189 0.1
190 0.09
191 0.09
192 0.08
193 0.06
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.04
213 0.05
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.08
223 0.09
224 0.13
225 0.15
226 0.18
227 0.28
228 0.3
229 0.35
230 0.41
231 0.5
232 0.58
233 0.67
234 0.75
235 0.74
236 0.82
237 0.84
238 0.84
239 0.76
240 0.72
241 0.67
242 0.57
243 0.53
244 0.48
245 0.41
246 0.35
247 0.31
248 0.26
249 0.22
250 0.22
251 0.17
252 0.16
253 0.16
254 0.16
255 0.2
256 0.19
257 0.2
258 0.23
259 0.26
260 0.33
261 0.41
262 0.48
263 0.55
264 0.65
265 0.73
266 0.77
267 0.82
268 0.84
269 0.85
270 0.87
271 0.85
272 0.86
273 0.85
274 0.83
275 0.82
276 0.81
277 0.81
278 0.81
279 0.82
280 0.82
281 0.83
282 0.87
283 0.86
284 0.82
285 0.79
286 0.79
287 0.8
288 0.78
289 0.78
290 0.76
291 0.75
292 0.76
293 0.76
294 0.75
295 0.75
296 0.73
297 0.7
298 0.66
299 0.68
300 0.65
301 0.64
302 0.58
303 0.57
304 0.58
305 0.6
306 0.65
307 0.68
308 0.72