Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

T5A909

Protein Details
Accession T5A909    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
287-310DKQMTTAQRNPRKRPRRDDFDDHYHydrophilic
382-411LANWKANRRGNYHRKRRRWARTRQIVDGTRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
389-402RRGNYHRKRRRWAR
Subcellular Location(s) mito 16, cyto 6, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0008168  F:methyltransferase activity  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MSFRSTVQPNGWIAVRLPNELLRLLQVTPNTTISLGKYGSFPSNLLIERPLNLCYEVQEKREGENFSRLRVVPATELNADQLTETSVDAADGDDVIVPADGEELALVDESGRVVARSNREIIDDSARQTLTTAEIEELKRKGAAAGKELIAKLMLSHTGIDQKTAFSLAKYKLLKEKKYLRRFTVLPVDVTLLAQWVLEDRDAGRILDMRLEMIGLVGCWADVHFGGFPIPGATEPHGGRWLAVDDAGGLLVAVMAERMGILHRDAEEDEDHLDSISGLGTSDAAEDKQMTTAQRNPRKRPRRDDFDDHYALTNTITVVHFNTQPNLSLLRYFDYDASDPNPPFPYHPLFTNLLPISWLQFVNPEEDPVYADKPADATPEELANWKANRRGNYHRKRRRWARTRQIVDGTRAGGFSGLAVASAMDPVSVLRHALPLLAGGSPIAISSPNIEPLTQLADCFAIARRTAWVSSPPPGAEGKTVAELDRWEGTPEFPINPTLVLGATIQTSRATRWQVLPGRTHPFMTARGGPEGYVFTGWRAIPAEGRISARGRFQRRRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.29
3 0.25
4 0.26
5 0.26
6 0.27
7 0.26
8 0.25
9 0.2
10 0.2
11 0.19
12 0.2
13 0.2
14 0.21
15 0.23
16 0.24
17 0.22
18 0.21
19 0.21
20 0.19
21 0.22
22 0.2
23 0.18
24 0.18
25 0.2
26 0.23
27 0.23
28 0.21
29 0.18
30 0.23
31 0.23
32 0.22
33 0.23
34 0.21
35 0.23
36 0.24
37 0.23
38 0.2
39 0.21
40 0.2
41 0.18
42 0.25
43 0.26
44 0.27
45 0.33
46 0.32
47 0.34
48 0.4
49 0.41
50 0.37
51 0.44
52 0.42
53 0.38
54 0.43
55 0.39
56 0.37
57 0.35
58 0.33
59 0.26
60 0.28
61 0.29
62 0.25
63 0.25
64 0.23
65 0.21
66 0.19
67 0.15
68 0.13
69 0.1
70 0.09
71 0.09
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.06
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.04
85 0.04
86 0.05
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.04
94 0.03
95 0.04
96 0.04
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.07
101 0.12
102 0.17
103 0.2
104 0.23
105 0.23
106 0.25
107 0.28
108 0.28
109 0.3
110 0.27
111 0.26
112 0.27
113 0.26
114 0.24
115 0.22
116 0.2
117 0.16
118 0.15
119 0.13
120 0.1
121 0.15
122 0.16
123 0.21
124 0.21
125 0.19
126 0.18
127 0.18
128 0.2
129 0.21
130 0.22
131 0.21
132 0.24
133 0.24
134 0.27
135 0.27
136 0.24
137 0.19
138 0.16
139 0.13
140 0.1
141 0.1
142 0.07
143 0.08
144 0.09
145 0.15
146 0.15
147 0.16
148 0.16
149 0.15
150 0.15
151 0.17
152 0.16
153 0.1
154 0.16
155 0.16
156 0.23
157 0.24
158 0.26
159 0.33
160 0.41
161 0.44
162 0.47
163 0.56
164 0.59
165 0.68
166 0.73
167 0.68
168 0.66
169 0.64
170 0.61
171 0.6
172 0.51
173 0.41
174 0.35
175 0.32
176 0.26
177 0.25
178 0.19
179 0.09
180 0.07
181 0.06
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.06
187 0.06
188 0.09
189 0.09
190 0.1
191 0.09
192 0.1
193 0.11
194 0.12
195 0.12
196 0.09
197 0.09
198 0.08
199 0.08
200 0.06
201 0.06
202 0.03
203 0.04
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.06
220 0.07
221 0.11
222 0.12
223 0.13
224 0.14
225 0.14
226 0.14
227 0.13
228 0.12
229 0.08
230 0.08
231 0.07
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.04
236 0.03
237 0.02
238 0.02
239 0.02
240 0.02
241 0.02
242 0.02
243 0.02
244 0.02
245 0.02
246 0.02
247 0.03
248 0.04
249 0.05
250 0.05
251 0.06
252 0.07
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.09
257 0.08
258 0.08
259 0.07
260 0.07
261 0.05
262 0.05
263 0.04
264 0.03
265 0.03
266 0.03
267 0.03
268 0.03
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.04
274 0.05
275 0.05
276 0.07
277 0.07
278 0.1
279 0.16
280 0.26
281 0.34
282 0.42
283 0.5
284 0.6
285 0.7
286 0.76
287 0.8
288 0.8
289 0.81
290 0.81
291 0.81
292 0.77
293 0.74
294 0.67
295 0.57
296 0.49
297 0.39
298 0.31
299 0.23
300 0.16
301 0.08
302 0.08
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.09
307 0.13
308 0.13
309 0.15
310 0.13
311 0.14
312 0.15
313 0.15
314 0.14
315 0.12
316 0.12
317 0.12
318 0.13
319 0.13
320 0.12
321 0.13
322 0.13
323 0.13
324 0.14
325 0.17
326 0.16
327 0.17
328 0.19
329 0.17
330 0.18
331 0.21
332 0.23
333 0.2
334 0.22
335 0.24
336 0.24
337 0.24
338 0.29
339 0.25
340 0.2
341 0.19
342 0.18
343 0.15
344 0.15
345 0.15
346 0.08
347 0.11
348 0.12
349 0.15
350 0.15
351 0.14
352 0.13
353 0.13
354 0.14
355 0.13
356 0.14
357 0.11
358 0.1
359 0.1
360 0.1
361 0.11
362 0.11
363 0.1
364 0.1
365 0.11
366 0.12
367 0.12
368 0.12
369 0.13
370 0.16
371 0.17
372 0.18
373 0.23
374 0.27
375 0.31
376 0.36
377 0.45
378 0.52
379 0.61
380 0.7
381 0.75
382 0.8
383 0.87
384 0.91
385 0.92
386 0.91
387 0.91
388 0.91
389 0.91
390 0.87
391 0.83
392 0.8
393 0.73
394 0.66
395 0.58
396 0.48
397 0.37
398 0.32
399 0.25
400 0.16
401 0.12
402 0.08
403 0.07
404 0.05
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.05
410 0.05
411 0.03
412 0.03
413 0.04
414 0.05
415 0.05
416 0.06
417 0.06
418 0.08
419 0.08
420 0.08
421 0.08
422 0.08
423 0.08
424 0.08
425 0.07
426 0.06
427 0.06
428 0.05
429 0.05
430 0.05
431 0.04
432 0.04
433 0.08
434 0.09
435 0.14
436 0.15
437 0.15
438 0.15
439 0.15
440 0.2
441 0.17
442 0.16
443 0.12
444 0.11
445 0.11
446 0.12
447 0.14
448 0.11
449 0.12
450 0.13
451 0.14
452 0.17
453 0.18
454 0.19
455 0.23
456 0.23
457 0.28
458 0.31
459 0.28
460 0.28
461 0.29
462 0.28
463 0.23
464 0.22
465 0.19
466 0.19
467 0.19
468 0.18
469 0.18
470 0.17
471 0.18
472 0.19
473 0.18
474 0.17
475 0.17
476 0.18
477 0.21
478 0.22
479 0.21
480 0.19
481 0.2
482 0.18
483 0.18
484 0.17
485 0.13
486 0.11
487 0.1
488 0.09
489 0.09
490 0.09
491 0.09
492 0.1
493 0.11
494 0.12
495 0.14
496 0.2
497 0.24
498 0.26
499 0.3
500 0.39
501 0.44
502 0.49
503 0.54
504 0.54
505 0.57
506 0.55
507 0.52
508 0.45
509 0.41
510 0.39
511 0.38
512 0.37
513 0.32
514 0.35
515 0.34
516 0.31
517 0.29
518 0.28
519 0.23
520 0.19
521 0.16
522 0.13
523 0.17
524 0.17
525 0.18
526 0.19
527 0.18
528 0.2
529 0.22
530 0.26
531 0.24
532 0.27
533 0.29
534 0.3
535 0.31
536 0.37
537 0.43
538 0.49