FuNGI

T5A343

Protein Details

Accession

T5A343

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
33-52	QDSISQRPFKRQKGSFNADY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009057 Homeobox-like_sf IPR039601 Rrn5 IPR001005 SANT/Myb
Gene Ontology	GO:0000500 C:RNA polymerase I upstream activating factor complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0042790 P:nucleolar large rRNA transcription by RNA polymerase I
CDD	cd00167 SANT

Amino Acid Sequences

MDPNGDLNSDKPGSGIADEGVTPPQHSHKRLSQDSISQRPFKRQKGSFNADYLELLNRDIDDAVHRVCLDDKFDLPPTEVGLTTWSALEKRLFFEAIARLGRLDLSGIASRITSKSIVEVRQYIDFLDEARDLRRRDRGSFLEVAEYPAAVELSEPCCHAQEQAADAISLLQEHRETQREEKKWGCNWNITPKVASKLERGGDDTDQSPPFTQLFHLRRWLKLSGRIFMNSSVPDGNWTFIDDVPPSVWATTFNDFHSLVVSLTKRLVQTTLIISTSRIRDKKELVPKTSGVVRKRDVEAAVASLGMSPNTQQFWNKSARRLRLNVVQDEDSDEEPLTYNQVESLLVDEGDEDIPIEVDTITPKVVSDHDQDGDLSDDSLGDLSDDSLSDPSNDCSEGEKSPDSSSARRALKPSIAIERRQEEQAQRYDEHASYKAEVDMWDVLQTKPPMEIPKRQEPGPLERSNVDVESPVKRDWKSQLKYHSEWETSGR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.17
2	0.17
3	0.11
4	0.11
5	0.12
6	0.13
7	0.15
8	0.14
9	0.14
10	0.15
11	0.24
12	0.3
13	0.34
14	0.4
15	0.44
16	0.53
17	0.58
18	0.63
19	0.59
20	0.61
21	0.66
22	0.69
23	0.69
24	0.68
25	0.65
26	0.69
27	0.72
28	0.71
29	0.72
30	0.69
31	0.73
32	0.75
33	0.81
34	0.75
35	0.7
36	0.63
37	0.54
38	0.48
39	0.39
40	0.32
41	0.24
42	0.19
43	0.16
44	0.14
45	0.14
46	0.13
47	0.12
48	0.11
49	0.13
50	0.13
51	0.14
52	0.14
53	0.14
54	0.17
55	0.18
56	0.19
57	0.18
58	0.19
59	0.22
60	0.26
61	0.26
62	0.25
63	0.24
64	0.23
65	0.22
66	0.2
67	0.17
68	0.15
69	0.14
70	0.13
71	0.13
72	0.11
73	0.1
74	0.13
75	0.16
76	0.15
77	0.17
78	0.19
79	0.19
80	0.17
81	0.22
82	0.22
83	0.24
84	0.24
85	0.22
86	0.19
87	0.19
88	0.19
89	0.15
90	0.12
91	0.07
92	0.09
93	0.11
94	0.11
95	0.11
96	0.11
97	0.12
98	0.12
99	0.13
100	0.11
101	0.1
102	0.15
103	0.19
104	0.22
105	0.23
106	0.26
107	0.26
108	0.27
109	0.27
110	0.22
111	0.18
112	0.16
113	0.13
114	0.13
115	0.13
116	0.11
117	0.14
118	0.2
119	0.21
120	0.25
121	0.33
122	0.33
123	0.35
124	0.42
125	0.42
126	0.42
127	0.44
128	0.4
129	0.36
130	0.33
131	0.32
132	0.24
133	0.2
134	0.15
135	0.11
136	0.11
137	0.06
138	0.06
139	0.06
140	0.09
141	0.1
142	0.11
143	0.11
144	0.12
145	0.13
146	0.13
147	0.13
148	0.12
149	0.13
150	0.14
151	0.14
152	0.13
153	0.12
154	0.12
155	0.09
156	0.08
157	0.06
158	0.05
159	0.05
160	0.07
161	0.1
162	0.14
163	0.16
164	0.25
165	0.34
166	0.36
167	0.41
168	0.45
169	0.49
170	0.51
171	0.56
172	0.51
173	0.49
174	0.5
175	0.55
176	0.54
177	0.48
178	0.44
179	0.38
180	0.4
181	0.36
182	0.34
183	0.26
184	0.27
185	0.28
186	0.27
187	0.27
188	0.25
189	0.22
190	0.22
191	0.2
192	0.18
193	0.17
194	0.17
195	0.15
196	0.14
197	0.13
198	0.12
199	0.12
200	0.18
201	0.2
202	0.22
203	0.3
204	0.31
205	0.32
206	0.35
207	0.38
208	0.31
209	0.36
210	0.36
211	0.32
212	0.32
213	0.32
214	0.29
215	0.26
216	0.25
217	0.18
218	0.17
219	0.12
220	0.11
221	0.12
222	0.11
223	0.11
224	0.09
225	0.09
226	0.09
227	0.09
228	0.1
229	0.08
230	0.08
231	0.08
232	0.08
233	0.08
234	0.06
235	0.06
236	0.06
237	0.09
238	0.11
239	0.12
240	0.12
241	0.15
242	0.15
243	0.15
244	0.14
245	0.12
246	0.09
247	0.11
248	0.11
249	0.09
250	0.1
251	0.12
252	0.11
253	0.11
254	0.12
255	0.09
256	0.11
257	0.12
258	0.13
259	0.11
260	0.11
261	0.12
262	0.14
263	0.17
264	0.22
265	0.22
266	0.23
267	0.26
268	0.31
269	0.39
270	0.46
271	0.49
272	0.46
273	0.48
274	0.45
275	0.44
276	0.45
277	0.43
278	0.36
279	0.35
280	0.34
281	0.34
282	0.35
283	0.35
284	0.3
285	0.26
286	0.23
287	0.18
288	0.15
289	0.11
290	0.1
291	0.08
292	0.07
293	0.06
294	0.05
295	0.05
296	0.06
297	0.08
298	0.09
299	0.11
300	0.13
301	0.17
302	0.26
303	0.28
304	0.35
305	0.41
306	0.47
307	0.51
308	0.53
309	0.53
310	0.52
311	0.55
312	0.5
313	0.47
314	0.41
315	0.34
316	0.34
317	0.31
318	0.23
319	0.19
320	0.15
321	0.11
322	0.11
323	0.11
324	0.1
325	0.08
326	0.07
327	0.07
328	0.07
329	0.07
330	0.06
331	0.08
332	0.07
333	0.07
334	0.06
335	0.06
336	0.07
337	0.07
338	0.07
339	0.05
340	0.05
341	0.05
342	0.05
343	0.05
344	0.04
345	0.04
346	0.06
347	0.06
348	0.06
349	0.06
350	0.06
351	0.07
352	0.09
353	0.13
354	0.16
355	0.19
356	0.19
357	0.2
358	0.2
359	0.19
360	0.2
361	0.16
362	0.12
363	0.09
364	0.08
365	0.07
366	0.08
367	0.06
368	0.04
369	0.04
370	0.05
371	0.05
372	0.05
373	0.06
374	0.07
375	0.07
376	0.08
377	0.09
378	0.1
379	0.12
380	0.12
381	0.12
382	0.15
383	0.17
384	0.17
385	0.2
386	0.2
387	0.21
388	0.21
389	0.27
390	0.27
391	0.27
392	0.31
393	0.36
394	0.39
395	0.41
396	0.43
397	0.42
398	0.43
399	0.45
400	0.44
401	0.46
402	0.45
403	0.46
404	0.5
405	0.49
406	0.47
407	0.46
408	0.46
409	0.42
410	0.45
411	0.48
412	0.46
413	0.43
414	0.43
415	0.44
416	0.4
417	0.38
418	0.33
419	0.29
420	0.26
421	0.26
422	0.25
423	0.21
424	0.2
425	0.19
426	0.18
427	0.16
428	0.17
429	0.18
430	0.17
431	0.22
432	0.23
433	0.21
434	0.21
435	0.24
436	0.3
437	0.35
438	0.44
439	0.45
440	0.55
441	0.58
442	0.57
443	0.6
444	0.56
445	0.6
446	0.6
447	0.56
448	0.49
449	0.46
450	0.48
451	0.44
452	0.39
453	0.3
454	0.24
455	0.23
456	0.26
457	0.28
458	0.29
459	0.32
460	0.32
461	0.38
462	0.44
463	0.52
464	0.53
465	0.58
466	0.64
467	0.67
468	0.7
469	0.71
470	0.7
471	0.62

T5A343

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer