Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

T5A246

Protein Details
Accession T5A246    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-40EPSPKRPRRLTGAQSRHRHQHSBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035426  Gemin2/Brr1  
Gene Ontology GO:0000387  P:spliceosomal snRNP assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04938  SIP1  
Amino Acid Sequences MSAKRDYDDVDEGEISDDEPSPKRPRRLTGAQSRHRHQHSAIDPTWGQKYVFSNKGDATTIPYGEESDFEHDAEAMAYLRSVRQEAHGISHLLVAPTKQIGPQLPPELQGQHHDDEHEVKSESDGHQSVYAIASDARAYYEDGAYIARDPETDDDHEAQDEQARREKELHNAFFASTLDRYIRLRRILHSKPPPGAAKRLSVTQLTYAASLDSSTTIKRWSTIIRTADPHPLQLVLMSKDSVLRVLHVLLGGKFFFGGYTLSERTSQWLGGLAAAGSLGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.16
3 0.13
4 0.13
5 0.13
6 0.15
7 0.21
8 0.29
9 0.37
10 0.45
11 0.5
12 0.56
13 0.62
14 0.7
15 0.74
16 0.75
17 0.78
18 0.79
19 0.82
20 0.81
21 0.81
22 0.75
23 0.69
24 0.6
25 0.59
26 0.55
27 0.55
28 0.5
29 0.46
30 0.43
31 0.42
32 0.43
33 0.35
34 0.29
35 0.24
36 0.29
37 0.3
38 0.36
39 0.34
40 0.34
41 0.33
42 0.36
43 0.33
44 0.28
45 0.26
46 0.22
47 0.21
48 0.19
49 0.18
50 0.17
51 0.16
52 0.16
53 0.12
54 0.14
55 0.14
56 0.13
57 0.13
58 0.12
59 0.12
60 0.11
61 0.1
62 0.06
63 0.05
64 0.05
65 0.05
66 0.06
67 0.07
68 0.07
69 0.07
70 0.09
71 0.13
72 0.14
73 0.17
74 0.19
75 0.19
76 0.18
77 0.19
78 0.18
79 0.14
80 0.14
81 0.1
82 0.09
83 0.09
84 0.09
85 0.08
86 0.1
87 0.11
88 0.13
89 0.17
90 0.2
91 0.19
92 0.21
93 0.22
94 0.21
95 0.2
96 0.22
97 0.21
98 0.19
99 0.19
100 0.17
101 0.17
102 0.19
103 0.19
104 0.17
105 0.14
106 0.12
107 0.13
108 0.14
109 0.14
110 0.14
111 0.14
112 0.12
113 0.12
114 0.12
115 0.12
116 0.1
117 0.09
118 0.06
119 0.06
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.06
127 0.06
128 0.05
129 0.05
130 0.06
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.05
137 0.07
138 0.09
139 0.1
140 0.12
141 0.13
142 0.13
143 0.13
144 0.13
145 0.11
146 0.13
147 0.14
148 0.14
149 0.18
150 0.19
151 0.2
152 0.23
153 0.25
154 0.3
155 0.36
156 0.36
157 0.32
158 0.32
159 0.31
160 0.28
161 0.26
162 0.2
163 0.11
164 0.11
165 0.1
166 0.11
167 0.13
168 0.17
169 0.21
170 0.24
171 0.26
172 0.29
173 0.38
174 0.42
175 0.5
176 0.54
177 0.55
178 0.52
179 0.56
180 0.58
181 0.52
182 0.53
183 0.45
184 0.41
185 0.38
186 0.38
187 0.35
188 0.3
189 0.27
190 0.23
191 0.23
192 0.18
193 0.17
194 0.14
195 0.12
196 0.11
197 0.1
198 0.08
199 0.07
200 0.08
201 0.08
202 0.09
203 0.11
204 0.12
205 0.13
206 0.15
207 0.19
208 0.24
209 0.31
210 0.35
211 0.36
212 0.4
213 0.41
214 0.48
215 0.43
216 0.39
217 0.32
218 0.27
219 0.23
220 0.22
221 0.23
222 0.16
223 0.17
224 0.16
225 0.15
226 0.16
227 0.17
228 0.17
229 0.14
230 0.13
231 0.13
232 0.13
233 0.14
234 0.14
235 0.15
236 0.13
237 0.15
238 0.14
239 0.12
240 0.11
241 0.1
242 0.09
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.14
247 0.15
248 0.17
249 0.19
250 0.19
251 0.23
252 0.24
253 0.22
254 0.17
255 0.19
256 0.18
257 0.17
258 0.17
259 0.12
260 0.1