Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

T5AKW2

Protein Details
Accession T5AKW2    Localization Confidence High Confidence Score 20.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-127LPPRMSRKKQTAPGAQKPPRHydrophilic
385-404GENAGTKKRKLRQGLFDPPSHydrophilic
416-438QEAFRRFQQRPKKSRAMLNGTRLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
115-116KK
122-126AQKPP
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR003195  TFIID_TAF13  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0006366  P:transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF02269  TFIID-18kDa  
CDD cd07978  TAF13  
Amino Acid Sequences MEEIHPHQSQTIMSPTMEEAHHDEIQEDWFPDMEEHKPNQFQESLFSIIEQDHQCQNLEDWSPDGEQNKQHQCQEDSFSITEETHQCQSQEKSSSIREEQKQHQSQNLPPRMSRKKQTAPGAQKPPRRSPHTTRNLMINKIEQMMYVSGETAEPSVETSSIIEDIVRQQVIELLRNCTELASRRGSKSISTNDLIFQIRHDQAKVSRLRTFLSWKDVRKNVKDSEDKGADADLAAGDDPGAGGVMPGGPVDEGAKKNKKQKVGLPWEPASFYPVEVPERDDEDDEEEDEMNYMTLQRLRKADERTKVMTREEYVTWSEYRQASFTWRKGKRFREWAGFGIVTDSKPSDDIVDILGFLTFEMVATLTEMALKAKDQEDMARAQTGGENAGTKKRKLRQGLFDPPSEGKTPIEPRHVQEAFRRFQQRPKKSRAMLNGTRLLQHTALNII
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.22
3 0.23
4 0.22
5 0.21
6 0.2
7 0.24
8 0.25
9 0.24
10 0.23
11 0.21
12 0.24
13 0.24
14 0.2
15 0.15
16 0.13
17 0.14
18 0.15
19 0.16
20 0.18
21 0.23
22 0.25
23 0.31
24 0.35
25 0.36
26 0.39
27 0.39
28 0.35
29 0.32
30 0.33
31 0.31
32 0.26
33 0.25
34 0.21
35 0.19
36 0.25
37 0.22
38 0.22
39 0.21
40 0.22
41 0.23
42 0.23
43 0.24
44 0.23
45 0.23
46 0.2
47 0.18
48 0.19
49 0.2
50 0.22
51 0.23
52 0.22
53 0.26
54 0.34
55 0.42
56 0.44
57 0.46
58 0.5
59 0.51
60 0.51
61 0.51
62 0.45
63 0.4
64 0.36
65 0.33
66 0.28
67 0.25
68 0.25
69 0.22
70 0.23
71 0.21
72 0.22
73 0.21
74 0.26
75 0.29
76 0.31
77 0.32
78 0.31
79 0.33
80 0.35
81 0.41
82 0.41
83 0.47
84 0.47
85 0.5
86 0.56
87 0.62
88 0.65
89 0.62
90 0.63
91 0.59
92 0.6
93 0.63
94 0.62
95 0.54
96 0.5
97 0.57
98 0.6
99 0.62
100 0.63
101 0.62
102 0.63
103 0.68
104 0.75
105 0.76
106 0.76
107 0.78
108 0.82
109 0.79
110 0.78
111 0.77
112 0.77
113 0.75
114 0.73
115 0.72
116 0.7
117 0.73
118 0.77
119 0.76
120 0.68
121 0.69
122 0.66
123 0.6
124 0.53
125 0.45
126 0.36
127 0.32
128 0.3
129 0.2
130 0.17
131 0.15
132 0.13
133 0.11
134 0.09
135 0.07
136 0.07
137 0.08
138 0.06
139 0.05
140 0.04
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.05
150 0.06
151 0.07
152 0.1
153 0.09
154 0.08
155 0.08
156 0.11
157 0.12
158 0.17
159 0.17
160 0.17
161 0.18
162 0.19
163 0.19
164 0.16
165 0.17
166 0.15
167 0.18
168 0.22
169 0.24
170 0.24
171 0.26
172 0.26
173 0.26
174 0.29
175 0.3
176 0.28
177 0.26
178 0.26
179 0.24
180 0.27
181 0.26
182 0.2
183 0.16
184 0.16
185 0.17
186 0.18
187 0.17
188 0.16
189 0.17
190 0.25
191 0.29
192 0.27
193 0.27
194 0.27
195 0.28
196 0.28
197 0.31
198 0.26
199 0.3
200 0.32
201 0.32
202 0.38
203 0.43
204 0.47
205 0.46
206 0.49
207 0.44
208 0.47
209 0.49
210 0.45
211 0.46
212 0.41
213 0.37
214 0.31
215 0.28
216 0.19
217 0.15
218 0.12
219 0.05
220 0.04
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.02
227 0.02
228 0.02
229 0.02
230 0.02
231 0.02
232 0.02
233 0.02
234 0.03
235 0.02
236 0.03
237 0.04
238 0.08
239 0.1
240 0.17
241 0.24
242 0.28
243 0.37
244 0.42
245 0.47
246 0.48
247 0.53
248 0.57
249 0.61
250 0.63
251 0.62
252 0.59
253 0.54
254 0.5
255 0.43
256 0.34
257 0.24
258 0.17
259 0.13
260 0.12
261 0.13
262 0.12
263 0.14
264 0.13
265 0.16
266 0.16
267 0.15
268 0.14
269 0.16
270 0.16
271 0.14
272 0.14
273 0.11
274 0.1
275 0.1
276 0.09
277 0.06
278 0.05
279 0.05
280 0.06
281 0.1
282 0.11
283 0.15
284 0.17
285 0.21
286 0.28
287 0.35
288 0.42
289 0.45
290 0.5
291 0.51
292 0.55
293 0.53
294 0.5
295 0.45
296 0.39
297 0.35
298 0.3
299 0.28
300 0.25
301 0.24
302 0.22
303 0.19
304 0.22
305 0.2
306 0.2
307 0.18
308 0.17
309 0.23
310 0.3
311 0.35
312 0.41
313 0.46
314 0.53
315 0.61
316 0.69
317 0.71
318 0.73
319 0.73
320 0.73
321 0.7
322 0.64
323 0.61
324 0.52
325 0.42
326 0.36
327 0.31
328 0.21
329 0.19
330 0.17
331 0.12
332 0.12
333 0.12
334 0.1
335 0.09
336 0.1
337 0.1
338 0.1
339 0.09
340 0.09
341 0.09
342 0.07
343 0.06
344 0.06
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.06
354 0.06
355 0.07
356 0.07
357 0.08
358 0.1
359 0.11
360 0.13
361 0.13
362 0.16
363 0.18
364 0.21
365 0.22
366 0.21
367 0.2
368 0.19
369 0.19
370 0.17
371 0.16
372 0.14
373 0.15
374 0.15
375 0.25
376 0.28
377 0.3
378 0.38
379 0.44
380 0.52
381 0.59
382 0.67
383 0.68
384 0.74
385 0.82
386 0.77
387 0.72
388 0.68
389 0.59
390 0.54
391 0.46
392 0.37
393 0.27
394 0.31
395 0.37
396 0.39
397 0.45
398 0.46
399 0.47
400 0.56
401 0.57
402 0.52
403 0.52
404 0.55
405 0.51
406 0.56
407 0.59
408 0.51
409 0.59
410 0.67
411 0.69
412 0.7
413 0.76
414 0.77
415 0.77
416 0.83
417 0.84
418 0.83
419 0.81
420 0.8
421 0.78
422 0.69
423 0.65
424 0.58
425 0.52
426 0.43
427 0.36