Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

T5AMP1

Protein Details
Accession T5AMP1    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-65PSKRKAITPPTPPVKRRKVGENKAKQPFPSRKQDGRKDEARNHydrophilic
301-324RYTPKPTPSSRHTGKRSRKGKNKSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
25-59SKRKAITPPTPPVKRRKVGENKAKQPFPSRKQDGR
309-324SSRHTGKRSRKGKNKS
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013520  Exonuclease_RNaseT/DNA_pol3  
IPR037431  REX4_DEDDh_dom  
IPR047021  REXO1/3/4-like  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0008408  F:3'-5' exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00929  RNase_T  
CDD cd06144  REX4_like  
Amino Acid Sequences MAELSSNWKQLQVKLKAQGTSEGPSKRKAITPPTPPVKRRKVGENKAKQPFPSRKQDGRKDEARNMGGVQSSTVGHESTNGLSSPSLALWAQDNDISAESLAEAYGLGLQGNTVALASQSDRVNHGLSAGIELGKYVAMDCEMVGVGSGAHESALARVSLVDFHGRQIYDSFVKPRERVTDWRTAVSGVSQKEMRFARDFEEVQKQVSDMIKDRVLVGHDIKHDMEAMMLSHPPRDIRDTAKHAGFRRFGNGRKPALRILARELLGVEVQDGSHSSIEDARVTMLLFRKHKSEFDVHHANRYTPKPTPSSRHTGKRSRKGKNKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.59
3 0.57
4 0.56
5 0.55
6 0.48
7 0.45
8 0.44
9 0.43
10 0.41
11 0.42
12 0.44
13 0.41
14 0.43
15 0.45
16 0.48
17 0.5
18 0.56
19 0.62
20 0.7
21 0.76
22 0.77
23 0.8
24 0.8
25 0.78
26 0.74
27 0.75
28 0.76
29 0.77
30 0.82
31 0.83
32 0.82
33 0.84
34 0.83
35 0.75
36 0.74
37 0.74
38 0.7
39 0.71
40 0.7
41 0.7
42 0.77
43 0.83
44 0.82
45 0.79
46 0.8
47 0.76
48 0.74
49 0.73
50 0.64
51 0.55
52 0.47
53 0.41
54 0.34
55 0.26
56 0.2
57 0.13
58 0.12
59 0.12
60 0.12
61 0.1
62 0.08
63 0.1
64 0.11
65 0.1
66 0.12
67 0.11
68 0.1
69 0.1
70 0.11
71 0.1
72 0.08
73 0.09
74 0.07
75 0.08
76 0.09
77 0.1
78 0.1
79 0.1
80 0.1
81 0.1
82 0.1
83 0.1
84 0.08
85 0.07
86 0.06
87 0.06
88 0.05
89 0.04
90 0.03
91 0.03
92 0.04
93 0.04
94 0.04
95 0.03
96 0.03
97 0.04
98 0.04
99 0.03
100 0.03
101 0.03
102 0.03
103 0.04
104 0.05
105 0.08
106 0.09
107 0.1
108 0.12
109 0.13
110 0.14
111 0.13
112 0.13
113 0.11
114 0.1
115 0.1
116 0.09
117 0.07
118 0.06
119 0.06
120 0.06
121 0.05
122 0.05
123 0.04
124 0.03
125 0.03
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.02
137 0.02
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.05
147 0.05
148 0.07
149 0.07
150 0.08
151 0.1
152 0.1
153 0.1
154 0.1
155 0.12
156 0.12
157 0.13
158 0.15
159 0.18
160 0.21
161 0.21
162 0.23
163 0.25
164 0.27
165 0.32
166 0.34
167 0.39
168 0.38
169 0.38
170 0.36
171 0.32
172 0.28
173 0.24
174 0.23
175 0.14
176 0.15
177 0.16
178 0.16
179 0.21
180 0.22
181 0.23
182 0.21
183 0.21
184 0.21
185 0.24
186 0.25
187 0.23
188 0.31
189 0.28
190 0.26
191 0.26
192 0.23
193 0.21
194 0.22
195 0.21
196 0.15
197 0.18
198 0.18
199 0.18
200 0.18
201 0.17
202 0.16
203 0.17
204 0.16
205 0.17
206 0.17
207 0.19
208 0.18
209 0.17
210 0.16
211 0.14
212 0.12
213 0.08
214 0.08
215 0.07
216 0.08
217 0.08
218 0.09
219 0.1
220 0.11
221 0.12
222 0.16
223 0.18
224 0.23
225 0.3
226 0.36
227 0.4
228 0.44
229 0.47
230 0.47
231 0.52
232 0.49
233 0.42
234 0.43
235 0.44
236 0.45
237 0.49
238 0.52
239 0.52
240 0.53
241 0.54
242 0.5
243 0.52
244 0.51
245 0.44
246 0.43
247 0.42
248 0.38
249 0.36
250 0.32
251 0.25
252 0.22
253 0.19
254 0.13
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.09
262 0.09
263 0.11
264 0.12
265 0.13
266 0.12
267 0.11
268 0.11
269 0.11
270 0.14
271 0.17
272 0.24
273 0.27
274 0.28
275 0.33
276 0.35
277 0.38
278 0.4
279 0.43
280 0.41
281 0.46
282 0.55
283 0.51
284 0.57
285 0.56
286 0.53
287 0.53
288 0.52
289 0.49
290 0.44
291 0.49
292 0.47
293 0.53
294 0.59
295 0.58
296 0.64
297 0.67
298 0.72
299 0.76
300 0.79
301 0.82
302 0.85
303 0.87
304 0.88