FuNGI

T5AB52

Protein Details

Accession

T5AB52

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
443-469	LEQDATCPRPRKRRCLRQRQPQGGLNA	Hydrophilic
544-568	EETETSPRRGRGRPRKERGPSMPSA	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
503-606	APNKRRRATAAPKAAAPAARPTPSERHHARTRPVPARAPPKEETETSPRRGRGRPRKERGPSMPSAVEKKPTRTRTAARTGSGGATGTDGPGAPRRRGRPRKNN

Subcellular Location(s)

nucl 19, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017956 AT_hook_DNA-bd_motif IPR000637 HMGI/Y_DNA-bd_CS
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006355 P:regulation of DNA-templated transcription
PROSITE	View protein in PROSITE PS00354 HMGI_Y

Amino Acid Sequences

MPPFFDHVQLHRAVDSQAVLVLEAMAANDNLRSLRRFERDDPPPYASSTESEEFDEMHLFPPPRGGSLAEELQAILEPPLNDQELDMIAYTLGKSVHPAKPYHTEAKYEEYRLGKATSGLPSSLMFQRLNGARRQGVIIRHGLKRRWQKLGVWNPAWGFAGRKMQPADDFRRWTWPWQPDGASDDLDRAAQIGSELVARALRLRRNLRRGEHAPVLPRSRIRQHTTTSQAEAFLISRPWFIFKLEVAEERERFRRIDLPDRERYQYDPVKQVVTWWKERGDWRDDFGSWVTAWKWRHESPSPEPEDLTPVRNMKDSPLEAAAEMDLTPSEIDELETIDLPRSEQPEGFWVIVDGDLPPFFPGQCHDQIAEAEKRYKERLERLEKARAEEEPEPENDPVTESIHERCRLHGGLFGELKRAENEEACPGEHKDALAERQEDVSELEQDATCPRPRKRRCLRQRQPQGGLNAAQDQEQLLDPPPPRRSTRIAAIQRPAEPVPSQAAPNKRRRATAAPKAAAPAARPTPSERHHARTRPVPARAPPKEETETSPRRGRGRPRKERGPSMPSAVEKKPTRTRTAARTGSGGATGTDGPGAPRRRGRPRKNN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.2
3	0.15
4	0.14
5	0.13
6	0.12
7	0.11
8	0.1
9	0.08
10	0.07
11	0.07
12	0.06
13	0.06
14	0.06
15	0.06
16	0.07
17	0.09
18	0.12
19	0.13
20	0.17
21	0.26
22	0.33
23	0.39
24	0.44
25	0.53
26	0.59
27	0.64
28	0.64
29	0.61
30	0.56
31	0.51
32	0.47
33	0.39
34	0.32
35	0.31
36	0.29
37	0.24
38	0.25
39	0.23
40	0.22
41	0.21
42	0.21
43	0.15
44	0.14
45	0.18
46	0.17
47	0.17
48	0.22
49	0.22
50	0.21
51	0.22
52	0.22
53	0.21
54	0.25
55	0.27
56	0.22
57	0.21
58	0.2
59	0.18
60	0.17
61	0.14
62	0.09
63	0.09
64	0.09
65	0.1
66	0.13
67	0.14
68	0.13
69	0.13
70	0.14
71	0.12
72	0.12
73	0.11
74	0.08
75	0.07
76	0.08
77	0.08
78	0.08
79	0.08
80	0.07
81	0.1
82	0.17
83	0.22
84	0.26
85	0.27
86	0.3
87	0.38
88	0.44
89	0.5
90	0.45
91	0.45
92	0.43
93	0.5
94	0.5
95	0.44
96	0.43
97	0.37
98	0.36
99	0.34
100	0.32
101	0.24
102	0.22
103	0.24
104	0.23
105	0.22
106	0.21
107	0.19
108	0.18
109	0.21
110	0.22
111	0.22
112	0.18
113	0.16
114	0.23
115	0.27
116	0.3
117	0.3
118	0.31
119	0.29
120	0.3
121	0.33
122	0.3
123	0.29
124	0.29
125	0.33
126	0.35
127	0.39
128	0.44
129	0.45
130	0.49
131	0.56
132	0.59
133	0.59
134	0.57
135	0.58
136	0.63
137	0.7
138	0.71
139	0.61
140	0.58
141	0.5
142	0.49
143	0.43
144	0.33
145	0.24
146	0.19
147	0.26
148	0.24
149	0.28
150	0.28
151	0.28
152	0.33
153	0.38
154	0.42
155	0.4
156	0.44
157	0.4
158	0.48
159	0.47
160	0.46
161	0.48
162	0.46
163	0.42
164	0.41
165	0.42
166	0.35
167	0.37
168	0.34
169	0.27
170	0.21
171	0.19
172	0.15
173	0.14
174	0.12
175	0.09
176	0.07
177	0.05
178	0.05
179	0.04
180	0.04
181	0.05
182	0.05
183	0.05
184	0.05
185	0.05
186	0.09
187	0.14
188	0.17
189	0.24
190	0.33
191	0.41
192	0.5
193	0.57
194	0.57
195	0.61
196	0.62
197	0.6
198	0.57
199	0.52
200	0.49
201	0.47
202	0.47
203	0.41
204	0.39
205	0.37
206	0.39
207	0.43
208	0.44
209	0.43
210	0.44
211	0.49
212	0.53
213	0.51
214	0.46
215	0.39
216	0.34
217	0.29
218	0.25
219	0.18
220	0.12
221	0.11
222	0.09
223	0.09
224	0.09
225	0.11
226	0.11
227	0.11
228	0.12
229	0.1
230	0.14
231	0.14
232	0.17
233	0.2
234	0.23
235	0.24
236	0.26
237	0.29
238	0.26
239	0.25
240	0.24
241	0.26
242	0.26
243	0.35
244	0.4
245	0.44
246	0.5
247	0.53
248	0.54
249	0.48
250	0.46
251	0.44
252	0.41
253	0.37
254	0.34
255	0.32
256	0.31
257	0.3
258	0.32
259	0.33
260	0.31
261	0.32
262	0.29
263	0.29
264	0.31
265	0.35
266	0.35
267	0.33
268	0.3
269	0.29
270	0.29
271	0.28
272	0.26
273	0.22
274	0.18
275	0.12
276	0.13
277	0.11
278	0.14
279	0.14
280	0.16
281	0.2
282	0.21
283	0.26
284	0.29
285	0.35
286	0.36
287	0.44
288	0.45
289	0.41
290	0.39
291	0.34
292	0.35
293	0.3
294	0.25
295	0.19
296	0.17
297	0.17
298	0.18
299	0.18
300	0.15
301	0.18
302	0.16
303	0.15
304	0.15
305	0.14
306	0.13
307	0.13
308	0.11
309	0.07
310	0.06
311	0.05
312	0.04
313	0.04
314	0.03
315	0.03
316	0.03
317	0.03
318	0.04
319	0.04
320	0.04
321	0.05
322	0.05
323	0.06
324	0.06
325	0.06
326	0.07
327	0.09
328	0.1
329	0.11
330	0.1
331	0.11
332	0.13
333	0.15
334	0.14
335	0.12
336	0.1
337	0.09
338	0.09
339	0.09
340	0.06
341	0.05
342	0.05
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.05
347	0.05
348	0.07
349	0.12
350	0.14
351	0.15
352	0.15
353	0.16
354	0.17
355	0.21
356	0.23
357	0.19
358	0.22
359	0.22
360	0.24
361	0.25
362	0.28
363	0.28
364	0.33
365	0.41
366	0.45
367	0.52
368	0.55
369	0.62
370	0.59
371	0.58
372	0.51
373	0.42
374	0.38
375	0.34
376	0.31
377	0.25
378	0.25
379	0.24
380	0.23
381	0.22
382	0.17
383	0.16
384	0.13
385	0.13
386	0.12
387	0.11
388	0.15
389	0.2
390	0.25
391	0.23
392	0.24
393	0.27
394	0.27
395	0.26
396	0.26
397	0.22
398	0.23
399	0.26
400	0.25
401	0.23
402	0.22
403	0.23
404	0.19
405	0.2
406	0.16
407	0.14
408	0.16
409	0.17
410	0.18
411	0.18
412	0.19
413	0.18
414	0.19
415	0.18
416	0.16
417	0.14
418	0.15
419	0.18
420	0.2
421	0.2
422	0.19
423	0.19
424	0.19
425	0.18
426	0.17
427	0.15
428	0.12
429	0.11
430	0.12
431	0.11
432	0.11
433	0.13
434	0.15
435	0.19
436	0.25
437	0.31
438	0.4
439	0.48
440	0.59
441	0.68
442	0.75
443	0.82
444	0.86
445	0.9
446	0.91
447	0.95
448	0.93
449	0.89
450	0.83
451	0.75
452	0.68
453	0.59
454	0.5
455	0.42
456	0.33
457	0.26
458	0.2
459	0.17
460	0.14
461	0.12
462	0.11
463	0.09
464	0.14
465	0.16
466	0.23
467	0.28
468	0.32
469	0.35
470	0.39
471	0.44
472	0.44
473	0.5
474	0.54
475	0.57
476	0.6
477	0.62
478	0.61
479	0.57
480	0.55
481	0.47
482	0.4
483	0.32
484	0.27
485	0.25
486	0.22
487	0.23
488	0.25
489	0.34
490	0.4
491	0.5
492	0.58
493	0.57
494	0.58
495	0.62
496	0.67
497	0.67
498	0.69
499	0.7
500	0.62
501	0.6
502	0.59
503	0.55
504	0.46
505	0.37
506	0.34
507	0.28
508	0.28
509	0.28
510	0.31
511	0.37
512	0.39
513	0.47
514	0.45
515	0.48
516	0.55
517	0.61
518	0.64
519	0.64
520	0.71
521	0.7
522	0.72
523	0.7
524	0.69
525	0.73
526	0.72
527	0.7
528	0.62
529	0.61
530	0.59
531	0.54
532	0.53
533	0.52
534	0.53
535	0.53
536	0.58
537	0.56
538	0.58
539	0.63
540	0.68
541	0.69
542	0.73
543	0.78
544	0.8
545	0.86
546	0.88
547	0.91
548	0.88
549	0.85
550	0.78
551	0.74
552	0.7
553	0.64
554	0.61
555	0.54
556	0.54
557	0.51
558	0.55
559	0.58
560	0.59
561	0.61
562	0.64
563	0.68
564	0.68
565	0.74
566	0.72
567	0.64
568	0.61
569	0.55
570	0.48
571	0.42
572	0.32
573	0.22
574	0.18
575	0.16
576	0.13
577	0.12
578	0.1
579	0.12
580	0.2
581	0.24
582	0.28
583	0.37
584	0.45
585	0.56
586	0.67

T5AB52

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer