Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

T5AA57

Protein Details
Accession T5AA57    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
131-152EEKTLKARLARRKHKPLPKADABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
135-148LKARLARRKHKPLP
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 9.5, cyto 5.5, mito 3, plas 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007667  Hypoxia_induced_domain  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF04588  HIG_1_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51503  HIG1  
Amino Acid Sequences MADRLPPPPPPSGSMPSSFDGNQDFHNERRMKKITRRIIEEPLVPLGLCLTVFAFVNAYRALRRGDSMQANKMFRARVAAQGFTIIAMLAGSMYYSKDREKTKELQKLKEQRDAEEKRIKWIRELEVRDEEEKTLKARLARRKHKPLPKADAETTPEETPQSGTGGVLGKMGLWPRSATQKEPAPVDAKAAEESTPKKRNPTSSLGAIGEAITSSKQDEGGSKPAEVKPEKKEP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.42
3 0.38
4 0.38
5 0.34
6 0.3
7 0.27
8 0.24
9 0.22
10 0.25
11 0.26
12 0.24
13 0.34
14 0.37
15 0.36
16 0.44
17 0.5
18 0.52
19 0.58
20 0.67
21 0.68
22 0.71
23 0.77
24 0.73
25 0.73
26 0.69
27 0.61
28 0.53
29 0.45
30 0.37
31 0.29
32 0.23
33 0.16
34 0.12
35 0.09
36 0.07
37 0.05
38 0.05
39 0.06
40 0.06
41 0.07
42 0.06
43 0.09
44 0.09
45 0.1
46 0.1
47 0.12
48 0.13
49 0.13
50 0.15
51 0.15
52 0.21
53 0.28
54 0.31
55 0.36
56 0.4
57 0.4
58 0.4
59 0.4
60 0.34
61 0.26
62 0.28
63 0.22
64 0.24
65 0.25
66 0.25
67 0.22
68 0.23
69 0.22
70 0.16
71 0.15
72 0.07
73 0.04
74 0.04
75 0.03
76 0.02
77 0.02
78 0.02
79 0.02
80 0.03
81 0.05
82 0.06
83 0.08
84 0.13
85 0.16
86 0.21
87 0.26
88 0.33
89 0.42
90 0.5
91 0.54
92 0.55
93 0.61
94 0.66
95 0.65
96 0.65
97 0.56
98 0.49
99 0.55
100 0.52
101 0.5
102 0.49
103 0.44
104 0.44
105 0.49
106 0.46
107 0.39
108 0.4
109 0.39
110 0.38
111 0.4
112 0.37
113 0.37
114 0.38
115 0.36
116 0.32
117 0.27
118 0.21
119 0.2
120 0.16
121 0.13
122 0.13
123 0.16
124 0.23
125 0.32
126 0.41
127 0.5
128 0.59
129 0.68
130 0.76
131 0.8
132 0.81
133 0.81
134 0.79
135 0.76
136 0.72
137 0.64
138 0.59
139 0.55
140 0.5
141 0.44
142 0.35
143 0.28
144 0.23
145 0.2
146 0.17
147 0.14
148 0.11
149 0.08
150 0.08
151 0.09
152 0.1
153 0.1
154 0.09
155 0.08
156 0.07
157 0.09
158 0.11
159 0.1
160 0.09
161 0.1
162 0.12
163 0.21
164 0.23
165 0.24
166 0.29
167 0.34
168 0.36
169 0.38
170 0.39
171 0.33
172 0.31
173 0.31
174 0.26
175 0.21
176 0.19
177 0.18
178 0.16
179 0.18
180 0.22
181 0.29
182 0.35
183 0.36
184 0.42
185 0.47
186 0.54
187 0.56
188 0.59
189 0.56
190 0.53
191 0.56
192 0.48
193 0.43
194 0.35
195 0.29
196 0.21
197 0.15
198 0.11
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.08
203 0.09
204 0.1
205 0.13
206 0.17
207 0.25
208 0.26
209 0.27
210 0.31
211 0.33
212 0.4
213 0.42
214 0.44