Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

T5A9R3

Protein Details
Accession T5A9R3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MARSSSRRRRRAESDDQEASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
303-309ARDRKKE
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 12, cyto 4, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR038729  Rad50/SbcC_AAA  
IPR027131  SMC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030915  C:Smc5-Smc6 complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0000724  P:double-strand break repair via homologous recombination  
Pfam View protein in Pfam  
PF13476  AAA_23  
Amino Acid Sequences MARSSSRRRRRAESDDQEASDGPRSQASSDSPKRRRLHLEPDDESVDEASRPDAASHVSMDDFHPGAILRVKVENFVTYEQAEFFPGPHLNMVIGPNGTGKSSLVCAICLGLGYSPKHLGRAGSVKEFVKHGKDTATIEIELQKRPNDRSNHVVRVQIRREQNSQKWWLNGKETSQKAIQRLMHSLKIQVDNLCQFLPQDRVVEFAACTPIDLLHETLRAAAPEAMLQWQKQLQDLHKDKKDLAQTVHADVDILRNLESRQQGLQADVDRIREREEIQQRVQNLRSALVLARYQEARNKHSGARDRKKEAERALRRLEEECGPSLEAVNLKTEYAGNIETAILRREQALKDAEQATSTTARHVSTAVEDVKDMGDRIDAERKGFEAKKKELATSRSKITMFQADLKNRPADFNAAEWNQKIRAEEHTLRELEIERRQLSTEITSVKDKGRAVIQQISRVEAEVEALDTQQGQQLNLLRKHFPDVATGWDWVQEHQGDFEKEVFGPPMISCSMKDERYSDQVQALLQNDDFVCFTAQTKNDYKRLTDQLYRVLSLSVTIRTCSHSLEAFQPPVSRAEASTLGLDGFAVDYLEGPALVLAMLCAEKRLHQSGVSLSDHNDAEYESLVNNGRVSQWVAGQHSYAVRRRREYGPQAMTTISKSIRPGRFWTSQPIDSQEKMELNRRLTELKGEKDLRAGELRELKAKLPNIEEQATDVTEKIDALKSDKSTLQREYQKWQALPAKIESEERVKATHEHALRDSRKTVLDLHYQWDNAALKRVELVLKHKKLIDQLRDAHCALLEARIQHIEARSDIEGLKNRNASLTARLEQERQNLQKASDEAGRAKEDGRRLSEQVRDLLAQNADKRDLWTQLSDGKTPEELDMDMTAEEAKLELIHAANPNVIREFERRAQEIGRLRSKMEGFNEKLEGLDRQRAEIMGKWEPKLDELVSKINDAFAYNFEQISCAGEVRVHKDDDFDLWALDIMVKFR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.77
3 0.71
4 0.64
5 0.55
6 0.47
7 0.42
8 0.35
9 0.27
10 0.24
11 0.24
12 0.23
13 0.26
14 0.3
15 0.35
16 0.42
17 0.52
18 0.56
19 0.65
20 0.68
21 0.72
22 0.76
23 0.73
24 0.75
25 0.74
26 0.76
27 0.7
28 0.71
29 0.65
30 0.56
31 0.48
32 0.38
33 0.29
34 0.19
35 0.16
36 0.12
37 0.11
38 0.11
39 0.11
40 0.11
41 0.12
42 0.14
43 0.14
44 0.15
45 0.14
46 0.15
47 0.15
48 0.18
49 0.16
50 0.14
51 0.14
52 0.12
53 0.14
54 0.18
55 0.18
56 0.16
57 0.2
58 0.21
59 0.23
60 0.24
61 0.24
62 0.23
63 0.24
64 0.24
65 0.2
66 0.21
67 0.2
68 0.19
69 0.19
70 0.16
71 0.14
72 0.16
73 0.17
74 0.17
75 0.16
76 0.16
77 0.14
78 0.16
79 0.17
80 0.15
81 0.14
82 0.13
83 0.14
84 0.14
85 0.14
86 0.13
87 0.12
88 0.1
89 0.12
90 0.16
91 0.14
92 0.14
93 0.14
94 0.13
95 0.13
96 0.12
97 0.11
98 0.08
99 0.13
100 0.14
101 0.16
102 0.21
103 0.22
104 0.24
105 0.24
106 0.24
107 0.25
108 0.32
109 0.34
110 0.33
111 0.37
112 0.37
113 0.37
114 0.4
115 0.38
116 0.35
117 0.33
118 0.29
119 0.28
120 0.3
121 0.31
122 0.33
123 0.32
124 0.26
125 0.26
126 0.31
127 0.3
128 0.3
129 0.31
130 0.31
131 0.32
132 0.37
133 0.44
134 0.44
135 0.46
136 0.52
137 0.57
138 0.6
139 0.59
140 0.6
141 0.58
142 0.61
143 0.61
144 0.59
145 0.58
146 0.56
147 0.61
148 0.64
149 0.65
150 0.64
151 0.68
152 0.65
153 0.63
154 0.64
155 0.61
156 0.58
157 0.54
158 0.51
159 0.52
160 0.49
161 0.47
162 0.46
163 0.46
164 0.42
165 0.47
166 0.45
167 0.39
168 0.45
169 0.45
170 0.45
171 0.41
172 0.42
173 0.4
174 0.4
175 0.39
176 0.33
177 0.33
178 0.29
179 0.3
180 0.26
181 0.21
182 0.18
183 0.19
184 0.2
185 0.17
186 0.18
187 0.16
188 0.18
189 0.19
190 0.19
191 0.17
192 0.14
193 0.16
194 0.13
195 0.13
196 0.11
197 0.11
198 0.11
199 0.12
200 0.12
201 0.11
202 0.12
203 0.12
204 0.13
205 0.13
206 0.12
207 0.12
208 0.11
209 0.09
210 0.09
211 0.1
212 0.13
213 0.14
214 0.14
215 0.15
216 0.17
217 0.17
218 0.2
219 0.24
220 0.24
221 0.34
222 0.42
223 0.49
224 0.51
225 0.53
226 0.5
227 0.51
228 0.54
229 0.47
230 0.42
231 0.41
232 0.38
233 0.38
234 0.38
235 0.31
236 0.25
237 0.21
238 0.21
239 0.14
240 0.13
241 0.1
242 0.11
243 0.11
244 0.16
245 0.18
246 0.17
247 0.16
248 0.19
249 0.19
250 0.19
251 0.22
252 0.18
253 0.21
254 0.21
255 0.23
256 0.22
257 0.22
258 0.24
259 0.22
260 0.23
261 0.28
262 0.35
263 0.37
264 0.39
265 0.42
266 0.42
267 0.46
268 0.45
269 0.39
270 0.32
271 0.27
272 0.23
273 0.21
274 0.19
275 0.16
276 0.16
277 0.13
278 0.15
279 0.16
280 0.17
281 0.21
282 0.24
283 0.26
284 0.29
285 0.31
286 0.32
287 0.37
288 0.46
289 0.52
290 0.58
291 0.62
292 0.63
293 0.69
294 0.71
295 0.7
296 0.69
297 0.69
298 0.66
299 0.66
300 0.66
301 0.6
302 0.57
303 0.51
304 0.46
305 0.38
306 0.33
307 0.27
308 0.22
309 0.2
310 0.18
311 0.17
312 0.15
313 0.12
314 0.11
315 0.12
316 0.11
317 0.1
318 0.11
319 0.1
320 0.1
321 0.1
322 0.1
323 0.07
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.09
328 0.09
329 0.08
330 0.08
331 0.09
332 0.13
333 0.13
334 0.16
335 0.18
336 0.18
337 0.22
338 0.24
339 0.22
340 0.19
341 0.19
342 0.16
343 0.16
344 0.16
345 0.13
346 0.13
347 0.13
348 0.13
349 0.13
350 0.11
351 0.1
352 0.14
353 0.14
354 0.13
355 0.12
356 0.12
357 0.12
358 0.12
359 0.11
360 0.06
361 0.06
362 0.06
363 0.09
364 0.16
365 0.16
366 0.16
367 0.16
368 0.17
369 0.22
370 0.25
371 0.28
372 0.28
373 0.31
374 0.38
375 0.39
376 0.42
377 0.42
378 0.45
379 0.47
380 0.44
381 0.43
382 0.39
383 0.38
384 0.36
385 0.33
386 0.32
387 0.25
388 0.29
389 0.32
390 0.32
391 0.35
392 0.36
393 0.36
394 0.31
395 0.31
396 0.25
397 0.22
398 0.19
399 0.17
400 0.2
401 0.18
402 0.19
403 0.19
404 0.19
405 0.17
406 0.18
407 0.17
408 0.13
409 0.16
410 0.22
411 0.26
412 0.28
413 0.31
414 0.3
415 0.29
416 0.29
417 0.26
418 0.23
419 0.22
420 0.23
421 0.19
422 0.19
423 0.2
424 0.2
425 0.19
426 0.16
427 0.15
428 0.13
429 0.14
430 0.15
431 0.16
432 0.17
433 0.19
434 0.18
435 0.17
436 0.18
437 0.18
438 0.2
439 0.26
440 0.25
441 0.27
442 0.28
443 0.28
444 0.25
445 0.23
446 0.2
447 0.12
448 0.12
449 0.06
450 0.06
451 0.05
452 0.05
453 0.05
454 0.04
455 0.04
456 0.06
457 0.07
458 0.06
459 0.08
460 0.12
461 0.19
462 0.22
463 0.24
464 0.23
465 0.23
466 0.26
467 0.27
468 0.23
469 0.19
470 0.16
471 0.19
472 0.19
473 0.19
474 0.15
475 0.15
476 0.15
477 0.13
478 0.14
479 0.1
480 0.09
481 0.1
482 0.12
483 0.1
484 0.11
485 0.11
486 0.1
487 0.1
488 0.1
489 0.09
490 0.07
491 0.07
492 0.06
493 0.07
494 0.07
495 0.08
496 0.08
497 0.12
498 0.16
499 0.16
500 0.17
501 0.18
502 0.19
503 0.24
504 0.25
505 0.21
506 0.18
507 0.18
508 0.17
509 0.17
510 0.16
511 0.12
512 0.1
513 0.11
514 0.1
515 0.09
516 0.09
517 0.08
518 0.07
519 0.06
520 0.07
521 0.1
522 0.11
523 0.15
524 0.21
525 0.25
526 0.3
527 0.31
528 0.32
529 0.34
530 0.38
531 0.38
532 0.37
533 0.34
534 0.36
535 0.36
536 0.35
537 0.29
538 0.23
539 0.19
540 0.15
541 0.15
542 0.1
543 0.1
544 0.1
545 0.1
546 0.12
547 0.13
548 0.13
549 0.13
550 0.11
551 0.13
552 0.17
553 0.19
554 0.17
555 0.18
556 0.18
557 0.17
558 0.18
559 0.18
560 0.13
561 0.1
562 0.12
563 0.13
564 0.12
565 0.12
566 0.1
567 0.09
568 0.09
569 0.08
570 0.05
571 0.04
572 0.03
573 0.03
574 0.03
575 0.03
576 0.03
577 0.03
578 0.03
579 0.03
580 0.03
581 0.03
582 0.03
583 0.02
584 0.02
585 0.03
586 0.03
587 0.03
588 0.04
589 0.05
590 0.07
591 0.11
592 0.14
593 0.14
594 0.14
595 0.16
596 0.17
597 0.22
598 0.22
599 0.19
600 0.18
601 0.2
602 0.19
603 0.18
604 0.15
605 0.1
606 0.09
607 0.09
608 0.08
609 0.05
610 0.07
611 0.08
612 0.08
613 0.08
614 0.08
615 0.08
616 0.09
617 0.1
618 0.09
619 0.1
620 0.13
621 0.15
622 0.15
623 0.15
624 0.15
625 0.17
626 0.2
627 0.24
628 0.28
629 0.31
630 0.34
631 0.38
632 0.42
633 0.48
634 0.51
635 0.54
636 0.53
637 0.5
638 0.48
639 0.44
640 0.4
641 0.32
642 0.28
643 0.19
644 0.15
645 0.17
646 0.25
647 0.28
648 0.3
649 0.33
650 0.37
651 0.41
652 0.41
653 0.46
654 0.43
655 0.42
656 0.4
657 0.41
658 0.39
659 0.35
660 0.35
661 0.29
662 0.26
663 0.26
664 0.32
665 0.32
666 0.3
667 0.32
668 0.32
669 0.31
670 0.28
671 0.35
672 0.33
673 0.3
674 0.36
675 0.36
676 0.34
677 0.36
678 0.36
679 0.3
680 0.28
681 0.26
682 0.23
683 0.28
684 0.28
685 0.3
686 0.31
687 0.29
688 0.31
689 0.33
690 0.31
691 0.28
692 0.31
693 0.3
694 0.3
695 0.29
696 0.25
697 0.24
698 0.22
699 0.19
700 0.14
701 0.1
702 0.09
703 0.09
704 0.09
705 0.1
706 0.1
707 0.13
708 0.16
709 0.17
710 0.2
711 0.24
712 0.27
713 0.3
714 0.33
715 0.38
716 0.43
717 0.45
718 0.48
719 0.52
720 0.54
721 0.49
722 0.52
723 0.51
724 0.45
725 0.45
726 0.42
727 0.38
728 0.32
729 0.34
730 0.29
731 0.27
732 0.26
733 0.25
734 0.23
735 0.21
736 0.22
737 0.23
738 0.28
739 0.25
740 0.26
741 0.29
742 0.38
743 0.4
744 0.41
745 0.4
746 0.36
747 0.35
748 0.33
749 0.33
750 0.29
751 0.34
752 0.31
753 0.33
754 0.33
755 0.32
756 0.3
757 0.31
758 0.28
759 0.21
760 0.26
761 0.23
762 0.2
763 0.21
764 0.23
765 0.2
766 0.2
767 0.28
768 0.32
769 0.36
770 0.39
771 0.39
772 0.4
773 0.46
774 0.53
775 0.51
776 0.48
777 0.53
778 0.55
779 0.58
780 0.55
781 0.48
782 0.38
783 0.32
784 0.25
785 0.2
786 0.17
787 0.13
788 0.15
789 0.15
790 0.16
791 0.17
792 0.19
793 0.17
794 0.15
795 0.18
796 0.17
797 0.18
798 0.18
799 0.2
800 0.24
801 0.26
802 0.31
803 0.29
804 0.29
805 0.29
806 0.3
807 0.27
808 0.28
809 0.3
810 0.28
811 0.31
812 0.33
813 0.35
814 0.37
815 0.42
816 0.44
817 0.42
818 0.45
819 0.42
820 0.41
821 0.43
822 0.41
823 0.38
824 0.33
825 0.32
826 0.29
827 0.3
828 0.32
829 0.27
830 0.28
831 0.28
832 0.3
833 0.33
834 0.36
835 0.36
836 0.38
837 0.42
838 0.46
839 0.45
840 0.42
841 0.39
842 0.34
843 0.31
844 0.32
845 0.3
846 0.28
847 0.29
848 0.29
849 0.29
850 0.28
851 0.3
852 0.29
853 0.29
854 0.28
855 0.26
856 0.25
857 0.29
858 0.32
859 0.31
860 0.29
861 0.27
862 0.26
863 0.25
864 0.23
865 0.18
866 0.16
867 0.15
868 0.15
869 0.13
870 0.12
871 0.11
872 0.1
873 0.08
874 0.08
875 0.06
876 0.06
877 0.05
878 0.05
879 0.07
880 0.07
881 0.11
882 0.13
883 0.14
884 0.17
885 0.18
886 0.2
887 0.2
888 0.2
889 0.2
890 0.21
891 0.28
892 0.31
893 0.37
894 0.37
895 0.38
896 0.39
897 0.43
898 0.49
899 0.5
900 0.52
901 0.47
902 0.46
903 0.5
904 0.51
905 0.49
906 0.47
907 0.48
908 0.43
909 0.46
910 0.48
911 0.41
912 0.39
913 0.35
914 0.33
915 0.28
916 0.32
917 0.28
918 0.28
919 0.29
920 0.3
921 0.3
922 0.3
923 0.31
924 0.32
925 0.36
926 0.35
927 0.38
928 0.38
929 0.37
930 0.36
931 0.32
932 0.28
933 0.27
934 0.33
935 0.31
936 0.32
937 0.3
938 0.28
939 0.27
940 0.23
941 0.21
942 0.16
943 0.21
944 0.2
945 0.2
946 0.18
947 0.19
948 0.17
949 0.19
950 0.18
951 0.13
952 0.12
953 0.15
954 0.19
955 0.25
956 0.29
957 0.28
958 0.27
959 0.29
960 0.3
961 0.3
962 0.3
963 0.24
964 0.2
965 0.18
966 0.18
967 0.15
968 0.16