Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

T5AFZ1

Protein Details
Accession T5AFZ1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-35ESDADETRRRPAKRRKAGPGSGAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-30RRRPAKRRKAGP
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11.333, cyto 5, cyto_mito 4.833, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027521  Usb1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0016829  F:lyase activity  
GO:1990838  F:poly(U)-specific exoribonuclease activity, producing 3' uridine cyclic phosphate ends  
GO:0034477  P:U6 snRNA 3'-end processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09749  HVSL  
Amino Acid Sequences MALVDYSSSTAESDADETRRRPAKRRKAGPGSGAAASSTSCSSVASAVAMPPLPATFHDLYASTVRQSVSDDPGLHQGRKRQTPHVPGNWPTHLYVEWHPSEAQHDALDELLGLAEVELGDDIKLRNFVTSDLGAHLPLHISLSRPLSLRTANKDDFLDKVTKSIRSSGTGAFVVRPGGLAWYRSPDSDRMFLVLHVVAGAGTGSTNPQLMRLLTRCNTVSTSFNQPALYQKTHNEAVGTAFHVSIAWTFEQPDEEASLRVLGLFKRRQFKELQTWKINVSSVKAKIGNVVSDIALAERAQAATLSSSLLFGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.19
3 0.23
4 0.24
5 0.33
6 0.4
7 0.43
8 0.51
9 0.58
10 0.65
11 0.72
12 0.8
13 0.83
14 0.85
15 0.88
16 0.84
17 0.79
18 0.72
19 0.62
20 0.52
21 0.41
22 0.31
23 0.24
24 0.19
25 0.12
26 0.09
27 0.08
28 0.08
29 0.09
30 0.09
31 0.09
32 0.08
33 0.09
34 0.08
35 0.1
36 0.1
37 0.09
38 0.09
39 0.09
40 0.08
41 0.08
42 0.15
43 0.14
44 0.15
45 0.16
46 0.16
47 0.18
48 0.21
49 0.21
50 0.15
51 0.16
52 0.16
53 0.15
54 0.18
55 0.18
56 0.19
57 0.22
58 0.22
59 0.21
60 0.3
61 0.33
62 0.32
63 0.32
64 0.34
65 0.39
66 0.47
67 0.49
68 0.48
69 0.54
70 0.61
71 0.68
72 0.68
73 0.66
74 0.64
75 0.66
76 0.6
77 0.54
78 0.45
79 0.37
80 0.3
81 0.27
82 0.24
83 0.24
84 0.22
85 0.22
86 0.21
87 0.2
88 0.21
89 0.19
90 0.17
91 0.11
92 0.1
93 0.09
94 0.09
95 0.08
96 0.06
97 0.05
98 0.03
99 0.03
100 0.03
101 0.02
102 0.02
103 0.02
104 0.02
105 0.02
106 0.03
107 0.03
108 0.04
109 0.04
110 0.05
111 0.06
112 0.06
113 0.07
114 0.07
115 0.08
116 0.1
117 0.1
118 0.1
119 0.11
120 0.11
121 0.11
122 0.1
123 0.1
124 0.07
125 0.06
126 0.07
127 0.06
128 0.06
129 0.09
130 0.11
131 0.12
132 0.12
133 0.13
134 0.14
135 0.18
136 0.2
137 0.23
138 0.27
139 0.27
140 0.28
141 0.27
142 0.26
143 0.23
144 0.22
145 0.19
146 0.13
147 0.16
148 0.16
149 0.18
150 0.18
151 0.21
152 0.2
153 0.2
154 0.22
155 0.2
156 0.2
157 0.19
158 0.18
159 0.14
160 0.13
161 0.11
162 0.09
163 0.08
164 0.06
165 0.07
166 0.07
167 0.08
168 0.08
169 0.12
170 0.13
171 0.13
172 0.15
173 0.17
174 0.19
175 0.2
176 0.19
177 0.17
178 0.17
179 0.16
180 0.16
181 0.13
182 0.1
183 0.07
184 0.07
185 0.05
186 0.04
187 0.04
188 0.02
189 0.02
190 0.03
191 0.03
192 0.04
193 0.05
194 0.05
195 0.06
196 0.08
197 0.08
198 0.13
199 0.14
200 0.19
201 0.2
202 0.23
203 0.23
204 0.23
205 0.25
206 0.23
207 0.24
208 0.21
209 0.28
210 0.27
211 0.28
212 0.27
213 0.25
214 0.3
215 0.33
216 0.33
217 0.27
218 0.27
219 0.31
220 0.32
221 0.32
222 0.26
223 0.2
224 0.2
225 0.19
226 0.18
227 0.13
228 0.11
229 0.11
230 0.1
231 0.1
232 0.08
233 0.09
234 0.09
235 0.09
236 0.1
237 0.1
238 0.12
239 0.12
240 0.12
241 0.13
242 0.13
243 0.13
244 0.12
245 0.12
246 0.1
247 0.11
248 0.12
249 0.11
250 0.19
251 0.25
252 0.31
253 0.41
254 0.42
255 0.45
256 0.49
257 0.55
258 0.58
259 0.61
260 0.64
261 0.61
262 0.62
263 0.61
264 0.58
265 0.53
266 0.43
267 0.38
268 0.36
269 0.32
270 0.36
271 0.36
272 0.33
273 0.36
274 0.37
275 0.34
276 0.28
277 0.27
278 0.2
279 0.19
280 0.19
281 0.13
282 0.12
283 0.1
284 0.09
285 0.09
286 0.09
287 0.08
288 0.08
289 0.09
290 0.09
291 0.1
292 0.1
293 0.09