Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

T5ALM4

Protein Details
Accession T5ALM4    Localization Confidence Low Confidence Score 6.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
832-851VTCAERKKWWITYKYRPILGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 10, cyto 8.5, cyto_nucl 7.5, nucl 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046351  UTP4  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
Amino Acid Sequences MDIHRCRFVPYQPAAINAVSFSHPQAKSGLHRSIARLAVGRASGDIEIWNPSSGTWHQELVIRGGKDRSIDGLVWINEPDQDIGGGRTLIGKSRLFSIGYTATVTEWDLEKGKPKRHASGQHGDVWCLAAQPPIPANEAGSESQAPGKLIAGTIDGELAIYSVDDSHLRFQRLLVRSPTKKAQMVSITFQSRKVVIVGCSDSTIRAYDAGRGHMLRKMTLGSDLVGGAKNIIVWSVKCLPNGNIVSGDSTGQLCIWDGKTFTQAQRIQSHKQDVLSLAISSDGTSIVSGGMDRRTFLYKQNANEGQRWSKAWGRRYHEHDVKALASFESGRMSVVVSGGPDANLTVVPLKEMGRENHRTISSLPQQPPIASAPNARFMVSWWDRQVHVWVFRKRATELLDASGDGIDINQNRKLLKSIVIKGDSNITSATVNRSGTLLVVSTTTDVKAFRLTHEDPVKPSDVAITTVELPQKLTHLGASLVKLSPNGRRLCLVQEGSRVLMADIQPSLGAQDSPTSSIELQQLNRLSRGIPPHITNGGLGRYDRSITQADFSPDSEMLAVADLAGYIDTWILLGHGEGPKDGNGGGNGDGDGDDAASSSESDSEDAEEAVDANKGWIRNPNAKLIPKLASAPTVLSFSDTTIEQFVQPGKPDLGGDGSGDYVLAAITSSRHIVAFHPRHGSLTAWSRRHPRMHLPAAIQDLLDLPKGVIWQDQRAWVYGVSFLFMLDMSQDLCKPTTDADAPADSQAAHGTKRKRAGLTTGAGGVNEKENLAPHKVRKHGDNEQYEDMDVGKASRGSESEGEDDEELPDADGELSRLRHDKAEAGGRVEAVVTCAERKKWWITYKYRPILGMVPLNAGDQPLEVALVERPTWEMEMPERYLAGDERER
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.41
3 0.36
4 0.27
5 0.25
6 0.18
7 0.18
8 0.18
9 0.24
10 0.24
11 0.24
12 0.27
13 0.3
14 0.35
15 0.42
16 0.45
17 0.41
18 0.44
19 0.47
20 0.51
21 0.49
22 0.43
23 0.38
24 0.33
25 0.32
26 0.29
27 0.26
28 0.19
29 0.18
30 0.16
31 0.14
32 0.13
33 0.11
34 0.13
35 0.14
36 0.14
37 0.12
38 0.12
39 0.16
40 0.17
41 0.21
42 0.21
43 0.2
44 0.21
45 0.25
46 0.27
47 0.28
48 0.34
49 0.29
50 0.29
51 0.3
52 0.3
53 0.28
54 0.27
55 0.25
56 0.21
57 0.21
58 0.21
59 0.25
60 0.25
61 0.24
62 0.24
63 0.21
64 0.18
65 0.19
66 0.17
67 0.11
68 0.1
69 0.1
70 0.1
71 0.11
72 0.1
73 0.09
74 0.12
75 0.12
76 0.16
77 0.2
78 0.2
79 0.2
80 0.24
81 0.26
82 0.23
83 0.23
84 0.24
85 0.22
86 0.21
87 0.21
88 0.18
89 0.15
90 0.15
91 0.16
92 0.12
93 0.11
94 0.12
95 0.13
96 0.15
97 0.24
98 0.3
99 0.38
100 0.45
101 0.5
102 0.55
103 0.62
104 0.71
105 0.7
106 0.73
107 0.7
108 0.69
109 0.65
110 0.57
111 0.48
112 0.4
113 0.32
114 0.22
115 0.18
116 0.12
117 0.12
118 0.14
119 0.15
120 0.15
121 0.17
122 0.16
123 0.17
124 0.16
125 0.18
126 0.16
127 0.17
128 0.16
129 0.14
130 0.17
131 0.17
132 0.16
133 0.14
134 0.14
135 0.12
136 0.11
137 0.11
138 0.1
139 0.09
140 0.09
141 0.08
142 0.07
143 0.07
144 0.06
145 0.06
146 0.04
147 0.03
148 0.03
149 0.03
150 0.05
151 0.06
152 0.07
153 0.15
154 0.19
155 0.21
156 0.22
157 0.23
158 0.31
159 0.34
160 0.39
161 0.4
162 0.45
163 0.47
164 0.53
165 0.58
166 0.55
167 0.55
168 0.5
169 0.49
170 0.46
171 0.46
172 0.45
173 0.45
174 0.45
175 0.42
176 0.42
177 0.37
178 0.3
179 0.27
180 0.25
181 0.21
182 0.16
183 0.2
184 0.21
185 0.2
186 0.2
187 0.2
188 0.18
189 0.16
190 0.16
191 0.11
192 0.11
193 0.11
194 0.16
195 0.17
196 0.19
197 0.21
198 0.21
199 0.22
200 0.23
201 0.23
202 0.18
203 0.18
204 0.16
205 0.14
206 0.15
207 0.14
208 0.12
209 0.12
210 0.11
211 0.11
212 0.1
213 0.1
214 0.08
215 0.07
216 0.07
217 0.06
218 0.07
219 0.07
220 0.06
221 0.12
222 0.19
223 0.21
224 0.22
225 0.24
226 0.24
227 0.32
228 0.32
229 0.28
230 0.23
231 0.21
232 0.21
233 0.19
234 0.19
235 0.11
236 0.1
237 0.09
238 0.08
239 0.08
240 0.07
241 0.08
242 0.09
243 0.1
244 0.1
245 0.11
246 0.15
247 0.18
248 0.19
249 0.26
250 0.28
251 0.32
252 0.39
253 0.43
254 0.44
255 0.47
256 0.51
257 0.44
258 0.42
259 0.38
260 0.31
261 0.29
262 0.25
263 0.19
264 0.13
265 0.11
266 0.1
267 0.09
268 0.08
269 0.05
270 0.05
271 0.04
272 0.05
273 0.04
274 0.04
275 0.04
276 0.05
277 0.08
278 0.08
279 0.09
280 0.11
281 0.15
282 0.16
283 0.21
284 0.29
285 0.31
286 0.33
287 0.41
288 0.46
289 0.45
290 0.48
291 0.48
292 0.42
293 0.4
294 0.39
295 0.34
296 0.33
297 0.36
298 0.4
299 0.43
300 0.46
301 0.52
302 0.58
303 0.64
304 0.64
305 0.61
306 0.55
307 0.49
308 0.42
309 0.36
310 0.29
311 0.19
312 0.13
313 0.12
314 0.1
315 0.09
316 0.08
317 0.07
318 0.07
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.06
323 0.05
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.04
331 0.05
332 0.06
333 0.05
334 0.06
335 0.07
336 0.07
337 0.1
338 0.13
339 0.16
340 0.21
341 0.26
342 0.28
343 0.32
344 0.32
345 0.3
346 0.29
347 0.34
348 0.35
349 0.37
350 0.37
351 0.36
352 0.36
353 0.34
354 0.35
355 0.29
356 0.24
357 0.17
358 0.19
359 0.17
360 0.22
361 0.23
362 0.21
363 0.19
364 0.17
365 0.26
366 0.24
367 0.25
368 0.21
369 0.22
370 0.23
371 0.23
372 0.27
373 0.21
374 0.26
375 0.32
376 0.34
377 0.36
378 0.39
379 0.41
380 0.37
381 0.37
382 0.33
383 0.29
384 0.26
385 0.24
386 0.21
387 0.19
388 0.19
389 0.15
390 0.11
391 0.07
392 0.06
393 0.05
394 0.07
395 0.09
396 0.1
397 0.12
398 0.12
399 0.12
400 0.14
401 0.13
402 0.19
403 0.23
404 0.26
405 0.29
406 0.32
407 0.31
408 0.3
409 0.33
410 0.26
411 0.21
412 0.17
413 0.12
414 0.1
415 0.11
416 0.13
417 0.11
418 0.1
419 0.1
420 0.1
421 0.09
422 0.09
423 0.09
424 0.07
425 0.05
426 0.05
427 0.05
428 0.05
429 0.05
430 0.05
431 0.06
432 0.06
433 0.06
434 0.1
435 0.1
436 0.1
437 0.17
438 0.18
439 0.24
440 0.29
441 0.29
442 0.27
443 0.29
444 0.29
445 0.23
446 0.21
447 0.16
448 0.12
449 0.12
450 0.11
451 0.1
452 0.09
453 0.11
454 0.12
455 0.11
456 0.11
457 0.09
458 0.1
459 0.09
460 0.09
461 0.07
462 0.07
463 0.08
464 0.08
465 0.09
466 0.1
467 0.09
468 0.09
469 0.1
470 0.11
471 0.15
472 0.2
473 0.21
474 0.2
475 0.21
476 0.22
477 0.24
478 0.27
479 0.25
480 0.2
481 0.22
482 0.22
483 0.21
484 0.2
485 0.17
486 0.12
487 0.12
488 0.1
489 0.08
490 0.07
491 0.07
492 0.07
493 0.06
494 0.07
495 0.05
496 0.05
497 0.04
498 0.06
499 0.06
500 0.08
501 0.08
502 0.09
503 0.09
504 0.12
505 0.15
506 0.16
507 0.16
508 0.19
509 0.22
510 0.22
511 0.22
512 0.2
513 0.17
514 0.18
515 0.22
516 0.21
517 0.2
518 0.21
519 0.23
520 0.24
521 0.24
522 0.21
523 0.18
524 0.16
525 0.14
526 0.13
527 0.11
528 0.11
529 0.11
530 0.11
531 0.12
532 0.13
533 0.12
534 0.14
535 0.15
536 0.17
537 0.17
538 0.17
539 0.16
540 0.14
541 0.14
542 0.12
543 0.1
544 0.07
545 0.07
546 0.06
547 0.03
548 0.03
549 0.03
550 0.03
551 0.03
552 0.03
553 0.02
554 0.02
555 0.02
556 0.03
557 0.03
558 0.03
559 0.03
560 0.03
561 0.06
562 0.08
563 0.08
564 0.08
565 0.09
566 0.09
567 0.1
568 0.1
569 0.08
570 0.07
571 0.08
572 0.08
573 0.08
574 0.08
575 0.07
576 0.07
577 0.06
578 0.06
579 0.04
580 0.04
581 0.03
582 0.04
583 0.04
584 0.04
585 0.04
586 0.05
587 0.05
588 0.06
589 0.06
590 0.07
591 0.07
592 0.07
593 0.07
594 0.06
595 0.06
596 0.06
597 0.06
598 0.05
599 0.05
600 0.07
601 0.08
602 0.09
603 0.15
604 0.2
605 0.29
606 0.31
607 0.38
608 0.43
609 0.45
610 0.47
611 0.44
612 0.41
613 0.34
614 0.34
615 0.27
616 0.22
617 0.2
618 0.19
619 0.16
620 0.14
621 0.13
622 0.12
623 0.12
624 0.11
625 0.11
626 0.1
627 0.1
628 0.1
629 0.11
630 0.09
631 0.11
632 0.13
633 0.13
634 0.14
635 0.16
636 0.15
637 0.15
638 0.15
639 0.14
640 0.14
641 0.12
642 0.11
643 0.09
644 0.09
645 0.08
646 0.08
647 0.06
648 0.04
649 0.04
650 0.03
651 0.03
652 0.03
653 0.04
654 0.05
655 0.06
656 0.06
657 0.07
658 0.08
659 0.1
660 0.21
661 0.26
662 0.29
663 0.33
664 0.33
665 0.34
666 0.35
667 0.33
668 0.28
669 0.33
670 0.37
671 0.35
672 0.4
673 0.46
674 0.51
675 0.56
676 0.55
677 0.55
678 0.57
679 0.61
680 0.61
681 0.56
682 0.54
683 0.53
684 0.48
685 0.38
686 0.28
687 0.22
688 0.18
689 0.16
690 0.12
691 0.07
692 0.08
693 0.09
694 0.09
695 0.12
696 0.13
697 0.18
698 0.2
699 0.25
700 0.25
701 0.26
702 0.27
703 0.23
704 0.21
705 0.2
706 0.18
707 0.13
708 0.12
709 0.1
710 0.09
711 0.09
712 0.08
713 0.05
714 0.05
715 0.06
716 0.07
717 0.08
718 0.09
719 0.1
720 0.11
721 0.11
722 0.12
723 0.16
724 0.17
725 0.19
726 0.2
727 0.21
728 0.22
729 0.21
730 0.21
731 0.15
732 0.14
733 0.15
734 0.14
735 0.15
736 0.2
737 0.25
738 0.31
739 0.39
740 0.44
741 0.43
742 0.44
743 0.48
744 0.49
745 0.47
746 0.43
747 0.39
748 0.34
749 0.31
750 0.29
751 0.23
752 0.18
753 0.15
754 0.13
755 0.1
756 0.13
757 0.17
758 0.22
759 0.27
760 0.32
761 0.4
762 0.47
763 0.5
764 0.54
765 0.59
766 0.62
767 0.66
768 0.67
769 0.65
770 0.62
771 0.59
772 0.53
773 0.45
774 0.35
775 0.26
776 0.19
777 0.13
778 0.1
779 0.11
780 0.11
781 0.12
782 0.12
783 0.16
784 0.18
785 0.21
786 0.22
787 0.22
788 0.23
789 0.22
790 0.22
791 0.18
792 0.17
793 0.14
794 0.11
795 0.1
796 0.08
797 0.08
798 0.08
799 0.09
800 0.11
801 0.12
802 0.15
803 0.18
804 0.19
805 0.22
806 0.24
807 0.26
808 0.29
809 0.38
810 0.37
811 0.37
812 0.36
813 0.33
814 0.32
815 0.28
816 0.22
817 0.14
818 0.13
819 0.11
820 0.14
821 0.18
822 0.2
823 0.22
824 0.27
825 0.33
826 0.4
827 0.48
828 0.54
829 0.59
830 0.69
831 0.78
832 0.8
833 0.76
834 0.68
835 0.61
836 0.56
837 0.53
838 0.48
839 0.38
840 0.33
841 0.3
842 0.3
843 0.27
844 0.23
845 0.17
846 0.11
847 0.1
848 0.07
849 0.07
850 0.06
851 0.07
852 0.09
853 0.11
854 0.11
855 0.11
856 0.12
857 0.14
858 0.16
859 0.15
860 0.16
861 0.19
862 0.24
863 0.26
864 0.26
865 0.24
866 0.23
867 0.25
868 0.24