Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

T5AII1

Protein Details
Accession T5AII1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
37-66REKVSLKKLSARKPKRPIRKALQARSTRTSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
42-57LKKLSARKPKRPIRKA
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 11, cyto 6.5, plas 4, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034150  SF3B6_RRM  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12241  RRM_SF3B14  
Amino Acid Sequences MPNNESLHEESGGELMEEDSEPSRGADEEPGNEEDVREKVSLKKLSARKPKRPIRKALQARSTRTSADMTDYYLCLVAHMLVLLFVTFKQLLGGQSGSEVQGPAVGIQVFEPSEATLPPGRERWQARQIELFTGQADATGGRCMRKWQFPAWWIDEDKLTVHTLMIPFLNSQRRRFAPTRALVIVLQISQEMSGRGGKLAPEVNRALFIKNLSYNVTPEELFDIFGKFGPIRQVRQGISNTTKGTAFVVYEDVIDAKQACDKLNGFNFQNRYLVVLYHQPEKMIKSKEDFEARREVLAKLKKQHGID
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.08
3 0.08
4 0.08
5 0.09
6 0.09
7 0.09
8 0.1
9 0.1
10 0.11
11 0.1
12 0.11
13 0.16
14 0.18
15 0.2
16 0.23
17 0.25
18 0.26
19 0.25
20 0.24
21 0.2
22 0.19
23 0.19
24 0.16
25 0.16
26 0.2
27 0.29
28 0.34
29 0.34
30 0.42
31 0.47
32 0.57
33 0.67
34 0.71
35 0.72
36 0.78
37 0.86
38 0.88
39 0.89
40 0.88
41 0.87
42 0.88
43 0.88
44 0.87
45 0.87
46 0.83
47 0.81
48 0.75
49 0.68
50 0.58
51 0.49
52 0.41
53 0.32
54 0.29
55 0.24
56 0.21
57 0.2
58 0.19
59 0.17
60 0.16
61 0.15
62 0.1
63 0.1
64 0.08
65 0.06
66 0.06
67 0.05
68 0.04
69 0.04
70 0.04
71 0.04
72 0.03
73 0.06
74 0.06
75 0.06
76 0.07
77 0.08
78 0.09
79 0.11
80 0.11
81 0.09
82 0.09
83 0.1
84 0.1
85 0.09
86 0.08
87 0.06
88 0.07
89 0.07
90 0.06
91 0.07
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.07
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.05
100 0.06
101 0.06
102 0.08
103 0.09
104 0.1
105 0.12
106 0.15
107 0.17
108 0.23
109 0.27
110 0.32
111 0.38
112 0.39
113 0.39
114 0.42
115 0.4
116 0.37
117 0.34
118 0.27
119 0.18
120 0.16
121 0.14
122 0.09
123 0.08
124 0.06
125 0.05
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.08
130 0.12
131 0.15
132 0.2
133 0.23
134 0.24
135 0.28
136 0.31
137 0.36
138 0.35
139 0.35
140 0.3
141 0.28
142 0.25
143 0.2
144 0.17
145 0.13
146 0.11
147 0.08
148 0.07
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.07
155 0.11
156 0.2
157 0.21
158 0.23
159 0.28
160 0.29
161 0.36
162 0.38
163 0.4
164 0.4
165 0.41
166 0.43
167 0.38
168 0.38
169 0.31
170 0.29
171 0.24
172 0.15
173 0.12
174 0.07
175 0.06
176 0.05
177 0.06
178 0.05
179 0.06
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.08
184 0.08
185 0.1
186 0.14
187 0.14
188 0.17
189 0.18
190 0.18
191 0.21
192 0.21
193 0.2
194 0.17
195 0.16
196 0.15
197 0.16
198 0.17
199 0.17
200 0.17
201 0.17
202 0.17
203 0.18
204 0.15
205 0.14
206 0.15
207 0.13
208 0.13
209 0.13
210 0.12
211 0.1
212 0.11
213 0.12
214 0.09
215 0.11
216 0.19
217 0.22
218 0.24
219 0.29
220 0.34
221 0.33
222 0.39
223 0.4
224 0.38
225 0.39
226 0.41
227 0.36
228 0.33
229 0.32
230 0.27
231 0.25
232 0.19
233 0.15
234 0.11
235 0.12
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.09
240 0.08
241 0.09
242 0.08
243 0.07
244 0.11
245 0.12
246 0.13
247 0.16
248 0.18
249 0.24
250 0.3
251 0.35
252 0.34
253 0.39
254 0.41
255 0.39
256 0.4
257 0.33
258 0.3
259 0.25
260 0.23
261 0.19
262 0.23
263 0.24
264 0.28
265 0.28
266 0.27
267 0.29
268 0.33
269 0.38
270 0.36
271 0.38
272 0.37
273 0.41
274 0.48
275 0.55
276 0.54
277 0.5
278 0.54
279 0.51
280 0.5
281 0.47
282 0.41
283 0.4
284 0.47
285 0.5
286 0.49
287 0.56