Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

T5AP35

Protein Details
Accession T5AP35    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
81-104AQAKINQQKNSKQPKKNPKSGGESHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
92-125KQPKKNPKSGGESARGSEERGSAAAQGGARGGRR
155-183KKRAPTAAARKGASPPTRAKRATAPRVKK
288-310REPQPKHGRGKTGQGKKGQGEKH
Subcellular Location(s) cyto_mito 8, mito 7.5, cyto 7.5, nucl 7, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016197  Chromo-like_dom_sf  
IPR008676  MRG  
IPR025995  Tudor-knot  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006325  P:chromatin organization  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF11717  Tudor-knot  
CDD cd18983  CBD_MSL3_like  
Amino Acid Sequences MAPARQPQAQFSKDEKVLCFHMDMLYEAKVMDVQPGDTPGDGHRYKVHYKGWKNTWDDWVLADRIRPFDDEHKELAAQLHAQAKINQQKNSKQPKKNPKSGGESARGSEERGSAAAQGGARGGRRGKDWELEQWRLFTAISTINFLTFIAMAATKKRAPTAAARKGASPPTRAKRATAPRVKKSVSPATEQAKQPCIKINIKLKKTTSHAAKLAIPPTREDFPISNVRGCPESPPALPKFKPVTNPINLKGLKLAPDHLTMLPNIGYRYLSVQGRRLYDRRYDVKVPREPQPKHGRGKTGQGKKGQGEKHPAPEPGLEA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.45
3 0.4
4 0.41
5 0.37
6 0.33
7 0.26
8 0.24
9 0.21
10 0.21
11 0.19
12 0.17
13 0.15
14 0.13
15 0.12
16 0.12
17 0.11
18 0.13
19 0.11
20 0.11
21 0.12
22 0.15
23 0.16
24 0.14
25 0.15
26 0.13
27 0.21
28 0.2
29 0.21
30 0.24
31 0.29
32 0.33
33 0.39
34 0.45
35 0.47
36 0.54
37 0.62
38 0.65
39 0.67
40 0.69
41 0.67
42 0.65
43 0.57
44 0.5
45 0.42
46 0.38
47 0.31
48 0.26
49 0.25
50 0.21
51 0.21
52 0.22
53 0.21
54 0.2
55 0.27
56 0.33
57 0.33
58 0.33
59 0.32
60 0.31
61 0.31
62 0.29
63 0.22
64 0.16
65 0.15
66 0.18
67 0.18
68 0.19
69 0.21
70 0.27
71 0.35
72 0.4
73 0.43
74 0.43
75 0.49
76 0.58
77 0.67
78 0.7
79 0.7
80 0.75
81 0.81
82 0.85
83 0.87
84 0.85
85 0.81
86 0.79
87 0.78
88 0.74
89 0.69
90 0.6
91 0.51
92 0.48
93 0.41
94 0.33
95 0.27
96 0.21
97 0.15
98 0.14
99 0.13
100 0.09
101 0.09
102 0.1
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.1
109 0.12
110 0.11
111 0.13
112 0.17
113 0.19
114 0.22
115 0.23
116 0.29
117 0.34
118 0.37
119 0.36
120 0.32
121 0.3
122 0.27
123 0.25
124 0.16
125 0.11
126 0.1
127 0.1
128 0.12
129 0.11
130 0.11
131 0.11
132 0.11
133 0.09
134 0.06
135 0.06
136 0.04
137 0.05
138 0.05
139 0.06
140 0.09
141 0.1
142 0.1
143 0.11
144 0.11
145 0.12
146 0.21
147 0.3
148 0.36
149 0.39
150 0.39
151 0.4
152 0.42
153 0.47
154 0.4
155 0.34
156 0.34
157 0.35
158 0.42
159 0.41
160 0.4
161 0.43
162 0.5
163 0.56
164 0.58
165 0.6
166 0.59
167 0.65
168 0.64
169 0.58
170 0.55
171 0.54
172 0.46
173 0.42
174 0.41
175 0.4
176 0.45
177 0.45
178 0.41
179 0.39
180 0.37
181 0.34
182 0.35
183 0.36
184 0.33
185 0.38
186 0.45
187 0.48
188 0.51
189 0.56
190 0.52
191 0.52
192 0.53
193 0.54
194 0.5
195 0.47
196 0.45
197 0.42
198 0.43
199 0.42
200 0.42
201 0.38
202 0.32
203 0.28
204 0.3
205 0.29
206 0.26
207 0.25
208 0.21
209 0.22
210 0.29
211 0.29
212 0.29
213 0.27
214 0.28
215 0.27
216 0.26
217 0.24
218 0.2
219 0.22
220 0.2
221 0.26
222 0.29
223 0.34
224 0.34
225 0.38
226 0.39
227 0.39
228 0.43
229 0.44
230 0.48
231 0.49
232 0.55
233 0.5
234 0.53
235 0.5
236 0.45
237 0.42
238 0.36
239 0.32
240 0.27
241 0.28
242 0.22
243 0.24
244 0.26
245 0.23
246 0.23
247 0.19
248 0.19
249 0.18
250 0.17
251 0.15
252 0.13
253 0.12
254 0.12
255 0.15
256 0.18
257 0.21
258 0.23
259 0.29
260 0.32
261 0.36
262 0.42
263 0.44
264 0.43
265 0.46
266 0.52
267 0.52
268 0.54
269 0.58
270 0.59
271 0.65
272 0.69
273 0.65
274 0.66
275 0.71
276 0.66
277 0.68
278 0.72
279 0.71
280 0.72
281 0.75
282 0.74
283 0.68
284 0.76
285 0.76
286 0.75
287 0.73
288 0.71
289 0.71
290 0.69
291 0.74
292 0.69
293 0.66
294 0.66
295 0.65
296 0.66
297 0.65
298 0.6
299 0.54