Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

T5A690

Protein Details
Accession T5A690    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
290-313LSPGHDPTRPRRSGKKRSYGDSSFHydrophilic
335-354EGEGRQKRRKVDSGNSPQLPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
293-306GHDPTRPRRSGKKR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 9.5, mito 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013942  Mediator_Med19_fun  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF08633  Rox3  
Amino Acid Sequences MTFHPQTPQSPCRFSPVASLSDIMASHIPGPQPLATTLPTPAHSVNGGNSQPDAVMIDDSPHKRKRPLDDSCGDRDQKKMHLDVGELYLLCQKRTTSSVARSSFGQGSSRNETVVGLGEHLSNDDATSPVHPESLPRITEDLFEMFDLVDIAAEVAREKPNGEKNALRKTYKGHIKRLGVAGHFDVQKKEEDAPSDFLAMIQVPDLEWNVHQVKGREISAGLSETTHTNMIRALTMFKGPLPKAVWDTSVLGDLATANPDTSKSAASKPTAPNTPSASTPNAMGRSKSRLSPGHDPTRPRRSGKKRSYGDSSFEGYGEGFPDDDAGVDTGYSTGEGEGRQKRRKVDSGNSPQLPTMHPQSYGPGMVGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.48
3 0.44
4 0.4
5 0.35
6 0.35
7 0.27
8 0.27
9 0.26
10 0.19
11 0.15
12 0.13
13 0.12
14 0.14
15 0.14
16 0.13
17 0.15
18 0.15
19 0.16
20 0.16
21 0.18
22 0.16
23 0.17
24 0.2
25 0.2
26 0.2
27 0.22
28 0.21
29 0.2
30 0.2
31 0.2
32 0.2
33 0.24
34 0.23
35 0.21
36 0.21
37 0.19
38 0.18
39 0.17
40 0.15
41 0.08
42 0.09
43 0.08
44 0.1
45 0.17
46 0.21
47 0.28
48 0.34
49 0.37
50 0.43
51 0.49
52 0.57
53 0.6
54 0.65
55 0.66
56 0.67
57 0.69
58 0.69
59 0.7
60 0.63
61 0.54
62 0.5
63 0.44
64 0.43
65 0.42
66 0.37
67 0.34
68 0.33
69 0.32
70 0.3
71 0.29
72 0.24
73 0.19
74 0.18
75 0.19
76 0.18
77 0.17
78 0.16
79 0.14
80 0.15
81 0.18
82 0.23
83 0.24
84 0.31
85 0.39
86 0.4
87 0.41
88 0.4
89 0.41
90 0.38
91 0.32
92 0.28
93 0.22
94 0.25
95 0.3
96 0.29
97 0.25
98 0.23
99 0.22
100 0.19
101 0.19
102 0.13
103 0.08
104 0.09
105 0.09
106 0.08
107 0.09
108 0.09
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.05
113 0.06
114 0.06
115 0.08
116 0.08
117 0.09
118 0.09
119 0.1
120 0.14
121 0.18
122 0.18
123 0.17
124 0.18
125 0.18
126 0.19
127 0.19
128 0.15
129 0.11
130 0.1
131 0.09
132 0.08
133 0.07
134 0.06
135 0.05
136 0.04
137 0.03
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.05
143 0.06
144 0.07
145 0.07
146 0.12
147 0.18
148 0.21
149 0.24
150 0.26
151 0.31
152 0.41
153 0.45
154 0.42
155 0.36
156 0.38
157 0.44
158 0.49
159 0.48
160 0.47
161 0.49
162 0.5
163 0.52
164 0.52
165 0.45
166 0.36
167 0.32
168 0.25
169 0.22
170 0.21
171 0.19
172 0.16
173 0.15
174 0.15
175 0.15
176 0.15
177 0.13
178 0.14
179 0.15
180 0.17
181 0.16
182 0.16
183 0.15
184 0.13
185 0.12
186 0.09
187 0.07
188 0.05
189 0.04
190 0.03
191 0.04
192 0.04
193 0.05
194 0.04
195 0.09
196 0.1
197 0.12
198 0.14
199 0.14
200 0.17
201 0.19
202 0.2
203 0.16
204 0.15
205 0.14
206 0.13
207 0.13
208 0.11
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.09
213 0.1
214 0.09
215 0.08
216 0.09
217 0.1
218 0.1
219 0.1
220 0.1
221 0.09
222 0.1
223 0.1
224 0.11
225 0.16
226 0.15
227 0.2
228 0.2
229 0.21
230 0.23
231 0.24
232 0.24
233 0.2
234 0.21
235 0.17
236 0.17
237 0.15
238 0.11
239 0.1
240 0.09
241 0.07
242 0.07
243 0.06
244 0.05
245 0.06
246 0.06
247 0.08
248 0.08
249 0.1
250 0.11
251 0.15
252 0.2
253 0.22
254 0.29
255 0.32
256 0.37
257 0.42
258 0.4
259 0.41
260 0.41
261 0.41
262 0.35
263 0.34
264 0.31
265 0.25
266 0.26
267 0.27
268 0.27
269 0.27
270 0.27
271 0.27
272 0.31
273 0.33
274 0.34
275 0.35
276 0.36
277 0.42
278 0.49
279 0.54
280 0.58
281 0.6
282 0.64
283 0.67
284 0.72
285 0.71
286 0.67
287 0.69
288 0.7
289 0.77
290 0.8
291 0.82
292 0.78
293 0.78
294 0.81
295 0.75
296 0.69
297 0.62
298 0.56
299 0.45
300 0.39
301 0.33
302 0.24
303 0.2
304 0.16
305 0.12
306 0.08
307 0.07
308 0.08
309 0.07
310 0.07
311 0.08
312 0.07
313 0.06
314 0.06
315 0.07
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.05
320 0.05
321 0.07
322 0.08
323 0.16
324 0.25
325 0.34
326 0.43
327 0.47
328 0.54
329 0.62
330 0.69
331 0.7
332 0.71
333 0.73
334 0.76
335 0.81
336 0.77
337 0.7
338 0.63
339 0.56
340 0.49
341 0.43
342 0.39
343 0.32
344 0.3
345 0.29
346 0.31
347 0.33
348 0.31