Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

T5A3Y1

Protein Details
Accession T5A3Y1    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
104-130DEAAETEKPRRERKRKRKEDNEDLEANAcidic
485-510DGRPKDLKLGKKSPGKPQNRGARRAABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
111-121KPRRERKRKRK
400-418RAKDPRKTATAQERNKAKA
479-517RRASSKDGRPKDLKLGKKSPGKPQNRGARRAAGWKKKAA
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11.333, cyto_mito 5.833, mito 5.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12394  RRM1_RBM34  
Amino Acid Sequences MPKRNPAPTLGLASKAIDPTLDALFASSSGPVKAPHKSRYSAAQELRVPDADDKEPSDQEVDEVLSEASQELDYDDEDEPTSNVSGDDAPDKNAEKSDEATSADEAAETEKPRRERKRKRKEDNEDLEANYLAELTKHDVAQPAEKRLKGEKKHVDTDGDVPVHESLTQDSGAPDLDRAGRTVFLGNVSAEAITSKKAKKTLITHLSSVLDQNDAAAPQKLESIRFRSVAFSTGSMPKRAAYITKSVMSATTQSANAYAVFSSPAAARKVASELNGSEVLGRHIRVDSVAHPSVMAHRRCVFVGNLGFVDDETVVRTDGEGKTVEKKRNKIPSDVEEGLWRTFLKQGKVENVRVVRDPKTRVGKGFAYVQFYDVNDVESALLLDGKKFPPMLPRALRVTRAKDPRKTATAQERNKAKAIASSGAARRTKYEHKSTAEEQAAAAAGRAGKLLGRAGAAKQRTGAPGSVSKTPEQIVFEGRRASSKDGRPKDLKLGKKSPGKPQNRGARRAAGWKKKAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.28
3 0.24
4 0.16
5 0.15
6 0.15
7 0.15
8 0.13
9 0.1
10 0.1
11 0.1
12 0.1
13 0.1
14 0.09
15 0.09
16 0.1
17 0.11
18 0.15
19 0.18
20 0.26
21 0.33
22 0.39
23 0.44
24 0.47
25 0.49
26 0.55
27 0.59
28 0.61
29 0.58
30 0.57
31 0.55
32 0.55
33 0.55
34 0.46
35 0.41
36 0.34
37 0.34
38 0.29
39 0.27
40 0.27
41 0.28
42 0.27
43 0.26
44 0.25
45 0.21
46 0.19
47 0.18
48 0.16
49 0.12
50 0.12
51 0.1
52 0.08
53 0.08
54 0.07
55 0.07
56 0.06
57 0.06
58 0.05
59 0.06
60 0.07
61 0.1
62 0.1
63 0.1
64 0.11
65 0.11
66 0.11
67 0.11
68 0.12
69 0.09
70 0.08
71 0.09
72 0.09
73 0.1
74 0.15
75 0.14
76 0.16
77 0.19
78 0.21
79 0.21
80 0.22
81 0.23
82 0.2
83 0.22
84 0.23
85 0.22
86 0.22
87 0.22
88 0.2
89 0.19
90 0.17
91 0.14
92 0.11
93 0.11
94 0.13
95 0.13
96 0.17
97 0.22
98 0.28
99 0.38
100 0.49
101 0.59
102 0.67
103 0.76
104 0.83
105 0.89
106 0.94
107 0.96
108 0.95
109 0.95
110 0.92
111 0.88
112 0.79
113 0.69
114 0.59
115 0.48
116 0.37
117 0.26
118 0.17
119 0.1
120 0.07
121 0.07
122 0.1
123 0.11
124 0.11
125 0.12
126 0.16
127 0.18
128 0.26
129 0.28
130 0.33
131 0.36
132 0.37
133 0.39
134 0.44
135 0.52
136 0.49
137 0.56
138 0.57
139 0.59
140 0.64
141 0.63
142 0.57
143 0.5
144 0.48
145 0.43
146 0.33
147 0.26
148 0.22
149 0.2
150 0.17
151 0.15
152 0.12
153 0.07
154 0.09
155 0.09
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.07
162 0.07
163 0.09
164 0.09
165 0.1
166 0.1
167 0.1
168 0.11
169 0.11
170 0.1
171 0.09
172 0.1
173 0.09
174 0.08
175 0.08
176 0.07
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.07
181 0.11
182 0.13
183 0.16
184 0.19
185 0.21
186 0.27
187 0.32
188 0.41
189 0.46
190 0.46
191 0.44
192 0.43
193 0.43
194 0.37
195 0.32
196 0.22
197 0.13
198 0.1
199 0.1
200 0.08
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.1
207 0.1
208 0.13
209 0.15
210 0.2
211 0.21
212 0.22
213 0.23
214 0.22
215 0.22
216 0.22
217 0.19
218 0.15
219 0.15
220 0.21
221 0.22
222 0.2
223 0.2
224 0.18
225 0.18
226 0.18
227 0.17
228 0.12
229 0.16
230 0.18
231 0.19
232 0.19
233 0.18
234 0.17
235 0.16
236 0.15
237 0.12
238 0.11
239 0.09
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.09
244 0.08
245 0.06
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.06
250 0.06
251 0.09
252 0.09
253 0.09
254 0.09
255 0.1
256 0.12
257 0.12
258 0.12
259 0.11
260 0.1
261 0.13
262 0.13
263 0.12
264 0.1
265 0.1
266 0.11
267 0.1
268 0.1
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.08
273 0.09
274 0.09
275 0.15
276 0.15
277 0.14
278 0.14
279 0.14
280 0.21
281 0.27
282 0.26
283 0.22
284 0.23
285 0.25
286 0.25
287 0.27
288 0.2
289 0.18
290 0.18
291 0.16
292 0.15
293 0.14
294 0.14
295 0.11
296 0.12
297 0.07
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.06
304 0.09
305 0.09
306 0.11
307 0.11
308 0.12
309 0.21
310 0.27
311 0.35
312 0.37
313 0.42
314 0.49
315 0.58
316 0.6
317 0.57
318 0.57
319 0.55
320 0.57
321 0.53
322 0.45
323 0.38
324 0.38
325 0.31
326 0.26
327 0.21
328 0.13
329 0.16
330 0.2
331 0.2
332 0.21
333 0.25
334 0.33
335 0.39
336 0.4
337 0.41
338 0.41
339 0.4
340 0.4
341 0.41
342 0.38
343 0.38
344 0.39
345 0.41
346 0.47
347 0.47
348 0.45
349 0.47
350 0.42
351 0.39
352 0.43
353 0.38
354 0.35
355 0.32
356 0.31
357 0.28
358 0.26
359 0.26
360 0.18
361 0.17
362 0.12
363 0.12
364 0.1
365 0.09
366 0.09
367 0.06
368 0.07
369 0.06
370 0.07
371 0.1
372 0.11
373 0.12
374 0.13
375 0.14
376 0.2
377 0.24
378 0.32
379 0.33
380 0.37
381 0.43
382 0.45
383 0.51
384 0.49
385 0.52
386 0.52
387 0.58
388 0.62
389 0.62
390 0.67
391 0.67
392 0.66
393 0.63
394 0.62
395 0.63
396 0.65
397 0.65
398 0.66
399 0.66
400 0.64
401 0.63
402 0.56
403 0.45
404 0.39
405 0.36
406 0.3
407 0.25
408 0.28
409 0.29
410 0.36
411 0.37
412 0.33
413 0.32
414 0.36
415 0.43
416 0.45
417 0.51
418 0.51
419 0.54
420 0.6
421 0.61
422 0.63
423 0.56
424 0.49
425 0.39
426 0.33
427 0.28
428 0.21
429 0.18
430 0.11
431 0.08
432 0.08
433 0.08
434 0.07
435 0.07
436 0.09
437 0.1
438 0.1
439 0.11
440 0.12
441 0.16
442 0.23
443 0.24
444 0.24
445 0.24
446 0.27
447 0.28
448 0.29
449 0.28
450 0.25
451 0.29
452 0.32
453 0.36
454 0.35
455 0.33
456 0.33
457 0.34
458 0.32
459 0.29
460 0.27
461 0.29
462 0.3
463 0.32
464 0.34
465 0.33
466 0.35
467 0.35
468 0.4
469 0.41
470 0.47
471 0.54
472 0.57
473 0.65
474 0.66
475 0.67
476 0.71
477 0.71
478 0.71
479 0.7
480 0.71
481 0.71
482 0.76
483 0.78
484 0.79
485 0.8
486 0.81
487 0.79
488 0.8
489 0.83
490 0.81
491 0.82
492 0.77
493 0.75
494 0.7
495 0.72
496 0.73
497 0.73