Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A090DCJ5

Protein Details
Accession A0A090DCJ5    Localization Confidence High Confidence Score 25.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-44SSTDQSSSNPNKRPRVDKNRSLFVRSHydrophilic
241-265GEETKTEKKKAKKAKKEEEKEEEEDAcidic
653-718NANVVQRRRQHEQKIREEGPRAPGSRAEREKRERERERGRKNRWERKEEKKRPDTWNKSSKGKKSABasic
741-766KLAMRTKIVARKREMRKKKAELRGEKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
247-257EKKKAKKAKKE
569-581KEAERHRKEKGKG
661-766RQHEQKIREEGPRAPGSRAEREKRERERERGRKNRWERKEEKKRPDTWNKSSKGKKSAVPKEEKGKAEPQTKEGKKNAEAKLAMRTKIVARKREMRKKKAELRGEK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034808  Nop4p_RRM3  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12676  RRM3_Nop4p  
Amino Acid Sequences MGADKKRQREDGPVEATTSSTDQSSSNPNKRPRVDKNRSLFVRSLPPSATSESLTNFFSQHYPVKHATVVLDPKTKTSRGYGFVSFADPEDAIEAKIKLNNELLDGRRLRLDIAQPRLRDAAKVSTEVAARVVTEKRQREEELAEQRKAPKLIIRNLPWSIKSSEQLAKLFQPFGKIKFADLPNSKGKLSGFGFVTLRGRKNAEKALEAINGKEIDGRTVAVDWAVDKQTWEQHKEEEEGGEETKTEKKKAKKAKKEEEKEEEEDPNMTQEDRDLANFFKNYGKNLEDEVEDDDEDVNSEDEDEDDDEEKDSDEEMDEDGDAEFEDASDDEEEEAEPEKKLSTDNSTTVFIRNLPYTATDEQLKAHFETFGAVRYARVVKERGTDRPAGTGFVCFFNHDDYVSCLKGAPRRPAPTLAKHSVLQDETLDPEGTYTLDGRILQVAPAVDKSEAARLQEMSASKKDKDKRRLFLLQEGQIPASSPVFKTLSDQEIKMREASAKQRKKLIESNPALHISLTRLAVRNIPANMDSKALKALAREAVVGFAKDVKEGKRAPLSKEENLRGGEQDKEAERHRKEKGKGVVKQAKIVFETVQGSKIDEKKAEGGGKSRGYGFIEYTSHRWALMGLRWLNGHAMKNEAGKTSRLIVEFAIENANVVQRRRQHEQKIREEGPRAPGSRAEREKRERERERGRKNRWERKEEKKRPDTWNKSSKGKKSAVPKEEKGKAEPQTKEGKKNAEAKLAMRTKIVARKREMRKKKAELRGEK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.46
3 0.43
4 0.35
5 0.28
6 0.19
7 0.14
8 0.14
9 0.12
10 0.15
11 0.25
12 0.33
13 0.4
14 0.48
15 0.57
16 0.65
17 0.72
18 0.79
19 0.8
20 0.82
21 0.83
22 0.84
23 0.84
24 0.85
25 0.82
26 0.77
27 0.69
28 0.62
29 0.62
30 0.55
31 0.5
32 0.41
33 0.4
34 0.37
35 0.38
36 0.35
37 0.27
38 0.26
39 0.25
40 0.26
41 0.24
42 0.22
43 0.19
44 0.19
45 0.18
46 0.2
47 0.24
48 0.25
49 0.3
50 0.32
51 0.34
52 0.34
53 0.33
54 0.31
55 0.32
56 0.36
57 0.36
58 0.4
59 0.37
60 0.41
61 0.45
62 0.44
63 0.39
64 0.39
65 0.39
66 0.38
67 0.42
68 0.39
69 0.37
70 0.36
71 0.36
72 0.3
73 0.25
74 0.22
75 0.16
76 0.14
77 0.14
78 0.13
79 0.11
80 0.13
81 0.13
82 0.13
83 0.16
84 0.17
85 0.17
86 0.2
87 0.2
88 0.21
89 0.26
90 0.26
91 0.32
92 0.32
93 0.31
94 0.3
95 0.29
96 0.27
97 0.27
98 0.33
99 0.33
100 0.41
101 0.46
102 0.44
103 0.46
104 0.49
105 0.45
106 0.38
107 0.33
108 0.32
109 0.29
110 0.3
111 0.28
112 0.27
113 0.28
114 0.26
115 0.24
116 0.15
117 0.13
118 0.15
119 0.16
120 0.2
121 0.27
122 0.33
123 0.35
124 0.4
125 0.42
126 0.43
127 0.45
128 0.48
129 0.5
130 0.51
131 0.49
132 0.47
133 0.49
134 0.51
135 0.46
136 0.39
137 0.34
138 0.35
139 0.42
140 0.48
141 0.49
142 0.5
143 0.53
144 0.55
145 0.5
146 0.46
147 0.41
148 0.35
149 0.31
150 0.31
151 0.32
152 0.32
153 0.32
154 0.31
155 0.32
156 0.31
157 0.33
158 0.28
159 0.3
160 0.29
161 0.3
162 0.35
163 0.3
164 0.3
165 0.35
166 0.36
167 0.38
168 0.39
169 0.41
170 0.42
171 0.44
172 0.42
173 0.36
174 0.34
175 0.32
176 0.3
177 0.3
178 0.23
179 0.24
180 0.24
181 0.24
182 0.3
183 0.28
184 0.29
185 0.27
186 0.29
187 0.29
188 0.34
189 0.38
190 0.35
191 0.32
192 0.32
193 0.33
194 0.35
195 0.32
196 0.27
197 0.25
198 0.22
199 0.2
200 0.21
201 0.17
202 0.13
203 0.13
204 0.13
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.09
212 0.1
213 0.09
214 0.1
215 0.11
216 0.18
217 0.23
218 0.26
219 0.24
220 0.27
221 0.29
222 0.31
223 0.3
224 0.24
225 0.21
226 0.19
227 0.18
228 0.15
229 0.12
230 0.12
231 0.17
232 0.19
233 0.21
234 0.26
235 0.34
236 0.43
237 0.54
238 0.64
239 0.68
240 0.77
241 0.84
242 0.88
243 0.9
244 0.89
245 0.87
246 0.82
247 0.74
248 0.67
249 0.57
250 0.46
251 0.38
252 0.29
253 0.22
254 0.16
255 0.13
256 0.09
257 0.08
258 0.1
259 0.09
260 0.1
261 0.1
262 0.1
263 0.14
264 0.14
265 0.15
266 0.18
267 0.19
268 0.2
269 0.22
270 0.22
271 0.2
272 0.21
273 0.22
274 0.16
275 0.16
276 0.16
277 0.14
278 0.13
279 0.12
280 0.1
281 0.09
282 0.09
283 0.08
284 0.06
285 0.05
286 0.05
287 0.04
288 0.04
289 0.05
290 0.05
291 0.06
292 0.07
293 0.07
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.07
298 0.07
299 0.06
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.04
309 0.04
310 0.03
311 0.03
312 0.04
313 0.03
314 0.04
315 0.04
316 0.05
317 0.04
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.07
327 0.08
328 0.09
329 0.13
330 0.15
331 0.17
332 0.19
333 0.2
334 0.21
335 0.21
336 0.2
337 0.15
338 0.14
339 0.13
340 0.11
341 0.1
342 0.1
343 0.14
344 0.14
345 0.14
346 0.14
347 0.14
348 0.15
349 0.16
350 0.16
351 0.12
352 0.12
353 0.1
354 0.09
355 0.1
356 0.09
357 0.09
358 0.09
359 0.08
360 0.08
361 0.1
362 0.11
363 0.11
364 0.13
365 0.13
366 0.13
367 0.19
368 0.22
369 0.24
370 0.26
371 0.28
372 0.26
373 0.28
374 0.26
375 0.22
376 0.19
377 0.17
378 0.14
379 0.13
380 0.13
381 0.1
382 0.1
383 0.11
384 0.11
385 0.1
386 0.09
387 0.11
388 0.13
389 0.13
390 0.12
391 0.11
392 0.13
393 0.18
394 0.23
395 0.27
396 0.3
397 0.34
398 0.36
399 0.43
400 0.45
401 0.48
402 0.5
403 0.46
404 0.42
405 0.4
406 0.39
407 0.34
408 0.3
409 0.23
410 0.16
411 0.13
412 0.12
413 0.12
414 0.11
415 0.08
416 0.08
417 0.08
418 0.07
419 0.07
420 0.06
421 0.05
422 0.06
423 0.06
424 0.06
425 0.08
426 0.07
427 0.07
428 0.08
429 0.08
430 0.07
431 0.07
432 0.08
433 0.07
434 0.07
435 0.08
436 0.11
437 0.12
438 0.12
439 0.13
440 0.12
441 0.13
442 0.15
443 0.16
444 0.15
445 0.19
446 0.21
447 0.22
448 0.28
449 0.36
450 0.43
451 0.52
452 0.57
453 0.59
454 0.64
455 0.7
456 0.65
457 0.67
458 0.64
459 0.56
460 0.51
461 0.46
462 0.38
463 0.3
464 0.28
465 0.2
466 0.15
467 0.12
468 0.08
469 0.11
470 0.12
471 0.12
472 0.14
473 0.17
474 0.21
475 0.22
476 0.22
477 0.23
478 0.25
479 0.26
480 0.24
481 0.22
482 0.18
483 0.21
484 0.3
485 0.37
486 0.41
487 0.43
488 0.5
489 0.5
490 0.54
491 0.58
492 0.55
493 0.55
494 0.53
495 0.53
496 0.5
497 0.5
498 0.44
499 0.36
500 0.29
501 0.2
502 0.19
503 0.17
504 0.15
505 0.15
506 0.16
507 0.18
508 0.2
509 0.22
510 0.19
511 0.19
512 0.18
513 0.19
514 0.19
515 0.19
516 0.17
517 0.14
518 0.15
519 0.14
520 0.13
521 0.12
522 0.14
523 0.15
524 0.15
525 0.15
526 0.13
527 0.15
528 0.15
529 0.15
530 0.11
531 0.11
532 0.11
533 0.12
534 0.15
535 0.14
536 0.2
537 0.21
538 0.26
539 0.33
540 0.36
541 0.38
542 0.45
543 0.5
544 0.49
545 0.56
546 0.54
547 0.49
548 0.48
549 0.45
550 0.37
551 0.33
552 0.29
553 0.21
554 0.22
555 0.2
556 0.22
557 0.27
558 0.34
559 0.36
560 0.4
561 0.47
562 0.52
563 0.53
564 0.59
565 0.63
566 0.64
567 0.66
568 0.71
569 0.72
570 0.65
571 0.68
572 0.62
573 0.55
574 0.46
575 0.41
576 0.31
577 0.25
578 0.27
579 0.21
580 0.22
581 0.19
582 0.19
583 0.23
584 0.27
585 0.27
586 0.25
587 0.26
588 0.26
589 0.31
590 0.34
591 0.3
592 0.3
593 0.33
594 0.34
595 0.33
596 0.3
597 0.28
598 0.26
599 0.26
600 0.23
601 0.2
602 0.21
603 0.22
604 0.24
605 0.25
606 0.23
607 0.21
608 0.2
609 0.17
610 0.19
611 0.21
612 0.26
613 0.23
614 0.25
615 0.25
616 0.26
617 0.28
618 0.27
619 0.26
620 0.19
621 0.21
622 0.22
623 0.26
624 0.27
625 0.27
626 0.25
627 0.24
628 0.25
629 0.25
630 0.27
631 0.24
632 0.23
633 0.19
634 0.2
635 0.2
636 0.19
637 0.16
638 0.12
639 0.12
640 0.12
641 0.16
642 0.16
643 0.17
644 0.21
645 0.27
646 0.34
647 0.42
648 0.51
649 0.57
650 0.65
651 0.74
652 0.78
653 0.81
654 0.8
655 0.77
656 0.72
657 0.66
658 0.64
659 0.61
660 0.53
661 0.45
662 0.46
663 0.46
664 0.52
665 0.57
666 0.56
667 0.59
668 0.66
669 0.75
670 0.79
671 0.84
672 0.82
673 0.83
674 0.87
675 0.87
676 0.9
677 0.9
678 0.9
679 0.9
680 0.92
681 0.93
682 0.91
683 0.91
684 0.88
685 0.89
686 0.91
687 0.91
688 0.91
689 0.89
690 0.88
691 0.88
692 0.91
693 0.9
694 0.89
695 0.88
696 0.83
697 0.84
698 0.84
699 0.82
700 0.8
701 0.75
702 0.71
703 0.72
704 0.76
705 0.76
706 0.76
707 0.75
708 0.75
709 0.78
710 0.75
711 0.7
712 0.67
713 0.66
714 0.65
715 0.61
716 0.58
717 0.6
718 0.63
719 0.67
720 0.65
721 0.64
722 0.63
723 0.69
724 0.68
725 0.66
726 0.62
727 0.56
728 0.6
729 0.58
730 0.52
731 0.44
732 0.41
733 0.39
734 0.46
735 0.52
736 0.5
737 0.52
738 0.61
739 0.71
740 0.79
741 0.83
742 0.84
743 0.87
744 0.89
745 0.92
746 0.92