Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

T5A3T8

Protein Details
Accession T5A3T8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
637-666GSDIREREKARRERRKEEERKLRQNRMGAEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
476-493PPKFKHKKIPRGPPSPPP
600-615ERAGSGRGRRESRTSR
642-663EREKARRERRKEEERKLRQNRM
Subcellular Location(s) extr 7, nucl 5, plas 5, mito 2, cyto 2, pero 2, E.R. 2, golg 2, cyto_mito 2, cyto_pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009038  GOLD_dom  
IPR036598  GOLD_dom_sf  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF01105  EMP24_GP25L  
PF02731  SKIP_SNW  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50866  GOLD  
Amino Acid Sequences MRFPTIAAGAVACMATVASAAAATALTYKLVAGEKACFYTETTRDNEKVAFYFAVQSGGSFDVDYTVEGPGSRIILEGEKERQGDFVFTAQHVGEYSFCFDNEMSTFTDKLVDFEISSEHETRSAQLPSKQGTSPEQTSVLEESIFKISGQLSTISRSQKYFRTRENRNFSTVNSTEKRIVNFSMIQIGLIVCMGALQVFVVRFFFQRRQERLSHTVDAPHLEIFYPYSVLRLSTLACFIIHHPPPHPNLECEMTSIAASLQATLPKPKYTGEDEEEASRSLQRGPRIVGPGQLDETQIVLKRAAPPPYGQRSGWRPRSQEDFGDGGAFPEVLVAQYPLEMGKKSATASNALAIQVDAEGKVKYDAIARRGHGDGRIIHTSFKELIPLRQRADAGEIDLSRPDKDAVAATTEKTKNALAALIIGAVAAQKPKNVNVGQQKDATFVRYTPADQMGDNSRKQDRIMKIVERQRDPMEPPKFKHKKIPRGPPSPPPPVMHSPPRKLTAEDQEMWRIPPPVSNWKNPKGFTVPLDKRLAADGRGLQDIAINDKHAQFAEAVKMAERHAREEVQQRAMMQQRLAEKEKAQKEDNLRSLAQKARDERAGSGRGRRESRTSRDSRSRSRSGSYSYSESGSDGEGSDIREREKARRERRKEEERKLRQNRMGAERRIQVMAREQNRDISEKIALGLAKPTQAKETMYDSRLFNQSSGFDSGFNEDNHFDKPLFAAQDAISSIYRPRANVEEDDGEAGEQEMAKIHKVSRFGEALGKGTFKGAADVEAREGPVQFEKETADPFNVDKFLSEVDQSSSSKRGYGLQEGGDRQSKRPRVDDDDGD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.05
2 0.04
3 0.04
4 0.04
5 0.03
6 0.03
7 0.03
8 0.04
9 0.04
10 0.04
11 0.05
12 0.06
13 0.06
14 0.06
15 0.06
16 0.09
17 0.11
18 0.13
19 0.13
20 0.17
21 0.19
22 0.21
23 0.22
24 0.2
25 0.21
26 0.27
27 0.3
28 0.31
29 0.33
30 0.38
31 0.39
32 0.4
33 0.39
34 0.34
35 0.31
36 0.3
37 0.26
38 0.2
39 0.23
40 0.21
41 0.22
42 0.18
43 0.17
44 0.16
45 0.16
46 0.16
47 0.11
48 0.11
49 0.1
50 0.1
51 0.11
52 0.1
53 0.09
54 0.09
55 0.09
56 0.1
57 0.09
58 0.1
59 0.09
60 0.09
61 0.1
62 0.12
63 0.14
64 0.18
65 0.21
66 0.25
67 0.26
68 0.25
69 0.26
70 0.24
71 0.24
72 0.21
73 0.19
74 0.18
75 0.17
76 0.19
77 0.17
78 0.16
79 0.15
80 0.14
81 0.13
82 0.12
83 0.15
84 0.14
85 0.14
86 0.15
87 0.14
88 0.16
89 0.16
90 0.17
91 0.16
92 0.17
93 0.18
94 0.16
95 0.21
96 0.18
97 0.18
98 0.19
99 0.17
100 0.15
101 0.15
102 0.16
103 0.14
104 0.18
105 0.18
106 0.16
107 0.16
108 0.17
109 0.18
110 0.22
111 0.23
112 0.24
113 0.27
114 0.32
115 0.34
116 0.38
117 0.37
118 0.35
119 0.36
120 0.39
121 0.37
122 0.35
123 0.33
124 0.3
125 0.31
126 0.29
127 0.25
128 0.18
129 0.16
130 0.15
131 0.15
132 0.15
133 0.13
134 0.12
135 0.12
136 0.13
137 0.14
138 0.14
139 0.13
140 0.16
141 0.21
142 0.24
143 0.26
144 0.27
145 0.3
146 0.35
147 0.43
148 0.46
149 0.52
150 0.57
151 0.65
152 0.73
153 0.79
154 0.75
155 0.71
156 0.66
157 0.57
158 0.57
159 0.48
160 0.46
161 0.39
162 0.38
163 0.39
164 0.4
165 0.4
166 0.34
167 0.34
168 0.29
169 0.28
170 0.26
171 0.25
172 0.22
173 0.2
174 0.17
175 0.16
176 0.12
177 0.1
178 0.09
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.03
184 0.02
185 0.04
186 0.05
187 0.05
188 0.06
189 0.07
190 0.09
191 0.13
192 0.2
193 0.27
194 0.37
195 0.42
196 0.46
197 0.5
198 0.56
199 0.58
200 0.58
201 0.52
202 0.44
203 0.43
204 0.38
205 0.36
206 0.3
207 0.23
208 0.18
209 0.14
210 0.13
211 0.11
212 0.1
213 0.1
214 0.08
215 0.09
216 0.09
217 0.09
218 0.1
219 0.09
220 0.1
221 0.09
222 0.1
223 0.1
224 0.1
225 0.1
226 0.12
227 0.19
228 0.22
229 0.22
230 0.23
231 0.28
232 0.31
233 0.37
234 0.36
235 0.3
236 0.3
237 0.31
238 0.3
239 0.26
240 0.24
241 0.17
242 0.15
243 0.14
244 0.1
245 0.08
246 0.08
247 0.07
248 0.07
249 0.1
250 0.11
251 0.15
252 0.17
253 0.17
254 0.18
255 0.19
256 0.21
257 0.24
258 0.29
259 0.28
260 0.29
261 0.29
262 0.3
263 0.3
264 0.27
265 0.22
266 0.17
267 0.14
268 0.15
269 0.18
270 0.18
271 0.2
272 0.22
273 0.26
274 0.29
275 0.29
276 0.29
277 0.28
278 0.27
279 0.26
280 0.24
281 0.2
282 0.16
283 0.15
284 0.13
285 0.12
286 0.11
287 0.1
288 0.11
289 0.16
290 0.2
291 0.23
292 0.23
293 0.24
294 0.31
295 0.38
296 0.4
297 0.34
298 0.36
299 0.41
300 0.5
301 0.57
302 0.54
303 0.49
304 0.49
305 0.56
306 0.53
307 0.46
308 0.39
309 0.32
310 0.26
311 0.25
312 0.21
313 0.15
314 0.12
315 0.1
316 0.06
317 0.05
318 0.05
319 0.03
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.05
326 0.06
327 0.06
328 0.06
329 0.07
330 0.08
331 0.09
332 0.11
333 0.11
334 0.13
335 0.13
336 0.13
337 0.13
338 0.13
339 0.12
340 0.09
341 0.09
342 0.06
343 0.06
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.11
352 0.14
353 0.17
354 0.2
355 0.2
356 0.23
357 0.24
358 0.24
359 0.2
360 0.21
361 0.18
362 0.2
363 0.22
364 0.2
365 0.2
366 0.19
367 0.2
368 0.18
369 0.16
370 0.16
371 0.14
372 0.19
373 0.25
374 0.28
375 0.27
376 0.28
377 0.28
378 0.24
379 0.26
380 0.21
381 0.16
382 0.14
383 0.13
384 0.11
385 0.13
386 0.13
387 0.1
388 0.1
389 0.09
390 0.07
391 0.08
392 0.08
393 0.07
394 0.1
395 0.1
396 0.1
397 0.17
398 0.17
399 0.17
400 0.17
401 0.17
402 0.14
403 0.14
404 0.13
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.05
409 0.05
410 0.04
411 0.03
412 0.03
413 0.03
414 0.04
415 0.04
416 0.06
417 0.07
418 0.08
419 0.14
420 0.14
421 0.2
422 0.28
423 0.33
424 0.34
425 0.36
426 0.36
427 0.33
428 0.33
429 0.28
430 0.2
431 0.15
432 0.14
433 0.12
434 0.12
435 0.12
436 0.14
437 0.13
438 0.12
439 0.14
440 0.19
441 0.22
442 0.22
443 0.24
444 0.23
445 0.23
446 0.24
447 0.3
448 0.25
449 0.28
450 0.32
451 0.33
452 0.38
453 0.43
454 0.49
455 0.43
456 0.44
457 0.39
458 0.37
459 0.37
460 0.39
461 0.42
462 0.4
463 0.41
464 0.49
465 0.53
466 0.52
467 0.59
468 0.59
469 0.62
470 0.66
471 0.76
472 0.74
473 0.76
474 0.78
475 0.77
476 0.75
477 0.71
478 0.65
479 0.55
480 0.51
481 0.48
482 0.49
483 0.49
484 0.5
485 0.48
486 0.49
487 0.51
488 0.46
489 0.43
490 0.43
491 0.42
492 0.41
493 0.38
494 0.36
495 0.35
496 0.35
497 0.33
498 0.3
499 0.23
500 0.17
501 0.18
502 0.2
503 0.27
504 0.3
505 0.38
506 0.44
507 0.5
508 0.54
509 0.52
510 0.52
511 0.45
512 0.43
513 0.38
514 0.42
515 0.38
516 0.39
517 0.41
518 0.38
519 0.33
520 0.34
521 0.32
522 0.22
523 0.22
524 0.18
525 0.17
526 0.18
527 0.17
528 0.14
529 0.15
530 0.14
531 0.15
532 0.13
533 0.12
534 0.13
535 0.13
536 0.14
537 0.12
538 0.13
539 0.1
540 0.11
541 0.12
542 0.12
543 0.12
544 0.12
545 0.13
546 0.13
547 0.17
548 0.16
549 0.16
550 0.17
551 0.19
552 0.22
553 0.29
554 0.33
555 0.33
556 0.33
557 0.3
558 0.33
559 0.37
560 0.35
561 0.28
562 0.26
563 0.27
564 0.31
565 0.35
566 0.31
567 0.3
568 0.37
569 0.43
570 0.44
571 0.41
572 0.42
573 0.45
574 0.52
575 0.53
576 0.48
577 0.43
578 0.4
579 0.43
580 0.42
581 0.4
582 0.36
583 0.35
584 0.36
585 0.39
586 0.38
587 0.36
588 0.38
589 0.39
590 0.36
591 0.39
592 0.41
593 0.44
594 0.46
595 0.46
596 0.48
597 0.5
598 0.56
599 0.58
600 0.58
601 0.6
602 0.67
603 0.71
604 0.72
605 0.73
606 0.71
607 0.65
608 0.63
609 0.59
610 0.54
611 0.52
612 0.46
613 0.42
614 0.37
615 0.35
616 0.3
617 0.27
618 0.22
619 0.17
620 0.14
621 0.09
622 0.09
623 0.09
624 0.11
625 0.14
626 0.14
627 0.15
628 0.19
629 0.21
630 0.28
631 0.37
632 0.45
633 0.53
634 0.63
635 0.7
636 0.76
637 0.84
638 0.88
639 0.89
640 0.89
641 0.89
642 0.89
643 0.92
644 0.91
645 0.91
646 0.85
647 0.8
648 0.76
649 0.75
650 0.74
651 0.67
652 0.64
653 0.59
654 0.55
655 0.52
656 0.45
657 0.37
658 0.36
659 0.41
660 0.4
661 0.41
662 0.39
663 0.43
664 0.44
665 0.45
666 0.37
667 0.3
668 0.26
669 0.22
670 0.21
671 0.18
672 0.16
673 0.14
674 0.16
675 0.14
676 0.17
677 0.18
678 0.19
679 0.19
680 0.21
681 0.22
682 0.21
683 0.28
684 0.3
685 0.31
686 0.34
687 0.32
688 0.35
689 0.39
690 0.36
691 0.29
692 0.25
693 0.24
694 0.24
695 0.26
696 0.22
697 0.18
698 0.18
699 0.21
700 0.22
701 0.22
702 0.2
703 0.18
704 0.19
705 0.2
706 0.21
707 0.18
708 0.15
709 0.16
710 0.18
711 0.19
712 0.18
713 0.18
714 0.16
715 0.19
716 0.19
717 0.19
718 0.15
719 0.14
720 0.15
721 0.2
722 0.21
723 0.19
724 0.22
725 0.25
726 0.29
727 0.3
728 0.34
729 0.3
730 0.29
731 0.3
732 0.27
733 0.22
734 0.18
735 0.16
736 0.11
737 0.08
738 0.07
739 0.09
740 0.09
741 0.11
742 0.13
743 0.16
744 0.19
745 0.23
746 0.25
747 0.28
748 0.29
749 0.29
750 0.34
751 0.32
752 0.32
753 0.3
754 0.29
755 0.23
756 0.22
757 0.22
758 0.15
759 0.17
760 0.13
761 0.15
762 0.16
763 0.17
764 0.2
765 0.2
766 0.2
767 0.19
768 0.19
769 0.17
770 0.2
771 0.22
772 0.19
773 0.19
774 0.21
775 0.22
776 0.25
777 0.25
778 0.22
779 0.21
780 0.22
781 0.25
782 0.23
783 0.21
784 0.18
785 0.17
786 0.17
787 0.17
788 0.17
789 0.15
790 0.17
791 0.21
792 0.22
793 0.24
794 0.26
795 0.25
796 0.25
797 0.25
798 0.28
799 0.29
800 0.35
801 0.36
802 0.37
803 0.43
804 0.44
805 0.48
806 0.49
807 0.46
808 0.45
809 0.51
810 0.53
811 0.52
812 0.57
813 0.6
814 0.61