FuNGI

T5AMQ1

Protein Details

Accession

T5AMQ1

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
3-36	APPPRGQNGVPRNTRKPKPNPLRPMRKAPNPLVA	Hydrophilic
184-208	AQEANPKKPKKPKEEKTQFNRAPKS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
13-50	PRNTRKPKPNPLRPMRKAPNPLVAPRRNPAAKPDGKPA
189-207	PKKPKKPKEEKTQFNRAPK
463-522	DKKDAEKKEANKKDAEGKDGQAEAKDKPKAAGSKGATTPQGKQKQGDLLKKGKSLKRAGS
534-541	SRKKLKKT
680-686	KRLRRRK

Subcellular Location(s)

nucl 19, cyto 4, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSAPPPRGQNGVPRNTRKPKPNPLRPMRKAPNPLVAPRRNPAAKPDGKPAPDASRNAASKDPGLDEVRKMYGGWTEPPPLFPYTDIPIMTTKKALIDGARFHVMRFFQPRLNDKPIDPTNQDAFARPVTLHRRDARQPPPGRSGKAEEHEALQVDELEAERLAQIKAERDAQRATDQAMIAPVAQEANPKKPKKPKEEKTQFNRAPKSEAAKKESDLRYEEALPWHLEDADGRNVWVANYVAALSRSSVAFMIDKSVFRMVPLEKWYKFTSKPPFQPFNIDQAEALMNKKMDVSRWVMKDEERKMGQSDLEATRQLFYGRGAMVKTESDTFRAASRLEKLEHDELDVSGDEFQDDDEAPHFERNDDEDTKDAKDRIRREQLGANLFGDGNEQQVDKELQEQLREHLERQKYGKTTKKALIKRDREDIYASDDSEDNPWSSSSDDDSSDEDEEANKEDDKKDADKKDAEKKEANKKDAEGKDGQAEAKDKPKAAGSKGATTPQGKQKQGDLLKKGKSLKRAGSPTLSESSGNESSRKKLKKTAAPATGGRSDTPLPQANAPRHRKLGGAGPGSDGEATAGELSDGVRPRKKLKVVGGSGNGTPGASRADSPNPTQGGAPPGSQGASGIEPWEILEKIPSDGIAIGDLIKPFQGRVGDRPGQMPKGEWIKLVKQLCDYGPDKRLRRRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.71
2	0.77
3	0.83
4	0.83
5	0.83
6	0.85
7	0.86
8	0.89
9	0.89
10	0.91
11	0.94
12	0.91
13	0.92
14	0.9
15	0.88
16	0.86
17	0.81
18	0.8
19	0.74
20	0.75
21	0.75
22	0.73
23	0.69
24	0.64
25	0.67
26	0.62
27	0.57
28	0.56
29	0.56
30	0.57
31	0.56
32	0.61
33	0.6
34	0.57
35	0.59
36	0.56
37	0.55
38	0.53
39	0.51
40	0.48
41	0.48
42	0.48
43	0.48
44	0.46
45	0.39
46	0.35
47	0.35
48	0.31
49	0.27
50	0.3
51	0.3
52	0.29
53	0.31
54	0.3
55	0.27
56	0.25
57	0.22
58	0.22
59	0.22
60	0.24
61	0.24
62	0.28
63	0.28
64	0.3
65	0.32
66	0.28
67	0.27
68	0.24
69	0.24
70	0.22
71	0.26
72	0.24
73	0.22
74	0.26
75	0.28
76	0.28
77	0.26
78	0.22
79	0.2
80	0.21
81	0.22
82	0.2
83	0.22
84	0.25
85	0.28
86	0.33
87	0.32
88	0.3
89	0.33
90	0.3
91	0.31
92	0.34
93	0.33
94	0.31
95	0.38
96	0.45
97	0.48
98	0.54
99	0.5
100	0.44
101	0.5
102	0.51
103	0.51
104	0.46
105	0.44
106	0.4
107	0.42
108	0.41
109	0.34
110	0.32
111	0.26
112	0.25
113	0.2
114	0.24
115	0.28
116	0.33
117	0.39
118	0.41
119	0.47
120	0.53
121	0.62
122	0.63
123	0.64
124	0.66
125	0.64
126	0.69
127	0.68
128	0.64
129	0.59
130	0.57
131	0.54
132	0.51
133	0.5
134	0.41
135	0.37
136	0.36
137	0.32
138	0.26
139	0.19
140	0.15
141	0.11
142	0.1
143	0.08
144	0.07
145	0.06
146	0.06
147	0.06
148	0.08
149	0.07
150	0.09
151	0.1
152	0.12
153	0.15
154	0.23
155	0.25
156	0.27
157	0.29
158	0.29
159	0.31
160	0.29
161	0.28
162	0.24
163	0.21
164	0.18
165	0.17
166	0.15
167	0.12
168	0.11
169	0.1
170	0.07
171	0.07
172	0.12
173	0.14
174	0.23
175	0.32
176	0.35
177	0.43
178	0.52
179	0.62
180	0.67
181	0.76
182	0.76
183	0.79
184	0.87
185	0.89
186	0.88
187	0.9
188	0.85
189	0.83
190	0.79
191	0.69
192	0.63
193	0.56
194	0.56
195	0.53
196	0.52
197	0.49
198	0.45
199	0.44
200	0.49
201	0.48
202	0.44
203	0.39
204	0.35
205	0.32
206	0.31
207	0.32
208	0.24
209	0.24
210	0.2
211	0.18
212	0.16
213	0.13
214	0.12
215	0.11
216	0.12
217	0.14
218	0.13
219	0.13
220	0.13
221	0.13
222	0.13
223	0.14
224	0.1
225	0.06
226	0.06
227	0.07
228	0.07
229	0.07
230	0.08
231	0.06
232	0.07
233	0.07
234	0.07
235	0.07
236	0.07
237	0.07
238	0.07
239	0.11
240	0.11
241	0.11
242	0.13
243	0.14
244	0.13
245	0.13
246	0.16
247	0.13
248	0.16
249	0.21
250	0.26
251	0.25
252	0.29
253	0.31
254	0.32
255	0.33
256	0.37
257	0.42
258	0.44
259	0.52
260	0.56
261	0.59
262	0.56
263	0.62
264	0.55
265	0.53
266	0.46
267	0.38
268	0.3
269	0.26
270	0.26
271	0.19
272	0.18
273	0.11
274	0.1
275	0.09
276	0.11
277	0.1
278	0.1
279	0.12
280	0.17
281	0.21
282	0.23
283	0.24
284	0.24
285	0.26
286	0.33
287	0.33
288	0.34
289	0.29
290	0.29
291	0.28
292	0.28
293	0.26
294	0.18
295	0.2
296	0.15
297	0.16
298	0.15
299	0.14
300	0.14
301	0.14
302	0.14
303	0.1
304	0.08
305	0.09
306	0.08
307	0.09
308	0.09
309	0.09
310	0.09
311	0.09
312	0.1
313	0.1
314	0.1
315	0.1
316	0.11
317	0.11
318	0.11
319	0.12
320	0.12
321	0.11
322	0.14
323	0.15
324	0.15
325	0.16
326	0.19
327	0.2
328	0.2
329	0.19
330	0.16
331	0.13
332	0.13
333	0.12
334	0.08
335	0.06
336	0.06
337	0.05
338	0.05
339	0.05
340	0.04
341	0.04
342	0.05
343	0.05
344	0.06
345	0.07
346	0.08
347	0.09
348	0.08
349	0.09
350	0.11
351	0.15
352	0.15
353	0.15
354	0.16
355	0.18
356	0.19
357	0.21
358	0.2
359	0.18
360	0.23
361	0.27
362	0.33
363	0.41
364	0.41
365	0.41
366	0.44
367	0.46
368	0.43
369	0.4
370	0.32
371	0.23
372	0.21
373	0.18
374	0.15
375	0.1
376	0.07
377	0.07
378	0.06
379	0.06
380	0.08
381	0.08
382	0.07
383	0.1
384	0.13
385	0.13
386	0.15
387	0.16
388	0.16
389	0.22
390	0.23
391	0.22
392	0.26
393	0.28
394	0.29
395	0.31
396	0.35
397	0.32
398	0.39
399	0.46
400	0.43
401	0.47
402	0.5
403	0.56
404	0.56
405	0.63
406	0.66
407	0.66
408	0.65
409	0.67
410	0.62
411	0.55
412	0.51
413	0.42
414	0.39
415	0.31
416	0.27
417	0.2
418	0.19
419	0.18
420	0.17
421	0.17
422	0.1
423	0.09
424	0.09
425	0.09
426	0.09
427	0.09
428	0.1
429	0.11
430	0.12
431	0.13
432	0.14
433	0.15
434	0.15
435	0.14
436	0.12
437	0.11
438	0.11
439	0.12
440	0.12
441	0.11
442	0.12
443	0.12
444	0.15
445	0.17
446	0.22
447	0.28
448	0.31
449	0.35
450	0.39
451	0.45
452	0.53
453	0.55
454	0.55
455	0.54
456	0.58
457	0.64
458	0.67
459	0.64
460	0.56
461	0.52
462	0.56
463	0.52
464	0.49
465	0.41
466	0.34
467	0.34
468	0.33
469	0.31
470	0.24
471	0.24
472	0.21
473	0.25
474	0.26
475	0.23
476	0.23
477	0.28
478	0.29
479	0.3
480	0.36
481	0.32
482	0.36
483	0.38
484	0.4
485	0.39
486	0.37
487	0.4
488	0.41
489	0.46
490	0.42
491	0.41
492	0.42
493	0.47
494	0.53
495	0.55
496	0.53
497	0.52
498	0.54
499	0.58
500	0.63
501	0.57
502	0.57
503	0.57
504	0.56
505	0.58
506	0.59
507	0.58
508	0.55
509	0.53
510	0.49
511	0.45
512	0.39
513	0.3
514	0.25
515	0.28
516	0.27
517	0.26
518	0.26
519	0.25
520	0.3
521	0.39
522	0.44
523	0.41
524	0.45
525	0.53
526	0.58
527	0.66
528	0.7
529	0.68
530	0.67
531	0.66
532	0.63
533	0.59
534	0.51
535	0.41
536	0.34
537	0.29
538	0.26
539	0.29
540	0.28
541	0.25
542	0.29
543	0.36
544	0.41
545	0.5
546	0.55
547	0.55
548	0.54
549	0.54
550	0.5
551	0.45
552	0.46
553	0.44
554	0.4
555	0.35
556	0.33
557	0.33
558	0.32
559	0.29
560	0.2
561	0.12
562	0.08
563	0.08
564	0.06
565	0.05
566	0.05
567	0.05
568	0.06
569	0.1
570	0.14
571	0.19
572	0.24
573	0.28
574	0.33
575	0.42
576	0.47
577	0.5
578	0.55
579	0.6
580	0.61
581	0.66
582	0.66
583	0.6
584	0.54
585	0.48
586	0.38
587	0.28
588	0.22
589	0.15
590	0.13
591	0.11
592	0.12
593	0.15
594	0.22
595	0.25
596	0.28
597	0.34
598	0.33
599	0.33
600	0.32
601	0.31
602	0.3
603	0.28
604	0.26
605	0.2
606	0.2
607	0.19
608	0.18
609	0.16
610	0.12
611	0.12
612	0.11
613	0.11
614	0.1
615	0.1
616	0.11
617	0.13
618	0.11
619	0.1
620	0.13
621	0.13
622	0.15
623	0.15
624	0.14
625	0.12
626	0.13
627	0.13
628	0.1
629	0.09
630	0.09
631	0.11
632	0.11
633	0.11
634	0.11
635	0.11
636	0.11
637	0.14
638	0.19
639	0.2
640	0.26
641	0.35
642	0.4
643	0.41
644	0.47
645	0.5
646	0.48
647	0.46
648	0.42
649	0.41
650	0.42
651	0.42
652	0.39
653	0.39
654	0.4
655	0.47
656	0.49
657	0.45
658	0.41
659	0.44
660	0.41
661	0.43
662	0.41
663	0.4
664	0.44
665	0.5
666	0.55

T5AMQ1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer