Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

T5AF45

Protein Details
Accession T5AF45    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-30GEGAKRKRASAAPKPVKRRRSSWAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-26AKRKRASAAPKPVKRRR
Subcellular Location(s) nucl 10, plas 7, mito 6, cyto_nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005612  CCAAT-binding_factor  
IPR027193  Noc4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF03914  CBF  
Amino Acid Sequences MPTATPGEGAKRKRASAAPKPVKRRRSSWADEGEDETDPGAKILLMEQGILESKKNYNDIGALLTTAEAGADESMLATLALCRVFLRLLAQGSLASKKSTSENDAVVVGWLRDRLSQYKLLLLRLLAVSDLAVTALILCMRILEAEGEHRSDKDAYSFPTPFLQDIVGAILTSSADDVRRAYIEEFAEQHDDIRHYTFKSIRPAIESVAEQVEAPGVLFDRVYSLLSSLDGVPGSADDLEDFYVAAPQKKSHPLRSVSHHKKQAQEAWLALMEIIETKDQRKRILAIVTTVIAPWFTKPELLADFLTDCYDSGGSMSLLALSGVFYLMQQRNLDYPSFYAKLYSLLDRDMMHSRHRSRFFRLLDTFMASTHLPAALVASFIKRLARLALNAPPSAIALVTPWIYNLLKRHPSCTFLMHREVREPETRRRIQEEGFQDVFAADEPDPMESGAINSCLWELVQLQSHYHPNIATISKIISEQFTKQSYNMEDFLDHSYASLLEAEMAKEVRKAPVVEFHIPPRVFLAHEGASATPDSLLVKLWDFGGGPAYKPHA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.58
3 0.61
4 0.68
5 0.7
6 0.73
7 0.83
8 0.86
9 0.88
10 0.85
11 0.81
12 0.79
13 0.78
14 0.77
15 0.76
16 0.76
17 0.71
18 0.66
19 0.64
20 0.57
21 0.47
22 0.39
23 0.3
24 0.22
25 0.16
26 0.14
27 0.11
28 0.08
29 0.07
30 0.08
31 0.12
32 0.1
33 0.1
34 0.1
35 0.12
36 0.15
37 0.15
38 0.15
39 0.14
40 0.18
41 0.21
42 0.23
43 0.22
44 0.21
45 0.22
46 0.22
47 0.21
48 0.18
49 0.15
50 0.13
51 0.12
52 0.1
53 0.08
54 0.07
55 0.04
56 0.04
57 0.04
58 0.04
59 0.04
60 0.04
61 0.04
62 0.04
63 0.04
64 0.04
65 0.04
66 0.06
67 0.06
68 0.06
69 0.07
70 0.08
71 0.08
72 0.09
73 0.11
74 0.13
75 0.14
76 0.15
77 0.15
78 0.15
79 0.17
80 0.2
81 0.19
82 0.16
83 0.15
84 0.16
85 0.2
86 0.23
87 0.26
88 0.26
89 0.26
90 0.26
91 0.26
92 0.24
93 0.21
94 0.18
95 0.13
96 0.1
97 0.1
98 0.09
99 0.11
100 0.15
101 0.17
102 0.2
103 0.25
104 0.25
105 0.31
106 0.32
107 0.31
108 0.29
109 0.25
110 0.24
111 0.19
112 0.18
113 0.11
114 0.09
115 0.08
116 0.07
117 0.06
118 0.04
119 0.03
120 0.03
121 0.03
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.05
131 0.05
132 0.09
133 0.11
134 0.13
135 0.14
136 0.14
137 0.16
138 0.16
139 0.16
140 0.16
141 0.17
142 0.18
143 0.23
144 0.24
145 0.22
146 0.25
147 0.25
148 0.22
149 0.2
150 0.17
151 0.11
152 0.11
153 0.11
154 0.07
155 0.06
156 0.06
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.04
162 0.05
163 0.06
164 0.06
165 0.07
166 0.08
167 0.09
168 0.1
169 0.13
170 0.14
171 0.15
172 0.15
173 0.15
174 0.17
175 0.16
176 0.16
177 0.14
178 0.14
179 0.14
180 0.15
181 0.16
182 0.14
183 0.18
184 0.22
185 0.24
186 0.31
187 0.33
188 0.32
189 0.33
190 0.34
191 0.31
192 0.29
193 0.24
194 0.18
195 0.15
196 0.15
197 0.11
198 0.1
199 0.09
200 0.06
201 0.06
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.05
208 0.05
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.07
214 0.08
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.06
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.03
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.07
231 0.08
232 0.1
233 0.1
234 0.11
235 0.15
236 0.24
237 0.28
238 0.31
239 0.38
240 0.41
241 0.44
242 0.51
243 0.59
244 0.59
245 0.63
246 0.64
247 0.61
248 0.6
249 0.61
250 0.59
251 0.51
252 0.44
253 0.36
254 0.29
255 0.25
256 0.21
257 0.16
258 0.1
259 0.06
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.07
265 0.11
266 0.13
267 0.14
268 0.15
269 0.16
270 0.19
271 0.23
272 0.22
273 0.2
274 0.19
275 0.19
276 0.17
277 0.15
278 0.11
279 0.07
280 0.07
281 0.05
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.09
287 0.1
288 0.12
289 0.11
290 0.1
291 0.11
292 0.1
293 0.11
294 0.08
295 0.07
296 0.06
297 0.06
298 0.05
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.05
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.03
308 0.03
309 0.03
310 0.03
311 0.03
312 0.03
313 0.09
314 0.11
315 0.13
316 0.13
317 0.14
318 0.16
319 0.18
320 0.18
321 0.12
322 0.13
323 0.15
324 0.16
325 0.15
326 0.14
327 0.13
328 0.15
329 0.16
330 0.17
331 0.13
332 0.12
333 0.14
334 0.13
335 0.16
336 0.19
337 0.19
338 0.22
339 0.28
340 0.34
341 0.4
342 0.47
343 0.48
344 0.49
345 0.57
346 0.55
347 0.56
348 0.52
349 0.47
350 0.42
351 0.41
352 0.34
353 0.25
354 0.25
355 0.16
356 0.14
357 0.11
358 0.1
359 0.07
360 0.06
361 0.07
362 0.05
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.07
367 0.07
368 0.08
369 0.08
370 0.08
371 0.11
372 0.13
373 0.14
374 0.17
375 0.22
376 0.24
377 0.24
378 0.23
379 0.2
380 0.18
381 0.17
382 0.13
383 0.07
384 0.05
385 0.06
386 0.07
387 0.06
388 0.06
389 0.09
390 0.1
391 0.12
392 0.16
393 0.22
394 0.31
395 0.32
396 0.37
397 0.36
398 0.39
399 0.39
400 0.42
401 0.41
402 0.37
403 0.45
404 0.44
405 0.44
406 0.46
407 0.47
408 0.44
409 0.46
410 0.46
411 0.47
412 0.53
413 0.57
414 0.56
415 0.58
416 0.57
417 0.51
418 0.54
419 0.49
420 0.47
421 0.42
422 0.38
423 0.33
424 0.29
425 0.27
426 0.19
427 0.16
428 0.08
429 0.09
430 0.09
431 0.09
432 0.1
433 0.1
434 0.09
435 0.07
436 0.08
437 0.08
438 0.09
439 0.08
440 0.08
441 0.08
442 0.08
443 0.08
444 0.08
445 0.08
446 0.09
447 0.15
448 0.16
449 0.17
450 0.21
451 0.26
452 0.25
453 0.26
454 0.23
455 0.19
456 0.23
457 0.22
458 0.19
459 0.16
460 0.16
461 0.15
462 0.17
463 0.16
464 0.14
465 0.16
466 0.19
467 0.24
468 0.26
469 0.27
470 0.27
471 0.32
472 0.32
473 0.34
474 0.32
475 0.27
476 0.24
477 0.25
478 0.28
479 0.23
480 0.19
481 0.15
482 0.14
483 0.13
484 0.13
485 0.11
486 0.07
487 0.08
488 0.09
489 0.09
490 0.11
491 0.12
492 0.12
493 0.14
494 0.16
495 0.17
496 0.21
497 0.22
498 0.22
499 0.3
500 0.36
501 0.39
502 0.41
503 0.42
504 0.48
505 0.46
506 0.44
507 0.39
508 0.33
509 0.29
510 0.28
511 0.29
512 0.21
513 0.22
514 0.23
515 0.19
516 0.19
517 0.19
518 0.17
519 0.11
520 0.1
521 0.1
522 0.09
523 0.11
524 0.11
525 0.12
526 0.12
527 0.12
528 0.13
529 0.12
530 0.13
531 0.18
532 0.17
533 0.17