Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

T5AMZ6

Protein Details
Accession T5AMZ6    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
245-271VGGIFLYRRRQQKKRALRHAHMEEKARHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
257-260KKRA
Subcellular Location(s) extr 14, mito 4, E.R. 4, cyto 2, pero 2, mito_nucl 2, cyto_pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046936  BIM1-like  
IPR046530  BIM1-like_dom  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF20238  DUF6595  
CDD cd21176  LPMO_auxiliary-like  
cd12087  TM_EGFR-like  
Amino Acid Sequences MHSVGTMVAFGLGMAAAAAIDHTGKVAKSSKVHNPSTASVTDDYMGPSAFMWPYDRTWSGDMDNTAPCGSSAGATKRTEFPLAGGAVALVAQDDYYHSKISISYSNEPKKNADFSLLVQANDLNDLDPGHTCFSVPDAPEHIKAGTNATLQVVYQADWDASVNQTFYACADIVFVDRSDFRFKIPCFNATEPGEDNRKAAEANKAVEAESASDSAESPSNAAKMGSGAKAGTIVGSLGGASAVAVGGIFLYRRRQQKKRALRHAHMEEKARHGQYPLDKGSPQTSA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.03
2 0.03
3 0.02
4 0.02
5 0.03
6 0.03
7 0.04
8 0.04
9 0.04
10 0.06
11 0.07
12 0.11
13 0.16
14 0.21
15 0.25
16 0.32
17 0.41
18 0.48
19 0.51
20 0.52
21 0.52
22 0.5
23 0.5
24 0.45
25 0.38
26 0.3
27 0.28
28 0.24
29 0.2
30 0.18
31 0.14
32 0.13
33 0.1
34 0.09
35 0.1
36 0.09
37 0.09
38 0.11
39 0.12
40 0.14
41 0.19
42 0.21
43 0.22
44 0.23
45 0.24
46 0.23
47 0.25
48 0.24
49 0.22
50 0.21
51 0.19
52 0.18
53 0.16
54 0.14
55 0.11
56 0.1
57 0.08
58 0.12
59 0.15
60 0.21
61 0.22
62 0.24
63 0.27
64 0.29
65 0.29
66 0.25
67 0.22
68 0.2
69 0.2
70 0.17
71 0.13
72 0.11
73 0.09
74 0.09
75 0.08
76 0.03
77 0.02
78 0.02
79 0.02
80 0.04
81 0.07
82 0.09
83 0.09
84 0.1
85 0.1
86 0.11
87 0.14
88 0.18
89 0.2
90 0.25
91 0.33
92 0.41
93 0.43
94 0.44
95 0.44
96 0.41
97 0.39
98 0.33
99 0.27
100 0.21
101 0.2
102 0.27
103 0.26
104 0.23
105 0.2
106 0.2
107 0.17
108 0.17
109 0.15
110 0.06
111 0.05
112 0.05
113 0.06
114 0.06
115 0.07
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.09
121 0.11
122 0.1
123 0.1
124 0.13
125 0.14
126 0.15
127 0.16
128 0.14
129 0.12
130 0.12
131 0.13
132 0.12
133 0.1
134 0.1
135 0.1
136 0.09
137 0.08
138 0.09
139 0.08
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.05
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.05
151 0.06
152 0.05
153 0.05
154 0.06
155 0.06
156 0.05
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.07
161 0.07
162 0.06
163 0.07
164 0.09
165 0.14
166 0.14
167 0.14
168 0.21
169 0.21
170 0.3
171 0.31
172 0.33
173 0.35
174 0.37
175 0.42
176 0.36
177 0.38
178 0.3
179 0.32
180 0.32
181 0.27
182 0.25
183 0.19
184 0.18
185 0.16
186 0.16
187 0.2
188 0.19
189 0.2
190 0.22
191 0.22
192 0.22
193 0.22
194 0.2
195 0.14
196 0.12
197 0.11
198 0.09
199 0.08
200 0.09
201 0.09
202 0.1
203 0.09
204 0.09
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.1
209 0.09
210 0.09
211 0.12
212 0.11
213 0.11
214 0.1
215 0.1
216 0.11
217 0.1
218 0.09
219 0.06
220 0.05
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.02
230 0.02
231 0.02
232 0.02
233 0.02
234 0.03
235 0.04
236 0.06
237 0.13
238 0.19
239 0.3
240 0.39
241 0.48
242 0.58
243 0.68
244 0.78
245 0.83
246 0.88
247 0.88
248 0.87
249 0.89
250 0.88
251 0.86
252 0.81
253 0.78
254 0.7
255 0.67
256 0.68
257 0.59
258 0.51
259 0.43
260 0.44
261 0.45
262 0.49
263 0.47
264 0.43
265 0.42
266 0.44