Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

T5AMD9

Protein Details
Accession T5AMD9    Localization Confidence High Confidence Score 20
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
349-368AVKPSKAKPKKAKEGGENKDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
99-124KAKSSRRKSTAGDSKGKPLNKKGSKA
268-280AATPKKSKKGKGK
298-307KSAKSKKRKA
350-386VKPSKAKPKKAKEGGENKDETPKQAKMSTEERRARKE
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000313  PWWP_dom  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PF00855  PWWP  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50812  PWWP  
Amino Acid Sequences MADKPNEKPEAAAPVAEPEQQSGAKATPKPDDTEGAKGSANNSEEPAPPQEATENATDDPAKEQENPAADVEMKDAPQNAAPGAETASTAASAQPPATKAKSSRRKSTAGDSKGKPLNKKGSKARLTHIDAQPGDHFLVKLKGFPAWPAVICDETMLPAALINSRPASAARPDGSYSEAYADGGKRVQDRSFPVMYLYTNEFGWVQNTALSELSADRAKDSITDKMRRDLKAAFELAAEHHPVEHYKQILKSFQEEQIAQEEARKQAAATPKKSKKGKGKAADDDEDADVEDADVAPKSAKSKKRKAEEDASTPQRPDSVKKPKIKLNTSSTPKTANGAATPNFAGGAAVKPSKAKPKKAKEGGENKDETPKQAKMSTEERRARKEKEVLYLRHKLQRGLLTREQQPREDEMKSMSDYISVLENFVDLEVSIIRATKINKVLKAILKLESVPREEEFEFKKRSQSLLDKWNKLLAGDASGPPSATTNGVNGAGEEKKSEANGVKDEGEVAHEDEPGKASEPKAVETAADELCRLSTS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.29
3 0.29
4 0.26
5 0.19
6 0.22
7 0.21
8 0.21
9 0.19
10 0.2
11 0.24
12 0.27
13 0.3
14 0.34
15 0.37
16 0.4
17 0.41
18 0.44
19 0.41
20 0.45
21 0.42
22 0.37
23 0.35
24 0.32
25 0.31
26 0.3
27 0.29
28 0.22
29 0.23
30 0.23
31 0.24
32 0.26
33 0.29
34 0.26
35 0.24
36 0.23
37 0.23
38 0.21
39 0.22
40 0.22
41 0.2
42 0.17
43 0.19
44 0.19
45 0.17
46 0.2
47 0.19
48 0.19
49 0.19
50 0.2
51 0.22
52 0.25
53 0.26
54 0.24
55 0.23
56 0.22
57 0.2
58 0.21
59 0.19
60 0.16
61 0.15
62 0.16
63 0.15
64 0.16
65 0.17
66 0.14
67 0.13
68 0.13
69 0.12
70 0.12
71 0.11
72 0.09
73 0.09
74 0.09
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.09
80 0.1
81 0.12
82 0.13
83 0.18
84 0.2
85 0.24
86 0.29
87 0.39
88 0.49
89 0.54
90 0.62
91 0.64
92 0.67
93 0.67
94 0.71
95 0.7
96 0.68
97 0.7
98 0.62
99 0.64
100 0.65
101 0.65
102 0.6
103 0.58
104 0.6
105 0.59
106 0.65
107 0.66
108 0.71
109 0.74
110 0.72
111 0.7
112 0.68
113 0.67
114 0.68
115 0.62
116 0.59
117 0.51
118 0.5
119 0.45
120 0.37
121 0.31
122 0.23
123 0.19
124 0.13
125 0.19
126 0.16
127 0.17
128 0.16
129 0.18
130 0.17
131 0.18
132 0.2
133 0.17
134 0.17
135 0.17
136 0.18
137 0.16
138 0.16
139 0.16
140 0.12
141 0.1
142 0.1
143 0.08
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.08
148 0.08
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.1
153 0.1
154 0.13
155 0.13
156 0.17
157 0.17
158 0.18
159 0.19
160 0.19
161 0.21
162 0.19
163 0.17
164 0.14
165 0.12
166 0.11
167 0.12
168 0.11
169 0.1
170 0.11
171 0.12
172 0.13
173 0.15
174 0.16
175 0.18
176 0.22
177 0.27
178 0.26
179 0.25
180 0.24
181 0.22
182 0.22
183 0.2
184 0.18
185 0.14
186 0.12
187 0.13
188 0.12
189 0.11
190 0.12
191 0.1
192 0.07
193 0.08
194 0.09
195 0.09
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.07
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.1
207 0.12
208 0.18
209 0.23
210 0.3
211 0.31
212 0.38
213 0.43
214 0.42
215 0.42
216 0.37
217 0.34
218 0.32
219 0.32
220 0.25
221 0.19
222 0.19
223 0.18
224 0.16
225 0.13
226 0.09
227 0.08
228 0.08
229 0.09
230 0.1
231 0.11
232 0.11
233 0.13
234 0.16
235 0.18
236 0.21
237 0.21
238 0.23
239 0.23
240 0.25
241 0.24
242 0.22
243 0.21
244 0.2
245 0.2
246 0.17
247 0.16
248 0.15
249 0.13
250 0.14
251 0.13
252 0.1
253 0.13
254 0.21
255 0.25
256 0.29
257 0.38
258 0.44
259 0.52
260 0.56
261 0.6
262 0.62
263 0.66
264 0.71
265 0.69
266 0.71
267 0.7
268 0.71
269 0.65
270 0.55
271 0.47
272 0.37
273 0.28
274 0.21
275 0.13
276 0.08
277 0.06
278 0.05
279 0.03
280 0.03
281 0.03
282 0.03
283 0.04
284 0.04
285 0.08
286 0.16
287 0.24
288 0.33
289 0.43
290 0.51
291 0.6
292 0.66
293 0.69
294 0.71
295 0.69
296 0.67
297 0.66
298 0.64
299 0.56
300 0.5
301 0.43
302 0.37
303 0.32
304 0.28
305 0.3
306 0.35
307 0.42
308 0.5
309 0.55
310 0.57
311 0.65
312 0.68
313 0.66
314 0.63
315 0.64
316 0.63
317 0.61
318 0.57
319 0.51
320 0.45
321 0.39
322 0.33
323 0.24
324 0.19
325 0.2
326 0.19
327 0.18
328 0.17
329 0.15
330 0.14
331 0.12
332 0.1
333 0.07
334 0.08
335 0.08
336 0.09
337 0.09
338 0.11
339 0.14
340 0.25
341 0.31
342 0.39
343 0.47
344 0.57
345 0.68
346 0.75
347 0.79
348 0.79
349 0.83
350 0.79
351 0.76
352 0.68
353 0.58
354 0.58
355 0.51
356 0.45
357 0.4
358 0.36
359 0.32
360 0.32
361 0.33
362 0.29
363 0.38
364 0.43
365 0.48
366 0.54
367 0.56
368 0.61
369 0.66
370 0.65
371 0.64
372 0.63
373 0.57
374 0.59
375 0.63
376 0.6
377 0.62
378 0.66
379 0.62
380 0.61
381 0.58
382 0.5
383 0.47
384 0.49
385 0.47
386 0.47
387 0.5
388 0.48
389 0.55
390 0.62
391 0.59
392 0.54
393 0.51
394 0.49
395 0.47
396 0.42
397 0.35
398 0.29
399 0.29
400 0.28
401 0.26
402 0.19
403 0.16
404 0.15
405 0.14
406 0.15
407 0.12
408 0.11
409 0.1
410 0.1
411 0.09
412 0.09
413 0.08
414 0.04
415 0.05
416 0.05
417 0.06
418 0.06
419 0.06
420 0.07
421 0.1
422 0.12
423 0.18
424 0.26
425 0.31
426 0.33
427 0.37
428 0.43
429 0.45
430 0.49
431 0.45
432 0.4
433 0.36
434 0.35
435 0.38
436 0.36
437 0.33
438 0.3
439 0.28
440 0.29
441 0.28
442 0.32
443 0.32
444 0.34
445 0.38
446 0.37
447 0.43
448 0.4
449 0.43
450 0.45
451 0.48
452 0.49
453 0.54
454 0.62
455 0.6
456 0.59
457 0.6
458 0.53
459 0.44
460 0.39
461 0.29
462 0.24
463 0.23
464 0.23
465 0.21
466 0.21
467 0.21
468 0.17
469 0.18
470 0.15
471 0.13
472 0.13
473 0.12
474 0.14
475 0.15
476 0.14
477 0.13
478 0.16
479 0.17
480 0.16
481 0.16
482 0.15
483 0.16
484 0.16
485 0.21
486 0.22
487 0.24
488 0.27
489 0.29
490 0.29
491 0.27
492 0.28
493 0.23
494 0.2
495 0.18
496 0.17
497 0.15
498 0.15
499 0.16
500 0.16
501 0.17
502 0.16
503 0.18
504 0.18
505 0.18
506 0.22
507 0.24
508 0.25
509 0.25
510 0.24
511 0.21
512 0.21
513 0.24
514 0.21
515 0.2
516 0.17
517 0.16