Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1GRM9

Protein Details
Accession U1GRM9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
98-163VPDKAPSKKTATRKKPAAKKPARKTKRKRSTKSKPEGKRKRLTDKQKAAKEKKDAGKKKKDLRKIABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
69-162KPGKPKAHTGRPAASKRKPAAAQRDAAAGVPDKAPSKKTATRKKPAAKKPARKTKRKRSTKSKPEGKRKRLTDKQKAAKEKKDAGKKKKDLRKI
254-255KK
Subcellular Location(s) mito 17, nucl 9, cyto_mito 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd00084  HMG-box_SF  
Amino Acid Sequences MKFFVSPRRVLSHQSVTRLSHLRATRLSCAHSWSRVTFNNNLGYLSSLLQCNASTSTLGQLLSRSYATKPGKPKAHTGRPAASKRKPAAAQRDAAAGVPDKAPSKKTATRKKPAAKKPARKTKRKRSTKSKPEGKRKRLTDKQKAAKEKKDAGKKKKDLRKIALLDPPKRLPSTAFIVLSTETSSKGMSLSQHSKEVSAQYKNLSPEEMERLNHVANENKAKNEAAFKKWLGEHSPVEIKAANAARSQLKRQAKKEGSKKIYPHIQDERIVKQARTSYTYFLKERFASGDMKNMKIGEVGALIGREWRALSAEEKKPYEDRAARDKARYIEEYTTVYGTAPQFQKRAKDTA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.55
3 0.5
4 0.55
5 0.55
6 0.48
7 0.45
8 0.43
9 0.43
10 0.44
11 0.46
12 0.46
13 0.44
14 0.46
15 0.4
16 0.43
17 0.42
18 0.41
19 0.41
20 0.37
21 0.4
22 0.42
23 0.45
24 0.44
25 0.45
26 0.46
27 0.42
28 0.4
29 0.33
30 0.3
31 0.26
32 0.23
33 0.19
34 0.14
35 0.14
36 0.14
37 0.13
38 0.13
39 0.14
40 0.13
41 0.11
42 0.11
43 0.13
44 0.14
45 0.15
46 0.13
47 0.13
48 0.13
49 0.14
50 0.14
51 0.14
52 0.13
53 0.22
54 0.26
55 0.31
56 0.39
57 0.46
58 0.53
59 0.54
60 0.63
61 0.64
62 0.7
63 0.71
64 0.69
65 0.69
66 0.7
67 0.76
68 0.75
69 0.71
70 0.7
71 0.65
72 0.67
73 0.64
74 0.62
75 0.64
76 0.6
77 0.57
78 0.49
79 0.48
80 0.41
81 0.35
82 0.29
83 0.19
84 0.15
85 0.12
86 0.13
87 0.13
88 0.15
89 0.16
90 0.18
91 0.24
92 0.31
93 0.41
94 0.5
95 0.57
96 0.65
97 0.74
98 0.8
99 0.83
100 0.85
101 0.86
102 0.86
103 0.87
104 0.88
105 0.89
106 0.89
107 0.9
108 0.92
109 0.92
110 0.92
111 0.92
112 0.91
113 0.91
114 0.93
115 0.93
116 0.93
117 0.92
118 0.91
119 0.91
120 0.92
121 0.91
122 0.88
123 0.85
124 0.85
125 0.84
126 0.85
127 0.84
128 0.83
129 0.83
130 0.82
131 0.85
132 0.81
133 0.78
134 0.74
135 0.72
136 0.69
137 0.71
138 0.72
139 0.72
140 0.75
141 0.77
142 0.79
143 0.79
144 0.81
145 0.78
146 0.75
147 0.74
148 0.67
149 0.64
150 0.61
151 0.6
152 0.55
153 0.5
154 0.46
155 0.39
156 0.35
157 0.3
158 0.24
159 0.21
160 0.22
161 0.21
162 0.19
163 0.17
164 0.18
165 0.17
166 0.17
167 0.14
168 0.09
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.07
175 0.08
176 0.13
177 0.18
178 0.19
179 0.22
180 0.22
181 0.22
182 0.22
183 0.26
184 0.26
185 0.22
186 0.22
187 0.21
188 0.24
189 0.25
190 0.25
191 0.2
192 0.16
193 0.16
194 0.2
195 0.2
196 0.17
197 0.17
198 0.18
199 0.18
200 0.18
201 0.17
202 0.16
203 0.17
204 0.25
205 0.25
206 0.23
207 0.25
208 0.24
209 0.24
210 0.29
211 0.3
212 0.25
213 0.29
214 0.28
215 0.31
216 0.32
217 0.33
218 0.29
219 0.29
220 0.26
221 0.26
222 0.3
223 0.26
224 0.26
225 0.24
226 0.2
227 0.21
228 0.22
229 0.2
230 0.16
231 0.19
232 0.24
233 0.26
234 0.29
235 0.33
236 0.4
237 0.46
238 0.49
239 0.58
240 0.6
241 0.67
242 0.73
243 0.75
244 0.73
245 0.72
246 0.71
247 0.68
248 0.68
249 0.61
250 0.6
251 0.57
252 0.54
253 0.53
254 0.53
255 0.49
256 0.49
257 0.49
258 0.4
259 0.37
260 0.38
261 0.36
262 0.36
263 0.35
264 0.32
265 0.36
266 0.41
267 0.39
268 0.36
269 0.38
270 0.34
271 0.33
272 0.31
273 0.27
274 0.26
275 0.25
276 0.32
277 0.3
278 0.31
279 0.31
280 0.28
281 0.26
282 0.22
283 0.22
284 0.14
285 0.11
286 0.1
287 0.09
288 0.09
289 0.08
290 0.1
291 0.1
292 0.09
293 0.09
294 0.09
295 0.1
296 0.11
297 0.17
298 0.24
299 0.31
300 0.38
301 0.39
302 0.42
303 0.43
304 0.45
305 0.49
306 0.46
307 0.45
308 0.48
309 0.56
310 0.57
311 0.59
312 0.62
313 0.57
314 0.57
315 0.54
316 0.49
317 0.44
318 0.42
319 0.41
320 0.37
321 0.33
322 0.26
323 0.23
324 0.23
325 0.2
326 0.25
327 0.27
328 0.3
329 0.35
330 0.38
331 0.47