Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U1GPI9

Protein Details
Accession U1GPI9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-30DSRAVIIRPKNHQKLCRACFHydrophilic
345-373AKPKPKPFSIHDKRQKGRRKAAAQQMGKCHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
345-365AKPKPKPFSIHDKRQKGRRKA
Subcellular Location(s) mito 19.5, cyto_mito 12.333, cyto 4, cyto_nucl 3.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032442  CTU1_C  
IPR000541  Ncs6/Tuc1/Ctu1  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
IPR011063  TilS/TtcA_N  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0016779  F:nucleotidyltransferase activity  
GO:0000049  F:tRNA binding  
GO:0032447  P:protein urmylation  
GO:0034227  P:tRNA thio-modification  
GO:0002098  P:tRNA wobble uridine modification  
Pfam View protein in Pfam  
PF01171  ATP_bind_3  
PF16503  zn-ribbon_14  
CDD cd01993  Alpha_ANH_like_II  
Amino Acid Sequences MAPTPCALCTDSRAVIIRPKNHQKLCRACFISLFEREIHETITSSALFQPGERIAIGASGGKDSTVLASVLKTLNDRYNYGLKLLLLSVDEGIKGYRDDSLETVKRNAVQYDMPLEIVGYDELYGWTMDQVVAQVGKKGNCTYCGVFRRQALDRGAAKLGIKHVVTGHNADDVAETVMMNLLRGDLPRLARATSILTASPASDIKRSKPLKYAYEKEIVLYAHHKQLDYFSTECIYSPEAFRGSARTLIKDLEKIRPSSILDIVRSGEDMARLVPPELLSSSSCDGGIDGEEGATSGCGSTKGRSGHGEMVDMEKRLAENEAASTQETEVTLSSANDRPRDAVQAKPKPKPFSIHDKRQKGRRKAAAQQMGKCERCGYLSSQTICKACLLLEGLNRNRPKTTIEIGVEDEDSSTTLMRQVASLEIPSAWTGSIEEQS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.36
3 0.42
4 0.44
5 0.49
6 0.58
7 0.65
8 0.71
9 0.76
10 0.78
11 0.81
12 0.79
13 0.79
14 0.72
15 0.63
16 0.59
17 0.57
18 0.54
19 0.47
20 0.44
21 0.35
22 0.34
23 0.36
24 0.33
25 0.29
26 0.22
27 0.19
28 0.18
29 0.19
30 0.16
31 0.14
32 0.15
33 0.15
34 0.14
35 0.14
36 0.17
37 0.15
38 0.16
39 0.15
40 0.13
41 0.11
42 0.12
43 0.12
44 0.11
45 0.1
46 0.1
47 0.1
48 0.09
49 0.09
50 0.09
51 0.09
52 0.08
53 0.08
54 0.07
55 0.08
56 0.1
57 0.12
58 0.13
59 0.13
60 0.15
61 0.21
62 0.23
63 0.24
64 0.26
65 0.31
66 0.31
67 0.31
68 0.29
69 0.23
70 0.21
71 0.2
72 0.16
73 0.1
74 0.1
75 0.1
76 0.09
77 0.09
78 0.08
79 0.08
80 0.08
81 0.08
82 0.07
83 0.09
84 0.1
85 0.11
86 0.13
87 0.21
88 0.24
89 0.26
90 0.28
91 0.27
92 0.3
93 0.3
94 0.29
95 0.23
96 0.2
97 0.2
98 0.21
99 0.2
100 0.17
101 0.15
102 0.14
103 0.11
104 0.11
105 0.09
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.06
111 0.06
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.06
119 0.07
120 0.07
121 0.11
122 0.14
123 0.15
124 0.17
125 0.2
126 0.2
127 0.21
128 0.25
129 0.23
130 0.29
131 0.33
132 0.35
133 0.35
134 0.36
135 0.38
136 0.37
137 0.41
138 0.34
139 0.36
140 0.34
141 0.33
142 0.32
143 0.28
144 0.26
145 0.22
146 0.21
147 0.18
148 0.16
149 0.14
150 0.15
151 0.17
152 0.18
153 0.18
154 0.17
155 0.14
156 0.14
157 0.14
158 0.12
159 0.09
160 0.09
161 0.07
162 0.06
163 0.05
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.06
171 0.07
172 0.08
173 0.09
174 0.11
175 0.12
176 0.12
177 0.12
178 0.13
179 0.13
180 0.11
181 0.11
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.12
190 0.13
191 0.15
192 0.25
193 0.27
194 0.28
195 0.34
196 0.38
197 0.42
198 0.48
199 0.5
200 0.45
201 0.47
202 0.45
203 0.38
204 0.35
205 0.28
206 0.21
207 0.19
208 0.17
209 0.16
210 0.17
211 0.16
212 0.14
213 0.16
214 0.17
215 0.17
216 0.16
217 0.12
218 0.13
219 0.13
220 0.13
221 0.12
222 0.12
223 0.09
224 0.09
225 0.11
226 0.11
227 0.11
228 0.11
229 0.12
230 0.12
231 0.17
232 0.17
233 0.17
234 0.17
235 0.19
236 0.2
237 0.22
238 0.23
239 0.25
240 0.27
241 0.27
242 0.27
243 0.28
244 0.28
245 0.25
246 0.28
247 0.22
248 0.2
249 0.2
250 0.19
251 0.17
252 0.16
253 0.14
254 0.1
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.08
260 0.08
261 0.08
262 0.08
263 0.08
264 0.08
265 0.09
266 0.09
267 0.11
268 0.12
269 0.12
270 0.11
271 0.1
272 0.1
273 0.09
274 0.09
275 0.06
276 0.05
277 0.05
278 0.04
279 0.05
280 0.04
281 0.04
282 0.03
283 0.03
284 0.03
285 0.05
286 0.06
287 0.08
288 0.13
289 0.15
290 0.18
291 0.2
292 0.23
293 0.28
294 0.27
295 0.28
296 0.23
297 0.26
298 0.26
299 0.24
300 0.2
301 0.15
302 0.14
303 0.13
304 0.14
305 0.09
306 0.08
307 0.1
308 0.11
309 0.11
310 0.12
311 0.12
312 0.1
313 0.11
314 0.11
315 0.09
316 0.08
317 0.08
318 0.08
319 0.08
320 0.12
321 0.15
322 0.19
323 0.2
324 0.2
325 0.22
326 0.23
327 0.31
328 0.29
329 0.32
330 0.4
331 0.48
332 0.55
333 0.61
334 0.67
335 0.64
336 0.66
337 0.65
338 0.6
339 0.62
340 0.64
341 0.67
342 0.71
343 0.75
344 0.79
345 0.82
346 0.86
347 0.85
348 0.85
349 0.84
350 0.82
351 0.81
352 0.85
353 0.85
354 0.82
355 0.78
356 0.77
357 0.76
358 0.69
359 0.6
360 0.51
361 0.42
362 0.37
363 0.34
364 0.29
365 0.28
366 0.34
367 0.36
368 0.38
369 0.41
370 0.4
371 0.38
372 0.33
373 0.26
374 0.19
375 0.2
376 0.18
377 0.18
378 0.22
379 0.31
380 0.35
381 0.42
382 0.45
383 0.44
384 0.43
385 0.41
386 0.39
387 0.37
388 0.37
389 0.37
390 0.37
391 0.38
392 0.39
393 0.39
394 0.36
395 0.29
396 0.25
397 0.16
398 0.14
399 0.12
400 0.09
401 0.08
402 0.1
403 0.12
404 0.11
405 0.12
406 0.12
407 0.14
408 0.16
409 0.16
410 0.14
411 0.13
412 0.14
413 0.14
414 0.13
415 0.1
416 0.09
417 0.1